Spiroplasma mirum ATCC 29335: SMM_0489
Help
Entry
SMM_0489 CDS
T03003
Symbol
secDF
Name
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
smir
Spiroplasma mirum ATCC 29335
Pathway
smir02024
Quorum sensing
smir03060
Protein export
smir03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smir00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SMM_0489 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SMM_0489 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SMM_0489 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
smir02044
]
SMM_0489 (secDF)
Secretion system [BR:
smir02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SMM_0489 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
Imm9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHF60922
UniProt:
W0GL69
LinkDB
All DBs
Position
457024..460158
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MKEKQQVKTIKKPVNRKVLTKLIVRIFVLLILTCAMIVGAVFSGENFSYSYKLGIAYSGG
YQVQINVFDTTVENPDGTPNGDNKKGLDLLRNKLDPLNNSNLYLQTLGHNGLELIAGKDL
FKSYADLKTDIQRLGAIYLMKGNGTDLLVSDKERTPLSNVISGAEAGIDKIRHPIINLNI
KDQAKWDAIIKSLTPSQGSPEPLYIWTDIGQFIDELRHDTDNIQAIATNFNVNILPNLSG
TDNINVRSIFDVSYKDAGQGGIIVYRNLLDLATSGMSHPELVKVMQEDSFRFTTVSLGKL
VIDPNDKKAIKNQYIDPLRKYLTGIVNYTPQLKDKYKKYIINYNAINKGATPGLNSNQIA
TSTDTEARTISNLVNGGLSGLKFVVRGHTTIPPVVSRNILNVSMIVLGIIAAAICVYLLI
YYRLFGFVAILTLAFTIILTLYFSSLLGVQISPESITAVIIAFGIALEGNLLLFSRYKRE
RYQNGLPYEPAMKIANKQTVAVFVDALVVLLVLGLSLFWAGTNNIKSFATILLVALIISL
VMVFAVARIMYWIIIKLRWQEKVTWLDIPRFSLLTYFQQKKHTHQVVNGEGQLLSDCFFA
LPTTDVNEATPSESDQPKKPHKLRFKPKFSLYNITKYSPIVGIILIIIALIIGFAGKANI
DSTIKPGTNITVASDIWRHRDDAAAEIQEMTQELKHLQATRGYNFSFNLYVIKADDMSMG
QQLLVISTNISGSNFARELLSSIAGYYGLTPEDPVFKLEKTSPVMETYILKTAGISLAIG
IACIFVYTLFRLDWAQFIGILFAAVFTLAVSVSIIVIAHILLTFEMSIAFIAIFGFAWAM
GAIVMAWAKQNKKLVNIKEYETFFTYMSEHRAQVRRLRRAKKVYMQEEIKKLMIANLNLK
QKEVKKEFAEHLKTQWKIAKDLAAKNKKEIKLINKEFRKYNYTHNFLQKIANLTIKQMLR
HCLTLGAIFTIILIILSAFSGSVFGFNITVFIGLAIGMFSVLFLAIPIWVALEKYRALNK
IRVKNYLDSQRVEIDEQIVAGVND
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaagaaaaacaacaagtaaagacaataaaaaaaccagttaatagaaaggttttaaca
aaattaattgttagaatttttgtcttattaattttaacgtgtgccatgatcgtaggagcc
gttttttcaggtgaaaatttttcttattcttataaattaggaattgcttattcgggaggc
tatcaagttcaaattaatgtttttgataccactgttgaaaatcccgatggaacccccaac
ggagataataaaaaagggctagatttattacgcaacaaacttgacccgttaaataattct
aacttatacttgcaaacattaggacataatgggttagaattaattgctgggaaggattta
tttaagtcttatgctgatttaaaaactgatattcaacggttaggggccatttatttaatg
aaagggaatggcaccgatttattggttagtgataaagaacgtacaccgttaagtaatgtt
atttcgggagcagaagctgggattgataaaattcgtcatccgattattaatttaaatatt
aaagaccaggctaaatgagatgctattattaaaagcttaactccaagtcaaggttcaccc
gaaccattatacatttgaacggatattggccaatttatcgatgaattgcgccatgatact
gataatattcaagcgattgctactaattttaatgttaacattttacccaacctaagcgga
actgataatatcaatgttcgtagtatttttgatgttagttacaaagatgctgggcaaggg
ggaattattgtttatcgaaacttactagatttagcaactagtggaatgagtcatcctgaa
ttagttaaagtaatgcaagaagatagtttccgctttaccactgtttccttaggcaaacta
gtaattgatcccaatgataagaaagcaattaaaaatcaatacattgacccgttacgaaaa
tatttaactggaattgtcaactatactccgcaattaaaagataaatataaaaaatacatt
attaactataatgccattaataaaggagcaacaccaggcttaaattcaaaccaaattgcg
acttcgactgataccgaagcacgaacaattagcaacttggttaatggggggctaagtggt
ttaaaatttgttgttcggggtcataccacaattccgccggttgtttcgcgcaacatttta
aatgtttcaatgattgtgttaggaattattgctgctgcgatttgtgtttatttattaatt
tactatcgtttgtttggttttgtggcaattctaaccttagcctttactattattttaact
ttatatttctcatctttattaggagtccaaatttctccggaaagtatcaccgctgttata
attgcctttggaatcgctttagaaggaaatctcttgttattttcgcgttataagcgtgag
cgatatcaaaatggcttgccttatgagccagcgatgaaaattgccaataaacaaacggtt
gctgtttttgtggatgccttagttgttttattagtattaggattatcattattctgagca
ggaactaacaatattaaatcatttgccacaatcttattagttgccttaataatttcgtta
gtaatggtctttgctgtggctcgtattatgtactggattattattaaacttcgttgacaa
gaaaaagtaacatggttagatattccccgcttttcattgttgacttatttccaacaaaaa
aaacatacgcaccaagtggtaaatggggaaggccaattactaagtgattgtttctttgcc
ttaccaacaaccgatgttaacgaagcaactccaagtgagtcagaccaacccaaaaaacct
cacaagttaagattcaaaccaaaattttcattatataatattactaaatattcaccaatt
gtgggaattatcttaattatcattgcattaattattgggtttgccggaaaagcaaatatt
gatagtacgattaaaccgggaactaatattaccgtcgctagtgatatttgacgtcatcgc
gatgatgccgctgcggaaattcaagagatgactcaagaattaaaacatttacaagcaacg
cgtggttataattttagttttaatttatatgtcattaaagccgatgatatgtcaatgggc
caacaattattagttattagtactaatatttctggaagtaattttgcccgcgaattacta
tcatcaattgcgggatattatggactaactcccgaggatccggtctttaaattagaaaaa
acatcaccggtgatggaaacctacattttaaaaactgcggggattagtttagcaattgga
attgcttgcatctttgtttatacattattccgattagactgagcacaatttattggaatt
ttatttgcggctgtctttaccttagcagttagtgtttcaattatagtaattgcccatatt
ctcttaacctttgaaatgagtattgcctttattgcgatctttggttttgcatgagcgatg
ggagcgattgtaatggcctgggcaaaacaaaacaaaaaactggttaatattaaagaatat
gaaactttctttacatatatgagtgagcaccgtgcccaagtccgccgtttgcgccgggcg
aaaaaagtttacatgcaagaagaaattaaaaaattaatgattgccaacctgaatttaaaa
caaaaagaagtgaagaaagaatttgctgaacatctaaaaacccaatgaaaaattgcgaaa
gatttagcagctaaaaataaaaaagaaattaaattaattaataaagaatttcgtaagtat
aattatacgcataactttttacaaaaaattgctaatttaacaattaaacaaatgctacgt
cattgtttaaccctaggagccatatttacaattattttaattatcttatctgccttttcg
ggaagtgtctttggttttaacattactgttttcattggtttagcaattgggatgtttagt
gtgttattcttggcgattcctatttgagtagcgttagaaaaatatcgggcattaaataaa
atccgggttaaaaattatttagactcgcagcgagttgaaattgatgaacaaattgttgct
ggtgttaatgactag
DBGET
integrated database retrieval system
