Spiroplasma mirum ATCC 29335: SMM_1159
Help
Entry
SMM_1159 CDS
T03003
Name
(GenBank) ABC-type transport system permease protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
smir
Spiroplasma mirum ATCC 29335
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smir00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
smir02000
]
SMM_1159
Transporters [BR:
smir02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
SMM_1159
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
TMEM169
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHF61526
UniProt:
W0GSG8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1078079..1082347)
Genome browser
AA seq
1422 aa
AA seq
DB search
MLLFWQTFKNMLKEKTQILIFVILVILSTLLLSVSWIVNERLTDAYRFMGQGTFNYDYLL
NYNSKKKSTHNVETIIPWFAFDNEYHMITDKAGKTKTLPFLSLGDNHVLKKINPDNIKII
ISGGQVSSIEINDPTNPLKFTNNGLYNFNVDNDNFRKSLIGSFYNPNTKQFSNIDVITYF
MENFVKSDISKNTINLLVAYANHVGITSDDSANRQKIADFINPTTGNVWLKDIDYSKGTP
QKDLPNQTDILNEIYTKGLDGNFSMLYKTDNSQLLNSVKMYYSPTITNNSEPGFNYNINN
ATFTVNDFYNSKNTNADFKNNLRNGKEYGPYAFTSSYYQLVGDATNFAIQMREQYEYWDL
ASNVKFKVINWQQLLDYDQLKIISKYSKFDINDSTNSVYVIITPQYAKNHNLSLGDQLTI
GQNTGFFVGAIGGDVANIYPTIYNTDVFPDLEIDSVVYVSPQVFRLQNNIAPDLDIEEDS
TAFLSYQRPNQKLTDLERFKTYLASDYLSLNTPTNKNAPILNRDDTKLIYVRYSLLGTSI
KIYRAVSITLVVIFLLILIFTLVILIKKIINQEKVENGILKANGYTGMHIASSYLVYSIF
VTLVGVPLGWLIGVVLQYPIMVVFNKYFVIPSVFSFNPIPLVICFGLILIVTVSVILFTA
ARQLSISPLDLLNPNKNIHPNKWIEKITSRVHFKHFNNKFRFIIMAISLKKIGWFFLTFF
VASLSLTFAILIPTSINKVSDDYYRNLAYENEYGYNNVVGNIPFSRYQLYDWNGPQASQY
PIYPLENNSLITKYFYKSGNWLTTNDVLATNPGKYALDINNMIVFNFMAGKGASLSIGAF
YDLYQRSGQNRDIENQINTLVCTTLPMAFGKQPIIPTDPNVIDRWTYCVQHATDGMLPGK
IKNMWLKNELAKEQFNFTFGTSTYNRQDEDLYTGFNSQIKNSIGLFTYGINGNNKTIVFP
NHSLKRQLAESATLDINKNKNALIPMVINEVVQKKYGIKPGDIFPANVESNTLQFCYTPN
TCVPVSQLDWGYEPPSGFNNNQTDPFKMDLTKLTVGSSSINRFGFSDQSGTPQDYYNLAN
FTLRLPKPPAGAFMTPSVSETTGKKLPGLLDTNPDPAIYPDQKVVEDDGKGYIKIHPFAS
RYDREINGLGDLTTGFPTNWYREAFKQGLLKIRVTKKQVFYNVIGLQESYDIPRAYINQK
VANQILGYPTTTANLYPQDQKNNPLSWFNGKFSKYPNQVDQTGRYNLSSSNSTYSMIDFM
NGSMGGAIGKTDYLIIKNQVIEKLAVISTILSTLFVIITIMAAIIIIYIMTESFVNSFLK
FIAVMKSLGYSNWEVNSLMLGIFTPFVVIAWGVGVGIMWLIVKLGMYGFSMTSSVIIPLG
FPWLIIPITFFFIVAIYAVTYWILNYKIKHMSIQEQINANEI
NT seq
4269 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttattgttttgacaaacatttaagaatatgttgaaggaaaaaactcaaattttaata
tttgtaattttagttattctttcaacattgctattatctgtttcttgaattgtcaatgaa
cggttaacagatgcttatcgttttatggggcaaggaacttttaactatgactatctttta
aattataatagtaagaaaaaaagcactcataatgttgaaacaattattccttggtttgct
tttgataatgagtatcacatgattacggataaggcgggaaaaacaaaaaccttgccattt
ttaagtttaggtgacaatcatgttttaaaaaaaattaatcctgataatattaaaattatt
attagtgggggacaagttagtagcattgaaattaatgatcccactaaccctttaaaattt
actaataacggtttatataattttaatgttgataatgataattttcgtaaatcattaatt
ggtagtttttataatccgaatacaaaacaattttctaatattgatgttattacttatttt
atggaaaattttgtgaagagtgacatctcaaaaaataccattaatttattagtggcctat
gctaaccatgtggggattactagtgatgatagtgcaaatcgtcaaaaaattgctgatttt
attaacccaaccaccggaaatgtttggttaaaagacattgattatagtaaaggaactcca
caaaaagatcttcctaaccaaactgatattttaaatgagatttatactaaaggtttagat
ggtaattttagcatgttatacaaaactgataattcgcaattattaaattcagttaaaatg
tattattcaccgacaattactaataattcagaaccaggatttaactataatattaataat
gctacttttactgttaatgatttttataattcaaaaaatacgaatgctgattttaaaaat
aacttacgtaatgggaaggaatatggaccttatgcttttacaagtagttattatcaacta
gttggagatgcgacaaattttgcaattcaaatgcgtgagcaatatgaatattgagattta
gcttcaaatgttaaatttaaagttattaattgacaacaattattagattatgatcaatta
aaaattattagtaaatatagtaaatttgatattaatgattcaaccaattcagtgtatgtt
attattactcctcagtatgctaaaaatcacaatttaagtttaggagatcagttaacaatt
ggtcaaaatactggcttttttgtgggtgccattgggggagatgtggctaatatttacccg
acaatttataatacggatgtttttcctgatttagaaatagattctgtggtatatgtttca
ccacaagtatttcgtttacaaaataatattgctcccgatttagatattgaagaagatagt
acagcgtttttatcttaccaacgtccgaaccaaaaattaactgatttagaacgctttaaa
acatatttagcaagtgattatttatcattaaatactccaactaataaaaatgctcctatt
ttaaaccgtgatgatacgaaattaatttatgttcgttattcattattaggaacttcaatt
aaaatttatcgtgcggtaagtattactttagttgttattttcttactaattttaattttt
actctagttattttaattaaaaaaattattaaccaggaaaaagttgaaaatggaatttta
aaagccaatggttataccggaatgcatattgctagttcttatttagtatattcaattttt
gttaccctggtcggagtaccattaggatgattaattggagttgtgttacagtatccaatt
atggtagtctttaataaatattttgtcatcccgagtgtattttcttttaatccgatccca
ttagtaatttgttttggcttaattttaattgtaactgttagtgtaattttatttaccgct
gctcggcaattatcaattagtccgttagatttattaaatccaaataagaatattcatcct
aataagtgaattgaaaaaattactagccgcgttcattttaaacattttaataataaattc
cgttttattattatggcaatttccttgaaaaaaattgggtggttctttttaaccttcttt
gttgctagtttatccttaacttttgcgattttaattcccacttcaattaataaggtgagc
gatgattattatcggaatttagcttatgaaaatgagtatggttataataatgttgttgga
aatattccgttttctcgttatcagttatatgattggaatggtccgcaagcttcgcaatat
ccaatctacccattggaaaataattcattaattacaaaatacttttataaaagcggtaat
tggttaacaaccaatgatgtgttagctactaatccggggaaatatgcgctagatattaat
aatatgatagtatttaactttatggccgggaagggagcaagcttatcaattggggctttt
tatgatttatatcaacgttctggacaaaaccgcgatattgaaaaccaaattaacacgtta
gtatgtacaaccttaccaatggcatttggtaaacaaccaattatcccaactgatccgaat
gtcattgaccgttgaacttattgtgtgcagcatgctactgatggaatgctacctggtaaa
attaaaaatatgtggttaaaaaatgaattagcaaaagaacagtttaattttacttttggt
acttcaacttataatcgtcaggatgaagatttatatactggttttaattcacaaattaaa
aatagcattggtttattcacttatggaattaatgggaataataaaactattgtgtttcct
aaccatagtctaaaacgtcaactagcagaaagtgctacgttagatattaataaaaataag
aatgccttaattccgatggtgattaatgaagttgtccaaaaaaaatatggcattaaacca
ggtgatattttccccgctaatgtcgaaagtaatacgttgcaattttgttatactcctaat
acatgtgttccagttagtcaattagattggggttatgagcctcctagtggttttaataat
aatcaaactgatccttttaaaatggatttaacaaaattaactgttggttctagttcaatt
aaccgttttggttttagtgatcagtcaggaacaccacaagattactataatttagctaat
tttactttaagattaccaaaaccaccagccggtgcttttatgaccccaagtgtaagtgag
acaacgggtaaaaaattgccaggtttattagatactaaccccgaccctgcaatttacccc
gaccaaaaagttgtggaagatgatggaaaagggtatattaaaattcatccgtttgcctct
cgttatgaccgtgaaattaatgggcttggtgatttaacaaccggctttccgacaaattga
tatcgtgaagcatttaaacagggattattaaaaattagagttactaaaaaacaagtattt
tataatgttattggattacaagaatcatatgatattcctagggcatatattaaccaaaaa
gtggcgaaccaaattcttggttatcccacaacaactgctaatttatatccccaagatcaa
aaaaataaccccttatcatgatttaatggaaaatttagtaagtatcccaatcaagttgac
cagactggacgatataatttatcatcctcaaatagtacttattcaatgattgattttatg
aatggttcaatgggaggggcaattggaaaaacagattatttaattattaaaaaccaagtt
attgaaaaattagctgttatttcaacaattctttcgaccttgtttgtgataattaccatt
atggcagccattattattatttatattatgactgaatcatttgttaatagtttcttgaaa
tttattgcggtaatgaagtcgttaggatactccaactgagaagttaatagtttaatgtta
ggaattttcacaccatttgtggtgattgcctggggagttggggttggaattatgtgatta
attgttaagttaggaatgtatggtttctcaatgacaagttcagttattattccgttagga
ttcccatgattaattattccaattacattcttctttatagttgctatttatgctgtgact
tattgaattttaaattataaaattaaacacatgagtattcaagaacaaattaatgctaat
gaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
