Sphingobacterium mizutaii: 4412673_01633
Help
Entry
4412673_01633 CDS
T05395
Name
(GenBank) Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
Organism
smiz
Sphingobacterium mizutaii
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5053
KH_DEAH11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNV48864
UniProt:
A0AAJ4XBM7
LinkDB
All DBs
Position
1:1870378..1873314
Genome browser
AA seq
978 aa
AA seq
DB search
MNKVSITKEELLFTYRKVKRELFYEKDYIKLDKILLFEENIESNINNLLSVLNGNKNETQ
RFFNNHENIGFSEFILKDIDFSKKASVDVKKSIKNLDRNLFEIKNIGFRFIGDLSIYFQI
IGGLWLNRIGYKLDLDFPDNVYGCRLKKYDDSINIPYYKQNHTLYKPYFNDYKKWQNDLF
NIIKEDKNVLVITSDLKKYYHSIEISELRFKVDKLIKKHSFNKTDLFINELLFQMIEHFN
DLNNKNYQDFFDSNINNLDNKNFGLPLTLNASRVLANIYLLDFDQDIIDNLKPLYYGRYV
DDLIIAVEYSGYTNDQLCLKDILKPLKSFVIYDNNSIFHEGFDTYLKFNPEKENIFVFNG
IEDKIEVNQLKKAINKNSSEWKLLPDNSDYEEIENLDLFHDLNKSCEEVNGLRKSTGLIL
KRNKFIKEIVSFETFICSYNSQVWRKRLFNFLNIIESYIFDFKNFVDLNKYLPRLFGILI
HSNNEDLIKKYFETLESVMGYIKVSKNINSTYFEKSKVFLYHKIAENILTNSSLHKIQSN
YAQNWVSKVLKGNSSKEDMLKNVIRLFNTDLHKIAYKDSFYKFPEFVKYLNNNINLSTVS
DNLANTFFNKSIIEFIKINVKTNYQENSSGITDSTGFYFFTRRPSLLELTVTFKNKILDK
DGFKDLAEKYYHKYSLSEEKEYDDVKNFSFVDFSDTKNKAKTRVCNTHFFTDDISFDAKV
RILNDEPDVTRFDRLIKIVNDVIKESKSIDYLVFHELSLPRNMYVHIAKKLSFVGVNLIA
GLEYKISGLTVDNQLVYILNSDDNRSGSIALYQSKLFGAIHESKEIYNKNGLSIVPKFEK
KLVVKHNGFIFSGLICNDLLDINNRSVLRGNIDLLFVVAWNPDLETYQHLINSACLDLHC
FVSICNNKQYGDTRIRAPYKDSWRRDLQKIHGGTLDSFIISEINFKELRDYQTNQISPDR
PFKPFPTGFQVSNERKLK
NT seq
2937 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaagtttcaattactaaagaagaactcttgtttacttatagaaaggtgaaaaga
gagttgttctatgaaaaagattatattaaactggataagattcttttatttgaagagaat
attgaaagcaatatcaataatcttctttctgtattaaatggtaataaaaatgaaacccaa
cgattctttaataatcacgaaaatattggtttttcagagtttatcttaaaggatattgat
ttttctaaaaaagcatctgttgatgtaaaaaaatcaattaaaaatcttgatcgtaattta
tttgagattaaaaatattgggtttaggttcattggagatttatcaatttattttcaaata
attggaggtctctggttaaatcggattggatataaattagatctcgattttcctgataat
gtttacggctgcaggcttaagaaatacgatgatagtattaatattccttattataaacaa
aaccatactctttataagccatattttaatgattataaaaaatggcaaaatgatcttttt
aatataattaaggaagataaaaatgtattggttattacatctgatttaaaaaaatattat
cattcaattgagataagtgagctaaggtttaaggtagataaattaattaaaaagcatagt
tttaacaaaacagatctttttattaatgaacttttatttcaaatgattgaacattttaat
gatcttaataacaaaaattatcaagatttttttgatagcaatattaataatttagataat
aaaaactttggacttcctttaactcttaatgcatcaagagttttagctaatatttattta
ttagattttgatcaagacattattgataacttgaagccattatattatggaagatatgta
gatgatctaattattgctgtagagtattctggatatacgaatgaccaattgtgtttaaaa
gatatattaaaacccttaaaaagttttgtaatatatgacaataattcaatatttcatgaa
ggatttgatacatatttaaagtttaatccagaaaaagagaatatttttgtttttaatgga
attgaagataaaatagaagttaaccaattaaaaaaagctataaataaaaattctagtgaa
tggaagttacttcctgacaattcagattatgaagagattgaaaaccttgatttatttcac
gatttaaataagtcttgcgaagaagtaaatggtctcagaaaatcaaccgggctaatatta
aaaaggaataaatttataaaggagatagttagttttgaaacttttatttgttcttacaat
agtcaagtttggaggaagcgattatttaattttttgaatattattgaaagctatattttc
gattttaaaaattttgtggacttaaataaatacttgcctaggttgtttggtatactaatc
cattcaaataatgaggatttaataaaaaagtactttgaaaccttagaaagtgttatgggc
tatataaaggtgtcaaaaaatatcaattcaacgtattttgaaaaatcaaaggtctttttg
tatcataaaattgcagaaaatatattaacaaatagttcattacataaaattcaaagtaac
tatgcccagaattgggtttcaaaagtattaaaaggaaattcttcaaaagaagatatgctg
aaaaatgtgattcgattatttaacacggacttacataagattgcatataaagattccttt
tataaatttcctgaatttgttaaatacttgaataataacattaatttatctactgtttcg
gataatttagccaatactttctttaataaaagtataattgaatttatcaagataaatgtt
aaaacaaactatcaagagaattccagtggaattacagattcaacggggttctactttttt
actagacgtccttcgttgcttgaattgacagttacttttaaaaacaaaattttagataag
gatggttttaaagatctagcagaaaagtattatcataaatacagtttatctgaagagaaa
gaatatgatgatgtgaaaaactttagctttgttgatttttcagatactaaaaataaagcg
aaaactagagtttgtaatacacacttttttacagatgatatttcctttgatgcaaaagtt
agaatattgaatgatgagccagatgtaactaggtttgatagattgattaagattgtaaat
gatgtaataaaagagagcaaatcaatagattatttagtgtttcatgaactttctttacct
aggaatatgtatgttcatatcgctaagaaactaagctttgttggcgttaatttaattgct
ggattagaatataaaatttctggtttaacggtagataatcaattggtttatatactgaat
tctgatgataatagaagtgggtcgattgcattataccaatctaagttatttggagctatt
catgaaagtaaagaaatctataataaaaacggacttagtattgtcccaaaatttgaaaaa
aagttagttgttaagcataatggttttattttcagcggattaatatgcaacgatttgtta
gatattaataatcgttctgttttgagaggaaatattgatttattgtttgttgttgcttgg
aatcctgatttggaaacttatcaacacttaattaattccgcatgtcttgatcttcattgt
tttgtttctatttgcaataataagcaatatggtgacacaagaattagagctccatataaa
gattcttggagaagagatcttcaaaaaatacatggaggaactttagattcgttcattatt
tctgagattaactttaaagagttgagagattatcaaacgaatcaaatatcaccagatagg
ccttttaagccatttccaactggttttcaagtttccaatgagagaaaactcaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
