Schistosoma mansoni: Smp_003340
Help
Entry
Smp_003340 CDS
T01095
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K23562
ER membrane protein complex subunit 1
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
smm04131
]
Smp_003340
Membrane trafficking [BR:
smm04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
ER membrane protein complex
Smp_003340
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EMC1_C
PQQ_2
Ribosomal_L2_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8348356
NCBI-ProteinID:
XP_018647688
LinkDB
All DBs
Position
1:8341994..8373791
Genome browser
AA seq
1085 aa
AA seq
DB search
MHLSLWLLASLALSVNAIYEDQVDVLDWNQKFVGKVKYSKLKFDGTIPKNYFVGSELNVI
SSINLKDGSIVWRQVLDEDGELTGFELCGNKLFSLSSKHGTKLRAWDIKFGGVLWEALID
SSESSSGDIWCDENSGILVVAYDKGVDAYRLQTGEKLSSDRNMNSSSNQINIVSGKTESS
LTISLVEKYLDKSGHLDIDAPELSYIIIRTYPIPSSGLQLTPMVVKNYTIPSSVYNQHSC
NIFGLHNIPTNAVVVCLSSERGRQGSLLRFSSVSSSSWDVITVKSTFANMVKLTDNDFLL
TSSSLEPTTGAVYHLDSSGIPVLKYFVNNSMIGCLGTLNGRSYLFTLHHNVDQYFKNLAL
NIYDLESGELSKELPPRHFTLASHHGTIESISAIMFTDATGAPSFRLLLYTEDDAVQLIR
QNGKQQWIREEALANIVAVEVIDLPVSEFQAKIEEEFNHASNNILEMFIQRLKSQMSQLV
VWTRHWIYNIPNLFMAIVSSKPFFKHSSNGDLSKRRVLPSSSPSLQDYSSSDPSSFSSYS
HSFPPRWQFSSHIPSLNVNNSTNNDNTIDNVDGDKLNVYKSSQIDSKLTSWDEKLTRDNF
NVHKMLVIATSVGKLFGLESERGRIVWDYFVPSAKLLANEKFALFQQRNLAHFPLPPIMS
LLFRSKKTNRRVLFSFNPITGVPSHEKGMDLYTLKSDIIQTVLEPGSVSERCEFIRPLLL
LRADLDVEVYPSTCTPTYSSSDSQPLYIFTIEREQARLTGYRINPVSSDGKSLKATRVWR
MLLSPDSNPVNKHIIVAAASRPPSEHIYSVGRVLGDRSVLYKYLNPNLIAVLTIGGDINS
HTNTLMIYLIDVVAGRILYSAVHRRCSEPISLVHSENWIIYTYYNHKSLRNEATVIELYE
PTKLSGELCASHSTGENSLIPQVLQQSYILNTPPRSGAVTVSVTERGITAKNIILALQRN
SLIELPKTFFDPRRSLDMTSELMEEGVHPYAPVLPFSDQAIITYNQSIMRIRAIRTAPTG
LESTGLVFAYGLDLFFTRISPSQTYDLLKEDFDYTAIATVTLGMIIASIVSCRLATRRAI
LRAWA
NT seq
3258 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatttatccctatggctgctggcttcccttgcactcagcgttaatgccatatatgaa
gaccaggttgacgttctagattggaatcaaaagtttgtgggaaaagtcaagtattcaaaa
ttaaagtttgatgggactatccctaaaaattattttgtgggttctgaactcaatgttatt
agttctatcaatttaaaggatggatcaattgtttggcgacaggtacttgacgaagatggt
gaattgactggatttgaattatgcggcaataagttgttttctctttcctccaagcatgga
actaagttacgtgcttgggacattaagtttggtggtgttttatgggaggctttaatagat
tcttctgaatcatccagtggggacatttggtgtgatgaaaactcagggattttagttgtt
gcttacgataaaggagtggatgcttatcgtcttcaaacaggtgaaaagctgtcatctgat
aggaatatgaactcaagttctaatcaaataaatatagtttccgggaaaactgaatccagt
ttaacaatctcactagttgagaaatatctggacaagagtggtcatctggatattgatgca
cctgaattatcttatatcattatcaggacatatccaattccaagttctggattgcagtta
actcctatggtcgtaaagaactatacgattccgtcgtctgtttataaccaacactcatgc
aatatattcgggttacataacataccaactaatgccgttgttgtgtgcttatcgtcggag
cgtggtagacagggaagcctgcttagattttcatctgtttcatcgtcaagttgggacgtt
atcacagtgaaaagtacctttgcaaatatggttaagctaacggacaatgattttctgtta
acctcttcatcgttggagcccaccactggggctgtatatcatttagattcctctggtatt
ccagttttaaaatattttgtcaataattctatgattggatgtttgggaacgctaaatggt
cgatcgtatttatttacacttcatcacaatgtagatcagtattttaagaatctggctcta
aacatctatgatttagaatctggtgaattatccaaagaactaccacctcgtcatttcact
cttgctagtcatcatggtacaattgaatcgatatctgctatcatgtttactgatgctacc
ggtgctccgagtttccgattattgctatatacagaggatgatgctgtacaactaatccga
caaaatggtaaacaacaatggattcgtgaagaggcgttagcgaacatagttgctgttgag
gtaatcgatttacctgtttcagagtttcaagcgaaaattgaagaagagtttaatcatgca
agcaacaacattctggaaatgtttattcaacgcttaaaatcacagatgtctcaattagtt
gtatggacgaggcattggatttataacataccaaatttattcatggctattgtatcgtct
aaaccgtttttcaagcattcatctaatggtgatctgtcaaaacgtagagtactaccatca
tcatctccttctttacaggactattcatcaagtgatccatcgtctttttcaagttattca
catagttttccacctagatggcaattttcatcacatattccctctttaaatgtcaataat
tctactaacaatgataataccattgataatgtagatggcgataagctaaatgtttataaa
tcatctcaaatagattccaaattaacatcatgggatgagaaacttacacgtgacaatttc
aatgttcataaaatgttggtcatagctacgtcagtcggaaaactgtttggtttagaaagt
gaacgtggtcgtattgtttgggattattttgtcccatctgcaaaacttttagctaatgaa
aagtttgctctcttccaacagcgcaatttagctcattttcctttaccacctatcatgtca
cttttatttcgatcaaagaaaacaaatcgacgggtacttttctcattcaatccaattact
ggtgttccatcacatgaaaaaggtatggatttgtatacattgaaatcggatattattcaa
actgtcttggaacctggttctgtaagcgaacgatgtgaatttattagacctctgttgctg
ttgagggcagatttagacgttgaagtttatccatctacctgtacccctacgtattcatca
tcagattcacagcccttatatatctttactattgaacgtgaacaagctcgtcttaccggt
tatcggataaatccagtatcttcagacggcaaatctttgaaagctacacgtgtctggcga
atgttattgagtcctgattctaatccggttaacaagcatatcattgtcgctgcagcttca
cgtccaccttctgaacatatttattcagttggtcgagtattaggtgatagaagtgttctt
tacaaatatttaaatcctaatcttattgcagtacttactattggtggtgatatcaacagt
catacaaatacattgatgatttatttgattgatgttgtagctggtcgaatattgtatagt
gctgtacatcgtcgatgttctgaacctattagtctagtgcattcagagaactggattatt
tatacttattataatcacaaatcattacgcaatgaagctaccgttattgaattatatgaa
ccgactaaattatccggggaattatgtgctagtcattcaactggtgaaaattctttaata
cctcaagttctacaacaatcttacatactaaacactccaccacgtagtggtgcagtgact
gtttcagttactgagagaggaataaccgccaagaatataattttggctttacagaggaat
agtctaattgaacttccgaagacatttttcgatccccgtcgtagtttggatatgacttct
gaactaatggaagaaggtgttcatccttatgctcctgtgctaccgttttccgatcaagct
ataattacatataatcaatcaattatgcgaattcgagctattcgtacagcacctaccggt
ttagagtccactggattagtatttgcatatggattagatttgtttttcactcgaatatca
ccttcacaaacatatgatttacttaaagaagatttcgattatactgcaatagctactgtc
acattaggaatgataattgcttccattgtatcatgtcgtttagctacaagacgagcaatt
cttagagcttgggcttga
DBGET
integrated database retrieval system