KEGG   Schistosoma mansoni: Smp_003340
Entry
Smp_003340        CDS       T01095                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K23562  ER membrane protein complex subunit 1
Organism
smm  Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:smm04131]
    Smp_003340
Membrane trafficking [BR:smm04131]
 Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
  Others
   ER membrane protein complex
    Smp_003340
SSDB
Motif
Pfam: EMC1_C PQQ_2 Ribosomal_L2_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 8348356
NCBI-ProteinID: XP_018647688
LinkDB
Position
1:8341994..8373791
AA seq 1085 aa
MHLSLWLLASLALSVNAIYEDQVDVLDWNQKFVGKVKYSKLKFDGTIPKNYFVGSELNVI
SSINLKDGSIVWRQVLDEDGELTGFELCGNKLFSLSSKHGTKLRAWDIKFGGVLWEALID
SSESSSGDIWCDENSGILVVAYDKGVDAYRLQTGEKLSSDRNMNSSSNQINIVSGKTESS
LTISLVEKYLDKSGHLDIDAPELSYIIIRTYPIPSSGLQLTPMVVKNYTIPSSVYNQHSC
NIFGLHNIPTNAVVVCLSSERGRQGSLLRFSSVSSSSWDVITVKSTFANMVKLTDNDFLL
TSSSLEPTTGAVYHLDSSGIPVLKYFVNNSMIGCLGTLNGRSYLFTLHHNVDQYFKNLAL
NIYDLESGELSKELPPRHFTLASHHGTIESISAIMFTDATGAPSFRLLLYTEDDAVQLIR
QNGKQQWIREEALANIVAVEVIDLPVSEFQAKIEEEFNHASNNILEMFIQRLKSQMSQLV
VWTRHWIYNIPNLFMAIVSSKPFFKHSSNGDLSKRRVLPSSSPSLQDYSSSDPSSFSSYS
HSFPPRWQFSSHIPSLNVNNSTNNDNTIDNVDGDKLNVYKSSQIDSKLTSWDEKLTRDNF
NVHKMLVIATSVGKLFGLESERGRIVWDYFVPSAKLLANEKFALFQQRNLAHFPLPPIMS
LLFRSKKTNRRVLFSFNPITGVPSHEKGMDLYTLKSDIIQTVLEPGSVSERCEFIRPLLL
LRADLDVEVYPSTCTPTYSSSDSQPLYIFTIEREQARLTGYRINPVSSDGKSLKATRVWR
MLLSPDSNPVNKHIIVAAASRPPSEHIYSVGRVLGDRSVLYKYLNPNLIAVLTIGGDINS
HTNTLMIYLIDVVAGRILYSAVHRRCSEPISLVHSENWIIYTYYNHKSLRNEATVIELYE
PTKLSGELCASHSTGENSLIPQVLQQSYILNTPPRSGAVTVSVTERGITAKNIILALQRN
SLIELPKTFFDPRRSLDMTSELMEEGVHPYAPVLPFSDQAIITYNQSIMRIRAIRTAPTG
LESTGLVFAYGLDLFFTRISPSQTYDLLKEDFDYTAIATVTLGMIIASIVSCRLATRRAI
LRAWA
NT seq 3258 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcatttatccctatggctgctggcttcccttgcactcagcgttaatgccatatatgaa
gaccaggttgacgttctagattggaatcaaaagtttgtgggaaaagtcaagtattcaaaa
ttaaagtttgatgggactatccctaaaaattattttgtgggttctgaactcaatgttatt
agttctatcaatttaaaggatggatcaattgtttggcgacaggtacttgacgaagatggt
gaattgactggatttgaattatgcggcaataagttgttttctctttcctccaagcatgga
actaagttacgtgcttgggacattaagtttggtggtgttttatgggaggctttaatagat
tcttctgaatcatccagtggggacatttggtgtgatgaaaactcagggattttagttgtt
gcttacgataaaggagtggatgcttatcgtcttcaaacaggtgaaaagctgtcatctgat
aggaatatgaactcaagttctaatcaaataaatatagtttccgggaaaactgaatccagt
ttaacaatctcactagttgagaaatatctggacaagagtggtcatctggatattgatgca
cctgaattatcttatatcattatcaggacatatccaattccaagttctggattgcagtta
actcctatggtcgtaaagaactatacgattccgtcgtctgtttataaccaacactcatgc
aatatattcgggttacataacataccaactaatgccgttgttgtgtgcttatcgtcggag
cgtggtagacagggaagcctgcttagattttcatctgtttcatcgtcaagttgggacgtt
atcacagtgaaaagtacctttgcaaatatggttaagctaacggacaatgattttctgtta
acctcttcatcgttggagcccaccactggggctgtatatcatttagattcctctggtatt
ccagttttaaaatattttgtcaataattctatgattggatgtttgggaacgctaaatggt
cgatcgtatttatttacacttcatcacaatgtagatcagtattttaagaatctggctcta
aacatctatgatttagaatctggtgaattatccaaagaactaccacctcgtcatttcact
cttgctagtcatcatggtacaattgaatcgatatctgctatcatgtttactgatgctacc
ggtgctccgagtttccgattattgctatatacagaggatgatgctgtacaactaatccga
caaaatggtaaacaacaatggattcgtgaagaggcgttagcgaacatagttgctgttgag
gtaatcgatttacctgtttcagagtttcaagcgaaaattgaagaagagtttaatcatgca
agcaacaacattctggaaatgtttattcaacgcttaaaatcacagatgtctcaattagtt
gtatggacgaggcattggatttataacataccaaatttattcatggctattgtatcgtct
aaaccgtttttcaagcattcatctaatggtgatctgtcaaaacgtagagtactaccatca
tcatctccttctttacaggactattcatcaagtgatccatcgtctttttcaagttattca
catagttttccacctagatggcaattttcatcacatattccctctttaaatgtcaataat
tctactaacaatgataataccattgataatgtagatggcgataagctaaatgtttataaa
tcatctcaaatagattccaaattaacatcatgggatgagaaacttacacgtgacaatttc
aatgttcataaaatgttggtcatagctacgtcagtcggaaaactgtttggtttagaaagt
gaacgtggtcgtattgtttgggattattttgtcccatctgcaaaacttttagctaatgaa
aagtttgctctcttccaacagcgcaatttagctcattttcctttaccacctatcatgtca
cttttatttcgatcaaagaaaacaaatcgacgggtacttttctcattcaatccaattact
ggtgttccatcacatgaaaaaggtatggatttgtatacattgaaatcggatattattcaa
actgtcttggaacctggttctgtaagcgaacgatgtgaatttattagacctctgttgctg
ttgagggcagatttagacgttgaagtttatccatctacctgtacccctacgtattcatca
tcagattcacagcccttatatatctttactattgaacgtgaacaagctcgtcttaccggt
tatcggataaatccagtatcttcagacggcaaatctttgaaagctacacgtgtctggcga
atgttattgagtcctgattctaatccggttaacaagcatatcattgtcgctgcagcttca
cgtccaccttctgaacatatttattcagttggtcgagtattaggtgatagaagtgttctt
tacaaatatttaaatcctaatcttattgcagtacttactattggtggtgatatcaacagt
catacaaatacattgatgatttatttgattgatgttgtagctggtcgaatattgtatagt
gctgtacatcgtcgatgttctgaacctattagtctagtgcattcagagaactggattatt
tatacttattataatcacaaatcattacgcaatgaagctaccgttattgaattatatgaa
ccgactaaattatccggggaattatgtgctagtcattcaactggtgaaaattctttaata
cctcaagttctacaacaatcttacatactaaacactccaccacgtagtggtgcagtgact
gtttcagttactgagagaggaataaccgccaagaatataattttggctttacagaggaat
agtctaattgaacttccgaagacatttttcgatccccgtcgtagtttggatatgacttct
gaactaatggaagaaggtgttcatccttatgctcctgtgctaccgttttccgatcaagct
ataattacatataatcaatcaattatgcgaattcgagctattcgtacagcacctaccggt
ttagagtccactggattagtatttgcatatggattagatttgtttttcactcgaatatca
ccttcacaaacatatgatttacttaaagaagatttcgattatactgcaatagctactgtc
acattaggaatgataattgcttccattgtatcatgtcgtttagctacaagacgagcaatt
cttagagcttgggcttga

DBGET integrated database retrieval system