Schistosoma mansoni: Smp_056290 Help Entry Smp_056290        CDS       T01095                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K05641   ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 1 Organism smm  Schistosoma mansoni Pathway smm02010   ABC transporters smm04148   Efferocytosis Brite KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]  09130 Environmental Information Processing   09131 Membrane transport    02010 ABC transporters     Smp_056290  09140 Cellular Processes   09141 Transport and catabolism    04148 Efferocytosis     Smp_056290  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:smm02000]     Smp_056290 Transporters [BR:smm02000]  ABC transporters, eukaryotic type   ABCA (ABC1) subfamily    ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups     Smp_056290 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  ABC_tran AAA_21 ABC2_membrane_3 R1_ABCA1 SMC_N AAA_29 RsgA_GTPase AAA_23 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  8355069 NCBI-ProteinID:  XP_018647577 LinkDB All DBs Position 1:complement(3878032..3894485) Genome browser AA seq 1952 aa AA seqDB search MKDSNDKDTKISLSKSKEFFIHYQLLMWKNFLLRKRRPGFLLAEILVPLMIPIILVGIRT ESPPVNENTCHVRSINLPTMGLFSYLQSIVCNFLYRCHSIDPDSTSQQFNYTVFGNLLEN ISSIVGDLLTENVLSKFICGTKTANLNDLGKLMEFLKDIDFTNLIDIEKKLKRIRRYTSS SSSSSLLLSTINHMDTIETNYKINCIALDQLLRNSLLIHYTGRLRFLLNGYIFYYPVNQW TNEIMYRVMEPQRLLILLKNILKQYQLQTKPILNQLLSNTTILKQIRSMLKTCTIHSNGT LHGLIQKFCLNALLWLNPEGQNHFNETNDLLNQPMIFHRINIMIDIIIQLLDCFPLATHI YGVNNQSMFNVYMNLFKSQVHPIVQGILFNNTIFSSNHHQLNSIQNTSTIITIRQNPYII DDTNNYKVLDHTWNPKPRNNVNDGDTKYLTSGFLDIQDLISNAIIEISNNIPERIKQLNN SWNSWTGSSSTSSSPSTSSSNHLLIGKQMKFFPTSCYKKDEFLNKIKKLLPQLLLLTWIL NAMLITKYIVEEKENYIKEFTKIMGFTNTTHWLSWFSSTFIIVLPITIIITLILKYGNIF IISSIFIIFFLLISYIISIIMFCFLCSIFFQKSNLSAIVTGLFYFIIYIPIPLILMNEKW IKEEIIYITSLSNQVAFSLGLYSLLRLESQNLDTYWNDLWQPKLSDSLFSPGKSILMLWI DSILYLCMTLLIEWIISKKYNIYQSFYSRIKCQNWKIFNKHKDEPIDCIKNVIYKEDGGN VQLCVESNHECLPISISVKNLSKMYNKKSKPALDHLNIEFYTNQITSLLGHNGSGKSTLI SILTGIHKPSNGLAMICGYNIHQQMNQIRTNLGYCPQHNILFEYLTVIEHIKFYAKLKGF NKEQINNEVNYFSNLLNLTNKLNDQVKTLSGGQKRKLSIAIAFVGQASVILLDEPTTGVD PYSRRSIWDLILKMKLNKTIIITTHHMDEADILGDRIAIISQGKLKCYGSSLFLKSTYGQ GYYLILERHNQLLDGDSTESLHSDTLTDEDLNDIIHYLKQYIKDISLIDYNQNEMIYRIP IQNIIDGSLSQLFKQFENPLSPNDQIILPIELTSHGIISCGLTDTSLEEIFLNIADDPAM LLQDSSYHLGGMTTATDNKNDNQYETDVNKNDTSMNQIQQQHEQQMFTSTGLRQSQMNSL RQSSHLSHLTNRGPISAPPTLPNLLHRKHYYNKTDKSNDTVNVHPISNVNVPLNQPNTRQ QIKAMFLKRFHYLKRSKLSLFIEFILPICVLILVLKSLQFFKKPSSNQPMIITPWLMSDE NNKLPLNTFYENNLYELENPTDNLLNKSNTFKSVLNIAWNYENALKQPYGWTGIGCLPKY TLQNINAYYKTYSQCNLSNIKIIKKELTHQQMKYIRSYQSNECSCNTSCFMNSFTQYEQQ PSSKILPTKDIFLNLTSFKVSDYLIRTQNQYIKQRYGGLSYHTHNYPSLRKLSKYLLNSN NLFIYSLTNMTSIYDLHACLFFLFIIFKENQFFIQSINNYFYINYPKLLKKHNMIFMIFM KKLDRIKSNNDHNNNHQRSDINKSINDNDNHDEDNNNSEDEDVHAERLRIMKADKEGYLN SLCSVAVINLTKFFPLKKKPSVNRLTFAVRPGECFGLLGVNGAGKTTAFNMITGKLHPSM GTVYVNGFNVVTQTKNALKNLGYCPQFDAVHDLLTGRETLSLYARLRGFPENEISKTVSE LLQNMGLSPYADRITSAYSGGNRRKLSTAIAIIGKPQVILLDEPTSGMDPIGKRFMWDQI ILLIKEGRSIILTTHSMEECEALCQYIGIMINGQLKCFGTIQHLKNRFGNGYQVDIRLNH LVTNNQINQLKNEFHLKFPNSILNELQSYYYKYQMDKNIQLSLLFTLLNQMQMDHIIEHY SVRQTTLDQVFVNFSSDEMNHIDNVNNIEFIQ NT seq 5859 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaagattcaaatgataaagatactaaaatttcattgtcaaaatccaaggaattcttt atacattatcaactattgatgtggaaaaatttcttactacgtaaacgacgtcctggattt ctcttagctgaaatcttagtccctttaatgatcccaattatattagttggaatacgaact gaatcacctccagtaaatgagaatacatgccatgttcgttcaataaatcttccaacaatg ggtttatttagttatctacaatcaattgtttgtaatttcctttatcgttgtcattcaata gatcctgatagtacttctcaacagtttaattatactgtatttggtaatttacttgagaat atttctagtattgttggagatctattgactgaaaatgttttatctaaatttatatgtggt acaaaaactgctaatttaaatgatttaggtaaattaatggaatttttaaaagatattgat tttacaaatcttattgatatagaaaaaaaattaaaacgaatacgtcgttatacatcatca tcatcatcatcatcccttcttctatcaacaatcaatcatatggataccatagaaactaat tataaaattaattgtattgcattagatcaattattacgtaatagcttattaatccattat acaggacgtttaagatttttattaaatggttatatcttttattatcctgttaatcaatgg acaaatgaaataatgtaccgggtaatggaaccacaaagattattaattttattaaaaaat atattaaaacaatatcaattacaaacaaaaccaattttaaatcagttactatctaataca actatattaaaacaaatacgaagtatgttaaaaacttgtacaatacattcgaatggtacc ctccatggactgattcaaaagttttgtttaaatgcattattatggttaaatcctgaagga caaaatcatttcaatgaaaccaatgatttattgaatcaaccaatgatatttcatcgtatc aatataatgattgatattattatacaattattagattgtttccccttagcaacacatatt tatggggtaaataatcaatctatgtttaatgtatatatgaatttatttaaatcacaagta catccaattgttcaaggtattctatttaataatacaatattctcatcaaatcatcatcaa ttgaatagtatacaaaatacatcaactattataaccatacgtcaaaatccatatattata gatgatacaaataattataaagtattagatcatacatggaatccaaaaccacgtaataat gttaatgatggtgatacaaaatatttgactagtggttttttagatatacaagatttaatt agtaatgctattattgaaatatctaataatataccagaaagaataaaacaattaaataat tcatggaattcatggactggatcgtcttcgacatcttcttctccttcaacatcttcttca aatcatttattaattggtaaacaaatgaaattttttccaacatcatgttataaaaaagat gaatttttaaataaaatcaagaaattattaccacaattattattgttgacatggatatta aatgcaatgttaataacaaaatatattgtagaagaaaaagagaattatataaaagaattt acaaaaattatgggttttacaaatactactcattggttaagttggtttagtagtacattt ataatagtcctacctattactataattattacattaatattaaaatatggtaatatcttt attataagtagtatatttattatattttttttattaatttcttatattatttcaattatc atgttttgttttttatgttcaatattttttcaaaaatctaatttaagtgctatagtaact ggattattttattttattatctatataccaataccattaatattaatgaatgaaaaatgg attaaagaagaaattatttatataacatcattatcaaatcaagtagcatttagtttaggt ttatattcattattaagattagaatcacaaaatttagatacatattggaatgatttatgg caaccaaaattaagtgattcattattttcaccaggtaaaagtattctcatgctatggatt gattctatattgtatctatgtatgacactattgattgaatggattatttcaaagaaatat aatatatatcaatcattttattcaagaatcaaatgccaaaattggaagatattcaataaa cataaagatgaacccatagactgtataaagaatgttatctataaagaagatggtggaaat gttcaactatgcgtagaatctaatcatgaatgtttaccaattagtatatctgtaaagaat ttaagtaaaatgtacaataaaaaaagtaaaccagcattagatcatttaaatattgaattt tatacaaatcaaattacatcacttttaggtcataatggatcagggaaatcaacattaata tctattttaacaggtatacataaaccatctaatggtttagctatgatttgtggttataat atacatcaacaaatgaatcaaatacgtacaaatctaggttattgtccacaacataatatc ctatttgaatatttaacagttattgaacatattaaattttatgctaaattaaaaggtttc aataaagaacaaattaacaatgaagttaactattttagtaatctattaaatttaactaat aaattaaatgatcaagtgaaaactttatctggtggacaaaaacgtaaattatctatagct atagcatttgtcggtcaagcttcagtgattttattagatgaaccaacaactggtgttgat ccatattcacgtagatcaatatgggatttaatattaaaaatgaaattaaataaaactatt attataacaacacatcatatggatgaagcagatatattaggagatcgtatagctattata tcacaaggtaaattaaaatgttatggttctagtttatttttaaaatcaacatatggtcaa ggatattatttaatattagaacgtcataatcaattattagatggtgattccacggaaagt cttcatagtgatacattaaccgatgaagatttgaatgatatcattcattatttgaaacag tacattaaagatatcagtttaattgattataatcaaaatgaaatgatttatcgtatacca atacaaaatattattgatggttcattaagtcaattatttaaacaatttgaaaatccacta tctcctaatgatcaaattatattacctattgaattgacatcccatgggataattagttgt ggattaactgatacttcattagaagaaatatttcttaatatagctgatgatcctgcaatg ttattacaagattcaagttatcatttgggtggtatgacaacagcaactgataataagaat gataatcaatatgaaactgatgtaaataaaaacgacacatcaatgaatcaaatacaacaa caacacgaacaacaaatgtttactagtactggattacgtcaatcacaaatgaacagttta agacaaagttctcatttatcccatttaacaaatagagggccaatttcagctccacctaca ttacctaatcttcttcatcgtaaacattattataataaaacagacaaatccaatgataca gtaaacgttcatccaatatccaatgtaaatgtaccattgaatcaacctaatacaagacaa caaatcaaagctatgtttcttaaacgttttcattatttaaaacgatctaaattaagtcta tttattgaatttattttacctatatgtgtattaattttagttttaaaatcattacaattt tttaaaaaaccttcttcaaatcaaccaatgattattacaccatggttaatgtctgatgaa aataataaacttccattgaatacattttatgaaaataatttatatgaattagaaaatcct actgataatctattgaataaatcaaatacattcaaatctgttttaaatatagcatggaat tatgagaatgcattaaaacaaccctatggatggactggtattggttgtctacctaaatat acattacaaaatataaatgcatactataaaacatatagtcaatgtaatctatcaaatatt aagattataaaaaaagaattaactcatcaacaaatgaaatatatccggtcatatcaatct aatgaatgttcttgtaatacatcatgtttcatgaatagttttacacaatatgaacaacaa ccaagttctaaaatcctaccaacaaaagatatatttcttaatttaacatcatttaaagta tcagattatttaataagaactcaaaatcaatatattaaacaaagatatggtggtttaagt tatcatactcataattatccatcattacgtaaactttcaaaatatcttttaaattcaaat aatttattcatttattcattaactaatatgactagtatatatgatttacatgcttgttta ttttttttatttattatatttaaagaaaatcaattttttattcaatctattaataattat ttttatataaattatcctaaattattaaaaaaacataatatgatatttatgatatttatg aaaaaacttgatcggattaaatctaataatgatcataataataatcatcaaagatcagat atcaataaatcaataaatgataatgataatcatgatgaagataataataattctgaagat gaagatgtacatgctgaaagactacgtatcatgaaggctgacaaagaaggttatctcaat tctctatgttcagttgcagttattaatttaactaaattttttcctctcaaaaagaaacca tctgtcaatcgtttaacatttgcggttcgtccaggagaatgttttggattacttggagtt aatggtgcaggtaaaactaccgcattcaatatgattactggtaaattacatccatccatg ggaactgtatatgtgaatggatttaatgtagttacacaaactaagaatgcacttaaaaat ctaggatattgtccacaatttgatgctgttcatgatctattaactggtagagaaacactt agtttatatgctcgtttacgtggttttcctgaaaatgagatttctaaaactgtctctgaa ttattacaaaatatgggcttatcgccatatgcagatcgaattacatcagcatattccggt ggtaatcgtagaaaattatcaactgcaattgctattattggtaaaccacaagttatatta cttgatgaaccaactagtggaatggatccaattggtaaacgttttatgtgggatcaaatt atattacttattaaagaaggtcgatctattatattaacaactcatagtatggaagaatgt gaagcattatgccaatatattggtattatgattaatggtcaattaaaatgttttggtact atacaacatttaaaaaatcgttttggtaatggttatcaagttgatatacgtttaaatcac ttagtaactaataatcaaattaatcaattaaaaaatgaattccatttaaaatttcctaat tcaatattaaatgaattacaatcttattattataaatatcaaatggataaaaatattcaa ttatcattattatttacattattaaatcaaatgcaaatggatcatataattgaacattat tctgtaagacaaacaacattagatcaagtatttgtaaatttttcaagtgatgaaatgaac catatagataatgtaaacaatattgaattcattcaatag

DBGET integrated database retrieval system