KEGG   Schistosoma mansoni: Smp_123740
Entry
Smp_123740        CDS       T01095                                 
Name
(RefSeq) putative spectrin beta chain
  KO
K06115  spectrin beta, non-erythrocytic 1/4/5
Organism
smm  Schistosoma mansoni
Pathway
smm04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    Smp_123740
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04812 Cytoskeleton proteins [BR:smm04812]
    Smp_123740
Cytoskeleton proteins [BR:smm04812]
 Eukaryotic cytoskeleton proteins
  Actin filaments / Microfilaments
   Actin-binding proteins
    Cross-linking proteins
     Smp_123740
  Intermediate filaments
   Intermediate filament-binding proteins
    Smp_123740
SSDB
Motif
Pfam: Spectrin EAD7 DUF7203 Gp6-like_1st
Other DBs
NCBI-GeneID: 8348319
NCBI-ProteinID: XP_018652092
LinkDB
Position
4:17125968..17176836
AA seq 1294 aa
MIFQQAYLHLGIPILIESKHFIQTCWLEERCVMTIVATWYRYLTNSHNIKLSLERISKVI
QHSLIINHKIFNYIKQVKRWFKWSNINMKQMNQLLCKIQESNEIRNQLDIKEELQNLLIW
RQNEKAEKMSELVQLETLLTEIHTNQLAESRRLFKPPNGYNLSDLEESWQCLITAEHNCH
LAIVDELIRRDQNDSIKPIEFLKEELTENFNQISIQTHHSQSRLHLLMNELQLKYGINYY
NQHYYFIPNQTLYNKLQQIITHLNSMNFNQLTMNDISLMSIIQNIHLNESKTNETQEYDE
YEIIGNLEKCPLIRIYEDIITVLSNMHLSNFSFDHSTSISCQTIQHEERSIKVIEFIQLL
QRQWNKLLIGIKEIHINLIRHKKYLNELYSLITLNTKIEEINLRIYETYQSVLSISMLAD
SFEDLIEPVKDKSIQNEVIDTNNEGKQSSIIDKKVITNILGKQKALTIDKEIVINSILRQ
MDHIIEQLKLYTTYLNQLQNEVYIFLPSRSILNDNDYTEFLHLETKLNNLSVSRKSCIEL
TVQSDKQQQHEDSDHSDEISLTGLQTVGSSFQEDIDSIISKSIIDEDTKEQIDQNQLPGI
IQLNETLNLQQTNCEIDLVTNESENNLQRLLFTSIKSITSNNIEDNENDQYTEEHYRTPM
NSPEEHELSILLLPNISIIAYHLLNRLNFIQMHYIDYLKDSLNIRDKLEFQRNILRLIDN
IVSMENWIKEKERILLTFNPIIYPSVEFLKSLPTSCPIIITEEIIHSISQLSIQAYRFKT
FEHELISHANLRLSEIEVQEEEDSNEVKDKLDEITIDKGSDQEFIETDHADKASYLRTSK
GVNNEQTDDNNVYTSKYSKLLDYINKKWQHLKLLINSHHDRFELAASLSKFHTLCQTTNE
WIIHKRELLISTDDLGTDLNSVMQLQRRLLGWEKDFIALQNEIQNLNIESERLLKALIEE
APKRRDLYLISGELYATKEVNQLRLNLNHEWELLQVELRNRHDKLLASAELQQFFQGLDD
NQLWLHNIEIRVATHQLAQSVEEAKLEIDIHNELIEQILTRKDEYNDLINYGRCITAGET
DLHYIQLDQRLDRLENGWIELMQMWTYQQKVLQQNLNFQIFLRDAHSFETLLSTQESKLM
NYQLITLQYTTLLDEARTLVDSTKDLIALREDMQQIQTLQEWLIEKKELAEEYDQASKLS
NMSSLVPYKVFVSKQYTQHRILESEIEANNDRIQQVCQHVTNTIVQYPRIADQLSELLNN
FMLLWKSLRKLIQERGDYMVQLHRGMLTSLSLVA
NT seq 3885 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatctttcaacaagcctatttacatttaggtataccaatattaattgaatcaaaacat
tttattcaaacatgttggttagaagaacgttgtgttatgactattgttgcaacatggtat
cgttatttaactaattcacataatatcaaattatcattagaacgtattagtaaagtaatt
caacacagcctaatcataaatcataaaatatttaattatattaaacaagttaaacgatgg
tttaaatggtctaatataaatatgaaacaaatgaatcagttactatgcaagatacaagaa
tcaaatgaaattagaaatcaattagatataaaagaagaattacaaaatttattaatttgg
cgtcaaaatgaaaaagcggaaaaaatgtctgaactggttcaattagaaaccctgttaact
gaaattcatactaatcagttggctgaatcacgtcgattattcaaaccaccgaatggttac
aatcttagtgatttagaagaatcttggcaatgtttaattacagctgaacataattgtcat
ttagctattgtagatgaattaattcgacgagatcaaaatgattcaattaaacctatagaa
tttcttaaagaagaacttactgagaatttcaatcaaatcagtatacaaactcatcattca
caaagtagattacatttacttatgaatgaattacaattaaaatatggaattaattattat
aatcaacattattattttataccaaatcaaacattatataataaattacaacaaattata
acccatttgaactcaatgaatttcaaccaactgactatgaatgatatttctttaatgagt
attattcaaaatatacatcttaatgaatccaagacaaatgaaactcaagaatatgatgaa
tatgaaatcatcgggaatttggaaaaatgtccattaatacgaatctatgaagatattata
acagttttaagtaatatgcatttatctaatttctcatttgatcattcaacatctattagc
tgtcaaactattcaacatgaagaacgttctatcaaagtaattgaattcattcaattatta
caaagacaatggaataaattgttgataggaattaaagaaatacatattaacttaataaga
cataagaaatatttgaatgaattgtatagcttaattacacttaatactaaaattgaagaa
attaatttaagaatatatgaaacatatcaaagtgtcctgtcaatatccatgcttgctgat
tcttttgaagatctaattgaacctgttaaagataaatcaatacagaatgaagtaattgat
acgaataatgagggaaaacaatcatcgattattgataaaaaagttatcactaatatattg
gggaaacaaaaagctttaacaattgataaagaaattgttattaattccatattaaggcaa
atggatcatataattgaacaattgaaattatatactacttatttaaatcaattacaaaat
gaagtatatatctttttaccatctagatctattttgaatgataatgattatacagaattt
cttcatttagaaactaaattaaataatctttctgtatctagaaaatcttgtatagaatta
actgttcaatctgataaacaacaacaacatgaagatagtgatcatagtgatgagatatca
ttaactggtctacaaacagttggttcatcatttcaagaagatatagattctattatatct
aaatctattattgatgaagatacaaaagagcagatagatcaaaatcaacttccaggaata
atccaattaaatgaaacattaaatttacaacaaactaattgtgaaatcgacttagttact
aatgaatctgagaataatctacaacggttattgtttacatcaataaaatctatcactagt
aataatattgaagataatgagaatgatcaatatactgaagaacattatagaacaccaatg
aattctcctgaagaacatgaattatctatattattattaccaaatatatcaataattgct
tatcatttattaaatcgattaaattttattcagatgcattatatagattatttaaaagat
agtttaaatataagagataaattagaatttcaacgaaatatattacgtcttattgataat
attgtatctatggaaaattggattaaagaaaaggaaagaattttgttaacattcaatcct
ataatctatccttcagtggaatttttaaaatctttaccaacatcatgtcctattattatt
acagaagaaattatacattctatatcacaactttctatacaagcttatcgttttaaaaca
tttgaacatgaattaataagtcatgcaaatttaagattaagtgaaattgaggtacaagaa
gaagaggatagtaatgaagtcaaagataaattagatgaaattactatagataaaggaagt
gatcaagagtttattgaaactgatcatgcagataaagcatcttacttacgtacatcaaaa
ggtgttaataatgaacaaactgatgataacaatgtttacacatcgaaatattcaaaacta
ttagattatattaataagaaatggcaacatttaaaactactgatcaattcacatcatgac
agatttgaattagctgcatctttatcaaaatttcatacattatgtcaaactacaaatgaa
tggataatacataaaagagaattacttatttcaacggatgatttaggtacagatttaaat
agtgttatgcaattacaaagaagattattaggttgggaaaaagattttattgcattacaa
aatgaaatacaaaatcttaatatagaaagtgaaagattattaaaagctcttatagaagaa
gcacctaaaagaagagatttatatcttatctctggtgaattatatgctacaaaagaagtg
aatcaattaagattaaatttaaatcatgaatgggaattattacaagtagaattaagaaat
cgtcatgataaattattagcttcagctgaattacaacaattttttcagggtttagatgat
aatcaattatggttacataatattgaaatacgtgtagcaacacatcaattagcacaatct
gtagaagaagctaaattagaaattgatatacataatgaattaattgaacaaattttaaca
cgtaaagatgaatataatgatttaataaattatggacgatgtattacagctggtgaaaca
gatttacattatatacaacttgatcaacgtttagatagattagaaaatggttggatagaa
ttaatgcaaatgtggacatatcaacaaaaagttttacaacaaaatttaaactttcagata
tttttacgtgatgcacattcatttgaaactttgttgtcaacacaagaaagtaaactaatg
aattatcaattgataactttacaatataccacattacttgatgaagctcgtacactagtg
gactcaactaaagatttaatagcacttcgagaggacatgcaacaaattcaaacgcttcaa
gaatggcttatagaaaagaaagagcttgctgaagaatatgatcaagcaagtaaactatca
aatatgagttcgctggtaccatataaagtatttgtcagtaaacaatatacacagcatcgt
atacttgaaagtgaaattgaagctaataatgatcgtattcaacaagtttgtcaacatgtt
accaataccattgtgcaatatccacgaattgctgatcaattaagtgaattacttaataat
tttatgttactatggaagagtctacgtaaattaatacaggaaagaggtgattatatggtt
cagttacacaggggtatgttaacttctttatcattggttgcataa

DBGET integrated database retrieval system