Schistosoma mansoni: Smp_123740
Help
Entry
Smp_123740 CDS
T01095
Name
(RefSeq) putative spectrin beta chain
KO
K06115
spectrin beta, non-erythrocytic 1/4/5
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Pathway
smm04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
Smp_123740
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04812 Cytoskeleton proteins [BR:
smm04812
]
Smp_123740
Cytoskeleton proteins [BR:
smm04812
]
Eukaryotic cytoskeleton proteins
Actin filaments / Microfilaments
Actin-binding proteins
Cross-linking proteins
Smp_123740
Intermediate filaments
Intermediate filament-binding proteins
Smp_123740
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Spectrin
EAD7
DUF7203
Gp6-like_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8348319
NCBI-ProteinID:
XP_018652092
LinkDB
All DBs
Position
4:17125968..17176836
Genome browser
AA seq
1294 aa
AA seq
DB search
MIFQQAYLHLGIPILIESKHFIQTCWLEERCVMTIVATWYRYLTNSHNIKLSLERISKVI
QHSLIINHKIFNYIKQVKRWFKWSNINMKQMNQLLCKIQESNEIRNQLDIKEELQNLLIW
RQNEKAEKMSELVQLETLLTEIHTNQLAESRRLFKPPNGYNLSDLEESWQCLITAEHNCH
LAIVDELIRRDQNDSIKPIEFLKEELTENFNQISIQTHHSQSRLHLLMNELQLKYGINYY
NQHYYFIPNQTLYNKLQQIITHLNSMNFNQLTMNDISLMSIIQNIHLNESKTNETQEYDE
YEIIGNLEKCPLIRIYEDIITVLSNMHLSNFSFDHSTSISCQTIQHEERSIKVIEFIQLL
QRQWNKLLIGIKEIHINLIRHKKYLNELYSLITLNTKIEEINLRIYETYQSVLSISMLAD
SFEDLIEPVKDKSIQNEVIDTNNEGKQSSIIDKKVITNILGKQKALTIDKEIVINSILRQ
MDHIIEQLKLYTTYLNQLQNEVYIFLPSRSILNDNDYTEFLHLETKLNNLSVSRKSCIEL
TVQSDKQQQHEDSDHSDEISLTGLQTVGSSFQEDIDSIISKSIIDEDTKEQIDQNQLPGI
IQLNETLNLQQTNCEIDLVTNESENNLQRLLFTSIKSITSNNIEDNENDQYTEEHYRTPM
NSPEEHELSILLLPNISIIAYHLLNRLNFIQMHYIDYLKDSLNIRDKLEFQRNILRLIDN
IVSMENWIKEKERILLTFNPIIYPSVEFLKSLPTSCPIIITEEIIHSISQLSIQAYRFKT
FEHELISHANLRLSEIEVQEEEDSNEVKDKLDEITIDKGSDQEFIETDHADKASYLRTSK
GVNNEQTDDNNVYTSKYSKLLDYINKKWQHLKLLINSHHDRFELAASLSKFHTLCQTTNE
WIIHKRELLISTDDLGTDLNSVMQLQRRLLGWEKDFIALQNEIQNLNIESERLLKALIEE
APKRRDLYLISGELYATKEVNQLRLNLNHEWELLQVELRNRHDKLLASAELQQFFQGLDD
NQLWLHNIEIRVATHQLAQSVEEAKLEIDIHNELIEQILTRKDEYNDLINYGRCITAGET
DLHYIQLDQRLDRLENGWIELMQMWTYQQKVLQQNLNFQIFLRDAHSFETLLSTQESKLM
NYQLITLQYTTLLDEARTLVDSTKDLIALREDMQQIQTLQEWLIEKKELAEEYDQASKLS
NMSSLVPYKVFVSKQYTQHRILESEIEANNDRIQQVCQHVTNTIVQYPRIADQLSELLNN
FMLLWKSLRKLIQERGDYMVQLHRGMLTSLSLVA
NT seq
3885 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatctttcaacaagcctatttacatttaggtataccaatattaattgaatcaaaacat
tttattcaaacatgttggttagaagaacgttgtgttatgactattgttgcaacatggtat
cgttatttaactaattcacataatatcaaattatcattagaacgtattagtaaagtaatt
caacacagcctaatcataaatcataaaatatttaattatattaaacaagttaaacgatgg
tttaaatggtctaatataaatatgaaacaaatgaatcagttactatgcaagatacaagaa
tcaaatgaaattagaaatcaattagatataaaagaagaattacaaaatttattaatttgg
cgtcaaaatgaaaaagcggaaaaaatgtctgaactggttcaattagaaaccctgttaact
gaaattcatactaatcagttggctgaatcacgtcgattattcaaaccaccgaatggttac
aatcttagtgatttagaagaatcttggcaatgtttaattacagctgaacataattgtcat
ttagctattgtagatgaattaattcgacgagatcaaaatgattcaattaaacctatagaa
tttcttaaagaagaacttactgagaatttcaatcaaatcagtatacaaactcatcattca
caaagtagattacatttacttatgaatgaattacaattaaaatatggaattaattattat
aatcaacattattattttataccaaatcaaacattatataataaattacaacaaattata
acccatttgaactcaatgaatttcaaccaactgactatgaatgatatttctttaatgagt
attattcaaaatatacatcttaatgaatccaagacaaatgaaactcaagaatatgatgaa
tatgaaatcatcgggaatttggaaaaatgtccattaatacgaatctatgaagatattata
acagttttaagtaatatgcatttatctaatttctcatttgatcattcaacatctattagc
tgtcaaactattcaacatgaagaacgttctatcaaagtaattgaattcattcaattatta
caaagacaatggaataaattgttgataggaattaaagaaatacatattaacttaataaga
cataagaaatatttgaatgaattgtatagcttaattacacttaatactaaaattgaagaa
attaatttaagaatatatgaaacatatcaaagtgtcctgtcaatatccatgcttgctgat
tcttttgaagatctaattgaacctgttaaagataaatcaatacagaatgaagtaattgat
acgaataatgagggaaaacaatcatcgattattgataaaaaagttatcactaatatattg
gggaaacaaaaagctttaacaattgataaagaaattgttattaattccatattaaggcaa
atggatcatataattgaacaattgaaattatatactacttatttaaatcaattacaaaat
gaagtatatatctttttaccatctagatctattttgaatgataatgattatacagaattt
cttcatttagaaactaaattaaataatctttctgtatctagaaaatcttgtatagaatta
actgttcaatctgataaacaacaacaacatgaagatagtgatcatagtgatgagatatca
ttaactggtctacaaacagttggttcatcatttcaagaagatatagattctattatatct
aaatctattattgatgaagatacaaaagagcagatagatcaaaatcaacttccaggaata
atccaattaaatgaaacattaaatttacaacaaactaattgtgaaatcgacttagttact
aatgaatctgagaataatctacaacggttattgtttacatcaataaaatctatcactagt
aataatattgaagataatgagaatgatcaatatactgaagaacattatagaacaccaatg
aattctcctgaagaacatgaattatctatattattattaccaaatatatcaataattgct
tatcatttattaaatcgattaaattttattcagatgcattatatagattatttaaaagat
agtttaaatataagagataaattagaatttcaacgaaatatattacgtcttattgataat
attgtatctatggaaaattggattaaagaaaaggaaagaattttgttaacattcaatcct
ataatctatccttcagtggaatttttaaaatctttaccaacatcatgtcctattattatt
acagaagaaattatacattctatatcacaactttctatacaagcttatcgttttaaaaca
tttgaacatgaattaataagtcatgcaaatttaagattaagtgaaattgaggtacaagaa
gaagaggatagtaatgaagtcaaagataaattagatgaaattactatagataaaggaagt
gatcaagagtttattgaaactgatcatgcagataaagcatcttacttacgtacatcaaaa
ggtgttaataatgaacaaactgatgataacaatgtttacacatcgaaatattcaaaacta
ttagattatattaataagaaatggcaacatttaaaactactgatcaattcacatcatgac
agatttgaattagctgcatctttatcaaaatttcatacattatgtcaaactacaaatgaa
tggataatacataaaagagaattacttatttcaacggatgatttaggtacagatttaaat
agtgttatgcaattacaaagaagattattaggttgggaaaaagattttattgcattacaa
aatgaaatacaaaatcttaatatagaaagtgaaagattattaaaagctcttatagaagaa
gcacctaaaagaagagatttatatcttatctctggtgaattatatgctacaaaagaagtg
aatcaattaagattaaatttaaatcatgaatgggaattattacaagtagaattaagaaat
cgtcatgataaattattagcttcagctgaattacaacaattttttcagggtttagatgat
aatcaattatggttacataatattgaaatacgtgtagcaacacatcaattagcacaatct
gtagaagaagctaaattagaaattgatatacataatgaattaattgaacaaattttaaca
cgtaaagatgaatataatgatttaataaattatggacgatgtattacagctggtgaaaca
gatttacattatatacaacttgatcaacgtttagatagattagaaaatggttggatagaa
ttaatgcaaatgtggacatatcaacaaaaagttttacaacaaaatttaaactttcagata
tttttacgtgatgcacattcatttgaaactttgttgtcaacacaagaaagtaaactaatg
aattatcaattgataactttacaatataccacattacttgatgaagctcgtacactagtg
gactcaactaaagatttaatagcacttcgagaggacatgcaacaaattcaaacgcttcaa
gaatggcttatagaaaagaaagagcttgctgaagaatatgatcaagcaagtaaactatca
aatatgagttcgctggtaccatataaagtatttgtcagtaaacaatatacacagcatcgt
atacttgaaagtgaaattgaagctaataatgatcgtattcaacaagtttgtcaacatgtt
accaataccattgtgcaatatccacgaattgctgatcaattaagtgaattacttaataat
tttatgttactatggaagagtctacgtaaattaatacaggaaagaggtgattatatggtt
cagttacacaggggtatgttaacttctttatcattggttgcataa
DBGET
integrated database retrieval system