Schistosoma mansoni: Smp_125290
Help
Entry
Smp_125290 CDS
T01095
Name
(RefSeq) IPR001194 DENN,domain-containing protein
KO
K20163
DENN domain-containing protein 4
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
smm04131
]
Smp_125290
Membrane trafficking [BR:
smm04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Other Rab GTPase associated proteins
Smp_125290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DENN
uDENN
dDENN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8342074
NCBI-ProteinID:
XP_018648757
LinkDB
All DBs
Position
1:38441657..38513556
Genome browser
AA seq
2129 aa
AA seq
DB search
MKTQSLPERLAEYFVICGLPKNPSTYDVSKILTHAEEIIAPNTSIDFTRFPEPIVDIKIV
SLREKEEIPEGYTCIKYSVSGKHKANILLNFGEEACICYRRGRDQPFIRDIELKAYICYR
KSLVKQCIISYKPEVLYWYRVPSVDYNCSNPSINNKTPQYSSVVPNNPSSDPPEMCDQLN
KGMDDKTCSDFSPESQVAPLDPDIFQVANFCLPWGASIESWSVNQDPPEVNSFTFMLTNE
AYQKLYGVALTFYEPYVEQLDLHKCYCLGVDPELIYSKSSTDLVNDEYDANEEAIAKRQR
HFLASRVGDRILGVTKTLCILSRWSFTLPFSNFLGFLYSRCLLSNNLDNIPFERYLGYFL
FEIPFPDRAIPSISVDLCAAPILIQRPDDTNASSSSCESFFRLLDNLSVDLIIQLLVQLL
TEQKILMSSVRHSVLSDIGEALIYMIFPLKWTVVYIPYIYMGCIHVIQSPSPYLIGMDSR
FFDFFRLPPNGGIAYLDLDTNNFKPPLAPGQPVFDSKVLPKKPLKQLKTRLLELKEKIFQ
MKNTRIASSKTMPRNMMLDCMFSTSNSELAQEELIKVRKRTQIGSCIKEAFLQFMVHLLK
DYRLCLESVRNSQTDVMFNIEHFLRECADKHTIPFYRALFETQQWNNFVRDRIYASSRDE
ELDYFDNRIELLLESESKSRPHPHQHLHRSRNNISLTTMSNIFTIKRSASSYVDHNNHSE
DRSVSSNASIKDKSDESTDSQVSSDLGLLPNNNNLSITVISPPCWPVPEFVDTPQLQHLL
WTREYSLGFFPTNINSELLDLLASRAFLLKATLSNNSIITPMLSGNDNPDNSNLITTLIT
SVSGEVKNKENWMSSNSTTCTDMLLSPSPVNCWSKSPVITNILDHNPDSRRTTGMSILMM
KKLQLNTPQRFGSLMLVNSPSPLIIRSNRPENTSLIGLSTKYCLPVNNATILKRTSQELR
YTLNYCSSIAQTDDYSKVKYLAGSAYSIWFMLLPGYLSTYFEVINIIKQIIVQSLGVYNR
IHDYELEVPDQVALRILLVLLYQNRIEGFDLLKFINSMDWSSSSSGIANHIYKAFEKELR
EHERLENERSMSTFKHHNHRRSASADTELNPSTQINSSENTTGIIVPQPFNSSDDLTDQG
YSTLNIHEDKTSSDQDWSPVVDQSTNINNDSMSCVVSTVDNHRIPMEQHQQIQELTECHQ
ALSVIGSGDDTLCHHSSQSKEHLTSCSSNTISQFIPSSSINDHQTSSLSNVEQSDPTTVI
GNDDNNVKNVRENTPSKEGNHINAPDTAKSSSASADVINDHNNESSSSNGTNLSDDDSCA
DDDEDSENEHIPYGYNLLSSALSKIKRPFLQHYNTSPATTTTTTTTTTHTPSSNGLYSLF
TSSIDITRDSKHLLFSKSSRQSFDDNSSSVNIMRQSAHHHDIMTTTSTTTPIAVATSNGN
SNLTASLVDNNIDGDDDDDVEDNDEDNEDANAQPKVSVVHNALNFFNRSTSDFINRINMN
RSLLDWRSLIPSLSTNPTPQTGRRATTSNCFTSSNLTNQHGGYHVQQQNYYYPIPPPYQP
QSERISRVSWSKSSCIGMNNNTDSTYNQSTDNIPFTNTHKLSDSVYLTNPINGILLNMNY
HSFDNYNMNSNANQVDVSNSLKDMWINVAGPLLVGDVNRRISPANTRTIHLQQCLYQQYM
YNSSSPSPVPAPSFHINQIESSHVIPTLNNAYHELTTTKHDNSTTSIPVTVATITASNLD
SQQSNSNPDDHHSNPVVSDSCLFSTIKTPTVQSPSPCLSQGDNNNNNNNKESSPSFSSTS
TTISDGNQLPNINRNNNNNSITHLNVFITTCSTCPKCKHYVYDEEIMAGWSTDENDHRTF
CPFCKTYFIPQLSIRIFGDTCGGKSLETIIQNEGDECLHCQSVQLSLLHRHTQLTWNLVW
LMYRLGLPTYLLDLLPIWIMNYQLEQRIKFKTNPLHTTHHHHHCSQQCNCNNNKQIHNQN
SPWSLVRIPSSQDTVNSNGNSCCPIHATIDQLINAIKYDNMRFALEYLIQIQTGNIKMRR
NKLNQPIRCGSIECYTACLENSLYRELLFLIVQALSRTSLDLMSFDEKYDLVYRSFRNSG
CTLLTDFDQPPTLIASICRQILRPLILRP
NT seq
6390 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactcagagtcttccggaacgtcttgcagaatattttgtgatttgtggcttgccc
aaaaatccaagtacatatgacgtttccaagatccttacacatgctgaggagataattgct
cccaatacttcgattgacttcacgcgattccctgagcctattgtcgatattaagattgtg
agcttaagagagaaagaagaaataccggaagggtatacatgcattaaatacagtgtctct
ggaaaacataaggccaacatccttttgaattttggagaggaggcctgtatatgttaccgt
agaggacgagaccaaccgtttataagagatatcgaattaaaagcttatatttgttatcgc
aagtcacttgtgaaacaatgtataatttcctataaacctgaggtattatattggtataga
gttccaagcgttgattacaattgttcaaatcccagtataaataataaaactcctcagtat
tcctcggttgttcccaataatccatcgagcgaccctcctgaaatgtgtgaccaactcaac
aaaggaatggatgacaaaacctgttcggatttttcaccagaatcccaagttgctccatta
gatccggatatattccaagtagccaatttctgtcttccatggggtgcatcaattgaatca
tggtctgtaaatcaagatccacctgaagttaattctttcacatttatgcttacaaatgaa
gcttaccaaaagctttatggtgttgcgcttactttctatgaaccctatgttgaacaatta
gatttacataaatgctactgtttaggagttgatccagaattaatttattccaaatctagt
acagatttagtaaatgatgaatatgatgctaatgaagaagcaatagctaaacgacaacgt
cattttttagcatcacgtgttggtgatcgtattcttggtgtgacaaaaactctttgtata
ctttctcgttggtcatttactttaccattttctaattttttgggatttctgtacagtcga
tgtttattatcaaataatttagacaatataccatttgaacggtatttaggttatttcttg
tttgaaattccttttcctgatcgagcaataccaagtatatctgttgatctatgtgctgct
cctattctaattcaacgtccagatgacactaatgcatcttcttcaagttgtgaatcattc
tttcgtcttttggataatttaagtgtggatttaattattcagttattagttcaactactt
actgaacaaaaaattcttatgtcatctgtacgacattcagtattgagtgatattggtgaa
gccttgatatatatgatattcccattgaaatggactgttgtatatattccatacatatat
atgggctgtattcatgtgattcaatcaccttcaccatatttaattggaatggactcaaga
ttttttgattttttccgtttaccacctaatggtggcattgcctatcttgacttggataca
aataatttcaagccaccattagcaccgggtcaaccagtatttgattcaaaagttctcccc
aaaaaaccactgaagcaactgaaaacaagattactagaattaaaagagaaaatatttcaa
atgaaaaatactcgtatagcatcatctaaaacgatgcctagaaatatgatgttagattgt
atgttttcaacatcgaattcagaattagctcaagaggaattaattaaagttcgtaaacgt
acacaaattggttcatgtattaaagaagcatttctacaatttatggtacatttattgaaa
gattatcgtttatgtcttgaatctgttcgtaattctcaaacggatgttatgttcaatatt
gaacatttcttacgagaatgtgcggataagcatacaataccattttatcgtgctttattt
gaaacacaacaatggaataattttgtacgtgatcgaatttacgcttcatcacgtgatgaa
gaattagattatttcgataatcgtattgaattattactagaaagtgaatcgaaatctcga
ccacatccacatcaacatcttcatcgttctcgtaataatattagcttaacaactatgagt
aatatatttacaattaaacgatcagcatcatcctatgtggatcataataatcattcagaa
gatcgatcagtgtcaagtaacgcatcgattaaagataaatcggatgaatcaacggattca
caggtttcaagtgatttaggacttttacctaataataacaatttgagtataacggttatt
agtcctccatgttggccagttcctgaatttgttgacacacctcaactgcaacacttatta
tggacaagagaatattcactcggtttctttccaactaacattaattctgaattattagac
ttattagcttcaagagcatttcttttaaaagctactttgtcaaataattctataatcaca
ccaatgttaagtggtaatgataatcctgataattctaacctaattactacattgataaca
tcagtatcaggagaagtgaaaaataaagagaattggatgtcttctaattctaccacatgt
actgatatgcttttatcaccaagtcctgtcaactgttggtctaaatccccagtaattacc
aatatattagatcataatccagattctcgaagaacgactggaatgtcaatattgatgatg
aaaaaattacaacttaatactcctcaacgatttggttcattaatgttagtcaacagtcca
tctccactaattattcgttcaaatcgtccagagaatacaagtttaattggtttaagtaca
aaatattgtttaccagtgaataatgcaactattttaaagcgtacatcgcaagaattacga
tatacgctaaattattgtagtagtatagcacaaactgatgattattctaaagtcaaatat
ttagcaggatctgcttattcaatttggtttatgttattaccaggttatctatctacttat
tttgaagtgattaatataattaaacaaattattgtgcaatcacttggtgtatacaataga
atacacgactatgaacttgaagttcctgatcaggttgctttacgtatattactagtgtta
ttgtatcaaaatcgtattgaaggcttcgatttactgaagtttattaattcaatggattgg
tcatcatcgtcatcgggaattgcgaatcatatttacaaagcatttgagaaagaattaaga
gaacacgaaagattggaaaacgaacgttcgatgtccacatttaaacaccataatcatcgt
cgttcagcttctgccgatactgaactgaatccatctacacaaattaatagttctgaaaat
acaactggtatcatagtacctcaaccgtttaattcatctgatgatcttactgatcaagga
tattcaacgttgaatatacatgaggataagacaagttcagatcaagattggtcacctgtt
gttgaccaatctacaaatatcaacaatgattcaatgtcatgtgttgtttcaaccgttgat
aatcatcgaattccaatggaacaacatcaacaaattcaagaattaacagaatgccatcaa
gctttgtctgttattggtagcggtgatgatactttatgtcatcacagttcacaatcaaaa
gaacacttaactagttgcagttcaaatactatcagccaatttataccttcttccagtata
aatgatcatcaaacatcaagcttgagtaatgttgaacaatcagatccaactacagttatt
ggtaatgatgataataatgtgaaaaacgtaagggaaaatactccatctaaagaagggaat
catatcaatgctcctgacactgctaagtcatcatcagcctcagctgacgttattaatgat
cataacaatgagagtagcagtagtaatggtaccaatctcagtgatgatgattcatgcgca
gatgatgacgaagattctgaaaatgaacacattccttacggatataatttattatcatca
gcactgtcaaaaatcaaacgtccattccttcaacattataatacttcaccagctactact
actactactactactactactactcatactccgtcatcgaatgggttgtactccttattc
acatcaagtatagatataactcgagatagtaaacatttgttattttcaaaatcatctaga
caatcatttgatgataattcttcgtcagttaatattatgagacaatcagcacatcatcat
gatattatgactactacttcgactactactcccattgctgttgctacttctaatggtaat
tcaaatttgacagcttcacttgtagataataatattgatggtgatgatgatgatgatgtt
gaagacaacgacgaagacaatgaagatgctaatgcacagcccaaagtttcagttgttcat
aatgcattgaactttttcaatagatctacatcggattttatcaatcgtatcaatatgaat
cgatcattgttagattggcgttctcttattccaagtttatctacaaatccaactccacaa
acaggaagacgtgcaactacttcaaattgttttacaagttcaaatttaactaatcaacat
ggtggttatcatgttcaacaacaaaattactattatcctattccaccaccatatcaacca
caaagtgaacgtatttcacgtgtttcatggtctaaatcatcatgtataggaatgaataat
aatactgattcaacatataatcaatctactgataatatcccatttactaatacacataaa
ctatcagattctgtatatcttacaaatccaataaatggtatattgttgaatatgaattat
cattcttttgacaattataatatgaatagtaatgctaaccaagtggatgtttcaaactca
ctgaaagatatgtggatcaatgtcgctggtccattacttgttggcgatgttaatcgacgt
atatcgcctgccaatacgcgtacaatacatttacaacagtgtttataccaacagtatatg
tacaacagttcatcaccatcaccggtaccagctccatcatttcatatcaatcaaattgag
tcatctcatgttatcccaacactgaataatgcttatcatgaattaacaacaacaaagcat
gataattcaaccacttcaataccagttacagtagcaacaataacagcttcaaatcttgat
tcacaacaatcgaattcgaatccagatgatcatcattcaaatccagtagtcagtgattct
tgtttattttcaacaatcaaaacaccaactgttcaatcaccatctccatgtcttagccaa
ggtgataataataataacaataataataaagaatcatcaccatcgttctcttccacctcg
acaacaatatcagatggtaaccaacttcctaacattaatagaaacaacaataataatagt
attactcatttgaatgtattcattacaacttgttcaacatgtccaaagtgtaaacattat
gtttatgatgaagagataatggctggttggtctacagatgaaaatgatcatagaacattt
tgtccattttgtaaaacttactttataccacaattgtcaatacgtatatttggtgataca
tgtggaggaaaatctttagaaactattattcaaaatgaaggtgatgaatgtttacattgt
caatctgttcaattatcattattacatcgtcatactcaattaacatggaatttagtatgg
ttgatgtatcgtttaggtttaccaacctatttattagatttattaccaatatggataatg
aattatcaattggagcaacgtattaaatttaaaacaaatccattacatactactcatcat
catcatcattgttcacaacaatgtaattgtaataacaataaacaaatacacaatcaaaat
tcaccttggtctttggttagaatacctagttcacaagatactgtgaatagtaatgggaat
agttgttgtccaattcatgccactattgatcaattaatcaatgctattaaatatgataat
atgcgatttgctttagaatatcttatacaaatacagacaggaaatattaaaatgagacga
aataaactaaatcaaccaattcgatgtggtagtattgaatgttatacagcatgtttagaa
aattcactatatcgtgaattattattcctaattgtacaagcattgtctcgaacatcgttg
gatctaatgtcattcgacgaaaaatatgatctagtttatcgatcattcagaaactctggt
tgtacattattgactgattttgaccaaccgccaaccctgatagcttcaatttgtcgtcaa
atactacgcccattaatattaagaccataa
DBGET
integrated database retrieval system
