KEGG   Schistosoma mansoni: Smp_125550
Entry
Smp_125550        CDS       T01095                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K20476  RAB6A-GEF complex partner protein 1
Organism
smm  Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:smm04131]
    Smp_125550
Membrane trafficking [BR:smm04131]
 Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
  Retrieval pathways
   Rab associated proteins
    Smp_125550
SSDB
Motif
Pfam: RIC1 ANAPC4_WD40 Beta-prop_EML_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 8352325
NCBI-ProteinID: XP_018654107
LinkDB
Position
W:complement(12638688..12678398)
AA seq 1412 aa
MHYLVGWPSVLEAHCSLGEVSAVCSSEDGETSIVCTGADVVIFHLKKDPEIISVPNPSIE
IFLLKSVRVAECKCSVFSLGETVIVASEKGDLVKLRWDGSYYGESINLRSINLPRDIKSF
SDKNSEQVYCKTVEWSPTFGGAFALFSSGHIALFVSLGAVANQTDIEVILVENVSHPTCI
GVNNRFRTLAVGTESNEVLLYKMDENSGVFKIKHTLCISGRESSHTTEKVGPVSEISWSP
DGYTLAVVWLRSGWSLWSVFGALLYTSLSEHLSRFGGINISNLSWAHHGYNILGLFTLNN
VTEISRVANTDSFVSEKVSTKDTIKVEESQFFSGGLDCPSRNSSYLVVFHLARSSITANP
TSDNHLHIVLQTTDRIIVANRDLLTSRMQTENLLVPKQYINSNWPVRYVAVSTDGKKIAV
SGRNGFIHYNTDSQRWHVFGNIKQENSLHVFGGMAWWKQYICLTCFTENYGTSEVRVYSS
DHKLDNQFSSICDLPSLTLPVIVDNFGNLFLVLTNDGCLQIFGLSESVSSKSTVIVSPFK
AVNLTDIVIFPACVVRICLTTLKSNASFTRTTTSGTNLFRNFDPGFCSIESLVMNYAGDV
FMLQRSYLDVTPKSHSGTPEEINQQLLSFGTPLLVASEIEILWSTSCFTPITSQANNDRL
SPLNGIDANAYTKDSLWLYSGAVGLSVWLPLPQVPSSLAFSFNYESVRSDTNQKFSTDHD
SSSVLNCDYRRIMLSFELGGDLYPLSICFQEGLLVGILNEFHRCWNKPLVHWKEDISSDL
FVLFPYGTLLTKIRVALHHIIRQLLRKNLGIHAFQMSLAYQHLPYFPLILELLLHEVLEV
EAASKIPTPDPLLPQVVAFIQEFSNFLEILAHCSRKTDVTWWPHLFITIGRKPKDLFELC
LENNKLETAASFLILLQTSEPLSVSWECALTLFRASLQSMNWNLIRDLLRFLCAIDPTEY
NSSDGRSRKKDFNKSHNMYLNPCNHLKNLPSLDNHHMQLKASPEKSINKIVWYGGMSMYR
PTRVPMELLDFGNDQIKDLCNNIKISSDTSGTHIQKPSSTLRNQLEQLLFRVATDYFSQG
YLKRASQLVTNIPEIFNDGFCTGPTNVLQMWLNKNVTVNKETLCQLRYLLNQLTLARSKE
WICLINLICLDRDAFLRSVSMAVNWTVFSDYSEIHQDISATNICLKKLITGLSEIKQWSH
GTIPPYYYFLESCEPHIKIILEKVYEISDEKNKVPVVSVFSSTTLVEDDMVNKIQKKQIM
EVNSSSITHTYQYSRACQLNLEQDCLIPLEVSKVGPSLLDLTLSPAKDETVVLKNNPVHC
SVLLDSHHASLDNSSCSTPIILSNETAITKHWTSSYPDRWKSVNDLGPLGRLVVLNLNET
DTGSKNECLFDGTTENLADGSFNAEQRTCSVM
NT seq 4239 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcactaccttgttggatggccttcggttcttgaggcgcattgtagcttgggtgaagtc
tctgcggtatgttcatctgaagatggtgagacatccattgtttgcactggtgcagatgtc
gttatttttcatcttaagaaagatcctgagataatcagcgttcctaatccgtctatagaa
atattccttctaaaatctgttcgagttgctgaatgtaaatgcagtgtgttctcattaggt
gaaactgttattgttgcttctgagaaaggggatttagtaaaattgcgatgggacggttcg
tactatggtgaatctatcaaccttaggtctatcaacttgccgcgagatatcaaaagcttc
agtgataaaaactcagaacaagtttactgcaaaactgtagaatggtctcctacgtttggc
ggcgccttcgctcttttttcttctggtcatatagctttgtttgtatcacttggtgctgtt
gcaaatcaaacggacattgaagtaattttggtcgaaaacgtcagtcatccaacatgtata
ggtgtaaataatcgctttcggacacttgctgttggaactgaaagcaacgaagttttattg
tacaagatggatgaaaattccggtgtttttaaaattaaacatactctttgtatatctggt
cgggaatcatctcatactaccgagaaagtaggccctgtctcggagatttcatggtcaccg
gatggatatactctggctgttgtttggttacgttcgggttggtcgttgtggtcagttttt
ggtgcattgttatacaccagcttaagtgagcatcttagtcgatttggtgggataaatatt
tcaaacctctcctgggctcatcatggttataatatactcggtttgttcaccttgaacaac
gtgacggaaatttccagggttgcaaacactgactcctttgtttcagaaaaggtctccacc
aaagatactataaaagtagaggagtcacaatttttttctggtggtctggactgtccttca
cgaaactcttcatacctggttgtctttcatttggctaggtcttcaataacagctaaccca
acgtcagataaccatttgcatatcgttcttcaaactactgaccgaataattgtggcgaac
agggatctattgacctctagaatgcaaacagagaatttgttagtcccaaaacagtatatc
aactctaattggccagttcggtatgttgctgtttctacagatggtaaaaaaatagccgtt
tcaggtcgtaatggatttattcattataacactgattcacaacgttggcatgttttcggc
aatataaaacaggaaaactccttgcacgtctttggaggtatggcttggtggaaacagtat
atttgtctcacctgtttcacagaaaattatggtactagtgaggttcgtgtgtactcgtct
gaccataaacttgacaatcaattcagctctatctgtgatcttccatcccttacattacca
gtcattgtagacaatttcggaaatctgtttcttgtacttaccaacgatggatgtctgcaa
atctttggtttatcagagtctgtttccagtaaaagcactgtcatcgtatctcctttcaag
gctgtaaatttaacagatattgtcatatttccagcatgtgttgttcgaatttgccttaca
actctaaagagtaatgcatcttttacccgtacaaccacttcaggaactaatttgtttcgt
aacttcgacccaggtttctgctcaattgaaagcttagttatgaattatgccggtgatgtg
tttatgttacaacgttcgtatttagatgtcactccgaaaagccattctggaactccggag
gaaattaaccaacagttactatcatttggaacacctttgttagtggcttctgaaatagaa
attctatggtctacaagctgtttcacaccaatcacttctcaggctaataatgatcgttta
tcgccattgaatgggattgatgcaaatgcttatacgaaagactccttgtggctttattcc
ggagcagttggacttagtgtttggcttccactaccacaagttccttcttcgcttgcattt
agttttaattatgaatctgtgagatcagataccaatcaaaaatttagtacggatcacgat
agttcgtcggtcttaaattgtgattaccgaagaataatgttgtcatttgagttgggcggc
gacttgtaccctcttagtatttgctttcaggaaggcttgctagtcggtattcttaatgag
tttcatcgttgctggaacaagccactggttcattggaaggaagatatatcttcggattta
ttcgtgctatttccttatggaactttgttaactaagattcgggtagcactacatcatatc
attcgacagcttctaagaaaaaatttggggatacatgcgtttcaaatgagtttagcgtat
caacatttaccgtactttccccttattttggaactgttattacatgaagtgttggaggtt
gaagctgcctccaaaattccaacgccagatccattactaccgcaagttgtagcatttatt
caagaattctccaattttctggagattttggcccattgttctcgtaaaaccgatgtcact
tggtggcctcatttattcattaccatcggaaggaaaccaaaagatctatttgaattatgt
ttggaaaataataaactggaaacagcagcttcttttcttattcttcttcaaacatcggaa
cctctttctgttagttgggagtgcgcattaaccttgtttcgagcatcgcttcaatctatg
aattggaatctcattcgtgatctgttgcgttttctatgtgctattgatcctacagaatat
aattcaagtgatggacgtagtagaaaaaaagactttaacaagtcccacaatatgtacttg
aacccgtgtaatcatttaaaaaatttgcctagtcttgataatcatcatatgcagttaaaa
gccagtcctgagaaatctatcaacaagatcgtctggtatggtggaatgtcaatgtatcga
cccacaagagttcctatggaattactggactttggaaatgaccaaatcaaagatttgtgt
aataacatcaagatatcatctgacacgtcaggaactcatatccaaaaaccatcttccact
cttcgaaatcagcttgaacagctcttgtttagggtagctacggattacttttctcaaggt
tacctcaaacgcgcatcccaattggttacaaatattcccgaaatttttaatgatggtttt
tgtactggtcctacaaacgtattgcaaatgtggttaaataaaaatgtaactgttaataaa
gagactctttgtcagttacgatacctgttgaaccagttaaccttagctcgttcaaaagaa
tggatctgccttatcaacttgatttgtctagatagagatgcctttttacggtcagttagt
atggctgtcaactggactgtgttttcagattactctgaaatccatcaggatatctctgcc
acaaacatttgtttgaaaaagctgataactggtctttcagaaataaaacagtggtcacat
ggcacgattcctccgtactattactttttagagtcttgtgagcctcacataaagataatt
ttggaaaaggtgtacgaaatttctgatgagaaaaataaggtgccagtggtatcagtattt
tccagcaccacattggttgaagatgatatggtaaataaaattcagaaaaagcaaataatg
gaagtaaatagttcatctataacacatacataccaatattcaagagcctgtcagttaaac
ttggaacaggactgtcttatcccactagaagtatcgaaagtgggtcctagtcttttggat
cttaccttatcgcctgcaaaggatgaaacagttgttcttaaaaataaccctgttcactgt
tcagtacttttggattcacatcacgcatccctggacaattctagttgttcgacaccaatt
attcttagtaacgaaactgccattactaagcattggacatcgagttatcctgatcgctgg
aaatctgtaaatgatcttggcccactagggcgtcttgtggttcttaatctcaatgaaacg
gataccggtagcaaaaatgaatgtttatttgatgggacaaccgaaaatttagcggacggg
tctttcaacgctgaacaacgtacctgttctgtcatgtag

DBGET integrated database retrieval system