Schistosoma mansoni: Smp_143650
Help
Entry
Smp_143650 CDS
T01095
Name
(RefSeq) putative midasin (midas-containing protein)
KO
K14572
midasin
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Pathway
smm03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
Smp_143650
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
smm03009
]
Smp_143650
Ribosome biogenesis [BR:
smm03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
Smp_143650
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_5
AAA_lid_7
AAA
AAA_16
AAA_7
AAA_22
AAA_3
nSTAND3
AAA_lid_5
Sigma54_activat
Sigma54_activ_2
AAA_18
TsaE
AAA_14
ABC_tran
Mg_chelatase
Rad17
RNA_helicase
RuvB_N
AAA_6
RsgA_GTPase
NACHT
AAA_25
AAA_30
bpMoxR
AAA_28
PduV-EutP
DUF815
ATPase_2
Dynein_heavy
AAA_33
TIP49
SRP54
MDN1_4th
AAA_PrkA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8341243
NCBI-ProteinID:
XP_018652763
LinkDB
All DBs
Position
5:6435747..6486328
Genome browser
AA seq
2375 aa
AA seq
DB search
MVKRNKRKSKVLGPCAEEPTVKSPEDICITTHECKKNPLVLFSRLIEVEAAAKQSLERYE
PILIAGPVGCGKSSLANKLAKEYCNVIRTIQISEHTDAKTLLGAYCCTEIPGQFTWRPGP
LISSIEQGHGLVLEDIDRGSSELQLLITSVLRKLRSYSVNSKNILLDPVSGNPITHHPNF
RLLMTRRFISCHGEDFRQESGNILVEFLDRYCFVITLPNFSKDETNLLISHQYPTLVPFI
DRIMNIYTFVVDSFRNANIVIQSTMNSSRLRGISVRDLLKFCSRISTLTEKENFSELLLL
NAVDCFLSSMCNSIKQLEIACRLAVGQLVINVDLFTSGNSILQSSNDIIWPFASTRLSSS
LLERLAVAVQHKEPVLLVGETGTGKTSTVQRLAYLTGHRLRVINLNQQSDSVDLMGGFKP
VDFQVFVRPLREKFESLFTCTFKLDNNLVFLGHINTCFQSGRWLDLITLMRHPARVAVQR
DSSVDTSEWIKFLNDLTILEKRLENITKSNKPGLGFAFIEGALVRSVQDGDWILLDEINL
APAEMLDSLSGLLDSEYGSLILTERGDNEPIKRHPDFHLFAAMNPATDVGKRELPVGLRN
RFTEFYIPELDPCINVNKSEASMDLDSSRHIEVIRSNNCEDLATLARSYLVALNPTPSQL
STIVRLYSALRQAAVEGLVDGVGQRPHFSLRTLCRALIEAGRGYHGSILRSLYEGLLFSF
GSQICRTSRPILDTLIQRYLCSGWNKDSSSLLRLLNTPLPIPQLNNQYSDDYFVNVEGYW
LPKGSQQPISIDNKNELPGNYILTPSVQANLKDLARVVAAGGGLPVLLQGETSVGKTSLI
TYLAKRVGQVCYRINNHEHTDQQTYLGTYTVSSTAYTTQSNTDNHNNQGNDNEALKKTST
SLVFKDGLLVKAMRNGYWIILDELNLAPTEILEALNRVLDDNRSVFITETQETIKAHPHF
RLFATQNPPGLYAGRKMLSRALRNRFIELHFDTIPRNELEIILEKKCLLPSSRAQRLVEV
MHRLQLARCTSNLFQGKDSFITLRDLFRWAERYRLATCDKLVTGQIDNKKNEQTIFFDWD
GYLADQGYLLLAGRVRNPTEIHIVTDVIESVFKRKVTESRLFDLNESTSPVVYEFLQPVL
SKETVCYTGFDHIVWTKDMRRLLVLVGNALKYEEPVLLVGETGCGKTTICQLIAALHNQR
LHCLNCHQCTEASDFLGELRPVRHSSEVNEKESKNDCRLFEWINGPLVTAMVNGDLFLLD
EISLADDAVLERLNSLLEPERQLHLAECSEDSLMVNNNDNNNNSNSITTPYTQLLTAHSK
FRFIATMNPGGDYGKKELSPALRNRFTEIWCPSPIFTSNHIQSTISSLSYNESDQLSNSL
LDCQHIVMHNLQLKVPMYFKMGNDDFVKQFSEKMINFIHWYAVTQNEYKSNGTGSLCQRP
SPTIRDLIVWIDFIQTAVTTQNVINSSNRLNLFSACIHGACLVFLDVIDHVLPNRNVNGM
FAFSYCLREISLLINCDEMYASFASELNEKFVSTKNNELFGCEPFFISTGPFIDSLTNTN
FIFDAPTPSSNLKRLLRAMQLPSRALLLEGSPGVGKTTLVLALAKASGHKVIRINLSEAT
EVSDLFGCDLPVEGAEAGVFAWKSGPFLQGLCEGHWIILDEMNLASQSVLESLNACLDHR
GEVFIPELNNTFKINSYATRLFACQNPLREGGGRKGLPRSFLNRFTQVYMKPLSKSDQEF
ILIQLYPDIPKNYIHLMVTFNDMVNEQINIKHEFGNQGGPWEFNLRDLTRWCDLIIKGKD
FEGFNPGLYVHLLYTNRMRTAQDKQKVFPLFNSIYFAKSQSIFHHFKMFYYEPYGDIRLF
NESSLQCGLAHFTCYSINYSICNEFEYLIIMDHHRSILESFLKVIEMGWMVMLNGSPGCG
KRTLAHIASILLGQTLVTMCLSPTSDTIELLGSLEQRESGGLFEWIDSPLVKGIINGYWV
LIENAQLCSPSVLDRLNSLLEPNGELLLSERGLDANGKLVTLKAHPNFRLILTVDEFVGV
GANCSTGISRAMRNRGLEITFTEPIMQPHVDLLRLFTAINVPKPIAIGLVEFQGLFLEVC
ENQTSFLEFYSKCFNGKAQLLDNNTTTHQSINCHHLKRIPIGALISASHYAKQLLIGSSS
DPSVSIKGLQVPKIETKKRKMQKMVTKKHDDINKLNNTDDDITTDEILIHILNYTYCHRQ
MNTKSIEFVKYLINYYVKHIRHTDPLHTELHSMYHLPVNYLHHTVNEIIQNRLPIIYRKS
YTNLIQITLKEYYDKPLNIDIQLMIQRILLEQANFTDIQSELFDLKAFQFNESNMTMIKL
SEWSNWPDLRWIPGWKHLIYSLENESDDLIYEWNK
NT seq
7128 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaagaggaataaacgtaaatcaaaggtacttgggccgtgtgcagaagaacctaca
gttaaaagccccgaagatatctgtattacaactcatgaatgcaagaaaaatccacttgta
cttttttcgcgtcttattgaggttgaagctgctgccaagcagtctctagagagatatgaa
cctatccttattgcaggtcctgttggctgtgggaaatcatcacttgcaaataagcttgct
aaagaatattgcaatgtaattcgtactattcaaattagtgagcatacagatgcaaagact
cttctaggagcttactgttgtactgaaatacctggacagtttacatggcgtccaggtcct
ttgatttcatcaatagaacaaggtcatggattagtcctggaagatattgatcgtggttct
tctgaattgcagctattaatcacttctgtgttgagaaagctaagaagttattcagtcaat
tcaaaaaacatactattagatcctgtttctggtaatccaatcactcatcatcccaatttt
cgcttgttaatgacgagacgttttatttcatgtcatggtgaagattttcgccaagaatct
ggaaacatattggttgagtttttggaccgttactgttttgtgatcacgctgccaaatttt
tcgaaagatgaaacaaacctacttattagtcatcagtatccaacacttgttcctttcatt
gatcgcataatgaatatttatacatttgtcgtcgactctttccgaaatgctaatattgtt
atacaaagtactatgaattcttctagactacgaggaatatcagttagagacttattaaaa
ttttgttcacgtatatcaacgttaactgaaaaggagaatttttccgaattgttgctacta
aatgctgtcgattgtttcctatcctcaatgtgcaattctataaaacaacttgagatagct
tgccgactagctgttggtcagttagtcatcaatgtagacttattcactagtggaaattct
atacttcaaagctccaacgatatcatttggccatttgcttctactcgtttatcatcttcc
ttattggaacgattagctgttgctgtacagcataaagaacctgtcctacttgtcggtgaa
acaggaactggtaaaacatctacggtccaacgacttgcctatctcacaggccatcgttta
agagtaatcaatttaaatcaacaatcagatagtgttgatctaatgggaggatttaaacct
gtagactttcaagtttttgtacgaccattacgggaaaaattcgaatcacttttcacgtgt
acatttaaattagataataatctagtttttcttggtcatataaatacttgtttccaatct
ggacgttggcttgatttaatcactttaatgcgtcatccagctcgtgtggctgttcaacgt
gattcatcagttgatacttcagaatggattaaatttttaaatgatctaactatcctggag
aaacgtttagaaaatatcacaaaatcaaataaacctggattaggatttgcttttattgaa
ggtgctctagttcgttcagtgcaagatggtgattggatactgttggatgaaattaattta
gctccagctgaaatgcttgattcactaagtggtctattagattctgaatatggtagtctt
atcttgacagagcgtggcgataatgaaccaataaaacgtcatccggactttcatttattt
gctgctatgaatccagctacagatgtcggtaaacgtgaattacctgttggacttcgtaat
cgttttactgaattttacattcctgaattagacccttgtattaatgttaataagtcagaa
gcatcgatggatttggattctagtcgtcatattgaagttatacgctcaaataattgtgaa
gatttagccaccttagctcgttcctatttagttgcattgaatccaactccatcacaatta
tcaactattgtacgactttattcagctttgagacaagctgctgttgagggtttggttgat
ggtgtaggtcaaagaccacatttcagtcttcgaacattatgtcgagccttaattgaagct
ggtcgtggctatcatggaagtatcttacgttccttgtatgaaggtttactttttagtttt
ggttcacaaatttgtcgaacatcacgaccaattttagatactttaattcaacgttattta
tgctctggttggaataaagattcatcatcattattacgcttattaaatactccattacct
atacctcaattaaataatcaatattccgatgattattttgtgaatgttgaaggttattgg
ttaccaaaaggttcacaacaaccaatttcaatagataataaaaatgaattacctggaaat
tatattttaacaccaagtgttcaagcaaatttaaaagatttggcacgtgttgtcgctgca
ggtggaggtcttccagttctattacaaggtgaaacatctgttggcaaaacatcacttatt
acatatttagctaaacgtgttggtcaagtgtgttatcgaattaataatcatgaacatact
gatcaacaaacttatttaggcacatatacagtttcatcaactgcatatacaacacaaagt
aatactgataatcataataatcaaggcaatgataatgaagctttgaagaaaacatccaca
tcattagttttcaaagatggtttattagtgaaagcaatgcgtaatggttattggataata
ttggatgaattaaacttagcaccaactgaaattttagaagcattaaatagagttttagat
gacaatcgttctgtattcatcactgaaacacaggaaacaattaaagcacatccacatttt
cgattatttgctacacagaatccaccaggtctttatgctggtcgaaagatgctttcacgt
gccttacgtaatcgtttcattgaattacattttgatacaatacctcgaaatgaattagaa
ataattttagaaaagaaatgtttactaccttcaagtagagcacaacgtcttgttgaagta
atgcatcgtcttcagcttgctagatgtacttcaaatttatttcaaggcaaagatagtttc
attacattacgtgatctattccgatgggctgaacgttatcgtttagctacatgtgataaa
ttggtaactggtcaaattgacaataaaaagaatgaacaaacgatatttttcgattgggat
ggatatttagctgatcaaggctatttattacttgctggacgtgtacgtaatccaactgaa
atacacattgttacagatgtgattgagagtgttttcaaacgaaaagtcactgaatcacga
ttattcgacttgaatgagagtacatcaccagttgtatatgaatttttacaacctgttcta
agtaaagaaacagtttgttatactggatttgatcatattgtttggacaaaagatatgaga
cgtttattagttctagttggtaatgcattaaaatatgaagaaccagttttattggttggt
gaaacaggttgtggtaaaactactatttgtcaattgattgctgcattgcataatcaacgt
ttacattgtcttaattgtcatcaatgcactgaagcatctgattttcttggtgaactacga
ccagttcgacattcatcagaagtgaatgaaaaagaatccaaaaatgattgccgtttattt
gaatggattaatggtccattagtaacagctatggtaaatggagatttatttctattagat
gaaatttcattagctgatgatgctgttttagaacgtttgaatagtttattggaacctgaa
agacaattacacttagctgaatgttctgaagattctcttatggttaataataatgataat
aataataatagcaattcaataacaacaccatatacacaattattaacagcccattctaaa
tttcgttttattgcaacaatgaatcctggtggagattatggtaaaaaagaattatcacca
gcattacgtaatcgtttcactgaaatttggtgtccatcaccaatatttacttcgaatcat
atccaatcaaccatctcatcattatcttataatgaatctgatcaattatcaaattcatta
ttggattgtcaacatattgttatgcataatttacaattaaaagtaccaatgtattttaaa
atgggtaatgatgattttgttaaacaattctctgagaaaatgattaattttattcattgg
tatgctgttacacaaaatgaatataaatcaaatggtaccgggtcattatgtcaaagacca
tcgccgactattcgtgatttaattgtttggattgatttcattcaaaccgctgttacaaca
caaaatgtgataaattcatctaatcggttaaatttattcagtgcttgtatccatggtgca
tgtttggtatttttggatgtaattgaccatgttttgcctaacagaaatgttaatggtatg
tttgcattttcttattgtctacgcgagatctcattattgattaattgtgatgagatgtat
gctagttttgctagtgaactaaatgagaaatttgtatcaacaaagaacaatgaattattt
ggttgtgaaccatttttcatatctacaggtccatttatagattccctaacaaataccaac
tttatttttgatgcacccacgccttcatccaatctaaagcgtttacttagagctatgcaa
ctaccttctagagctctccttctagaaggtagtccaggtgttggtaaaaccactcttgtc
ttagctttagctaaagcatctggtcataaagtgatacgtataaatttatccgaagcaact
gaagttagtgacttattcgggtgtgatttaccagtggaaggtgctgaagctggtgtcttt
gcatggaaatctggtccatttctacaaggtctatgtgaaggtcattggattatattagat
gaaatgaatttagcatctcaatctgtattagaatctttgaatgcatgtttagatcatcgg
ggtgaagtttttatacctgaattaaataatacattcaaaattaattcatatgcaacacgt
ttattcgcatgtcaaaatccattacgtgaaggtggtggtcgtaaagggttgccacgttcg
tttttgaatcgtttcactcaagtttatatgaagccattgagtaaatcagatcaagaattt
attcttatacaattatatcctgatatacctaagaactatattcatttaatggtgaccttt
aatgatatggtaaatgaacaaatcaatattaaacatgaatttggaaatcaaggtggacca
tgggagtttaatttacgtgatttaactcgttggtgtgatcttatcattaaaggaaaagat
tttgaaggtttcaatcctggtttatatgttcatctgttgtatacaaatcgtatgcggact
gcccaagataagcaaaaggtatttccactgtttaattcaatttatttcgcaaaatcgcag
tctatctttcatcacttcaaaatgttctattatgaaccatatggtgatattcgccttttt
aatgaatcatctttgcaatgtggattggctcatttcacatgttattcaataaattattca
atctgtaatgaatttgaatatttgattataatggatcatcatcgaagtattctggagagt
tttttaaaagttatagaaatgggttggatggtaatgctgaatggttcccctggatgtggc
aaacgtactttagctcacatagcatcaattcttcttggtcaaactctggtaactatgtgt
ttatcaccgacatcggatacaattgaattacttggttcattagaacaacgtgaatcagga
ggtttattcgaatggatcgatagtccattagtcaaaggaattattaatggttattgggta
ctaattgaaaatgcacaattatgcagtccttcagtattagatcgtctaaatagtcttctt
gaaccaaatggtgaacttttacttagtgaacgtggtttagatgcaaatggtaaacttgtt
acattgaaagcacatcctaatttccgtttaattttaactgtggatgaatttgttggagtt
ggagccaattgttcaactggaatttctcgtgcaatgcgtaatcgaggtttagaaatcact
ttcactgaaccaattatgcaaccacatgtagacttactacgtttgttcaccgcaatcaat
gtccctaaaccgattgctataggtttagttgaattccaaggattattccttgaagtctgt
gaaaatcaaacatcttttcttgaattttattcaaaatgtttcaatggaaaagcacaatta
ttagataataataccaccacacatcaatctatcaattgccatcatttgaaaagaattcca
attggtgcattaatctcagctagtcattatgctaaacaacttttaattggatcttcaagt
gatccgtcagtttcaataaaaggacttcaagtgccgaagatagaaactaaaaagagaaaa
atgcaaaaaatggtgacaaagaaacatgatgatataaacaaactgaacaatactgatgat
gatattacaacagatgaaatattaatacatattttgaattatacctattgtcatcgtcaa
atgaatacaaagagtattgagtttgtgaaatatttaattaattactatgtcaaacatatt
aggcatacagatccattacatactgaactacattcaatgtatcatcttcctgttaattat
ttacatcatactgtaaatgaaatcattcaaaatcgtctacctatcatctatcgtaaatca
tatactaatttaattcagataacattaaaagagtattatgataaaccattgaatattgat
atacaattaatgattcaacgtattctactagaacaagctaatttcactgatatacaatca
gaactctttgatttaaaagcatttcaattcaatgaatccaatatgacaatgataaagtta
tctgaatggtcaaattggcctgatctacgttggatacctggatggaaacatttgatttat
tcattggaaaatgaatcagatgatttaatttatgaatggaataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
