Schistosoma mansoni: Smp_143660
Help
Entry
Smp_143660 CDS
T01095
Name
(RefSeq) mdn1, midasin-related
KO
K14572
midasin
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Pathway
smm03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
Smp_143660
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
smm03009
]
Smp_143660
Ribosome biogenesis [BR:
smm03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
Smp_143660
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWA_2
VWA_CoxE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8341244
NCBI-ProteinID:
XP_018652764
LinkDB
All DBs
Position
5:6488876..6544646
Genome browser
AA seq
2491 aa
AA seq
DB search
MATKCLYKINNCEQMRVMKQLLQELNFTIMNTNNSEWRSISHALIHITWPMLCEYGTCSF
TGKLTVYGWRYRQQAIQKANHLLYLSPKQETTNMSKNEYLHPLDPYIVVQVEEEAVKHEI
NYIRNELQFRENMQKLASGAYNNSLLPSLINANPLNINGHVNCGLLHPWLGVLVNRLHYL
KQKAETLKQQLGFSCENVLVTRQNSNFEIYRGLRVMFHETIAQNNSLNVTVSSMITNLVT
SLLPNTQNDNVILPVISGGQRLSRSLSLALELANSKSRRLIQQLFNSINNPTSFTGNVIG
VSHRIHETQFRISSFILNLLWLHNAEKHSSSNVTDIHNKLIGRILNSIILPLNQHWKQIE
LERKQLAESRASLFLEADHRKQLIRNDLQGIKSKKMKHHERSTSPDLIDQSLNEEVDWRL
RFSEIGCINAYTELGIHHNSQTVAKLEAIDKWLKNSLNGSGKYWIPEEKELVYFIKRLVY
LLLLNSNCTINYPLNSSLLIDKHSTTQSVDISSIFSWHWHTVLYGFNLASWLSIESKFSL
DPTIDEQTTLSYIGITAYMGQYDIRANPILPIHHLSKFSNTSFNHYCNTKSHCYNIYLDP
IPLEEAEKLNVLMRNLEKQIKHILTQWPGQPSLLRLLVIIHRIESFTVSDPLIKFVTGVE
MLWQVMQEWERDAAKHVSLNESSKEVCNLLVSWRKMELSYWLATLDSAEIQISNRCVTLW
FHLYDLFLRPGSYSRQLKSLYSKYQSKMSNSSCLKDNTGADDNDDHGRKRLELETDRFDA
LIELFEKGPIERSSSKRIVGNAVWFYAQFLPCVTEELSNLRHPIEKELKGLVNVTKWGHY
SRFWSVKTNVDRCKKSIHKHVKKWESILQQPVRPIFENAVKIPTYLKSNNGNNNNDHICS
SSLLKLEMTDLLAILKHCSFKKSFNNLQQLYGHFNEQEDQEQSKFNFTLHLNKRNHPSNN
EEDEEEDEELNKTRQWYQEFTALQQRKRLALSDWLKVATFKHSSTVINQSLDISDPTTKL
TESIDSTELINDGNEVEILSDNNDDDHLFEELNLPNLGLSYRRGQRQTQTGHMSRFLVQL
HGDPWSYVNQFIGRNLDVINTDSEDYFIHCVCNRLSRLISLRASLPSVPGPGDGDVDTSV
AILSEIGGPNNLSRLIGIMSDLLNQCSSEFKVCCEFTGISKKISRLVMEYANSLNVSMIT
SNDKQPVDDGNEQIIQYCTCYPLDLDKLKRIRISTQNLDQIIREHLYQWNVFWIVFQKQT
INEPFNISKLSCLFGSEGWTWLTNNPELLSTYTLENSKQLVEITESYMESLKLAFINVLT
CTTHLLGLNTFLWNNAVHEAYEKLSSSMKHLQEILNSLLNAYKTCNRVVLFASVFESVQQ
QINVEWNKIHCELSIISYDGIHNDSDLTNFHTTNLTTDNNLSSINSITYKSDMKFEQLTN
RLVHSMLKAIEILYDSDQINDNTDNKSDQLSLLHHYSTMISKVLTSTLPQINKYLINIRS
MLQERQSTLLKNEYEMVFQSRLIIIQCIYPLMDGLSKALCIRCIQFWHLLDIWFKLGEFA
MQITGRIITEGFCRPANLARDNQLTGDENSSSSSSSKADNEQSVDRGGESGGTSLTSNTN
DAVNAKDITNELECQEQIEGLLNDRKQQRDDNDLNKNRNEEDNNTNGIEMPDDDFDGQYD
DPDLENCDLDNDDSEQLEQENFDDKMDETDGHNNDDLAKEMWASDDEETDKDDNNKPKRD
SDGNKENDKTGGVEDDKPRNNRNKKADHDSGNIQEQKSKQHPESTEDDDGDNDEDHSDKL
DELENKSPKRKKPKHANETPGNRTTVANEDIMQDEMDNESDQPTDNKSESTQTKPSDDHE
TSDVDERDQGLPVDIDADQMNNEEDMTERDVEDLPDDPSSGQLDGEKDNEEESAINENEI
NENNKIETMDTDEQNTEIPENVEVFPYHGAGTSDLDDNNNKSNAFGGDEHNPQEDDKTET
NNVDHDDTDVNSSNQTSTQHSNQGNVSGEKYTTSTSQSDTSGANAEQQQQCQQDVKRNQT
HSGPKPTSDNRSLSNKQNALSKAETIEIDLEHCSEKQQSPLPNQNSELFQHLPNSEDLNA
HNEDDYPCVRDSATLDQAEQQLLGNSDPMKKSNDNDREEKDIGLENDNDNNIDDDGKLPI
SELEKTDASTNVLPQQNKHVKPLMKGNQVPGGHETVESDPTKEFVPTLSAQRPPESISCT
RAETRQLCETLRLVLEPTKASRLRGDYRTGKRINMRKIIPYLASQFRKDKIWLRRSQPSQ
REYRILIAVDDSSSMSENLCKQMTFESLTTVITALNLLEVGRIGVCSFGESVRVLHDLKD
PWVTDAGPRVLSQFTFGQPKTSLVQLLQCTIQLMNSTSYMNSTNTNAIPSQLLLILSDGV
FSEDPQSPSLQAAVRLARDSHIFPVCLILDDVRKKHSIFDLRRYCGPGKLQPYMDVFPLP
YYLVLRDLACLPNLLADALRQWFELESSIGR
NT seq
7476 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacaaaatgtttatataaaatcaataattgtgaacaaatgcgggttatgaaacag
ttgctacaggaattgaatttcactataatgaatactaataatagtgaatggcgttccata
agtcatgcacttattcatataacatggccaatgttatgtgaatatggaacttgttctttt
actgggaagctaacagtttatggttggcgttatcgtcaacaagctatacagaaagcaaat
catttattgtatttatctccaaaacaagaaacaaccaatatgtcaaagaatgaatattta
catccattagatccttatatagttgtacaggttgaagaggaagcagttaaacatgaaata
aactatattagaaatgaattacagtttcgtgaaaatatgcaaaagcttgctagtggtgca
tataataattctctattaccatctttaataaacgctaatccattgaatattaatggacat
gttaattgtggtttgctacatccatggttaggtgtacttgttaatcgattgcattatctt
aaacaaaaagctgaaacattaaaacaacaattaggatttagttgtgaaaatgttttagtt
acacggcaaaattcaaattttgaaatctatcgaggacttcgtgttatgttccatgagact
attgcacagaataattcattgaatgttactgtgtcttctatgattacaaatttagtgact
agtcttttgcctaatacacaaaatgataatgttattctaccagttatttctggtggtcaa
cgattatctcgatcattatcacttgcattagagttagccaattctaaatcaagacgatta
attcaacagttatttaattctattaataatccgacttcattcactggtaatgtgattggt
gtttcgcatagaattcatgagacccagtttcgaataagttcattcatattaaatttatta
tggttacataatgctgaaaaacattcatcttcaaatgtaactgatattcataataaatta
attggtcgtattctaaactcaatcatattaccattaaatcaacattggaaacaaattgaa
ttagaacgtaaacaattagctgaatcacgtgctagtctattcttagaagctgatcatcgt
aaacagctaattcgtaatgatttacaaggtattaaatcaaagaaaatgaagcatcatgaa
cgatctacatcacctgatttaatagatcaatcattaaatgaagaagtggattggcgtctt
cgtttctctgaaattggttgtataaatgcttatacagaattaggtattcatcataattca
caaactgttgccaaattagaagcgatcgataaatggttgaagaattcattgaatggttcc
ggaaaatattggatcccagaagaaaaggaattagtctattttataaaacgtcttgtttat
ttattattgttaaattcaaattgtacaataaattatccattgaattcatcattactaatt
gataaacatagtactactcaatcagtagatatcagtagtatattttcttggcattggcat
acagttctatatggttttaatttagctagttggttatcgattgaatcgaaattcagttta
gatcccactatcgatgaacagactactttgtcttatatcggtatcactgcttatatgggt
caatatgatatacgagctaatcctattttaccgatccatcatttgtccaaattctcaaat
acatctttcaatcattattgtaatactaaatcacattgttacaatatttaccttgatcct
attccattagaagaagctgagaaattaaatgtattaatgagaaatttagaaaaacaaatt
aaacatatactcactcaatggcctggacaaccgagtttattacgtctgttagttatcatt
catcgtattgaatcattcactgtatcagatccattaataaaatttgttactggagttgaa
atgctttggcaagtgatgcaggaatgggaacgtgatgcagccaagcatgtttctcttaat
gaatcaagtaaagaagtttgtaatttgttggttagttggcgtaaaatggaattaagttat
tggttggctacattagattcagctgaaattcaaatcagtaatcgttgtgtaacattatgg
tttcatctatatgatctatttctacgtcctggtagttatagtcgtcaattaaaatctctt
tattcaaaatatcaatctaaaatgagtaattcatcttgtctgaaagataacactggtgcg
gatgataatgatgatcatgggagaaaacgactagaattagaaactgatcgttttgatgct
ttaattgaattattcgagaaaggaccaatcgaacgttcatcatccaaacggattgtcggt
aatgcagtttggttttatgcacaatttctaccatgtgtaacggaagaattgagtaattta
cgacatccaattgagaaagaattaaagggtcttgtgaatgttaccaaatggggtcattat
tcacgtttctggtcagttaaaacaaatgttgatcgttgtaaaaagtcgattcataaacat
gtaaaaaaatgggaatcaatactacaacaaccagtacgcccaatatttgaaaatgcagtc
aaaataccgacttatctaaaatcaaataatggtaataataataatgatcatatatgttcc
agttcattgctaaaactggaaatgactgacttattagcaatactgaaacattgttcattt
aagaagtcatttaacaatctacaacaattatatggtcatttcaatgagcaagaagaccaa
gaacaatcaaagttcaatttcacattgcatttaaacaaaagaaatcatccaagtaacaat
gaggaagatgaggaagaagatgaagaattgaacaaaactcgtcaatggtatcaagaattt
acagctttacaacaacgtaaacgtctagcattatcggattggctaaaagttgcaactttt
aaacattcatctactgtcattaatcaatcacttgatatttctgatccaacaacaaagtta
actgaatcaattgattctactgaattaattaatgatgggaatgaagttgaaatcctgtca
gataataatgatgacgatcatttattcgaggaattaaatctacccaatcttggtttatca
tatcgtagaggtcaacgacaaacacaaactggtcatatgagtcgttttcttgttcaacta
catggtgatccatggagttatgttaatcagtttattggtcgaaatcttgatgttatcaat
actgattctgaggattacttcatacattgtgtatgtaatcgattatcacgattaatttct
ttacgtgccagtctaccatctgttcctggacctggtgatggagatgttgatacaagtgtt
gcaattttaagtgaaatcggtggaccgaataatttatctcgattaattggaataatgagt
gatttattaaatcaatgtagttcagagttcaaagtttgttgtgaattcactgggattagt
aagaaaataagtcgattggttatggaatatgcgaatagtttaaatgtatcaatgataaca
tccaacgataaacaaccggttgatgatggtaatgaacaaattatccagtactgtacatgt
tatcctttggatttggataagttaaaacggattcgtatatcaactcaaaatttagatcaa
attatccgtgaacatttgtatcaatggaatgtattttggattgtttttcaaaaacaaaca
attaatgaaccatttaatatatccaaattatcttgtctattcggttcagaaggttggaca
tggttaactaacaatccagaattattatcaacatatacactagaaaattcgaaacaatta
gttgaaatcactgaatcttatatggaatcattaaaattagctttcattaatgtattgaca
tgtactacacacttgcttggattgaatacatttttatggaataatgctgtgcatgaagct
tatgaaaaactatcttcatcaatgaaacatttacaagaaattttaaattctttactgaat
gcatataagacttgtaatcgtgttgtgttgttcgcttctgtgttcgagtctgtacaacag
cagattaatgttgaatggaataaaattcattgtgaattaagcatcatatcttatgatggg
atccataacgatagtgatttaacaaactttcatactactaatcttactactgataacaat
ttaagtagtataaatagcattacatataaatcagatatgaaatttgaacaattaactaat
cgtttagtgcattccatgcttaaagctattgaaattctgtatgattcagatcaaatcaat
gataatactgataataaatcggatcagttaagtttattgcatcattattcaacgatgatt
tcaaaagtattaacttcaacattacctcaaattaacaaatacttgataaatatccgttca
atgttacaagaacgacaatctacattgttaaagaatgaatatgaaatggttttccaatca
agactgatcatcattcaatgtatatacccattaatggatggtttatcaaaagcattatgt
atacgttgtatacaattttggcatttattagatatatggtttaaacttggtgaatttgca
atgcaaataactggacgtataattacggaaggattttgtcgtccagccaacttggctaga
gataatcaattaacaggtgatgaaaatagtagctcatcaagttcctcgaaagcagacaat
gaacaatcggtagatagaggtggtgaatcaggcggtacaagtttaacatcgaatacaaat
gatgcggtaaatgctaaagatattactaatgaattggaatgtcaagaacaaatcgaaggt
ttgttgaatgatcgtaaacaacaaagagacgataacgatttgaataaaaatagaaatgaa
gaagataacaatacaaatggtattgaaatgccagatgatgattttgatggacaatatgat
gatccagatttggaaaattgtgatcttgacaatgatgattcagaacaattggaacaagag
aattttgatgataaaatggatgaaacagatgggcataataatgacgatttagctaaagaa
atgtgggcgtcggatgatgaggaaactgataaggatgataataataaaccgaaacgtgat
tctgatgggaataaagaaaatgataaaaccggaggtgttgaagatgataaaccacgtaat
aacagaaataagaaagccgaccacgattctggtaatattcaagagcaaaaaagtaaacag
catccagaatctacggaagatgatgatggtgacaatgacgaagatcattctgacaaactt
gatgaacttgagaataaatcaccgaaacgcaagaaaccaaagcatgcaaatgagactccc
ggcaatcgaactactgtggcaaatgaagatataatgcaagatgaaatggataatgaatcc
gatcaacctactgataataaatcagaatcaactcaaacaaaaccgagtgatgatcatgaa
acctcggatgttgatgaacgtgatcaaggtttacctgtagatattgatgctgaccaaatg
aataatgaagaagatatgacagaaagagatgttgaagatttgccagatgatccatcatct
ggtcaattagatggagagaaagataacgaagaggaatctgcaataaatgagaatgaaatc
aatgaaaataacaaaattgaaactatggatactgatgaacaaaacacagaaattcctgaa
aatgttgaagtatttccttatcacggagctggtacaagtgatttggatgacaataataat
aaatctaatgctttcgggggagatgagcacaatcctcaagaggatgataaaacagaaacc
aataatgtcgatcatgatgatactgatgttaattcttccaatcaaacttctacacaacat
agcaatcaaggaaatgtttcaggtgaaaaatatactacatccactagtcagtcagatact
tccggagccaatgcagaacagcaacaacagtgtcagcaagacgttaaaagaaatcaaaca
cactctggtccaaaaccaacatcagacaatcgaagcttatcaaacaaacaaaatgctcta
tctaaggctgaaaccatagaaatagacttggaacattgttcagaaaagcaacaatcgccg
ttgcctaatcaaaactcagaactatttcaacatttaccaaattcagaagacttaaatgct
cacaatgaagatgattatccgtgtgttcgtgattctgctacattagatcaagctgaacag
caattattaggcaacagtgatccaatgaagaaatctaatgataatgatcgagaggagaaa
gatattggattagaaaatgacaatgacaataacattgatgacgacggaaaattacccata
tctgaattagagaagactgatgcctccacaaatgtattacctcaacaaaataaacatgta
aaacctttaatgaaaggaaatcaagtacccggtggtcatgaaacagttgaatcagatcca
acaaaagaatttgtcccaactttaagcgcacaaagaccacctgaatcaatcagttgtaca
agagctgaaacacgtcaattatgtgaaacacttcgtttagttcttgaaccaactaaagct
tcacgtttacgtggagattatcgaacaggaaaacgtatcaatatgcgaaagattattcca
tatttagctagtcaatttcgtaaagataaaatttggctacgtcgttcacagcctagtcaa
cgtgaatatcgtattttaattgctgtagacgattcatcatcaatgtctgaaaatctttgt
aaacaaatgacttttgaatcattgacaacagtaatcactgcattaaatcttttagaagta
ggtcgaataggtgtttgcagtttcggtgaatcagtacgtgtacttcatgatttaaaagat
ccatgggtaacagatgctggtccacgtgtattaagtcaattcacttttggacaaccgaaa
acatcacttgttcagctattacagtgtactattcaactgatgaattcaactagttacatg
aattctaccaatactaatgctattcctagtcaattattacttattctatcagatggtgtc
ttctcagaagatccacaaagtccatcactacaagctgctgttcgactagcacgtgattct
cacatattcccagtttgccttattctagatgatgttcgaaagaagcattctatatttgat
cttcggcgatattgtggccccggtaaactacaaccttatatggacgtattcccattacca
tattatttagtgttacgagatttggcttgtctaccgaatctacttgctgatgccttaaga
caatggtttgagttggaatcatcaattggacgctaa
DBGET
integrated database retrieval system