Schistosoma mansoni: Smp_143670
Help
Entry
Smp_143670 CDS
T01095
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K15216
RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
smm03021
]
Smp_143670
Transcription machinery [BR:
smm03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
Other transcription-related factors
Transcription initiation factors
Smp_143670
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRN3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8341245
NCBI-ProteinID:
XP_018652765
UniProt:
G4VKF6
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(<6548438..6552828)
Genome browser
AA seq
623 aa
AA seq
DB search
MDPENNPSSNHIQDIIDLIKQSNDNFKSFKLIREKFSNSISTTEFNDFLSILTNHLHELT
SNHVKKLLLDNINTLNWFTYNHNSVVYLNIINLYITSLTYYPNLLYDICEFYINQIFYIK
DFINEQLKIEDLNQFIDFSIDFFISLCQMIPQSITIIIDLLIKRFPNWRKSIKELIWATY
QLLYLLSNQKSSKLLTHTHKCDIVSILFRVIIDLELNPDGIQSENLLVLLDNTTNNTTDN
TTTTSGSSTTDNTTNINLMFHQFDPMMLKTNLTHFFHTIQQLIIHDKNWLKLELVCWLLI
THISSICTECNKNSSIELNWNLLCSIFRRVRDLFSEHILPVNVTMVAFPMICFYICSLRG
GLVINFIDFLWNIIKDHCRDQGSRLMALSYLCFLLVNGKFCFIDLIIEIMHDMATWCIDY
AYRHRGVLMTASNSTTSLSDNKLYYAICNVLIYIFVQLHSELLDDEHFQSCNRLPIAQIS
ISPFKPLVHIPKELRQLFFRIISTYHLSWSMLGLTQSIHDQDHLNNEIPLTIEMIQSMIP
SQMIHIPKNQCLLSLSSPIMNCLFRNIHLGKRFINQQVDNSEDHSKSTSVPLTSSSRRKR
KAESDNEESMTNESITKATQESE
NT seq
1872 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccagaaaacaatccatcatctaatcatatacaagatatcatagatctgatcaaa
caatctaatgataattttaaatcatttaaattaatacgtgaaaaattttcaaattcaata
tctactactgaatttaatgatttcttatcaatattaactaatcatctacatgaattaaca
tcaaatcatgtcaagaaattactcttagataatattaatacattaaattggtttacttat
aatcataattcagtagtatatctaaatataataaatttatatataacaagtttaacatat
tatccaaatttattatatgatatttgtgaattttatattaatcaaatattttatataaaa
gattttataaatgaacaattgaagattgaagatttgaatcaatttattgatttttcaatc
gatttttttatatctttatgccaaatgataccccaatccataacgatcattattgattta
ttgattaaacgatttccaaattggcgtaaatcaataaaagaattaatttgggcaacttat
caactattatatctattatctaatcaaaaatcatcaaaattattaacacatactcataaa
tgtgatattgtatctatactgtttcgtgtaattattgatttagaattaaatcctgatgga
atacaaagtgagaatttattagtattattggacaatactactaataatactactgataat
actactactactagtggtagtagtactactgataatactactaatataaatttaatgttt
catcaatttgatccaatgatgttaaaaaccaatttgactcatttctttcatactattcaa
caattaatcattcatgataaaaattggttaaaacttgaacttgtttgttggttattaata
acacatataagtagtatatgtacagaatgtaataaaaattcatctatagaactgaattgg
aatttattatgttccatatttcgtcgtgtacgtgatttattttctgagcatattctaccg
gtgaatgttactatggtagctttccctatgatttgtttttatatatgtagtttacgtggt
ggattagtaatcaattttattgattttttatggaatattattaaagatcattgtcgtgat
caaggaagtcgtcttatggcattatcttacctttgttttttattagttaatgggaaattt
tgttttattgatctgattatcgaaatcatgcatgatatggctacatggtgtattgattat
gcctatcgtcatcgtggagttcttatgaccgcttcgaattcgacgacttctttatcagat
aataaattatattatgctatatgtaatgttttaatttatatatttgtacaattacattca
gaattattggatgatgaacactttcaaagttgtaatcgcttgcctatagcacaaattagt
atatcaccatttaaaccattagtgcatataccgaaggaattacgtcaactattttttcgt
attatatctacttatcatttaagttggtctatgcttggtttaacacaatctattcatgat
caagatcatttgaataatgaaattccattgactatagaaatgattcaatcaatgatacca
agtcaaatgattcatataccaaagaatcaatgtttattatcactttcatcaccaattatg
aattgtttatttcgtaatattcatttagggaaacgttttataaatcaacaagttgataat
tcagaagatcattctaagtctacttcggttccattaacatcatcgtctcgtagaaaacgt
aaagcagaatcagataatgaagaaagtatgactaatgaatctattacaaaggctactcaa
gaatcagaatag
DBGET
integrated database retrieval system