Schistosoma mansoni: Smp_143680
Help
Entry
Smp_143680 CDS
T01095
Name
(RefSeq) putative laminin
KO
K05637
laminin, alpha 1/2
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Pathway
smm04512
ECM-receptor interaction
smm04518
Integrin signaling
smm04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
Smp_143680
04518 Integrin signaling
Smp_143680
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
Smp_143680
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
Laminin_N
EGF_LMN_ATRN
Laminin_B
Laminin_G_2
Laminin_G_3
EzrA
TPR_MLP1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8341246
NCBI-ProteinID:
XP_018652766
LinkDB
All DBs
Position
5:<6558477..6668129
Genome browser
AA seq
3085 aa
AA seq
DB search
MDPDSILEENAIITANATCGIGRKEYFCRLVEHADGFITYDGRLHRTPREVLTYSQEAKS
YRDPSGQWVQCGYCDDRDPNLRHPIEYVLSGEANLWWQSPSLAQGLQYHAVTITMDFRQV
YQIVYVLLRMGDSPRPANWILERSVDGEVYHPWVFFAKTEYDCKKLYEPLIDRPLTITSG
PRPWHLGDDEVYCTTFYSQPQALQSGEIIVTLTLDRESTISTESGLESPISSKLIDFLSA
RFVRLRFQQLQTLSGDWMAMPNQLDSSVYNRYYYSIRTIKVGGKCVCNSHASRCEQKVID
GVPRAVCDCQHNTCGNNCEKCCPLFNQQPWRPGRICEECNCNQKADECIYNQTVANLRLS
MRKDGVLEGGGVCLNCREDTTGVNCEKCKQGYYRPLNVRPDSQYPCRPCECSTFGSTGDC
TSNDAEIPERYPGDCICKEGYAGRRCDECAEGYQRSNIDPQLCIPCTCDIRGSHRGPGYQ
CEPPCNCKINVDPDSYCNTCQKGFFNLDVNNPEGCQSCYCSGLTDRCTGVTPSTAMVNTL
ANWKIIVPSLSTPDTGYTIPMTETSVQYDKVLFAQTRTVEAWLSSVTSTPVTRGYYWSAP
EAYLGNQITAYRDTLNIILRFNSPTMLTYRQPTIPTDISGSRQFSMSMAMTDHLNYIHMI
LNIPLSESSFRVIVEPPTSIPLDRFPISWLQGDQLRFDESTLERVGRPATIADIMTVLSS
IDRLMIKAKYITDQTTTELMSVTLGRAIRDEIGGIPNIEECICPNGYSGSSCESCAIGYY
RDYQKQSMIQTNQTSFTSSTALSLWRSTMMTQLPVCVLCECHGHSDICDEKTGVCIDCAH
NTAGDKCDICAPGFYGDPRTGDPKACKSCECPHLDYQMTTVCLAHEEELFKEEKPYVCLD
CTENTRGRYCEVCAEMYYGDPLNGVPCRPCNCGPAAIGCNATNGACICGFNTAGPQCDAC
AEGTHGDPTRGQPCRPCNCHPKGSISPSCRLEDGQCNCLSTYEGVRCDRCIPGRGNTEAG
CPPCQCDPIGTRPEYLTMCDPVSGQCSCKPGVGGTLDCSTCQIGYYNLGPNGCTECKCTS
RAIDRTCNPITGQCKCGENVIGDTCDKCLPGYYWNNTGSNCLPCSCGIGTELTRTLTQLT
ECDMNTGQCKCAPHVVGRDCTECELGYFGVSESGCKPCLPCPNGQVCDQITGKCICPPNT
EGDRCDKCIAGSWDYNPVIGCKNCNCSIDGSVIGLEDQCDLITGQCTCKPEFSGRACNEC
SKGYYGYPDCRKCNCDMRGTAWGNLSISDTVVPCNPKDGQCNCKENVEGDQCDQCKPGTF
GLNIDYPLGCYSCFCFPTGTPSRCSLLTGYRSVPGKVKGVEIISTDDPRYPGGPLIDLKL
GLRDIDVNELTIGLSQFSWRFSVHRPTHLEIPELKGSLTRNYGSVIIGVLTECLPTGDCK
LGIEDAQTTTTTILSTRDDLPGGLIIRRNDIVDARMTALNGYIEMEYQPSENSPTSIADG
YRQIWLREQDWVLTRVSGIDTRVRPTRNELMLALLNVTSFSVRLFMPEARPKLVSVKYKI
YQPRTEITTLSGIEIKTIEKCECPPTASGDHCEIASSGFYFPPIKPKPGREILPPTSIID
PTLPTGHIIWEGGAQKCRCHGMSSNCDPITGICLDCTGNTEGPNCGNCATGYMGDPKIGQ
PCVKCQCPTEQTDYAITCTPSTDPSFLPHKCICKVGYAGLRCEQCAPGYYGDPTSMTACQ
ACDCDIGGSRSETCNQDTGQCDCWPGIKGRRCDQCEEDHVVDHGTCRANSITRFKTNLYT
TRIDNTYNPIEQESKRIIDSLIPSDQLNRTYLAYNAYQFIIDNINLAENATNEAENAFFN
STTTIDELQTTENDLSTLNQIAKNNLKLTKDITNKVDSIQQFLKDTKPLVQNASDKLQVQ
LGRYNELHDRLQGMENRFSQIQGTAKTLVDRANITQSYLIKSIDEAETVARQLDSKLLNL
RRLADEARSMLDVNYGSLSHDPVPLQLGQDCVYTLVPYSLTKSRVFDIEFWFNLNNLPTL
SSISSVLMVGRRAFEGHTQMFAFTIEAPDARLRFSWNTPNGILELGPVTTNTWYHTRVTS
VGGETRMILMERPFQDRGDVFPEIRQTATTNGTLDQEANLIMDRQMELRIGGVMQSSSRL
SNPEAWGDNGAEEFWSRLMSMESIKFCMFNLRLSGTPISIANFADANLECSKPKEYQCQX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTPLKEYQRSNMTVMTFLNYDKDYGITIELMNGRPEAYYWSGRELYQLD
NTRQHNDIEIIRRRRFKLFNFKPRWKRQSTIYGSGTGHHDEDRRRLNLNILDPSMRILRL
DNFMTTDCNDDMILFLGGIPPSHYELRKRMKNLGFLLTPFAGRIGFTNGKPSQSGEVYLA
DYAITSVNQFGDTQFTDSRQLGEIRTIGHAEWIRIFLTEDHRLGIVIPGVSKTLYTRTSL
TSRALNDPYTNLLNLELIEYMNLTTVLPVWNNLNKQIQYFDSKQAEIEIVVTLYFGKIDT
EQLTVLFDQHIVQTWTIPKQPDIKNIRQIYIGPQLMPSYPITIEYLIIGKHLVDFTTELV
SKDNPYGSQVGICGGQLYPRFTERRGLAGLVTSKLQGLELTAPPSGRQLIFTPFNELLTK
QIIPGVSYDEQSVLENIRTGDGKIRKKNDCTENAENTAWFDQYPDSYWEIGNIGTIIQQQ
TTPFEFTIGFRAQLANTAIIGEHLSLSGVEEIEENVYSLLAAFNFDTTWHRLKLIFQSTN
SIEEQNGPGVENGLQLLFDHRHFWLPPVEIFNLPSVVFIGGLPRVLNLQLQENRQLSNIY
GLFGCVDELTMNNVIPEMFTQPGHDKLTFDFSFFYDRNTIKQASLFVLTFGGTIDQPSEE
IHLWLFLSNNEVKMGYITESNDELELNHEVNLANIGHNQNIWHYIKLDITFINRNPLFQL
KSQTSISDTLAPFMKASRLISIHLGRNTVLTPDKMKKSTYNYHGEMFRGCMRSLHLSTLT
EIRNINLPEDLPGFLYGLCHTSLVW
NT seq
9258 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcctgattcaattttggaagagaacgccataattacagcaaatgctacatgtggc
ataggtcgtaaggaatatttctgtcggcttgtcgaacatgctgatggctttatcacctac
gatggtcgcctacaccggacaccaagggaagttttgacgtacagccaggaagccaaatct
tatcgtgacccaagtgggcaatgggtgcaatgtggttattgtgacgatagagatcctaat
ctacggcatccaattgaatatgttctcagtggtgaggccaatttgtggtggcaaagccca
tctttggcacaaggtttacaataccatgcggttacaattactatggactttcgccaggta
tatcaaatagtctatgttcttttacgtatgggtgatagtccacgaccagctaattggatc
ctagaacgttcagtagatggtgaagtatatcatccatgggtattttttgctaaaactgaa
tatgactgtaagaagttatatgaaccattaattgatcgaccattaactattacaagtgga
ccaagaccatggcatttgggtgatgatgaagtttattgtacaacattttatagtcaacct
caagcattacaatcgggtgaaattattgtaaccttaacattggatcgtgaaagtaccata
tctactgaatcaggtcttgaaagtcctatatcatcaaagttaattgatttcttatctgca
cgatttgtacgactacgttttcaacaattacaaacactttctggtgattggatggctatg
ccaaatcaattagacagttcagtttacaataggtactattattcaattcgaacaattaaa
gttggcgggaaatgtgtatgcaatagtcatgctagtcgatgtgaacagaaagtaattgat
ggtgtacctcgagccgtatgtgactgtcagcataatacatgcggaaacaattgtgaaaag
tgttgtccattattcaatcaacaaccatggcgtccagggagaatatgtgaagagtgtaat
tgtaatcaaaaggcagatgaatgtatttataatcaaacagttgctaatcttcgtttaagc
atgcgtaaagatggtgttctagaaggtggaggagtttgtttaaattgtcgtgaagataca
actggtgtcaattgtgaaaaatgtaaacaaggttattatcgcccattaaatgttcgacct
gactcacaatatccctgtagaccatgtgaatgtagtacttttggttcaactggtgattgt
acatcgaatgatgctgaaataccggaacgatatcctggagattgtatctgtaaagaaggt
tatgcaggtagacgttgtgatgaatgtgctgaaggctatcaacgttctaacattgatcct
caattatgtataccatgtacatgtgatattagaggaagtcatcgtggtccaggatatcaa
tgtgaaccaccatgtaactgtaaaattaatgttgatccagactcttattgtaatacatgt
caaaaaggatttttcaatttagatgttaataatccagaaggttgtcaatcatgttattgc
tctggtcttacggatagatgtactggtgttactccatctactgcaatggtcaatacttta
gcgaattggaaaattattgtaccaagcttatcaacaccagataccggttacacaatacca
atgactgaaacatcagtacaatatgataaagttttattcgctcaaacacgtacagttgaa
gcttggctttcatcagttacttcaacaccagttacacgtggttattattggtcagcaccg
gaagcatatttaggcaatcaaattacagcttatcgtgatacattgaatatcattttacgt
tttaattcaccaactatgttaacatatcgtcaaccgacaatacccacagatatatcaggc
agtagacaattttctatgtcgatggctatgactgatcatttaaattatattcatatgatt
ttaaatattccattaagtgaatcatcattccgtgtaattgttgaaccaccaacctctata
ccattagatcgttttccaataagttggttacaaggtgatcaattaagatttgatgaatca
acattggaacgagttggtcgaccagcaacaatagctgatatcatgactgtattatccagt
atagatagattaatgattaaagctaaatatattactgatcaaacaacaactgaattaatg
tctgttacacttggtcgtgctatacgtgatgaaattggtggaataccaaatattgaagaa
tgtatttgtccaaatggttattcaggatcatcatgtgaatcatgtgccattggttattat
cgtgattatcaaaaacaatcaatgatacaaacgaatcaaacttcttttacttcatcaaca
gcattatcattatggcgttcaactatgatgacacaattacctgtttgtgtattatgtgaa
tgtcatggacattcagatatttgtgatgaaaagactggagtatgcattgattgtgctcat
aatactgccggagataaatgtgacatctgtgcaccgggattttatggggatccacgtacc
ggtgatccaaaagcatgtaaatcatgtgaatgtccacatttagattatcaaatgactaca
gtttgtttagcacatgaagaagaattatttaaagaggagaaaccatatgtttgtttagat
tgtacagaaaatactcgaggtcgatattgtgaagtatgtgcagaaatgtattatggtgat
ccactgaatggggtaccatgtcgtccatgtaattgtggacccgctgctataggatgcaat
gcaacaaatggagcttgcatctgtggatttaatacagctggaccgcaatgcgatgcatgc
gctgaaggaacacatggagatccaactagaggacaaccatgtagaccttgtaattgtcat
ccaaaaggtagtatctctccatcatgtagacttgaagatggtcaatgtaattgtttatca
acatatgaaggtgttagatgtgatcgttgtatacctggtcgtggtaatacagaagctggt
tgtccaccatgtcaatgcgatcctattggtactagaccagaatatttaacaatgtgtgat
ccagtctctggacaatgttcttgtaaaccaggagttggtggtactttagattgttcaaca
tgtcaaataggatattacaatctaggtccaaatggatgtacagaatgtaaatgtacttca
agagcaatcgatcgaacatgtaatcctatcacaggtcaatgtaaatgtggtgagaatgta
attggagatacatgtgataaatgtttgcctggatactattggaataacactggttcaaat
tgtttaccatgtagttgtggaattggaactgaattaactagaacactaactcagttaact
gaatgtgacatgaatactggtcagtgtaaatgtgctccacatgtggtaggacgagactgt
acagaatgtgaattaggatattttggtgtttctgaaagtggttgtaaaccttgcttacct
tgtccaaatggtcaagtttgtgatcagattactggaaaatgtatttgtccaccaaatact
gaaggtgatcgatgtgataaatgtattgctggatcatgggactataatccagtgattggt
tgtaaaaattgtaattgttcgatagatggttccgttataggccttgaagatcaatgtgat
ttaatcacaggacaatgtacatgtaaaccagaattttcaggtcgtgcatgtaatgaatgc
agtaaaggttattatggttatcctgattgtagaaaatgtaactgtgatatgcgtggtact
gcatggggaaatctatccatatcagatacggttgtaccatgcaatccaaaagatggacag
tgcaattgtaaagaaaatgttgaaggtgatcaatgtgatcaatgtaaaccaggaactttc
ggtttaaatattgattatccacttggttgttattcatgtttctgttttccaactggtaca
ccatccagatgtagtctattgacaggttatcgttctgttccaggaaaagtgaaaggagtt
gaaataatttctactgatgatccacgttatccaggtggaccgttgattgatttaaaactt
ggtttaagagatattgatgtaaatgaattaactattggtttaagtcaattcagttggcgt
ttctctgtacatcgtccaactcatttggaaataccagaattaaaaggttcactaacgcgt
aactatggaagtgtaattataggtgtattgacagaatgtttacctactggtgattgtaaa
cttggcattgaagatgcacaaactactactactaccatactatcaactagagacgattta
cctggaggtttaattatacgtagaaatgatattgtagatgctcgaatgacagcattaaat
ggttacatcgaaatggaatatcaaccatctgaaaattcacctacatctatagcggatggt
tatcgtcaaatttggcttcgtgaacaagattgggtattgacacgtgtatctggtattgat
acacgtgttcgaccaacacgtaatgaattaatgttagctttacttaatgttacatcattt
agtgtacgtttatttatgcctgaagcaagaccaaaacttgtaagtgtaaaatataaaatt
taccaaccacgtacagaaataacaacactatctggaatcgaaattaaaacaattgaaaaa
tgtgaatgtccaccgactgcatccggtgatcactgtgagattgcttcatctggattttat
ttcccaccaatcaaaccaaaacctggacgtgaaattctaccaccaacctctataattgat
cctacccttccaacaggacatataatttgggaaggtggagcccagaaatgccgttgtcat
ggtatgtcttcgaattgtgatccaatcactggaatatgcttggattgtactggtaacaca
gaaggtccaaactgtggaaattgtgctacaggttacatgggtgatccgaaaattggacaa
ccatgtgttaaatgccaatgtcctacagaacaaactgattatgcaatcacgtgtacacca
tcaaccgatccttcatttttaccacataaatgtatttgtaaagtaggctatgctggttta
cgatgtgaacaatgcgctcctgggtattacggtgatccaacaagcatgactgcgtgtcaa
gcatgtgattgtgatattggcggatcaagatcggaaacatgtaatcaagatactggacaa
tgtgattgctggcctggtattaaagggcgtagatgtgaccaatgtgaagaagatcatgtt
gttgatcatggaacgtgtcgtgcaaattcaattaccagattcaagacaaatttatatacc
accagaattgataacacatacaatccaatagaacaagaatcaaaacgtatcattgatagt
ttaataccatcagatcaattaaatcgtacttatttagcctataatgcatatcaattcatt
attgataatataaatttagctgagaatgcaacaaatgaagcagaaaatgcattttttaat
agtactacaactatagatgaattacaaactactgaaaatgatttaagtacattaaatcaa
attgctaaaaataatttaaaattaacaaaagatataacaaataaagttgattcaatacaa
caatttttgaaagatacaaaacccttagttcaaaatgcctcagataaattacaagtacag
ttagggcgttataatgaactacatgatcgtttacaaggaatggagaatcgattttctcaa
atacaaggaacagctaaaactctagttgatcgagcaaatattactcaatcatatttaatt
aaatcaattgatgaagctgaaactgttgctagacaattggattcaaaattattaaattta
cgtcgattagctgatgaagcacgttcaatgcttgatgtaaattatggttcattatctcat
gatccagttcctttacaattaggtcaagattgtgtatacacattggtcccgtatagtcta
acaaaatctcgagtgtttgatattgaattttggtttaatttaaataatttaccaacttta
tcaagtataagtagtgtattaatggttggacgtagagcttttgaaggacatacacaaatg
tttgcattcactattgaagcacctgatgctagattacgcttttcatggaatactccaaat
ggaatcttagaactaggtccagttactacaaatacttggtatcatacacgtgttacatca
gttggtggtgagacaagaatgatactcatggaaagaccattccaagatcgtggtgatgta
tttcctgagataagacaaacagctacaacaaatggaacacttgatcaagaagcaaatctt
attatggatagacaaatggaattacgtattggaggagttatgcaatctagtagtcgttta
agtaaccccgaagcgtggggtgataatggtgctgaggaattctggtcacgacttatgtca
atggaatcaatcaaattttgtatgttcaacttaaggttaagtgggacgcctattagtatt
gctaattttgctgatgctaatcttgaatgttctaaaccaaaagaatatcagtgtcaattn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaccattaaaagaatatcaacga
tctaatatgacagtaatgacatttttaaattatgataaagattatggtataacaattgaa
ttaatgaatggtcgacctgaagcttattattggtctggtcgtgaattatatcaattagat
aatactagacaacataatgatattgaaattataagacgacgtcgttttaaattattcaat
tttaaaccacgttggaaacgtcaatctactatatatggcagcggtactggtcatcatgat
gaagatagacgacgattaaatttaaatatattagatccatctatgcgtatattacgatta
gataattttatgacaacagattgtaatgatgatatgatattatttttaggtggtatacca
cctagtcattatgaattacgtaaacgaatgaaaaaccttggctttttattaactccattt
gccggacgcattggtttcacaaatggtaaaccaagtcaatctggtgaagtctatttagct
gattatgcaattacttcagtgaatcaatttggagatacacagtttactgattctagacaa
cttggtgaaattcgaactattggacatgcagaatggatacgtatattccttacagaagat
catcgtttaggtattgttataccaggcgtcagtaaaacattatacactcgaacatcttta
acatcacgtgcattaaatgatccatatacaaatttattaaatttagaattaatagaatat
atgaatttaacaacagttctaccagtatggaataatttaaataaacaaatacaatatttt
gattctaaacaagctgaaattgaaattgttgttacattatattttggtaaaattgataca
gaacaattaactgtattatttgatcaacatattgtacaaacatggactataccaaaacaa
ccagatataaaaaatatacgacaaatatatattggaccacaattaatgccatcatatcct
attactatagaatatttaatcattgggaaacacctagtggacttcacaactgaattagta
agtaaagataatccatatggtagtcaagttggaatatgtggtggacaattatatccacga
tttacagaacgtcgaggtttagctggactagtaacaagtaaactacaaggacttgaatta
acagcaccaccaagtggacgacaattaatatttacaccattcaatgaattattgactaaa
caaattattccaggagtaagttatgatgaacaatcggttttagaaaatatacgtactggt
gatggaaaaattcgtaaaaagaatgattgtactgaaaatgctgaaaatacagcttggttt
gatcaatatcctgattcatattgggaaattggtaatattggtacaattattcaacaacaa
actacaccttttgaattcactattggatttcgtgcacaattagctaatactgctattatt
ggtgaacatttatcattatctggtgttgaagaaattgaagaaaatgtctatagtttatta
gctgcatttaattttgatacaacatggcatcggttaaaattaatatttcaatcaactaat
tcaatagaagaacaaaatggtcctggtgttgaaaatggattacaattattatttgatcat
cgtcatttttggctaccacctgtggaaatatttaatttgccatcggttgtatttattgga
ggtttacctagggtgctcaatttacaattacaagaaaatcgtcaactttccaatatttat
ggtttattcggatgtgtcgatgaattaacaatgaataatgttataccagaaatgtttact
caacctggacatgataaattaacatttgattttagtttcttttatgatcgtaatactata
aaacaagctagtttatttgtattaacatttggtggaacaattgatcaacctagtgaagaa
attcatttatggttattcctatcaaataatgaagttaaaatgggttatataacagaatcc
aatgatgaattagaattaaatcatgaagtgaatctggctaatattggacataatcaaaat
atttggcattatattaaattagatataacatttattaatcgtaatccattatttcaatta
aaatctcaaacatcaattagtgatacattagcaccatttatgaaagctagtcgattgata
tcaatacatcttggacgtaatacagttttaacaccagataaaatgaaaaagtcaacttat
aattatcatggtgaaatgtttagaggttgtatgcgtagtttacatttatcaacactcaca
gaaatacgtaatattaatttaccagaagatttaccaggatttctgtatggtctttgtcat
acctcattggtttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system