KEGG   Schistosoma mansoni: Smp_143680
Entry
Smp_143680        CDS       T01095                                 
Name
(RefSeq) putative laminin
  KO
K05637  laminin, alpha 1/2
Organism
smm  Schistosoma mansoni
Pathway
smm04512  ECM-receptor interaction
smm04518  Integrin signaling
smm04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    Smp_143680
   04518 Integrin signaling
    Smp_143680
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    Smp_143680
SSDB
Motif
Pfam: EGF_laminin Laminin_N EGF_LMN_ATRN Laminin_B Laminin_G_2 Laminin_G_3 EzrA TPR_MLP1_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 8341246
NCBI-ProteinID: XP_018652766
LinkDB
Position
5:<6558477..6668129
AA seq 3085 aa
MDPDSILEENAIITANATCGIGRKEYFCRLVEHADGFITYDGRLHRTPREVLTYSQEAKS
YRDPSGQWVQCGYCDDRDPNLRHPIEYVLSGEANLWWQSPSLAQGLQYHAVTITMDFRQV
YQIVYVLLRMGDSPRPANWILERSVDGEVYHPWVFFAKTEYDCKKLYEPLIDRPLTITSG
PRPWHLGDDEVYCTTFYSQPQALQSGEIIVTLTLDRESTISTESGLESPISSKLIDFLSA
RFVRLRFQQLQTLSGDWMAMPNQLDSSVYNRYYYSIRTIKVGGKCVCNSHASRCEQKVID
GVPRAVCDCQHNTCGNNCEKCCPLFNQQPWRPGRICEECNCNQKADECIYNQTVANLRLS
MRKDGVLEGGGVCLNCREDTTGVNCEKCKQGYYRPLNVRPDSQYPCRPCECSTFGSTGDC
TSNDAEIPERYPGDCICKEGYAGRRCDECAEGYQRSNIDPQLCIPCTCDIRGSHRGPGYQ
CEPPCNCKINVDPDSYCNTCQKGFFNLDVNNPEGCQSCYCSGLTDRCTGVTPSTAMVNTL
ANWKIIVPSLSTPDTGYTIPMTETSVQYDKVLFAQTRTVEAWLSSVTSTPVTRGYYWSAP
EAYLGNQITAYRDTLNIILRFNSPTMLTYRQPTIPTDISGSRQFSMSMAMTDHLNYIHMI
LNIPLSESSFRVIVEPPTSIPLDRFPISWLQGDQLRFDESTLERVGRPATIADIMTVLSS
IDRLMIKAKYITDQTTTELMSVTLGRAIRDEIGGIPNIEECICPNGYSGSSCESCAIGYY
RDYQKQSMIQTNQTSFTSSTALSLWRSTMMTQLPVCVLCECHGHSDICDEKTGVCIDCAH
NTAGDKCDICAPGFYGDPRTGDPKACKSCECPHLDYQMTTVCLAHEEELFKEEKPYVCLD
CTENTRGRYCEVCAEMYYGDPLNGVPCRPCNCGPAAIGCNATNGACICGFNTAGPQCDAC
AEGTHGDPTRGQPCRPCNCHPKGSISPSCRLEDGQCNCLSTYEGVRCDRCIPGRGNTEAG
CPPCQCDPIGTRPEYLTMCDPVSGQCSCKPGVGGTLDCSTCQIGYYNLGPNGCTECKCTS
RAIDRTCNPITGQCKCGENVIGDTCDKCLPGYYWNNTGSNCLPCSCGIGTELTRTLTQLT
ECDMNTGQCKCAPHVVGRDCTECELGYFGVSESGCKPCLPCPNGQVCDQITGKCICPPNT
EGDRCDKCIAGSWDYNPVIGCKNCNCSIDGSVIGLEDQCDLITGQCTCKPEFSGRACNEC
SKGYYGYPDCRKCNCDMRGTAWGNLSISDTVVPCNPKDGQCNCKENVEGDQCDQCKPGTF
GLNIDYPLGCYSCFCFPTGTPSRCSLLTGYRSVPGKVKGVEIISTDDPRYPGGPLIDLKL
GLRDIDVNELTIGLSQFSWRFSVHRPTHLEIPELKGSLTRNYGSVIIGVLTECLPTGDCK
LGIEDAQTTTTTILSTRDDLPGGLIIRRNDIVDARMTALNGYIEMEYQPSENSPTSIADG
YRQIWLREQDWVLTRVSGIDTRVRPTRNELMLALLNVTSFSVRLFMPEARPKLVSVKYKI
YQPRTEITTLSGIEIKTIEKCECPPTASGDHCEIASSGFYFPPIKPKPGREILPPTSIID
PTLPTGHIIWEGGAQKCRCHGMSSNCDPITGICLDCTGNTEGPNCGNCATGYMGDPKIGQ
PCVKCQCPTEQTDYAITCTPSTDPSFLPHKCICKVGYAGLRCEQCAPGYYGDPTSMTACQ
ACDCDIGGSRSETCNQDTGQCDCWPGIKGRRCDQCEEDHVVDHGTCRANSITRFKTNLYT
TRIDNTYNPIEQESKRIIDSLIPSDQLNRTYLAYNAYQFIIDNINLAENATNEAENAFFN
STTTIDELQTTENDLSTLNQIAKNNLKLTKDITNKVDSIQQFLKDTKPLVQNASDKLQVQ
LGRYNELHDRLQGMENRFSQIQGTAKTLVDRANITQSYLIKSIDEAETVARQLDSKLLNL
RRLADEARSMLDVNYGSLSHDPVPLQLGQDCVYTLVPYSLTKSRVFDIEFWFNLNNLPTL
SSISSVLMVGRRAFEGHTQMFAFTIEAPDARLRFSWNTPNGILELGPVTTNTWYHTRVTS
VGGETRMILMERPFQDRGDVFPEIRQTATTNGTLDQEANLIMDRQMELRIGGVMQSSSRL
SNPEAWGDNGAEEFWSRLMSMESIKFCMFNLRLSGTPISIANFADANLECSKPKEYQCQX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTPLKEYQRSNMTVMTFLNYDKDYGITIELMNGRPEAYYWSGRELYQLD
NTRQHNDIEIIRRRRFKLFNFKPRWKRQSTIYGSGTGHHDEDRRRLNLNILDPSMRILRL
DNFMTTDCNDDMILFLGGIPPSHYELRKRMKNLGFLLTPFAGRIGFTNGKPSQSGEVYLA
DYAITSVNQFGDTQFTDSRQLGEIRTIGHAEWIRIFLTEDHRLGIVIPGVSKTLYTRTSL
TSRALNDPYTNLLNLELIEYMNLTTVLPVWNNLNKQIQYFDSKQAEIEIVVTLYFGKIDT
EQLTVLFDQHIVQTWTIPKQPDIKNIRQIYIGPQLMPSYPITIEYLIIGKHLVDFTTELV
SKDNPYGSQVGICGGQLYPRFTERRGLAGLVTSKLQGLELTAPPSGRQLIFTPFNELLTK
QIIPGVSYDEQSVLENIRTGDGKIRKKNDCTENAENTAWFDQYPDSYWEIGNIGTIIQQQ
TTPFEFTIGFRAQLANTAIIGEHLSLSGVEEIEENVYSLLAAFNFDTTWHRLKLIFQSTN
SIEEQNGPGVENGLQLLFDHRHFWLPPVEIFNLPSVVFIGGLPRVLNLQLQENRQLSNIY
GLFGCVDELTMNNVIPEMFTQPGHDKLTFDFSFFYDRNTIKQASLFVLTFGGTIDQPSEE
IHLWLFLSNNEVKMGYITESNDELELNHEVNLANIGHNQNIWHYIKLDITFINRNPLFQL
KSQTSISDTLAPFMKASRLISIHLGRNTVLTPDKMKKSTYNYHGEMFRGCMRSLHLSTLT
EIRNINLPEDLPGFLYGLCHTSLVW
NT seq 9258 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatcctgattcaattttggaagagaacgccataattacagcaaatgctacatgtggc
ataggtcgtaaggaatatttctgtcggcttgtcgaacatgctgatggctttatcacctac
gatggtcgcctacaccggacaccaagggaagttttgacgtacagccaggaagccaaatct
tatcgtgacccaagtgggcaatgggtgcaatgtggttattgtgacgatagagatcctaat
ctacggcatccaattgaatatgttctcagtggtgaggccaatttgtggtggcaaagccca
tctttggcacaaggtttacaataccatgcggttacaattactatggactttcgccaggta
tatcaaatagtctatgttcttttacgtatgggtgatagtccacgaccagctaattggatc
ctagaacgttcagtagatggtgaagtatatcatccatgggtattttttgctaaaactgaa
tatgactgtaagaagttatatgaaccattaattgatcgaccattaactattacaagtgga
ccaagaccatggcatttgggtgatgatgaagtttattgtacaacattttatagtcaacct
caagcattacaatcgggtgaaattattgtaaccttaacattggatcgtgaaagtaccata
tctactgaatcaggtcttgaaagtcctatatcatcaaagttaattgatttcttatctgca
cgatttgtacgactacgttttcaacaattacaaacactttctggtgattggatggctatg
ccaaatcaattagacagttcagtttacaataggtactattattcaattcgaacaattaaa
gttggcgggaaatgtgtatgcaatagtcatgctagtcgatgtgaacagaaagtaattgat
ggtgtacctcgagccgtatgtgactgtcagcataatacatgcggaaacaattgtgaaaag
tgttgtccattattcaatcaacaaccatggcgtccagggagaatatgtgaagagtgtaat
tgtaatcaaaaggcagatgaatgtatttataatcaaacagttgctaatcttcgtttaagc
atgcgtaaagatggtgttctagaaggtggaggagtttgtttaaattgtcgtgaagataca
actggtgtcaattgtgaaaaatgtaaacaaggttattatcgcccattaaatgttcgacct
gactcacaatatccctgtagaccatgtgaatgtagtacttttggttcaactggtgattgt
acatcgaatgatgctgaaataccggaacgatatcctggagattgtatctgtaaagaaggt
tatgcaggtagacgttgtgatgaatgtgctgaaggctatcaacgttctaacattgatcct
caattatgtataccatgtacatgtgatattagaggaagtcatcgtggtccaggatatcaa
tgtgaaccaccatgtaactgtaaaattaatgttgatccagactcttattgtaatacatgt
caaaaaggatttttcaatttagatgttaataatccagaaggttgtcaatcatgttattgc
tctggtcttacggatagatgtactggtgttactccatctactgcaatggtcaatacttta
gcgaattggaaaattattgtaccaagcttatcaacaccagataccggttacacaatacca
atgactgaaacatcagtacaatatgataaagttttattcgctcaaacacgtacagttgaa
gcttggctttcatcagttacttcaacaccagttacacgtggttattattggtcagcaccg
gaagcatatttaggcaatcaaattacagcttatcgtgatacattgaatatcattttacgt
tttaattcaccaactatgttaacatatcgtcaaccgacaatacccacagatatatcaggc
agtagacaattttctatgtcgatggctatgactgatcatttaaattatattcatatgatt
ttaaatattccattaagtgaatcatcattccgtgtaattgttgaaccaccaacctctata
ccattagatcgttttccaataagttggttacaaggtgatcaattaagatttgatgaatca
acattggaacgagttggtcgaccagcaacaatagctgatatcatgactgtattatccagt
atagatagattaatgattaaagctaaatatattactgatcaaacaacaactgaattaatg
tctgttacacttggtcgtgctatacgtgatgaaattggtggaataccaaatattgaagaa
tgtatttgtccaaatggttattcaggatcatcatgtgaatcatgtgccattggttattat
cgtgattatcaaaaacaatcaatgatacaaacgaatcaaacttcttttacttcatcaaca
gcattatcattatggcgttcaactatgatgacacaattacctgtttgtgtattatgtgaa
tgtcatggacattcagatatttgtgatgaaaagactggagtatgcattgattgtgctcat
aatactgccggagataaatgtgacatctgtgcaccgggattttatggggatccacgtacc
ggtgatccaaaagcatgtaaatcatgtgaatgtccacatttagattatcaaatgactaca
gtttgtttagcacatgaagaagaattatttaaagaggagaaaccatatgtttgtttagat
tgtacagaaaatactcgaggtcgatattgtgaagtatgtgcagaaatgtattatggtgat
ccactgaatggggtaccatgtcgtccatgtaattgtggacccgctgctataggatgcaat
gcaacaaatggagcttgcatctgtggatttaatacagctggaccgcaatgcgatgcatgc
gctgaaggaacacatggagatccaactagaggacaaccatgtagaccttgtaattgtcat
ccaaaaggtagtatctctccatcatgtagacttgaagatggtcaatgtaattgtttatca
acatatgaaggtgttagatgtgatcgttgtatacctggtcgtggtaatacagaagctggt
tgtccaccatgtcaatgcgatcctattggtactagaccagaatatttaacaatgtgtgat
ccagtctctggacaatgttcttgtaaaccaggagttggtggtactttagattgttcaaca
tgtcaaataggatattacaatctaggtccaaatggatgtacagaatgtaaatgtacttca
agagcaatcgatcgaacatgtaatcctatcacaggtcaatgtaaatgtggtgagaatgta
attggagatacatgtgataaatgtttgcctggatactattggaataacactggttcaaat
tgtttaccatgtagttgtggaattggaactgaattaactagaacactaactcagttaact
gaatgtgacatgaatactggtcagtgtaaatgtgctccacatgtggtaggacgagactgt
acagaatgtgaattaggatattttggtgtttctgaaagtggttgtaaaccttgcttacct
tgtccaaatggtcaagtttgtgatcagattactggaaaatgtatttgtccaccaaatact
gaaggtgatcgatgtgataaatgtattgctggatcatgggactataatccagtgattggt
tgtaaaaattgtaattgttcgatagatggttccgttataggccttgaagatcaatgtgat
ttaatcacaggacaatgtacatgtaaaccagaattttcaggtcgtgcatgtaatgaatgc
agtaaaggttattatggttatcctgattgtagaaaatgtaactgtgatatgcgtggtact
gcatggggaaatctatccatatcagatacggttgtaccatgcaatccaaaagatggacag
tgcaattgtaaagaaaatgttgaaggtgatcaatgtgatcaatgtaaaccaggaactttc
ggtttaaatattgattatccacttggttgttattcatgtttctgttttccaactggtaca
ccatccagatgtagtctattgacaggttatcgttctgttccaggaaaagtgaaaggagtt
gaaataatttctactgatgatccacgttatccaggtggaccgttgattgatttaaaactt
ggtttaagagatattgatgtaaatgaattaactattggtttaagtcaattcagttggcgt
ttctctgtacatcgtccaactcatttggaaataccagaattaaaaggttcactaacgcgt
aactatggaagtgtaattataggtgtattgacagaatgtttacctactggtgattgtaaa
cttggcattgaagatgcacaaactactactactaccatactatcaactagagacgattta
cctggaggtttaattatacgtagaaatgatattgtagatgctcgaatgacagcattaaat
ggttacatcgaaatggaatatcaaccatctgaaaattcacctacatctatagcggatggt
tatcgtcaaatttggcttcgtgaacaagattgggtattgacacgtgtatctggtattgat
acacgtgttcgaccaacacgtaatgaattaatgttagctttacttaatgttacatcattt
agtgtacgtttatttatgcctgaagcaagaccaaaacttgtaagtgtaaaatataaaatt
taccaaccacgtacagaaataacaacactatctggaatcgaaattaaaacaattgaaaaa
tgtgaatgtccaccgactgcatccggtgatcactgtgagattgcttcatctggattttat
ttcccaccaatcaaaccaaaacctggacgtgaaattctaccaccaacctctataattgat
cctacccttccaacaggacatataatttgggaaggtggagcccagaaatgccgttgtcat
ggtatgtcttcgaattgtgatccaatcactggaatatgcttggattgtactggtaacaca
gaaggtccaaactgtggaaattgtgctacaggttacatgggtgatccgaaaattggacaa
ccatgtgttaaatgccaatgtcctacagaacaaactgattatgcaatcacgtgtacacca
tcaaccgatccttcatttttaccacataaatgtatttgtaaagtaggctatgctggttta
cgatgtgaacaatgcgctcctgggtattacggtgatccaacaagcatgactgcgtgtcaa
gcatgtgattgtgatattggcggatcaagatcggaaacatgtaatcaagatactggacaa
tgtgattgctggcctggtattaaagggcgtagatgtgaccaatgtgaagaagatcatgtt
gttgatcatggaacgtgtcgtgcaaattcaattaccagattcaagacaaatttatatacc
accagaattgataacacatacaatccaatagaacaagaatcaaaacgtatcattgatagt
ttaataccatcagatcaattaaatcgtacttatttagcctataatgcatatcaattcatt
attgataatataaatttagctgagaatgcaacaaatgaagcagaaaatgcattttttaat
agtactacaactatagatgaattacaaactactgaaaatgatttaagtacattaaatcaa
attgctaaaaataatttaaaattaacaaaagatataacaaataaagttgattcaatacaa
caatttttgaaagatacaaaacccttagttcaaaatgcctcagataaattacaagtacag
ttagggcgttataatgaactacatgatcgtttacaaggaatggagaatcgattttctcaa
atacaaggaacagctaaaactctagttgatcgagcaaatattactcaatcatatttaatt
aaatcaattgatgaagctgaaactgttgctagacaattggattcaaaattattaaattta
cgtcgattagctgatgaagcacgttcaatgcttgatgtaaattatggttcattatctcat
gatccagttcctttacaattaggtcaagattgtgtatacacattggtcccgtatagtcta
acaaaatctcgagtgtttgatattgaattttggtttaatttaaataatttaccaacttta
tcaagtataagtagtgtattaatggttggacgtagagcttttgaaggacatacacaaatg
tttgcattcactattgaagcacctgatgctagattacgcttttcatggaatactccaaat
ggaatcttagaactaggtccagttactacaaatacttggtatcatacacgtgttacatca
gttggtggtgagacaagaatgatactcatggaaagaccattccaagatcgtggtgatgta
tttcctgagataagacaaacagctacaacaaatggaacacttgatcaagaagcaaatctt
attatggatagacaaatggaattacgtattggaggagttatgcaatctagtagtcgttta
agtaaccccgaagcgtggggtgataatggtgctgaggaattctggtcacgacttatgtca
atggaatcaatcaaattttgtatgttcaacttaaggttaagtgggacgcctattagtatt
gctaattttgctgatgctaatcttgaatgttctaaaccaaaagaatatcagtgtcaattn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaccattaaaagaatatcaacga
tctaatatgacagtaatgacatttttaaattatgataaagattatggtataacaattgaa
ttaatgaatggtcgacctgaagcttattattggtctggtcgtgaattatatcaattagat
aatactagacaacataatgatattgaaattataagacgacgtcgttttaaattattcaat
tttaaaccacgttggaaacgtcaatctactatatatggcagcggtactggtcatcatgat
gaagatagacgacgattaaatttaaatatattagatccatctatgcgtatattacgatta
gataattttatgacaacagattgtaatgatgatatgatattatttttaggtggtatacca
cctagtcattatgaattacgtaaacgaatgaaaaaccttggctttttattaactccattt
gccggacgcattggtttcacaaatggtaaaccaagtcaatctggtgaagtctatttagct
gattatgcaattacttcagtgaatcaatttggagatacacagtttactgattctagacaa
cttggtgaaattcgaactattggacatgcagaatggatacgtatattccttacagaagat
catcgtttaggtattgttataccaggcgtcagtaaaacattatacactcgaacatcttta
acatcacgtgcattaaatgatccatatacaaatttattaaatttagaattaatagaatat
atgaatttaacaacagttctaccagtatggaataatttaaataaacaaatacaatatttt
gattctaaacaagctgaaattgaaattgttgttacattatattttggtaaaattgataca
gaacaattaactgtattatttgatcaacatattgtacaaacatggactataccaaaacaa
ccagatataaaaaatatacgacaaatatatattggaccacaattaatgccatcatatcct
attactatagaatatttaatcattgggaaacacctagtggacttcacaactgaattagta
agtaaagataatccatatggtagtcaagttggaatatgtggtggacaattatatccacga
tttacagaacgtcgaggtttagctggactagtaacaagtaaactacaaggacttgaatta
acagcaccaccaagtggacgacaattaatatttacaccattcaatgaattattgactaaa
caaattattccaggagtaagttatgatgaacaatcggttttagaaaatatacgtactggt
gatggaaaaattcgtaaaaagaatgattgtactgaaaatgctgaaaatacagcttggttt
gatcaatatcctgattcatattgggaaattggtaatattggtacaattattcaacaacaa
actacaccttttgaattcactattggatttcgtgcacaattagctaatactgctattatt
ggtgaacatttatcattatctggtgttgaagaaattgaagaaaatgtctatagtttatta
gctgcatttaattttgatacaacatggcatcggttaaaattaatatttcaatcaactaat
tcaatagaagaacaaaatggtcctggtgttgaaaatggattacaattattatttgatcat
cgtcatttttggctaccacctgtggaaatatttaatttgccatcggttgtatttattgga
ggtttacctagggtgctcaatttacaattacaagaaaatcgtcaactttccaatatttat
ggtttattcggatgtgtcgatgaattaacaatgaataatgttataccagaaatgtttact
caacctggacatgataaattaacatttgattttagtttcttttatgatcgtaatactata
aaacaagctagtttatttgtattaacatttggtggaacaattgatcaacctagtgaagaa
attcatttatggttattcctatcaaataatgaagttaaaatgggttatataacagaatcc
aatgatgaattagaattaaatcatgaagtgaatctggctaatattggacataatcaaaat
atttggcattatattaaattagatataacatttattaatcgtaatccattatttcaatta
aaatctcaaacatcaattagtgatacattagcaccatttatgaaagctagtcgattgata
tcaatacatcttggacgtaatacagttttaacaccagataaaatgaaaaagtcaacttat
aattatcatggtgaaatgtttagaggttgtatgcgtagtttacatttatcaacactcaca
gaaatacgtaatattaatttaccagaagatttaccaggatttctgtatggtctttgtcat
acctcattggtttggtaa

DBGET integrated database retrieval system