Schistosoma mansoni: Smp_152940
Help
Entry
Smp_152940 CDS
T01095
Name
(RefSeq) putative otopetrin
KO
K26153
proton channel OTOP
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
smm02000
]
Smp_152940
Transporters [BR:
smm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Smp_152940
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Otopetrin
DUF5905
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8345785
NCBI-ProteinID:
XP_018653600
LinkDB
All DBs
Position
7:5339149..5355381
Genome browser
AA seq
747 aa
AA seq
DB search
MNFLIFQYCLSILALAYLQSLIFYYDRKENLRHKQEILFMNQMNEARRRWQDHQSSPEET
DNNLMNNHDDIDNNNNINNYGDNQWNLQLQKREDKLRLVTFIHDAHELSTDVYSDSTSVH
VDSTDMKYLEDRTRLINQHDDNISSNEEEGNPSGENDKLSNNKIMKADDVYFTFNNVKPC
NSFNHHVSRIKDSSDVIQNGYNSTRRPNNKNKCLAIKAKNVNTSKTKKKRMTSCCGERSG
SPTQSGSFYPLAILFGDKPRVSRRECYFSRDTEGVNLYLRLGAVGFGFGVMIFDGFKIAE
PWEEVANSVVSCHGHLWIPLHLLHFVYVFWQTYFLFKHHRVVFNVQKFVLRFLLCHLAVA
NLCQWLKTIVDEIGSEPGHEEELIPDSAIVFPSEYFLDAKTPLNSTTLHKYTNGTMSPTF
NLTNLANMVLLNRKKHNANTKPHDANYDNSTVHAAEQAVLGCGITVKYLAPYLFPCAIEY
SLIAGAIFYKMFEKVGHVRKESERLEKLRKANPKTSQFSECHRSHKGLFVGLLLFMATLV
AMSLFFIFIVKRDRRNTAITLYQGTELVLLSVSTVTCLISLFRLQALKLSDLSEEVAFDD
NLLLIGLVGMLFYDLFLLVPALEAIPNGVIAAKLYAAKAIMEMIQSMLQVFFILEASRRC
AGTLEHVQKKPGRTMITFLLVLNLAMWFVNTFEVKHADNHSIHINYYSSMAWKIITHIAL
PLIVFFRFHSTVCLSDIWANAYRFRTE
NT seq
2244 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttttaatatttcaatattgtttatccattttggcattggcttatctacaatca
ttaatattctattatgatcgtaaagagaatttacgtcataaacaagaaattctttttatg
aatcaaatgaatgaagccaggcgaagatggcaagatcatcagagttcaccggaagaaaca
gacaataatcttatgaataatcatgatgatattgataataataataatataaataattat
ggagataatcaatggaatttacaattacaaaaacgtgaagataaattacgtttggtcaca
tttattcatgatgcacatgaattatctactgatgtttatagtgattcaacatcagtccat
gtggattccacagatatgaagtatttggaagatcgaacacgtttgattaatcaacatgac
gataatattagctcaaatgaagaggaaggaaatccatctggagaaaacgataaattatca
aacaataagattatgaaagcagatgatgtttactttacgttcaacaacgttaaaccatgc
aacagtttcaatcatcatgtctctagaataaaggatagtagtgatgttattcaaaacgga
tataactcgacaaggaggccaaataacaaaaataaatgtttggcaataaaagcaaaaaat
gtgaacacatctaaaacaaagaaaaagcgaatgacatcatgttgcggtgaacgatcaggc
agtccaacacaatctgggtcattttatccgctggcaattctttttggcgataaaccaaga
gtatctagacgtgaatgctatttttcacgagatactgaaggcgttaatttgtatttgcgt
ttaggagctgtgggtttcggtttcggagtaatgatatttgatggctttaaaatagcggaa
ccatgggaagaagtagctaattctgtggtttcttgtcatgggcatttatggattccgtta
cacttacttcattttgtctacgtgttttggcaaacatacttcttgtttaaacatcatcgg
gttgtattcaatgtacaaaaatttgttttgcgtttccttttatgtcatttggctgtggct
aatttatgtcaatggttaaaaacaattgtcgatgaaatcggcagtgaacctggacatgaa
gaggaattaatacccgattcagctatagtttttccatcggaatattttttagatgcaaaa
acaccgctaaatagtacaactttgcataaatatacaaatggaacaatgtcaccaactttt
aatctgactaatttggcaaatatggttttattaaatagaaaaaagcataatgctaataca
aaacctcacgatgcaaattatgataattcaactgttcatgcagctgaacaagcagtgtta
ggttgtggaataacagtcaaatatttggctccatatttgtttccatgtgcaattgaatat
agcttaatagctggtgcaatattttataaaatgtttgaaaaagttggacatgtacgcaaa
gaatcggaacgcttagaaaaattacgtaaagctaatccaaaaactagtcaattctctgaa
tgtcatcgttcacataaaggtttatttgttggcctattattatttatggcaacattagtt
gcaatgagtctattttttatatttattgtgaaacgtgatcgacggaatacagctataaca
ttatatcagggaactgaactagttctattatctgttagtacagtgacatgtttaattagt
ttgtttcgtttacaagcattgaaattaagtgatctgtcagaagaagtagcgtttgatgat
aatttattattgattggtttggttggaatgttattctatgatttattcctattagtgccc
gctttagaagccataccaaatggtgtaattgcagcaaagttatatgcggctaaggctatc
atggaaatgattcaatctatgctacaagtatttttcattttggaagcatcaagaagatgc
gctggaacattggaacatgtacaaaaaaaaccaggacgtacaatgattacatttttatta
gtattaaatttagccatgtggtttgttaatacatttgaagtgaaacatgctgataatcat
agtatacatataaattattattcatctatggcatggaaaattattacacatattgcatta
cctttaattgtattttttcgttttcattctacagtttgtttatctgatatttgggcaaat
gcttatcgttttagaacagaataa
DBGET
integrated database retrieval system