Schistosoma mansoni: Smp_154240
Help
Entry
Smp_154240 CDS
T01095
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
smm
Schistosoma mansoni
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TSTD2_N
AA_permease_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8353191
NCBI-ProteinID:
XP_018653352
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(<16026550..>16042170)
Genome browser
AA seq
1203 aa
AA seq
DB search
MHELFTPYSNQYCGTHWPIEGFEGSRVLLIATILVNLVTPPPVAYASVVEDDDDELDFGP
IIPCNIFPNGLPLVTWRENARVIAGSPNALRFIFLCAYAHHSGLRSLGLQLLSSIRYPLD
PPSLSLPLECPEYWTPLIDNGCRLGQLTLAFLTRCILESNDRCDLIAGLMFLANLTKVRE
KTNLSSLLVGLPQTVWPRLAQLLCLPDLAVVCATLEALRCLTNLDATMCLTCWESCCLNV
NSFDQENIPFILLQPLLALLTLEGQAMGSQSLHRIRLLPRTPQAQNVQPQPPHGAGLRIP
ALSRVSPNVNELNRSRDAPAYTNGQMLKSSLRPKLPVVHPVPSDSFDNNDIHNSTTSSFR
NLKFESSTYSKQPAISSTSTCISHPVYRPQSGSTACSGLINLLSSVPPASSSPNTNMPVI
NSTSPNSPKVVTPSLSELTDRLQMPPPSLPPPSAMRRSIKRTHSRTSLISSPTQPTDAVK
INSSSLCRTNYSSGNMNVTDRISSTSLLLTNSCNLTSQPQGNSAPLGVSINSKEIQQTEK
HEGCSEKFSDESLNQINNSRNLLPHLKPIVTYDTCNKKTTNNNNKDELGDNDEIKPIVNG
EKSIDPIMDGGLKSSINSFHTNGLRTGILQEAVLAIQDRKLKQTSEQCKSIVKCVNGVLE
TKRELILSTKDNSNMDIDSNDGKSTPFDVCENSSKKLSKTSLSNGYLTDEIHENEKDNNS
LCENNPLHIASSGNGNINNNENSGKLEKNSNSRFRGLHSSHRFLKRRRKWGSKSRLFTPK
RRRDLTSKHIDCSPTLHVPLTFNPVPGSVLDPTWKQPTDPVSVESPSGTSTSSSSSEVIV
EPSSNDNKNSSISKDVIDKSNKLDCDVSVASESSERNSESGNASLTCSDNPSKTVNIEKP
VLYLCEWECCTATFELKHQVAFHVYSTHLPSKENWKVDGSHHTNHKYPVQLVRRCCRWRG
CQSASLARAPYALMTHVLDMHCSPRELEARRSNHEKSKTDYRTRNEHFSDVNSSIGDTHP
EYPLVGDRTGWGIIRSVEAKNIQTELLAAQHHFLLTNPHYHSNISVNPLIHSGINNPPRE
GPVTKHLRVTSALILKNLAVHVDQARRWLLKESQLLSEIAFGCTPSETGLKTNNASHIIA
QCLSICTLKQNPTNCILSHSLERSINIPLLSTDTYSSSRIQPNESTMHQFKQSTVDLDSE
TCN
NT seq
3612 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatgaactttttactccgtattccaatcagtattgtggaacccattggccaatcgaa
ggttttgaaggttcccgtgttttgttgatcgccactattcttgttaacctggtgactcca
ccacctgttgcctatgcatcagtagtcgaagatgacgatgatgaactagattttggacct
attataccttgcaatattttcccaaatggcttgcctcttgtaacctggcgagaaaacgca
cgtgttattgcaggaagtccaaatgcacttcgttttatatttctttgtgcttatgcacac
cactcaggattgagatccttggggctacaactactttcaagcatacgctatcccctagat
ccacctagtttatcactcccacttgaatgcccagaatattggacacctttaattgataac
ggttgtcgtcttggccagctaaccttagcatttctaactcgatgcattctggaaagtaat
gatcggtgtgatttaattgcaggtttaatgtttctggctaatctaacgaaagttcgtgaa
aaaacgaatttatctagtcttcttgtcggtctacctcaaactgtttggcccagacttgcc
cagttgttatgcttaccggatttggcagttgtgtgtgctactttagaggctcttcgttgc
ttaacaaatctggatgcaacgatgtgcttaacttgctgggagtcctgttgcttaaatgta
aattcattcgatcaagaaaacattccttttattttacttcaacctttgttagcattactt
acattagaaggccaggcgatgggttctcaatcgcttcatcgcattagacttttaccccgc
actccacaagctcaaaatgttcaaccacaacctcctcatggggccggtctacgaattcct
gctcttagtcgtgtgtctcctaatgtaaatgagctcaatcgatccagggatgcacctgca
tacactaatgggcagatgttaaagtcatctttacgcccaaaacttcctgtagtacaccca
gttccttctgattcttttgataataatgatattcataactctactacttcatccttccgt
aatttgaagtttgaatctagtacttattcaaaacaacccgcaatttcatcaacatctact
tgtatatcacacccagtgtacagacctcaaagcggaagtactgcttgctctggtcttatc
aacttactatcttcagtgccacctgcctcatcatcacctaataccaacatgccagtaatc
aattctacttctcctaattcaccaaaagtggtgacacctagtttatctgaactgacggat
agacttcaaatgccaccaccttctttaccaccgccatctgcaatgcgacgttccataaaa
cggactcattcacggacaagtctaatttcatctcctactcaaccgactgatgcagtaaaa
atcaatagttcttctctttgtagaactaattactcatcaggaaacatgaatgtaactgat
cgaatcagttcaacatctttgctgcttacaaattcgtgcaatctaacatcccaacctcaa
ggaaactcagctcctttaggggtatctataaattccaaggaaattcaacaaactgagaaa
catgaaggttgttcggaaaaattttccgatgaatctttaaatcaaataaataattctcgt
aatttactacctcacttgaagccaattgtaacttatgatacttgtaacaagaaaaccact
aataataataataaggacgagttaggtgacaatgatgaaatcaagcctattgttaatggt
gaaaaaagtattgatcctatcatggatggtggactaaaaagttcaattaatagttttcat
acaaatggtcttcgaactggtattttacaagaagctgttttagctattcaagacagaaaa
ttaaagcaaacttccgaacagtgtaaatcaattgtcaaatgtgtcaatggtgtactagag
acgaaacgtgaactaatcttaagtacaaaagataattcaaacatggatattgattcgaat
gatggtaaatcaacgccttttgatgtatgtgagaattcaagtaaaaaattgagcaagact
tctttaagcaatggttatttaacggatgagattcatgaaaatgaaaaagataacaattcg
ctatgtgaaaataatccattgcatattgcttctagtgggaatggtaacatcaataataat
gaaaacagtggtaaactggagaaaaattcaaattcccggtttcgtggtttacattcttct
catagattcttgaagcgtcgacgaaaatggggttcaaaaagtcgattgttcacacccaag
cgtcgacgtgatctgacgtctaaacatattgactgctcaccaactttgcacgttccatta
acgtttaatcctgtgcctggctctgttctggatcctacttggaaacaacccactgatcca
gtgtcagttgaatccccttcaggcaccagtactagcagtagtagtagtgaggtgatagtc
gaaccttcaagtaatgataacaaaaattcgtcaatttcaaaagatgttatagacaagtcg
aacaaacttgattgtgatgtttccgtggctagtgaatcgtcagaacgcaattcagaatct
ggcaatgccagtctcacatgttcagataatccatctaaaacggttaacatagaaaagcca
gtgttgtatttatgtgaatgggagtgttgtacagctacatttgaattgaagcaccaggtc
gcctttcatgtttacagtacacacttacctagcaaggaaaattggaaggtagatggatca
caccatacaaatcataagtatcctgttcaacttgtacgtcgttgctgtcgttggcgaggc
tgccagtcagcatcactggctcgagcaccgtacgctttaatgactcatgtgcttgatatg
cattgcagtccaagagaattagaagcgagaagatcaaatcatgaaaagtctaaaactgat
tacagaactcgaaatgaacatttttctgatgttaattcatcaattggagatacgcatcca
gaatatcccttagttggtgatcgtacaggatggggaatcattcgttctgttgaagctaaa
aatatacaaactgagctgttggctgcacaacatcattttctacttacaaatccccattat
cattcaaatatttcagtaaatccactgattcattcgggcataaataatccaccacgtgaa
ggaccagtaacaaaacatcttcgagtaacttctgcacttatattaaaaaacctagcagta
catgttgatcaggcgagaagatggttacttaaagagtcacaacttttatcagaaatagca
tttggctgtacaccaagcgaaacaggattaaaaacaaacaatgccagtcatattattgcc
caatgtttatctatatgcaccttaaaacaaaatcctacaaattgtattttatcacattca
ttagaacgttcaataaacattccgttactatctacagacacttattcatcgtcaaggatt
caaccgaatgaatcgacaatgcatcagtttaaacaatctactgtagatctagattcagaa
acttgtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system