Schistosoma mansoni: Smp_158610.1 Help Entry Smp_158610.1      CDS       T01095                                  Name (RefSeq) helicase mot1, putative   KO K15192   TATA-binding protein-associated factor [EC:5.6.2.-] Organism smm  Schistosoma mansoni Brite KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03021 Transcription machinery [BR:smm03021]     Smp_158610.1 Transcription machinery [BR:smm03021]  Eukaryotic type   RNA polymerase II system    Other transcription-related factors     Others      Smp_158610.1 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  SNF2-rel_dom DUF3535 Helicase_C HEAT HEAT_2 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  8343959 NCBI-ProteinID:  XP_018646567 LinkDB All DBs Position Unknown AA seq 2340 aa AA seqDB search MADGVCLFVPLCTRTFIPWTRINRDYQESNDQPVLLLTHCEILHLVSDGKLAVGFFKALA SYNLDRLFALLESCPNASLRTAAAEQLGEIAKSSPSSIDYVFTCLIPLLRHKNWVSRVAA SEAIRHIVRHLPDWEPTVNCQSYIDQKDVSTNGFLSLSGLRIDYVLAQGARLYSMDVREL DRNNCRGYFERCKKNNENAMECDTCDPQTVIHSPQILPPVQRQEINSRLGLENDNLLTEV LESHADVSIDKWITTDDFNDETQPGFAQVDVESPVQYDTKRIKLDSSSDVTIDKSGLNVQ ATASVLNQPLGHWPLDRMCTTLLGDLWALRWETRHGAASGLRELLSEPRHTKQAGKYIGQ SEIEMYNNHYQYLEDIVVRVLCTLALDQLSDFISDEVVAPVRETAAQLLGVLSLHLTTEQ VLLVTKHLIFLVSLNDETVTKLCTNIPCQKDNTNASKNSWMIAHGGLLGIKYLLASRKDL KDTLLPHVTPCLISRLFGIPNIADNQIVSQQSGRPSSFSANPLADDEDIRAAAASALLPM IDTMWVESLSQYEYNLFVNHVWSLIRNTPSDLSPSTGPVLSLVSALTKAEMGKRQSSEQH NSTIKSEEDISIYRINTSEKIMIITELLHHVSSSIRQSSLNTLQCVIESCENQIESLSAD TLHIILDNLFLRILLEPCTSIRALVTNLTIKIIQAAEVDCLVEASIRRLDVWLCQVMQPT GIPYPNKFLVPCLRSNSDIQLTTSELSSNNDELTSLGIKVRSTANINSNIPSSNQQAVFI PQPTYCIGGFQCLTASRSEMESYVLETRISAVRVLAYLCSRICQYNKLIPVHLLPCISDN PKSSTSSLPSSANNSDHNHVNNTSISVLNYVIGKLISQLHLKDRLAMQRFISGLLLSCWS LLPPISCLPTGSGDSNDNNSMNSSNRLFNSMNPFNQVNYIDKLTYTWANLLNTSSSTLLT CHLERLQNLSKSVFTNIKVDLHDITKQLRGRLESCLTEVIYYEEILAPFKLMQEDCRELI RLMKSGGLPVDSQIPINGVLTIVHCKTLLQKVAEIIHAQKQHSENEVSCVVDSSLLDRLH CQFERTRTTVDHCLTLQLYLGNRVELGIACAFANMNWILPGRLSLLIRPLMDTIRCVKPC INQSDNSVRSLNSGTDGIFQINSRHNITSTATTTSSIFGGSSSNSSAVGACIDILPIGTC VHLQRLAASCLARLLWLEWKMLSTNLPSQSSSTLLTNKSLLPNTSKAATKVIKNLTSYLV ESDSDFLLSLSSTSNPSSEASDQPNEDQSSFDTKIACVNSLSTYRLDLVTTTSSSSETQQ QSSQHRGAYISLSCICYTFINLYHHEEGETCWSSSSKSMEPIDHKPCLHRLSNASLNSLR LGIPSLWHLFWINPVKIVINLYRQSGISVENGKFIKEGGEIPERRGNFHLTLKKLTDEVK FNMSKLKSVDLPKSSQDELLSGLIVLSSCLNVILPCIDPDQKESSCDQKDDISFEQIIWL ASLVIRLPNIVYRRVGARLLADLTLLRPVYTLNILLPLLLLTSNGIFLPTDSSTICVGTL ETFLTIVDKFSNMHNSSSYILQSVPPVILEDPLAEPNSKSSSLLSMCRCFMSPVNEQLTS DFESKLPNELTTKTNNITVISNSEDGSSSLLSNNLKLFLPYVVLLLTPTLRLISNSNQHI RSIAGRLFAALLNLLPLESSIPNPEKMKEEFKQIRLAQREFIDNLLHPDRIQSYNLPIKI NGTLRTYQQEGVNWLCFLNRYGLNGVLCDDLGLGKTLQTICILAGSHHELKQCLATHNSN KYYVSNESNVMDTKVDGKPPISLVICPSTLCAHWFHEIQHFAQTEDLNPLIYGGSPSVRQ NLQSKLHQYDVIITSYDLVRSDVGFLELVNWNYIVLDEGHIIKSSKSKVTRAVKHLVAQH RLILTGTPIQNRVTELWSLFDFLMPEFLGTEQYFLAKFARPVASSRDPKASKSDQQAGQL ALEKLHRLVLPFMLRRLKEDVMQDLPPKIIQDFACKMTPIQRKLYESFQKTDEGQKVMNF VSTSSGDFYSEYRSSSFGGVSTSHGFHALRYFQAVCNHPCLVLKSNHPLLDEVKQELCID SMEQLRTVHYSGKLLALCRLLTDCGFGSPNSINGSNVGSLLSQHRALIFFQTREMLQLTG EMLKKQFPWITATRLDGTVPVNERHNRVVKFNQDPSIDLMLLTTAVGGLGLNLTGADTVI FVEHDWNPSKDLQAMDRAHRIGQRRTVNVYRLITEDSIEEQIMNLQAFKLHLANTVLTAD NKSLNEMDTGHLFDRLTENNDNRMSRDNHTDFQFASLDDLEACYEAEYNLDTFVARLKTN NT seq 7023 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggcggacggcgtatgcctctttgtcccattgtgcactcgtacattcattccctggaca cgtatcaatagagattatcaggagtctaatgaccagccggtactacttttgactcactgc gaaatcttacaccttgtttccgatgggaagcttgcagttggttttttcaaggctctagca agttataaccttgaccgtctttttgcgttactggaaagttgtcccaatgcgtctttacga actgcagctgcagaacaacttggagagattgcaaaaagtagtccatcaagcattgattat gtcttcacatgtcttatccctctcctgcgacataaaaactgggtttctcgtgttgctgca tcagaagctattcgtcacattgttcgtcacttgcctgattgggaaccaactgtgaattgt caaagctacatagatcagaaggacgtttcaactaatggcttcctcagcctaagtggactt cggatcgactatgttctagctcagggtgctcgactttacagtatggatgtgcgagagctg gacagaaataactgtcggggttattttgagcggtgtaaaaagaataatgaaaatgcaatg 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DBGET integrated database retrieval system