KEGG   Schistosoma mansoni: Smp_158830
Entry
Smp_158830        CDS       T01095                                 
Name
(RefSeq) putative transmembrane protein 1/tmem1b
  KO
K20307  trafficking protein particle complex subunit 10
Organism
smm  Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:smm04131]
    Smp_158830
Membrane trafficking [BR:smm04131]
 Endosome - Golgi transport
  Tethering complex
   TRAPP complex II
    Smp_158830
SSDB
Motif
Pfam: TRAPPC10_1st
Other DBs
NCBI-GeneID: 8343617
NCBI-ProteinID: XP_018651633
LinkDB
Position
4:complement(1129397..1168531)
AA seq 1407 aa
MDFILKPVISCAGDENLLPYFESRCLSTLGSQQVVWKHPKLSMVHSVRLGACFTRFRVSQ
LQSNVKVLSSGRPIRPVGTFQPLLYIYVTSNDVSHYTSHGGRNAIGSWLGHLRARNVFDW
LIIMVNSDPQYNTPKILQKSNVLDKIKSDFNVRTGDRQFLEVPAPNSAEEKLFNESWNQL
TYLVRKSIISACMSIIVDYDVHLQMLTDSCSTFTWDYFEYLDRKEELAHMYLFLGGHEHA
LHEYREATELLSKCIQASTQQGSKRPQWLDRLTQLSSSNEVSHYVCDYSLDVTNTEIKQS
SRLKNRNATLFELKNYLLSRQASILCICDRLNEFPALAYHTICSTLTEINILNVIINDSL
INQQSTRDSIQQQQQYDLVDQLEIETDQTKADQIQLDHSILFAHNHLIPLFTSSIIYSQI
FTAIGQTLIGFLKLIHCPKRAYEIVYDLADFLFSQGAHESASWLYESLINHYDESSWIGL
VTSTRICLAWCFHSLCVKKHFETKEDYEIARKYIQICFILAGTKCSILRIAAIHVYNKIQ
FWYQTINFTEILSIPTFNDSINPNYWWEEAVEFRNSLLSYHQYVILDPYQMSPLFRLKSI
ELEGVCNCGYQLIFIQLKSNSDRTFKASVHISGSEPSYIDWQTLLNPNEFLPYHVMDKTN
QLSMPQLDSQLHLINLTTAPSISVVKSLAGSNVHNPITIGSSNNNNRNSNNNSSGSHKVI
SRGQYSISSEKNSIQYNKYHLPTTEMTASIRRSYSSIPDSSKEYLNRNLALKGNQLRISK
MNSQSRLGSLLNVAASLASRPAWKSQDTIGVMSDEHNNTPMSTPHIIRNGRMIRIPSDGL
IEPNIHSSVQISRQHSLCSTKKRSRLSFSINGKHDMFGNENTESSTPVSTKNPLFILNHE
ESFVMIKPGLNKLSFIANVPGFLIPEQIFINCLDEINTEFKEASREQQSMEPSNNSRSEV
NFVSDIDSDVFGSSWRDTAMMKALLPKPEISVLNNSGDKRYPVVFGTCQPIPVRLRLGKL
GLPEDCKLSTSLYRICSNNKNFVFNTKPENTHINVKKTNSMKTYNNTNGNDGNETMFNNQ
TSITVDSSYEIRNQYSANDYSLISNSLDNHHQDEHLHKKHQTLFSQFILEDGPVDFIREY
NSLSQSLECKMNHPIPTFPPGCCLQLSRPLYLSATSCNDQFALSMPSGHYCILPVDIIKP
LGFNLNIFPLPKTYVIFSLNITCVDSDPDSTITPEVYYSQNLLCKYPVTFELSNMRFYIC
ASKLYLSRRLALSSSFSNGQHQLYNRQLKSRSHVSMEDNRQIAGDFTKNDVHETGSTDKL
HDTINESIESLTGDLLDNRITKAYVTHLTPFSIPWRFKSLEYNNFMKLCKESHCQPIGRF
ECTMNRIGNVKKINQDIRVDCVIGQQI
NT seq 4224 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggactttatattgaaaccagttatttcatgtgctggtgatgaaaatcttctgccctat
ttcgaaagtcgctgtttatcaactttggggagtcagcaggtggtatggaaacatccgaaa
ctgtcaatggtccattctgtacgattaggagcatgttttacaagatttcgtgttagccag
ttgcagtcaaacgtcaaagttttatcaagtggaagacctattcgacctgttggtacattt
caaccattactttatatttatgtgacttcaaatgatgtttcccattatacatcacatggt
ggacggaatgccatcggtagttggctgggtcatttacgtgccagaaatgtatttgactgg
ctgattattatggtcaattctgatccacagtataacacaccgaaaattctgcaaaaatca
aatgtacttgataaaattaaaagtgattttaatgttcgtacaggggaccgacaatttcta
gaagtaccagcacctaattcagctgaagagaaactattcaatgaatcatggaatcagtta
acttatcttgttcgtaaatctatcatatcagcttgtatgtcaattattgttgattatgat
gtacatttacaaatgctgaccgattcatgttcaacctttacatgggattattttgagtat
ttagatagaaaggaagaattagcacatatgtatttgtttctcggtggacacgaacatgct
ttacatgagtatcgtgaagcaactgaattactttctaaatgtattcaagcgtcaacacaa
caaggatctaaacgtcctcaatggttagatcgattaacacaattatcatcatcgaatgaa
gtatcacattatgtgtgtgactattctttagatgtgactaatacagaaataaaacagtct
agtcgtttaaaaaatcgtaatgctacattattcgaattgaaaaattaccttttatccagg
caagcatctatattgtgtatatgtgatcgattaaatgaatttcctgcacttgcctatcat
accatttgttctacattaactgaaataaacatattaaatgtaatcataaatgatagttta
ataaatcaacaatcaactagagattctattcaacaacaacaacaatatgatcttgtagat
caattagaaattgaaaccgatcaaactaaagcagatcaaatacaattagatcattctata
ttatttgctcataatcatttaataccattatttacttcatcaataatttattcacaaatt
tttactgcaattggacaaacattaattggttttttaaaattaatacattgtcctaaacga
gcttatgaaattgtatatgatttagctgatttcttattttcacaaggagcccatgaatcg
gcttcgtggttatatgagtcactaataaatcattatgatgaatcttcgtggattggttta
gtgacaagtacacgtatatgcttggcatggtgcttccattccttgtgtgtaaagaaacat
tttgaaactaaagaggattatgaaattgcccgaaaatatattcaaatctgtttcatctta
gctggtacaaaatgttctatattacgtatagctgctattcatgtatacaataaaattcaa
ttctggtatcaaacaataaatttcacagaaattttatcaataccaacatttaatgattca
atcaatccaaattattggtgggaagaagctgttgaatttcgtaattctttattatcatat
catcaatatgttattttggatccttatcaaatgtcaccattatttcgtttaaaatctatt
gaattggaaggtgtttgtaattgtggttatcaattgatttttattcaattaaagtctaat
tcagatagaacatttaaagcatcagtacacattagtggatcagaaccttcatacattgac
tggcaaacattgttgaatccaaatgaatttctaccttatcatgttatggataaaaccaat
caattatcgatgccacagttagatagccagctgcatttgatcaacttgaccactgctcct
agtatctctgttgtcaagagcttagcaggtagtaatgtgcataacccgataaccattggt
agtagtaataataataaccgtaatagtaataataatagttctggcagtcataaagttatc
tcacgtggtcagtactctatttcatctgaaaagaattcaatacaatacaataagtaccat
ttaccaacaaccgaaatgacagcctcgattcgtcgaagttattccagtataccagatagt
tctaaagaatatctgaatagaaatttagcacttaaaggaaatcaattgagaattagtaaa
atgaatagtcagtcacgtttaggttcattgttaaacgttgctgcatcattggccagtaga
ccagcatggaaatctcaagatactataggcgttatgagtgatgagcataataatactcct
atgtctacgccacatataatacggaacggcagaatgatacggataccttctgatggctta
atcgaaccaaatattcatagttcagtacaaatttcaagacaacattcactctgttcaacg
aaaaaacgatcacgtttatcattcagtattaatggtaagcatgatatgtttggaaatgaa
aataccgaatcatctactcctgtttcaactaaaaatccactatttattttaaatcacgaa
gagtcttttgtaatgataaaacctgggttaaataaattgtcatttatagctaatgtacct
ggatttttaattcctgagcaaatatttattaattgtcttgatgaaatcaataccgaattc
aaagaagcatcaagagaacaacaatctatggaaccgtcgaataatagtcgttccgaagta
aatttcgtatcagatatagacagtgatgtttttgggtctagttggcgtgatactgcaatg
atgaaagcgttgttacctaaaccagagatttcagtattaaataactcgggtgataaacgc
tatccagttgtatttggtacatgtcaaccaattccagttcgattaagattgggcaaattg
ggcttaccagaagattgtaagttaagcacaagtctatatcgtatttgttcaaataataaa
aattttgtattcaatactaaaccagaaaatactcatataaatgtaaagaaaaccaattcc
atgaaaacttataataacactaatggtaatgatggaaatgaaacaatgttcaataatcaa
accagtatcactgttgatagtagttatgaaatacgtaaccaatatagtgcaaatgattat
tcattaatttctaattcattggataatcatcatcaagatgaacatttgcataaaaagcat
caaactttatttagtcaatttattttagaagatggtccagttgattttatacgagaatat
aattcattatcacaaagtttagaatgtaaaatgaatcatcctataccgacgtttccacct
ggatgttgtttacaattaagtagaccattatatttatcggctacatcttgcaatgatcaa
tttgccctttcaatgcctagtggacattattgtattctaccagtagatattatcaaacct
cttggattcaatttgaatatattccctttacctaaaacatatgttatattcagtctaaac
attacttgtgtggacagtgacccagattcaactataacaccggaagtatactacagtcaa
aacctactttgcaaatacccagtaacatttgaattgtctaacatgcgattctatatttgt
gcttcgaaactttacttatccagacgtctagcgctaagtagttctttttcaaatggtcaa
catcaactttataatcgtcaattgaaatcacgtagccatgtctcaatggaagataatcgt
caaattgctggggattttactaaaaatgatgtccatgaaacaggttccacggataaatta
catgatactatcaatgaaagcattgaatctttaactggtgaccttctggacaatagaatc
actaaggcttatgtcactcatttaacaccattttcaataccttggcgtttcaaatcacta
gaatataataattttatgaaactttgtaaagaatcacactgtcaaccaattggacgtttt
gaatgtacaatgaatcgaattggtaatgttaaaaagattaatcaagatataagagtagat
tgtgttattggacaacagatataa

DBGET integrated database retrieval system