Schistosoma mansoni: Smp_161860
Help
Entry
Smp_161860 CDS
T01095
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19330
run domain Beclin-1 interacting and cysteine-rich containing protein
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Pathway
smm04140
Autophagy - animal
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04140 Autophagy - animal
Smp_161860
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
smm04131
]
Smp_161860
Membrane trafficking [BR:
smm04131
]
Autophagy
Other autophagy associated proteins
Others
Smp_161860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RH_dom
FLYWCH
HTH_75
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8349201
NCBI-ProteinID:
XP_018648306
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(<25801513..25846445)
Genome browser
AA seq
1578 aa
AA seq
DB search
MSTASSHVIPTLNSGGFLPPKFYHDKIHPFHTSDVYPKGTCHFCLNQNIQACWFYDLYAN
STNTMQLQSSCCHVVRLNGLIRSVSMEHLRCLKQTSVDYSQQANGLKNSFISCDRLNTTP
FADANIPVGSRSSGDGQTEDEEESNGVNYRITPDMQSKINSTCSNFSNEVNVLLGSHSKL
GSPSTSFTHDQINTKHLLLPGRSSFEKHLVREVAYFEICEFLIEQIEEIYDMENCEFLNS
MYNEKNKDNSLQILTDLQVHKSNTLPSSLLSSHMTLVDVTDQNLHNPLINSILHSQSRET
DYCEHCVDSATGLAVSLINTCIQKTAQNEKQEVILFKFLKLQELLLTTCDINWVRLNQKF
IESPRPTRFNCDTKFQNFSKNNWLSSTSSDSIQLDSQGRWNKFHHLTSLSQSTNSKRAMK
SISQSDYSPSVLTSSSSFGSHTTTLSKPTINKLSNNSTIIMDTLLKNDNSNNNDSHANNR
SSISLIKDFQLSDKIRSDNQDYPTSSLSLSSAFGCTPLPYGLLINPPIQKSKRKGVLVSQ
NNRCAGCGAFIETRYLKRMRFCEFFGRYFCCVCHSNTLMTLPGNLVTCWDFRMLSVSNFA
RDRLRQLHNKPLLRTIDFNKQVLNRQSNLLNCLTLRKQGNLMLPFIQRCQTAQQLVDFTS
IPSHWFETPDLWSMADLHSVHDGKLSIALRALLLPIVEHISICKRCLACGFICEICKSGQ
ILFPFGQFVSGSLVNSLNVQADWVLVHLTMLDVDILWWSVGNMNATSVNNFHTLAYDLKG
TEAEETSINGISTGELQNALGNNPNVRLAKKIHNDKEKGQTNYRSSSTEASKQNVTTELV
NKSSDGQWNLIKVRVGFDVTRKGERSLVINGYKFTKSRDGMGDRVFWRCSRRECKATAVT
VSNKVEHIRSIHSHLPPVAAEFFSDDSSRCEQEVRFNNLVYTQRSRIRRRSQPNPSMKLS
KQSVTKPCFLEQIKELACSTSYSEASNAVSHEKYSSNIGSMDCSHDSCIDSSEYASPIKK
RHCSDRVLSDYPTLKTLSSLLTKWVDSKQMNIENDEAKEHLSNISKCILPPKKLSNNLLT
SEEYQLFNNNSILDVNNSSNPTHGDVYEDSLSKVTKSESLKILTTLVTSLNNIYDHSSEI
DLIAMNKISQFITRNGTTDEDDSNRDFINDNSLKNSIINNLSKAQQSDISLPSIDVNSLE
LNSQRQIILLNNEQLNELLKIINRINNIPIQNESMASPLQTSSLVNDNLLNPIGLFTASN
PNLTGGLAQCTTTYCCSHYPRLNSKVVNRNNDCLPSFHHISRSTNLNSNPIVYSSNNCPN
NLFSTMSKSMAVNESNTDGCDTHLNGHKSSSPNFPIHWKKEKIRESVEEDGVNSLNGFYD
NNDTFSHQLYQYKDHGNTLEMVDNHQISVNNTPLMNCSSQFLYGTNDKLSTYNRFSSTSR
TTNTTNSYDGSSNSEARELIQSQSEITIQSSDDDQFLYNQIQDGILMKILNTVQHLTAKL
DADADPPEVIQNCRAIQACLDTITAIKRAKSNQIFIDKLDETRSTITLEDSNDNLQHREF
TSKNQENFQLFSPNFIQS
NT seq
4737 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaactgcaagttcacatgtaatacccaccctgaactcaggtggatttttgccaccg
aaattctaccatgataaaattcacccttttcacacttctgacgtatatcccaaaggtact
tgtcatttctgtcttaatcaaaatattcaagcttgttggttttatgatctttatgctaat
tcgacaaatacaatgcaacttcaatcgtcatgctgtcatgtggttcgtttaaatggtctc
atcaggtctgtaagcatggagcatttaagatgcttaaagcaaacttctgtagactattca
cagcaagcaaatggtctaaaaaattcatttatatcttgtgatcggttaaacacaacacca
tttgcagatgcaaacattccagttggatcacgttcatctggagatggtcaaacagaggac
gaagaggaatcgaacggagttaattaccgaattactcctgacatgcagtcaaaaatcaat
tctacttgttcaaatttttcaaatgaagtgaacgttttgctaggttctcattccaaatta
ggttcaccgtcaacttcttttacacacgatcaaattaatactaaacatctacttcttcca
ggtcgttcctcttttgaaaaacatttagttcgagaagtagcgtactttgaaatatgtgaa
tttttaattgaacaaatagaagaaatttatgatatggaaaattgcgagtttttgaattct
atgtacaacgaaaaaaataaggacaactctttacaaattcttactgaccttcaggttcac
aagtcaaatactttaccttcaagtctactctcgtcacatatgactttggtagatgttact
gaccaaaatttacataatccattgatcaattcaatattgcatagtcaatctagagaaaca
gattactgcgagcattgtgtagatagtgccactggactggcagtttcactaattaatacg
tgtatacaaaaaactgctcaaaacgaaaaacaagaagtgattttgtttaaatttttaaaa
ctacaagaactacttctcacgacttgtgatattaactgggttcgtttaaatcaaaagttt
attgaatcgccgagaccaacgaggtttaattgtgatactaaatttcaaaacttttccaaa
aataattggctatcaagtacatctagtgattcaatacaactggattctcagggaaggtgg
aacaaatttcatcatttgacttcattatctcagtcaactaattcaaaaagagctatgaaa
tcaatctcacaatctgattattccccatcagtgttaacttcatctagttcatttggtagt
catacaacaacactttcaaaacctaccataaataaattaagtaataattcaactattatc
atggacacacttttaaagaatgataatagtaataataatgatagtcatgctaataacagg
tcgtcgatttctttaattaaagattttcaattatcggataaaattagatccgataatcaa
gactatcctacatcatcattgtcactgtcatcagcgtttggctgtacacctttaccatat
ggattattgatcaatccacctatccaaaaatctaaacgtaaaggagttcttgttagtcaa
aataaccgatgcgccggttgcggtgccttcattgaaacgcgatatcttaaaagaatgcgt
ttttgtgaattttttggtcgttacttttgttgtgtttgtcattcgaatacacttatgact
cttcctgggaatttagtaacctgttgggattttcgtatgttatcagtcagtaattttgca
cgagacagacttcgtcagctgcataataaacctttattaaggacaatcgattttaacaaa
caagttttaaatcgtcagtctaatcttttgaattgcttgactttacgtaaacaagggaat
ttgatgctaccatttattcaacggtgtcaaacagctcaacaattagtcgattttacttcc
ataccaagtcattggttcgaaacaccagatttatggagtatggctgatttacattctgta
catgatggaaaattatcaatagctttacgtgcattactcttaccaatagtagagcatata
tcaatatgtaaacgatgtttagcttgtggctttatttgtgaaatttgtaaatctggtcaa
attctttttccattcggtcaattcgtttcaggaagtttggtgaactccctcaatgtacaa
gcagattgggtgcttgttcatcttacaatgttagatgttgatattctatggtggtcagtt
ggtaatatgaatgcgacgtctgttaacaactttcatactctggcgtacgatctaaaagga
acagaagctgaagaaaccagtattaatgggatttcgacaggagaacttcaaaatgctttg
ggtaataatcctaatgttcgtctggctaaaaaaattcataatgataaagaaaaagggcaa
acaaactatcggtcaagttcaacagaagcatcgaaacaaaacgtgacaactgagcttgtg
aataaatctagtgatggacagtggaatttaattaaagttcgtgtaggttttgatgttaca
cgtaaaggtgaaagaagtctagttatcaatggatataaatttacaaaatcaagagatggt
atgggtgatcgtgtattttggcgatgttctcgtcgtgaatgcaaagccacagcagttact
gtttcaaataaagtagaacatatacgatcgattcattctcatttgccaccagtagctgcg
gaatttttttctgatgattcttctcgttgtgaacaagaagtacgatttaacaatttagtc
tatactcaacgttctcgtatacgaagacgtagtcaaccgaatccttctatgaaactatca
aaacaatctgtaacgaaaccctgttttcttgaacaaataaaagaattagcctgctcaact
tcatattctgaagcatcgaatgcagtttcacatgaaaaatattcctcaaacataggaagt
atggattgttcacatgattcatgcattgattcaagtgaatatgcatctcctataaagaaa
agacattgttctgatcgagttctatctgattacccaactttaaaaacactgtcttccctt
ctaactaaatgggttgattcgaaacaaatgaatatagaaaatgacgaggcaaaagaacat
ctctccaatatttcaaaatgcattttacctccaaagaaattatcaaataatctcttgact
agtgaagaataccagttatttaataataattcaattttagatgtaaataattcttcgaat
ccaactcacggtgatgtttatgaggattccttgtcaaaagtaacaaaatcagaaagttta
aaaatactaactaccctggtcacttcattgaacaatatttatgatcatagttcagaaatc
gatttaatagcaatgaataaaatatctcagttcattacacggaacggtactactgatgaa
gacgatagtaatcgagactttataaatgataattcactgaaaaattccataattaataat
ttgtcaaaagctcagcaatccgatataagtttaccttcaatagatgtcaattctcttgaa
cttaactctcaacgtcaaattattcttcttaataacgaacaattgaatgaattattaaaa
ataataaatcgaatcaacaatattccaatccaaaatgaatctatggcttcacctctacaa
acatcaagtttagtcaatgacaatttgcttaatcctattgggctgttcacagcttccaat
cccaatttaactggaggtttagcacaatgcactactacttattgctgttcacactatcca
agacttaatagtaaagttgtgaatcgcaataatgattgtttaccatcatttcaccatatt
tcccgttctacaaacctaaattcaaatccaattgtatattcttccaataattgtccgaac
aatttattcagtacaatgtccaaatcaatggcagtcaatgagagtaacactgatggctgt
gacactcatctaaatggtcacaaatcatcatctcccaattttccaattcattggaaaaag
gagaaaatacgtgaatctgttgaagaagatggagtcaattcgttgaatggattctatgat
aataatgatacattttcacatcaactttatcaatataaagatcatggtaatacattggaa
atggtagataatcatcagatatcggttaataatactcctttgatgaattgttcatcacaa
ttcctttatggtacgaacgataaattgtccacttacaatagatttagttcaacttcaagg
actacaaatactactaatagttacgatggcagtagcaacagtgaagcacgtgaattaatt
caaagtcaatctgaaattaccattcagtcatcagacgatgaccaatttttatataatcaa
attcaagatggtattctcatgaaaatacttaatacagtacaacatttgaccgctaaactt
gatgcagatgctgatcctcctgaagttattcaaaactgtcgagctattcaagcgtgtcta
gatacaattactgctataaaaagagccaaatcaaatcagatctttattgataaactagac
gaaacacgttcaactattacacttgaagattcaaatgataatttacaacacagagaattc
acctctaagaatcaagaaaatttccaactattttctcctaattttattcaatcttag
DBGET
integrated database retrieval system