Schistosoma mansoni: Smp_169750 Help Entry Smp_169750        CDS       T01095                                  Name (RefSeq) dicer-1, putative   KO K11592   endoribonuclease Dicer [EC:3.1.26.-] Organism smm  Schistosoma mansoni Brite KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03036 Chromosome and associated proteins [BR:smm03036]     Smp_169750 Chromosome and associated proteins [BR:smm03036]  Eukaryotic type   Gene silencing    RISC (RNA-induced silencing complex)     Smp_169750    microRNA pathway     RISC loading complex      Smp_169750 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Ribonuclease_3 Dicer_dsRBD Ribonucleas_3_3 Dicer_platform Dicer_dimer PAZ Dicer_PBD Helicase_C RM44_endonuclase dsrm Motif Other DBs NCBI-GeneID:  8355393 NCBI-ProteinID:  XP_018644375 LinkDB All DBs Position Unknown AA seq 2319 aa AA seqDB search MILENLILCTFLSVGTLILVDSSLFLQDFNFQKWFSSGLCYFYLVVVDECHMVLDSNHPL SIVFGPNGPMLQNTEDFGPTATRQNMSDFNVSVTGKVRILCFTSALLPREITDPEKARLR LQTLEKRTSCRLETASELLTMLSLGARPQERVILCSKSSSIAAIPFHQFMLGVFREIKEF IIDIESNLPCTKSSSIGDSTSVVINSGGFRICVLDYCKRAISQCEEILNELGLWCAAQIV RVFAKHLIALDRQRSEILKNSDILKDNEYSITIPKINDNEDRISYLLRLTVTQMCFLSRL FQMEFDSILTLEEFQRMISPKVLNLIEQLKLYKPSMNFRIEVAELPTAKNPPIITTNNKK YRKGGSRQRNSRCQTSKISNSSLSSMGFISCDVDSLSDSMSDTMSSLSDDDDDTRSVRSL NSTKSRLSTQSMKNLNSSSKSRKRKNRSNSLINSFNLHDLHFVPASTLNNGGIRPDVDPS TLVYRAVLNTDNRHNKNHNRSGFIGQESSDMTASTNNNNDVSFNRLCGLILVPCQFSAYA LSRLIDELCIWDVDLYFIKIGHLFCRQTLLKEDNDLSTTTNQTLNKTKHGTNFNSYKTLV KFSNEPVNNNDSSTNNNNSNCRNPFSVNQEETITNFRRGAINLLVATQAAISTVTTSGTE LPRCNLVIALRLPNSLAEYLSSKARSRLVNYGAKVIYLMDHDSIEKINNNNNSNNNNNNN NNNNNVNKQSNLNDKQNRSKQTDDHSTVDSMYSNHINDQFLGNFQQLEQLLLQRCRGYNV FADEHAIDPTVVDKILPPIFPRGPCGPKFCLSKAINIINQYCARLPSDYITNLTPKWYWK IFPQPQGFTPSSTGPGSTCGSLKDLQPDGTFNLYQCVLRLPINSSVKETIVGEPMVCKKL AKYSAAFNAIHLLYLSGEMDSKWELINRETNPMHHLTSENYGNLKLSSQHSPMKYKSFSS LNGSANIDSESDYGDYASSIGCCESADDEGEMKSNIQNTVKRRQYYYRKFPTQISNCLPQ PNEPSSNYLYYIDMHLVKPFAEQQYLRGRVCHHPENEPIGFGLLTTKPLHHIPIFPIFSR SGEEKIRFIELWSPKSNYQFNDQYLPIQGPILTQEQIDRLIKFHRILFQEVLRFEKDSVL EFNFHKAYLQVLVVPARRDTCSIDWDFINLVLTSSCDKSICHLLPRRMNEISQEEWKERI DQIKLQAGVVTSNGSGKTFNTSNTHHHHNRKVGSDSVASILVNRLQKSGIIESNSVNNKP SIFEFRMEEFVNAVVTPGYRNLDQPQYYYVAIIRNDMSPLSPFPSDKFRNFAAYYINKYN ALITTNNQPLLDVDLTVLRLNLLIPRYMNIYGHNNTNANDNNGDINNSKSNNVYTHKQYY QQQNHDDHQGEDLTNKQLLVPELCFRHSFPASVWRKAVCIPSILYRLEHLLLAEELRHRI ACETNLGCAYLPECNKILKDDFVNLSSHYNKNGDVNDPDTTSCLFESLNIHLPIAPDHVV VNNESTSKSNTYNNNNERKPTRTNSKFLGSSGGKSRGGGRRKQNCRNTKRAKNHNVIGTT TKVKSTENVPSDLSDTCELNKKMSTIELNENNKKDSSYYSVSNSHTSTDQINKEQNNVSI SSDNDNIYDDEDHRNSIDAETKENHDSSNDNLVVVNEDDGDDDLLSEKPTILKLHATSAS MVHNNKHHRHQSSAQKSTTTALSSLPYDHFSLSNGNLESLLQETKVIELNSNEKPSNDIR KRAYQPGPTTILQALTMSCSNDFINLERMETIGDSFLKFVVTVHLYLTYPEAHEGKLSHL RSRIVCNSNLYRLGKAKDLQNRMIGCKFEPHENWIPPGYYVRQDKRLNNEIIKKFESNRN LVIWSTDTLMDDEVLRNIDFIDENKIKPIENFPISEWDPNDPKVLHAQHLNNQYLITIQQ AIPDKSIADCVEALIGCYLTTRGERSALRLMQWFGIDCLHKSDNSQPTARAPWSLPKSNY LDTDENRANLNEARLVWRFDELESSLNYTFKDPSLLIQAFTHPSYHQLRVLSTSNNLSDQ SNLMFSTDLDCYQRLEFLGDAVLDYVITRFLYEDSKQHSPGVLTDLRSALVNNNIFAALA VRIGLHKYFRASSPQLLHTIDVFVRYQKDVAKDDLDFITNESENQSSKPQHQTYEQHLSK SGKSNNANNTIPTNTGHLTTNRLSDDVEIPKALSDIFESLAGAIFLDSNFSLDTVWQIFY PIMKERIERYTACIPKSPVRQLLELEPEGTKFERARRMVDGRISVCAHVLGKGRFYGVGR NYRLAKSLAAKRALRVLRRLNQPSQTTPVTTNGDYDQQS NT seq 6960 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgatacttgaaaacttgatcctttgtacatttctgtcggtcggtacactgattctggtt gactcaagtttattcttacaagatttcaattttcaaaagtggttttcctccggattatgt tatttttacctcgtggtagtcgatgaatgtcatatggttttagattcaaatcatccatta tcaatagtgtttggaccaaatggtccaatgcttcaaaacacagaagactttggaccaacg gctactagacaaaacatgagtgactttaatgtgtcagtaaccggaaaagtcagaatctta tgctttacatcggccttattgcctagagaaataacagatccagaaaaggcacgattacgc ttgcaaacacttgaaaaaagaactagttgtcgacttgaaactgcttcagagttattaact atgctttcactaggtgcgagaccccaagaacgtgttatattgtgttccaaatcgtcctca attgctgcaatacctttccatcagtttatgttaggagtttttcgagagattaaagaattc atcatcgatatagaatccaatctaccttgtacaaaaagttcatcaataggtgattctaca tcagtggtcattaattctggaggttttcgtatttgcgtacttgactattgtaaacgtgct atatcacaatgtgaagaaatattaaatgaattaggcttatggtgtgctgcacaaattgtt cgtgtatttgctaaacacttaattgcattagaccgacagcgtagtgaaattcttaaaaac tcagacatacttaaagataatgaatattcaattaccatacctaaaataaatgataatgaa gatcgtatatcttatcttttacgtctcactgtaacacagatgtgttttcttagtcgttta tttcaaatggaattcgactcgatattaacgttggaagaatttcaacgtatgatatcgcct aaagtattaaaccttattgaacaattaaaattgtacaaaccaagtatgaattttcgtata gaagtagctgaattgcctactgctaaaaatccaccaataattacaacaaacaataagaaa taccgaaagggtgggagtcgacaacgtaatagtcgttgtcaaacatctaaaatatcaaat tcttcactatcgtcgatgggtttcatctcatgtgatgtagattccttgtctgatagtatg tcggatacaatgagtagtttatcagacgatgatgatgatacacgaagtgttcgtagttta aattctacaaaatctcggctttctacgcaatccatgaaaaatttaaattcctcatccaaa agtcgtaaacgtaaaaatagatcgaactctttaattaattcgttcaatttacacgatctt cattttgttcccgcatctacactaaacaatggcggtattagaccagatgttgatccttcc acattagtttatcgtgctgttttgaatactgataatcgacataataaaaatcataatcgt tccggatttataggccaagaatcatctgatatgactgcttctacaaacaataataacgat gtctcatttaatcgtctctgtggtttaatattagttccatgtcaattctcagcttatgca ttatctcgtttgattgatgaactatgtatttgggatgttgatttgtattttattaaaatt ggtcatttattctgtcgtcaaactttattaaaagaggataatgatctgtcaacaacaaca aatcaaacattgaataaaacgaaacatggtacaaatttcaattcatataaaacacttgta aaatttagtaatgaacctgtgaataataatgattcttcaaccaataataataatagtaat tgtcgtaatccattctctgttaatcaagaagaaacaataactaattttcgtcgtggtgct atcaatttactagtagctactcaggcagcaatttcgactgttaccaccagtggtactgaa ttgccacgttgtaatttagtcattgcattacgtttaccgaatagtttagctgaatacttg tccagtaaagccagatcaagattggttaattatggtgcaaaagtcatttatcttatggat cacgattctattgaaaagattaataataataataatagtaataataataataataataat aataataataataatgtaaataaacaatcaaatttgaatgataaacaaaacaggtcaaaa cagacagatgatcattctaccgttgattcaatgtatagtaatcatataaatgatcaattt ttgggcaattttcaacaacttgaacaattgttacttcaacgatgtagaggttataatgtc tttgcagatgaacatgctattgatccgacggtggtcgacaaaattctaccgccaattttt cctcgtggcccatgtggtccaaaattctgcttatccaaagcaatcaatataatcaatcaa tactgtgctcgtcttcctagtgattatataacaaatttaactccaaaatggtattggaaa atatttcctcaacctcaaggtttcactccttcatcaactggtccaggatcaacctgtggt tcacttaaagatctacaacctgatggaacgtttaatttatatcaatgtgttttacgacta ccaatcaatagttcagtaaaagagacaatagttggtgaaccaatggtgtgtaagaaacta gccaaatattcagctgccttcaatgctattcaccttttatacttaagtggtgaaatggat tctaaatgggaattaattaatcgtgaaactaatcctatgcatcatttaacaagcgaaaat tatggtaatttgaaattatcttctcaacactctccaatgaaatacaaatcattctcctct ttaaacggttccgctaatatagacagtgaatcagattatggagattatgcatcgtcaatt ggttgttgtgaatcagctgatgatgaaggtgaaatgaagtcgaacatacagaatactgtc aaacgaagacaatattactatcgtaaattccctactcaaatatccaattgtttacctcaa cctaatgaaccttcgtcaaattatctttattacattgatatgcatttggttaagccgttt gcagaacaacaatatttacgcggtcgtgtatgtcatcatcctgaaaatgaaccgataggc tttggtttactcactaccaaaccattacatcatatacctatatttccaatatttagtaga tctggtgaagagaaaattcgttttattgaattatggtcaccgaaatctaattatcaattc aatgatcaatatttacctatccaaggtcctattttaacgcaagaacaaattgatcgactc attaaatttcatcgtatactattccaggaagttctacgttttgaaaaagattctgttctg gagtttaattttcataaagcctatttacaggtccttgtggtacctgctaggcgagataca tgttcaattgattgggatttcattaatttagtgcttacatcatcttgtgataaatctata tgtcacctattaccacgtagaatgaatgaaatatctcaagaagaatggaaagaacgcatt gatcaaattaaattacaagctggtgttgttactagtaatggatcaggtaaaacatttaac actagcaacacccatcatcatcataatcgaaaagttggtagtgacagtgttgcatcaatc ttagtgaatcgtttacaaaagtcaggtattatcgagtcaaattcagttaataataaaccg agtatatttgaatttcgaatggaagaattcgtcaacgctgtggttacacctggttatcga aatttagatcaaccacaatattattatgtagcaataataaggaatgatatgagtccgcta tcaccatttccatcggataagtttcgtaatttcgctgcatactatatcaacaaatataat gctttaattacaacaaataatcaaccattgttggatgttgacttgacagtattgcgacta aatttattaataccacgttatatgaatatatatggacataataatactaatgctaatgat aataatggtgatattaataattctaaatctaataatgtttatacacacaaacaatattat caacaacaaaatcatgatgatcatcagggtgaagatcttacaaacaaacaattattagtt cctgaattatgttttcggcattcatttcctgcttcagtatggcgtaaagctgtatgtatc ccaagtatcttatatcgtttagaacacttattattagctgaagaattacgtcatcgtatt gcttgtgaaacgaatttaggatgtgcatacttaccagaatgtaataaaatcttgaaagat gactttgtcaatttgtcttcacattacaacaagaatggtgatgttaatgatcctgatact acttcctgtttatttgaatcattaaatattcacctgcctattgcaccagatcatgttgtc gtaaataatgaatcgaccagtaaatctaatacttataacaataataatgagcgaaaacct acgagaaccaattcgaaatttctgggtagtagcggtggcaaaagtcgtggtggtggccgg cgaaaacaaaattgtcgtaatacgaaaagagctaaaaaccacaatgttatcggtaccacc actaaggtgaaatcaactgaaaatgttccaagtgatctatcagatacatgtgaattaaac aagaaaatgtctaccattgaattgaatgaaaataataaaaaggactcatcatactattca gtgtctaatagtcatacttctaccgatcaaataaacaaggaacaaaataatgtaagcatt tcaagtgacaatgataatatttatgatgatgaagatcatcgcaactctatcgatgctgaa accaaagaaaatcatgatagcagtaatgacaatctcgttgttgttaacgaggatgatggt gatgatgatttattatctgaaaaaccgactattttaaaacttcatgctacttcagcatca atggttcataacaataaacatcatcgtcatcaatcgtcagcacagaaatctactaccaca gcgttatcatcattaccatacgatcatttcagtttatcaaacggaaatttagaatcatta ttacaagaaacaaaagttattgagttaaattcaaatgaaaaaccttcaaacgacattcgt aaacgtgcttatcaacctggacctacaactattttacaggctttaacaatgtcatgttct aatgatttcattaatctagaacgtatggaaacgattggtgatagttttttgaaatttgtc gtcacggtgcatctctatcttacctatccggaagcacatgaaggcaaattaagtcattta cgtagtcgaatcgtttgtaattccaatttatatcgtttaggtaaggctaaagatttacaa aatcgaatgattggttgtaaatttgaaccacatgaaaattggataccacctggatattat gtacgtcaagataaacgtcttaataatgaaataattaaaaaatttgaatctaatcgtaat ttagtaatttggtcaactgatactttaatggatgatgaagttctacgaaatattgatttt attgatgaaaataaaattaaacctattgaaaattttccaatttctgaatgggatccaaat gatccaaaagtgttacatgcacaacatttaaataatcagtatttaattactatacaacaa gctataccggataagtcgatagcagattgtgttgaagcattgatcggttgttatttaaca actcgtggagaacgctctgctctacgtttaatgcaatggtttggaatcgattgtcttcat aaatcagataatagtcaaccaactgctagagctccatggtctttaccaaaatccaactac ttagataccgatgaaaatagagcaaatttaaatgaagcacgtttagtttggagatttgat gaattggaatcttcgttaaattatactttcaaggatcctagtctattgattcaggctttt acacatccatcttatcatcaactacgtgttttatcaacatccaataatttatctgatcaa tccaacttaatgttttcaactgatttagattgttatcaacgtttagaatttttaggtgat gctgtattagattatgtaataacaagatttctatatgaagattctaaacaacattcacct ggtgtattaactgatttaagatcagctttagtaaataataatatatttgctgcattagct gtacgaattggtttacataaatattttcgtgcttcatcaccacaattgttgcatacaatc gatgtatttgtacgttatcaaaaagatgtagctaaagatgatctagattttattacaaat gagtctgaaaatcaatcctcaaaacctcaacaccaaacatacgagcaacatctgtcgaaa tcaggcaaaagtaacaatgccaacaacacaattcctaccaatactggtcacttgacaact aatcgattatcagacgatgtagaaattcctaaagctttaagtgatatatttgaatcttta gctggtgcaatatttcttgattcgaatttcagtctggatactgtttggcaaatattctat cccattatgaaagaacgtattgaacgatatactgcttgtattccaaaatcaccagttaga caattattagaactggaaccagaaggaacaaaattcgagagagctcgacgaatggtggac ggaagaatttcagtttgtgcccatgtattaggtaaaggtcgattttatggtgttggacga aattatcgattggccaaaagcttagctgctaaacgtgctttaagagtactgcgtagatta aatcagccgtctcaaactacaccagtaactactaatggagactacgatcaacaatcatga

DBGET integrated database retrieval system