Schistosoma mansoni: Smp_173990
Help
Entry
Smp_173990 CDS
T01095
Name
(RefSeq) rab11, putative
KO
K02105
catenin beta 1
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Pathway
smm04310
Wnt signaling pathway
smm05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04310 Wnt signaling pathway
Smp_173990
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
Smp_173990
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ras
Roc
Arm
Arf
ELMO_ARM
MMR_HSR1
GTP_EFTU
DUF6082
KAP_NTPase
RsgA_GTPase
NTPase_1
AAA_22
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8340519
NCBI-ProteinID:
XP_018646608
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
933 aa
AA seq
DB search
MYGGSISGEDDKYDYLFKVVLTGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATKSVEI
DGRTIKAQIWDTAGQERYRAITAAYYRGAVGALLVYDITKRETFNNLEHWLLELRGHAEP
DIVIMLVGNKCDLRHLRTILTEDAKLWAERHGLFFMETSALESTGVENAFYSILRTIFEA
VRSHPPASNVDMKMSPYPNQPIVSPNTDSSKSGRRCCRMCKRCAIMIWGVWMRLASNNDN
SFSNRIMLSEGIFYSLDKISVFKELKMKKHSHVYDPQNSKEFQHSVSVNSLKSDSSTPTF
HECFSSVEQLSGPVSKLNGIIQDLIDYKNDAEFALMTASDLAKRLRSNISVDEALQVVSY
IHKFARYEAARCGLVNCSELVRAIIHILQTTKNADLQSEAALTLQLLTKALTGAKLAYEE
IGISQLVEMLRHPSEVMYTTALYVLNQLLWHLPNYSRPKFRQCNGQLNLIYLLQENRLDD
SNWLLICLDTLRMAVYESSETKLSITATNIYQIIVHLLRTYPTNMKIAYNIARLIKVLSV
CNENKIKLVEAGTVEALTPLLNCTNEVLQLETLWGLRNISDQAYHLLATKNLIPILISLL
ASKNEHISICSAGCLCNLTCQNVQNKSLLVEKGGVKVLCRLLCLNSDRQEIAEPICSALR
HVTHRNPHSNSAIYEVRTSDTLSTIASLFLKYQFVSALPLLKSVVGLVRNLSTVEVTRHE
LKDLNVPGMVANIFLQTFNSLNKQQYHGITEQDSNHYLEGVNLEDMLELTLAALQIMAKD
QSIQEEFIHTAGLVSSVVQLVYSPSVCLQRASTAFLSQLSTSRSGCQAIENEGACPRFTE
LIQSNNEYIAAYTAAILHRIAQDKPEAYRRRLSLELRQSLFDGGLLNDPNEIGPYPSSPS
KLTDGILPNDNSPHITDRRSRNLSDSNLRQRSK
NT seq
2802 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatggaggttctatatctggtgaggatgataagtacgactatttgtttaaagttgta
ctgaccggggattcgggtgtcgggaaaagtaacttactctcacgtttcacaagaaacgag
tttaatttggagagtaaaagtacaatcggcgttgagttcgctacaaagagtgtggaaatt
gatggaaggactataaaggcccagatctgggatactgctggtcaggaacgttatcgagct
ataacagctgcctattatcgtggtgctgttggtgctctgttggtttacgatatcacgaaa
agagagactttcaacaatctggaacactggttactggagttacgaggccatgcagaacca
gatatcgttattatgttggttggtaataaatgtgaccttaggcatcttcgaactatattg
acggaagatgcaaagctttgggctgagaggcatggacttttttttatggaaacctcagct
ttggaatcgaccggcgttgagaatgctttttattcgattcttagaactatttttgaggct
gtccgttcacatcctccagcgagtaatgtggacatgaaaatgtctccatatcctaatcaa
ccgatcgtttcaccgaacacagacagttcaaagagtggacgacggtgttgtaggatgtgt
aaaaggtgtgcaatcatgatctggggagtttggatgcgtttagcaagtaataatgacaat
tcattctcaaatagaatcatgttatccgaaggcatattttattctttggacaaaatttct
gtcttcaaagaacttaaaatgaagaaacattcacacgtatatgatccacaaaactctaaa
gaatttcaacacagtgtatcagtcaattctttgaagtccgactcatctacaccaacattc
cacgaatgtttttcttcagttgaacagctgtctggacctgtgtctaaactgaacggaata
attcaagaccttattgactataaaaatgatgctgaatttgcgcttatgactgcttcagat
ttggctaaacgccttcggtctaacatttctgtcgatgaagcattacaagttgtatcatat
attcataaatttgcacgttatgaagctgcacgttgtggattggtgaattgttctgagctt
gttcgagctattatccacattcttcaaacaactaaaaatgctgatctacaatctgaagct
gcactgactctgcaattgttaactaaagctttaactggtgctaaattagcctatgaagag
attggtatttcacaattagttgaaatgttaaggcatccatcagaagtgatgtataccact
gctctttatgtattaaatcaattattatggcatttaccaaattattcacgtccaaaattt
cgacaatgtaatggtcaattaaatctgatttatttacttcaagaaaatcgtttggatgat
tcaaattggttattaatttgtttggatacattacgtatggcagtttatgaaagtagtgaa
acaaagctttccattacagcaaccaatatctatcaaattattgtacatctattgagaaca
tatccaaccaatatgaaaatagcttataatatagcaagattaattaaagtattaagtgta
tgtaatgaaaataagatcaaattagttgaagctggtactgtagaagctttaactccattg
ttgaattgtactaatgaagtattacaattagaaacactatggggtttgcgtaatatcagc
gatcaagcttatcatttattggctacaaaaaatcttatccctatattaattagtttattg
gctagtaaaaatgaacatatctctatatgttctgctggatgcttatgtaatttaacatgt
caaaatgtacaaaataaaagtctgctggttgaaaaaggtggtgtaaaagttctttgtaga
cttttatgtttaaattcagatcgtcaagagattgccgaaccaatttgttcagctttaagg
catgtaactcatcgaaatcctcattctaattcagcaatttatgaagtacgtaccagtgac
actttatcaactattgcttccttatttttgaaatatcaatttgtatctgctttaccttta
ttaaaatctgttgttggtcttgttcgtaatttatctacggtggaagtcacacgtcatgaa
cttaaagatttaaatgtaccaggaatggtagcaaatattttcttacagacgtttaattca
ttgaataaacaacaatatcatggtataactgaacaagattctaatcattatctagaaggt
gtaaatcttgaagatatgctcgaattaacattagctgcattacaaattatggctaaagat
caatctattcaagaagaattcattcatacagcaggtttagtttcatctgttgtacaatta
gtatattcaccatccgtatgtttgcaacgtgcttcaactgcattcttaagtcaattgtca
acatctcgttctggatgtcaagcaattgaaaatgaaggagcttgtcctcgatttactgaa
ttaattcaatcgaataatgaatatattgccgcatatactgcagcaattttacatcgtatt
gctcaagataaacctgaagcttatagacgtcgtttatcattggaattacgtcaatcactt
tttgatggtggactacttaatgatccaaatgaaataggtccatatccttcaagtccatca
aaactaactgatggtatactaccaaatgataattcacctcatattactgatcgaagatca
agaaatttatccgattcaaatttaagacaacgttcaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system