Schistosoma mansoni: Smp_176510
Help
Entry
Smp_176510 CDS
T01095
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
smm
Schistosoma mansoni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SH3_2
SH3_9
SH3_1
fn3
BLUF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8349581
NCBI-ProteinID:
XP_018645561
LinkDB
All DBs
Position
3
Genome browser
AA seq
1530 aa
AA seq
DB search
MVDQRNPGNMSYECQMEKTLQETEDSKSKDTVKQIRSKIKELEKRCALQLLKHEEILLEI
EDVRKRSFNHSNTNHNHNNNSSIITTINTIKNQLNDIDSINQLSSSTSCLINNQNQNQNN
QNNKVYGRLLQSGQQQQQHQHKLKHDDIQSTYEMDSLLFDSSAMGIIELDKQMTTTTTNN
NNNNKQVKGRLFRSNTDLQITEGDDPNLVELFQVIEESRKSTDVPAPRMITLERQLFQSV
LISWKSPELNENKIVSAYHIYVDGQFRLAVMAKEKTRALIDNVDADKPHRISIRSISSHG
QSKDAQCTLVVGRGMTATPARLKATQIGTKSAKLSWIPGNSNYYHRVYLNETSLHVCKPG
VYKLHLTDLPPDTLHQVCVQALPSPISIQESAQQSPPWINTACSGVYTQKLAAFIEFRTL
PIGLPDPPSHVQIEAGPQDGMLLITWLPVPQDKNAVEAVTAAGASSTLPVQGYTVCLNGQ
AIMELKGASRDHAILKLSTIKDHIQKLLHNSTQSPTDIYDHNTGHLSNPNHSSKSSTTYH
SMIELYITVHSTIPTELSSKQEINISKECTLIKGSEGPASKPIHLTASLLILAAGSLETA
YKIFGLNLATKLGINENTAKLAGVSLSLDGLQETTTRENNQNVENINSDGDHGLLVVSAE
NVVRKPSPTADALGSAEALLLRRKLEKQELKNNDNDDHDHNPITEISNYSHTIKPKNNLY
QSIWDTSHTQKSPINRYYQYQKSHYPRNNQESKYKLRQARSISDDYELNLRYGPLKDVYY
SDEASLNSSASSESSTAPDNNRWFRTSSSYNLTADYPNRRWKPRGVIRSNIDRGYPHEYH
ESFTIGRLNRREGIRRRHLHHLYDSKMYPLYKSQHFYNLPNHPQSFKSHTYSGRISPENK
PTSLFKHSSRRLLDQYPYNQHRKHEILPLSSSSNEERYPDSMLNNRNYFSQTDNFNKIPL
PETCLVNTRSRSTSPKRIHKLSGLSHPFRNTEMEYNIGNVPIHRTPKHYRPLPIGIENRR
WPIRERYYFGHRNPHENLSLPEIQITRNSSLSDNEPQFQANDQYQQQSRYSYQDFRGPTR
PIRSRFMDTRRHGSYDPQMNTANFSTTRHDPDYSRPVVPSDSYTPGPKRPFHFNMPSPAS
GPMPQHEYRPPFNQVNIKSCRSGDQGSGLRQSVVSQYSRPSKSFIQNEQQYGRNQRNIND
DYSSRISHNELKPIQVVVALYDYDPTTMSPNIDGAQEELPFREGQLIKILTECDEDGFYL
GECNGLRGLVPSNMVSELQSHSLRSQKINHSIDSHSNLIDNNYLSSDQLNKVRSTDMNSP
IQNYYYTTRKYDSFISQSNTTPRNAELSFRAGEQITVYGNMDDDGFYYGETKDGRRGLVP
SNFLHSCTNDTNYLNKQKNSSTISTQLSSTNISINHRDQSYSMDPNSSSVRMQSRMNSSQ
FHNVRNNKSEPNSDRTKLMHNNTRPNSPCTQTRLYTTNNSNEVINTNINSTAYHRDELTM
NGMERFPENEENPIIVMDLNPISNNSHVSE
NT seq
4593 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcgatcaaagaaatcctggaaatatgtcctatgaatgtcaaatggaaaaaactcta
caagagactgaagattccaagtcgaaagatactgtaaaacaaattcgttcaaaaattaaa
gaattagaaaaacgttgtgcattacaattattaaaacatgaagaaattttattagaaatt
gaagatgttcgtaaacgtagttttaatcattccaatactaatcataatcataataataat
tcatcaatcattacaacaatcaatacaatcaaaaatcaattaaatgatattgattcaatc
aatcaattatcctcatcaacatcatgtttaatcaataatcagaatcagaatcaaaataat
cagaataataaagtctatggtcgtttattacaatcaggacaacaacaacaacagcaccaa
cataagttgaaacatgatgatatacaatcaacatatgaaatggattcattattatttgat
tcatctgcaatgggtattatagaattagataaacaaatgacgactactactactaataat
aataataataataaacaagttaaaggtagattatttcgtagtaatacggatttacaaata
acagaaggagatgatccaaatttagtcgaactgtttcaagttattgaagaatctagaaaa
tcaaccgatgtaccagcaccaagaatgatcacattagaacgtcaattatttcaaagtgta
ttaattagttggaaatcaccagaattaaatgagaataaaattgtatccgcatatcatatt
tatgtggatggacaatttcgtttagctgttatggctaaagaaaaaactcgtgcacttatt
gataatgtggatgctgataaacctcatcgaatttcaattcgatctatttcttcacatggt
caatccaaagatgcacaatgtacattagtagtaggtcgtggtatgactgctacacctgct
cgactgaaagctacacaaatcggtactaaatcagctaaattaagttggattccaggaaat
agcaactattatcatcgagtctacttaaatgaaacttcattacatgtatgcaaacctggt
gtatacaaattacacttaactgatctaccaccagatactttgcatcaggtttgtgttcaa
gccttaccatcgccaattagtatacaagaatcagctcaacaatctccaccttggattaat
actgcttgtagtggtgtatacacacagaaactagcagcttttatagaatttcgtacacta
cctataggtctaccagatcctccaagtcatgtacaaattgaggctggtcctcaagatggc
atgctacttatcacatggcttccagttccacaagataaaaatgctgtagaagctgttaca
gctgccggtgctagtagtactttaccagtacaaggttatactgtttgtttaaatggtcaa
gcaattatggaattgaagggagcttcaagagatcatgctatattgaaattatcaacaatt
aaagatcatatacaaaaattattacataattcaactcaatcaccaacagatatatatgat
cataatactggtcatttatcaaatccaaaccattcaagcaaatcttcaactacatatcat
tcaatgattgaattatatatcactgtacattcaaccattccaacagaattatcatctaaa
caagaaattaatatatcgaaagaatgtacattaataaaaggttctgaaggtcctgcatca
aaaccaatccatttaacagctagtttattaattttagctgctggttccttggaaacagct
tataaaatatttggtttaaatcttgcaactaaacttggtataaatgaaaatacagctaaa
ttggctggtgtatctttatcacttgatggtctacaagagacaactacacgtgaaaataat
caaaatgtagaaaatataaattcagatggagatcatggattattagttgtttcagctgag
aatgttgtacgtaagcctagtccaacagctgatgctttaggttcagctgaagcattatta
cttcgtcgtaagttagaaaaacaagaattaaagaataatgataatgatgatcatgatcat
aatccaatcactgaaataagtaattatagtcatactataaaacctaaaaataatttatat
caatcgatttgggatacgtcacatacccaaaaatcaccaattaatcgatattatcaatat
caaaaaagtcattaccctcgaaataatcaagagtctaaatataaattacgtcaagctaga
tccatttcagatgattatgaattgaatttaagatatggtccattaaaagatgtttattat
agtgatgaagcttcattgaatagttcagcatcaagtgaatcttcaacagcaccagataat
aatcgatggtttcgtacatcttcatcatataatttaacagcagattatcctaatcgacga
tggaaaccacgtggtgttataagaagtaatatagatagaggttatccacatgaatatcat
gaatcttttacaataggacgtttaaatagaagggaaggaataagacggagacatttacat
catctttatgatagtaaaatgtatcctctatataaaagtcaacatttttacaacttacct
aatcatccacaatctttcaaaagtcatacttacagtggaagaatatcaccagagaataaa
ccaaccagtttattcaaacatagttcaagacgattacttgatcagtatccatataatcag
catagaaaacatgaaattcttccattgtcttcatcatccaatgaagaaagatatcctgat
tcaatgttaaacaatcgaaattattttagtcaaacggataatttcaacaagattccactt
cctgaaacttgcttagtgaatacaagaagtcgtagtacaagtcctaaaaggattcataaa
cttagtggattgtctcatccatttagaaatacagaaatggaatataatatcggaaatgta
cctattcataggactcctaaacattatcgtccattacctataggaattgaaaatcgacga
tggccaattagagaaaggtattattttggtcatcgtaatcctcatgaaaatctctcacta
ccggaaatacaaataacacggaatagtagcctatcagacaatgaacctcaatttcaagca
aatgatcagtatcaacaacagtcacggtattcctaccaggattttcgtggaccaactaga
cctattcgatctcgttttatggataccagacgacatggttcatatgatcctcagatgaat
actgctaacttctcaacaacacgtcatgaccctgactattcacgtcctgtagtaccatca
gattcatatacacctggaccgaagagaccgtttcactttaacatgccatcaccagcatcc
ggtccaatgcctcaacatgaatacagacctccatttaatcaagtcaacattaaaagctgt
agatcaggcgatcaaggaagtggtttaagacaatcagttgtatcacaatattcacgacca
agtaaatcatttatacaaaatgaacaacaatatggcagaaatcaaagaaatattaatgat
gattattcaagtcgaataagtcataatgaactgaaaccaatacaagttgtagtagcttta
tatgattatgatccaactactatgtcaccaaatattgatggtgcacaagaagaactacca
tttcgagaaggacaacttatcaaaattcttactgaatgtgatgaagatggattttatctt
ggtgaatgtaatggtctacgtggattggttccatccaatatggtttctgaattacaatcc
cattcattaagatcacagaaaatcaatcattctatagattcacattcaaatttaatagat
aataattatttatcatcagatcaacttaataaagttcgttcaacagatatgaattcacca
attcaaaattattattatacaactagaaaatatgattcattcatttcacaaagtaatact
actcctcgaaatgctgaattatcatttcgagctggtgaacaaattacagtatatggtaat
atggatgatgatggattttattatggtgaaacaaaagatggtcgtcgtggtcttgtgcct
tcaaattttttacattcttgtacaaatgatacaaattatttaaataaacaaaaaaattct
tcaactatttcaacacaattatcttcaacaaatatatcaatcaatcatagagatcaatca
tattcaatggatcctaacagttcatcagttcgaatgcaaagtcgaatgaattcatcacaa
tttcacaatgttagaaataataaatcagaaccaaattctgatagaactaaactgatgcat
aataatacacgacccaattcaccttgtacacaaacaagattatatactactaacaatagt
aatgaagtaataaatacaaacatcaattcaactgcttatcatcgtgatgaattaactatg
aatggtatggaacgttttccagagaatgaagaaaatccaatcattgtaatggatttaaat
ccgatatcaaataattcacatgtaagtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
