Schistosoma mansoni: Smp_180200
Help
Entry
Smp_180200 CDS
T01095
Name
(RefSeq) putative zinc finger protein
KO
K13291
terminal uridylyltransferase [EC:
2.7.7.52
]
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
Smp_180200
Enzymes [BR:
smm01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.52 RNA uridylyltransferase
Smp_180200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MTPAP-like_central
PAP_assoc
TUTase
NTP_transf_2
zf-CCHC
zf-CCHC_3
Polbeta
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8340849
NCBI-ProteinID:
XP_018649388
LinkDB
All DBs
Position
1:59316100..59370080
Genome browser
AA seq
1552 aa
AA seq
DB search
MAGTSILQPNLSQTAELKSTLLYLPPITDSHRIALDSELKSASLSVVADTCEMQRRQNFA
NDLIAAIEARIPSNSSPQPVCGQSTNDTEQSMGIGYVLSNIFDLLQLNACESPTNTPQIR
TISEKAASFNCSTGHNTKMNELSDKPKFPKFHTVLRTSGDYFYLCLTDFYGVRYRISTGN
PYGYDLAKLINTYLNLNDQALQLAILFRKLSRLGHLDMPENGTFEETVIPLLVIFYLQHY
EPPLLPNLHMLYRQHLDKIPENSYHQVLPPNTDCSFITDIELIRKLCPDQPYSSSSNNLP
CLADLWLGFLRFYLFDFKISSCTINIVEPEPVPCFNAPEKRCFTVTDPFNPKHNLCRNLT
QVSRDYINSQLLAAYGYFGVPRLTINGRHLFTHISVVEKSPVEPKDVCDKLDQNTSSSIN
QTTVSNDKMTTSAGIHLTPIIDDSDNFESNLNKSVNLWFDRLKLRNVVDDDISIDSLCGQ
SQEMNCSNENVFEDQDNHQLSPLEMNQDSNLLSKSDGDNYSEAIVEQSSNNFLDVEEYLN
FDISMTVSDDAFLDCNFENDFNDGEILEHLESALDVDYSDDIIDPISTFSSFVDRNSEVL
ETLTPQGSNQKRIKSSDNNNLTSNDLNSVNHLSSMSCPSKELVTASNELIRRDDKDEEDA
TASTNKLAKKARKSEKKQQSHSNNILNPNNNTTASKSSPTRAKKRKTAKKLEWEDVISSR
SAVAPPIDDDRPDYYNSKLLENLQPDDFDFKFVLHMNLSSNRRHNQSSVLGLASRNQPST
LLAHFDAPQPQCQACNLTGHRQSQCETTSDKSVSFLAWHKLLNKTPWPPIAEQIENLTHC
LNCLEEHHETDNKVNARQELVKKIYECFSYRFPSVQLELFGSCANGFDLQTSDLDICVFF
PVGSTEWHYLKDKNATNMLIRQFKKQLFYCKNRLNITHIQPILTARVPILKALSNTRMLA
FYTKVEPKLRTLGIALKTVTKITKIGRAASGGISSYAWIIMLIHYLQQIDQLPVLQELYE
GSTKPTTLVNGWNVWYQNDLSVINRLWKPANPSQPVGEMWLGFLRYYLFEFNHDKYVVTI
RQKKLLIRFVKMWRSLFAIEEYIVVDRKLLRKNTLCFICNQTGHVAFECPSNKKKNKREN
SDIVALHSLIGHFLHKTQASQSNSQKPMDQHYDNSNQNRQLNSTSTVCKTFRKPNNTPTN
ISSHTYRNPFKPQNSYQVQQIRNNFQQQPFISNYHHVQPHHVNMPTNLNSILPSVPYPTP
LLPNNTVGFIPNYGFMPNSLSNHLVQSNVYDRQQSFPPSYYSPPLGCVNNQQQYKNTIQA
NHPVNYRPKGQQNNNNETKNYHKFSRVSSSSVYQEQLPSVTSNHPIAVTSNKSPCKPKKY
NNNQNVSNPHQTNSVLRKSHNHEFESSFAKDSNCNNPGIINDHTSKSALPSSGNQTNSCS
TTSYRQKQSNSPVKVKSNFQQSPQKAKCSVSNGCVIDSHEKRKYPITESNKVNSVFRGNR
NCQRFGCPTKTQLSNNVNNNNGHLVDENLVKRLHNMSTTSSSSQSSNNKYRY
NT seq
4659 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaggcacatcaatattacaacctaacctatcacagactgctgaactaaaatcaacg
cttctttatttgcctcccatcacggattcccatagaattgcattagattcggagctaaaa
tccgcttctctttctgttgtggctgatacctgtgagatgcagcgacgacagaattttgca
aatgatctgattgctgctattgaagctcgaattccaagtaattctagtccacagcctgta
tgtggtcagtcaacaaatgacactgaacagtcaatggggattggttatgttctttctaat
attttcgatttattacaacttaatgcatgtgaatcaccgactaacacaccacaaatacga
acaatttccgaaaaagctgcctcgtttaattgttctactggtcacaatacaaaaatgaat
gaattatccgacaaacctaaattccctaaatttcatactgttttgcgtacaagtggtgac
tacttttatctttgtctgacggatttctatggtgtacgttatcgtattagtactggtaat
ccatatggatatgatttggccaaattaattaatacctacctcaatttaaatgatcaagct
ctacagttagcaatattatttcgtaaattatcacggttgggtcatttagatatgccggaa
aatggtacatttgaagaaacagtcatacctctgttagttatattctacttacaacattat
gaacctccattacttccaaatcttcatatgctttaccgccaacatcttgataaaattcct
gaaaattcttatcatcaggttttgccacccaatactgattgttcgtttattacagacatt
gaattaattcgaaaattatgtcctgatcaaccatattcctcttcgtctaacaatttacca
tgtttagctgatttatggcttggtttcctcagattttatttatttgattttaaaatttct
tcttgtacgattaatattgtggaacctgaaccagtgccatgtttcaatgctcctgaaaag
cgttgttttacagttaccgatccttttaaccctaaacataatctctgtaggaatttaact
caagtcagtcgagattatatcaattcacagttattagcggcctacggttatttcggtgtg
ccacgattgaccattaatggtcgacatttgttcacgcacatttctgttgttgaaaaatct
cctgttgagccaaaagatgtttgtgacaagttggatcagaatactagtagtagtattaat
caaacaactgtgtctaatgataaaatgacaacatctgcaggtattcatttaacacctatc
attgatgattctgacaattttgaatccaatttgaataaaagtgttaacttatggtttgat
cgtttaaaactacgaaatgttgttgatgatgatatttcaattgactcactttgtggtcaa
tcacaagaaatgaattgttcaaatgaaaatgtgtttgaagatcaagataatcatcaattg
tctcctttagaaatgaatcaagattctaatttgttaagtaaaagtgatggagacaattat
tcagaggctatagttgaacaaagttcaaataattttcttgacgtcgaagaatatttgaat
tttgatatatctatgactgtttcagatgatgcttttttggattgtaattttgaaaatgat
tttaatgacggtgaaatccttgaacatttagaatctgctcttgatgtagattatagtgat
gatataattgatccgatcagtacattttcatcttttgttgacagaaattctgaagtttta
gaaactttgactcctcaaggaagtaatcaaaaaagaattaaatcgtctgacaataacaat
ttaacatcaaatgatttaaattcagtcaatcatttatcatctatgagttgtccatcaaag
gaattagttactgcttcgaatgaactaattagacgtgatgataaagatgaggaggatgct
acagcatcaacaaataaattagctaaaaaagcacgtaaatctgagaaaaaacaacaaagt
cattccaacaatatattgaatccaaataacaatacaactgcatcgaaatcaagtcctacc
agagctaagaaaagaaaaaccgctaaaaagcttgaatgggaagatgtcatttcgtcacgt
tctgcagtcgctcctcctattgatgatgatcgtccagattattataattcgaaacttcta
gagaatctacaaccggacgattttgatttcaaattcgttttacatatgaacttatcctct
aatcgtcgacataatcaatcatcagttttaggtttagcttcacgaaaccaaccatccaca
ttattagctcatttcgatgcacctcaacctcagtgtcaagcttgtaacttaactggtcat
cgacaatcacaatgtgaaactactagtgataaatcagtatcatttttagcttggcataag
ttattaaataaaacaccttggccacctatcgctgaacaaattgaaaatttaactcattgc
ttaaattgtttagaagaacatcatgaaactgataataaagttaatgcacgtcaagaacta
gttaaaaaaatctatgagtgtttttcatatcgtttcccttctgttcaacttgaattattt
ggttcttgcgctaatggtttcgatctacagacaagtgatttagatatttgtgtctttttt
cctgttggatcaacagaatggcattatttgaaagataaaaatgcaacaaatatgttaatt
cgacaatttaaaaaacaattattttattgtaaaaatcgattaaatattactcatattcaa
ccaattcttacagctcgtgttccaatattaaaagctctttcaaatacacgaatgcttgca
ttttataccaaagttgagccaaaacttcgtactctaggaattgctttaaaaactgtcaca
aagataacaaaaattggaagagcagcttccggtggtatttcttcttatgcctggatcatt
atgttaatccactatctccaacaaattgatcaactccctgttttacaagaactttatgaa
ggatcaacaaaaccaaccactcttgttaacggttggaatgtctggtatcaaaatgattta
tccgttataaatcgcttatggaaaccagctaatccgtcacaaccagtcggagaaatgtgg
ttgggatttttgcgttattatctattcgaattcaatcatgataaatatgttgtaactatt
agacaaaagaaattgttaatacgatttgtgaaaatgtggagatctttattcgctattgaa
gaatacattgttgttgatagaaagcttttaagaaaaaatacgctttgttttatatgtaat
caaactggacatgttgcatttgaatgtccaagcaataaaaagaaaaataaaagggagaat
tctgatatagttgcattacattcactgattggtcattttttacataaaactcaagcatca
cagtcaaattcacagaaaccaatggatcaacattatgataattcaaatcaaaatcgccag
ttgaattcgactagtactgtttgtaaaacctttcgtaaacctaataatactccaacaaac
atatcatcacatacctataggaatcctttcaaaccacaaaatagttatcaagttcaacag
ataagaaataattttcagcaacaacctttcatttctaattatcatcatgtacaaccgcat
catgtaaatatgcctactaatttgaattcgatacttccgtcagtaccgtacccaactcct
ctgcttccgaataatactgttggctttatccctaactatggtttcatgcctaacagttta
tcaaatcaccttgtgcaatctaatgtctacgatcgacaacaatcctttcctccgtcctat
tattcaccacctcttggttgtgtaaacaatcaacaacaatataaaaataccatacaagcg
aatcacccagttaattaccgaccaaaaggtcaacaaaataataataatgagactaaaaat
tatcataaattcagtcgggtatctagttcaagtgtttatcaagaacaattgccatctgtt
acatcaaaccatccaatagctgttacgtctaataaatctccgtgtaagccaaaaaaatat
aacaataatcagaatgtgtctaatcctcatcaaactaatagtgtattacgaaaatcacac
aatcatgaatttgaatcttcctttgccaaagattcaaactgcaataatcctggaatcatt
aatgatcatacttctaaaagtgctttgccatcctcagggaatcagacaaatagttgcagt
acaacatcatatcgacaaaaacaatccaattctccagtgaaagttaaatcaaattttcaa
caatccccacaaaaggcgaaatgctcagtatctaatggatgtgttatagattcacatgaa
aaaagaaaatatccaataacagaatcaaataaagtcaattcagtgtttagaggcaatcga
aattgtcaacgttttggctgtccaactaaaacacaattatcaaacaatgtcaataataat
aatggtcatttggtagatgaaaatttagttaaacgtcttcacaatatgtccactacatct
tcatcttcacagagtagcaacaataaataccgctactaa
DBGET
integrated database retrieval system