Schistosoma mansoni: Smp_196370
Help
Entry
Smp_196370 CDS
T01095
Name
(RefSeq) putative voltage-gated potassium channel
KO
K04911
potassium voltage-gated channel Eag-related subfamily H member 8
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
smm04040
]
Smp_196370
Ion channels [BR:
smm04040
]
Voltage-gated cation channels
Potassium channel, voltage-gated (Kv)
Smp_196370
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ion_trans
Ion_trans_2
PAS_9
cNMP_binding
PAS
DUF7497
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29830124
NCBI-ProteinID:
XP_018649331
LinkDB
All DBs
Position
1:57228759..57311900
Genome browser
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MTNANFVLGNAQRKYYPIVYCSDGFLLLTHYSRANVMSRSSICQFLWGSETTPTVRMEIN
QAFHNHYEYRNRAVFYTRTGEPFTCDFTVTPIRNERSEVVLFLCSYQKITQDLIHSNMYQ
SGYKMNHSKTHSILSWASELPFSKSYLHMKNNNFKYKIQKLTKSNFVLLHYGLFHIIWDW
LLLILTFYIAFIVPYNVTFESHSTHSGRCRIIDLLVEIFLIVDVILNFHTTYVNKNGQIV
NDRHLIAKHYAKGWLILDLLAALPVDFILIICQMTSMINLQNISLLQMMKLARLLRLARL
IQKIIRLSQYSVIVLGLLMFSFALVAHWCACIWYVIGLYEIDGSDIGWLEDLARRLKSPF
QLNRSGGPTEGSKYFTALYFTCSSLTSVGFGNVSANTTNEKIFAICIMLLGALMHAAVFG
NVTAIIQRMYARRTTFQSKVQDLKEFIEVYRIPKTLKSRMEDFFQTTWAINRGIDVPEVL
KIYPEELQGDIYLHLNREVLGLKVFEKANRDCLKSLAINFKLTFCTPGEYLIHTGDILRR
LYFVSNGSLEVLETDEVVALLGKNDWFGAFLETDMPINGTTNNVSSSTFPIIRSRCDVKS
LTYCDLHYIDLVTLSEILNQHPRFKAELKSYLYEDLSFNIQEGVENYLSNDVITVPAITL
QLANDEKDWEGSETKLNVINDKLLTTYDEESGLLIPYANDRSNSEIAITKPLSTRTKPTI
TGINQIGWQFRSPSLSTKYLSHYPRRLQSTDKIVTKRRFFLLKSSKSSGCSSNIDLTQKS
KENKSPPSNYKPIEINETMSHKIFTCNPKSFSPKHNRRHTMPTVEARNSESKSTSSSVMN
KYRRSDLHTDDTWIFSNHSSGTQSNDELCSSSITSAQCLSYNYGKTLLSSQCLSIPNVNF
TDNTQPQMVPIKPICVSMQVTQFNSLNCDINTISTSNLCLYTPNTSPVNSIWSCTNDYNH
NRYTLSNRVYHVQGSNLNEINLTNELRNLNNRLESVELDKCFFLSEDHQLDVTPVTAKYK
LKVSQSL
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaatgcaaattttgtacttggtaatgcacaaagaaagtattatcctattgtttat
tgttctgatggatttttactgttaactcattattcaagagcaaatgtcatgtcacgtagt
agtatatgtcaatttttatggggttccgaaacaacaccaacagttcgtatggaaatcaat
caagcatttcataatcattatgaatatagaaatagagctgtattttatacacgtactggt
gaaccattcacttgtgattttacagttacaccgataagaaatgaacgatctgaagttgtt
ctttttctctgttcatatcaaaaaataacacaagatttaatacattctaatatgtatcaa
tcaggttacaaaatgaatcattcaaaaacacattctatactttcatgggcatcagaatta
ccattttctaaaagttatctacatatgaaaaataataattttaaatataaaatacagaaa
ttaactaaatcaaactttgttcttttacattatggtctttttcatataatatgggattgg
ttactattaatattaacattttacatcgcatttattgtaccatataatgtaacatttgaa
agtcattcaacacattctggtcgatgtagaattattgatttattggtagaaatttttcta
attgttgatgttatattaaattttcatacaacatatgtaaataaaaatggtcaaattgta
aatgatcgtcatttaattgctaagcattatgctaaaggttggttaatattagatttatta
gcagctttaccagttgattttatactcattatatgtcaaatgacatcaatgatcaattta
caaaatatatcattgttacaaatgatgaaacttgcaagactattacgtttagctcgtctt
atacaaaaaataattagattatctcagtacagtgtaattgtattaggattacttatgttt
agttttgcattagtagcacattggtgtgcttgtatttggtatgtcattggtttatacgaa
attgatggttcagatattggttggctagaagatttagcaagacggttaaagtctcctttt
cagttgaatagatcaggtggacctacagaagggtctaaatattttaccgcattatatttc
acatgcagcagtctaacatccgtaggatttggtaatgtttcagcaaatacaacaaatgag
aagatatttgctatttgtatcatgcttcttggagctcttatgcatgctgcagtttttggc
aatgtcactgctattatacaacggatgtatgcacgtcgaacaacttttcaatcaaaagtt
caggatttaaaagaattcattgaagtatatagaatacctaaaacacttaaaagtagaatg
gaagatttcttccaaacaacgtgggcgattaatcgcggaatcgatgtaccagaagtgtta
aaaatttatcccgaagaattacaaggtgatatttatttacatttaaaccgtgaagtgctt
ggcttgaaagtatttgaaaaagctaatcgtgattgtttaaaatctttagctattaatttt
aaattaacattttgtacacctggtgaatatttaatacatactggagatattctacgtcgt
ttatattttgtatcaaatggatctttagaagtattagaaacagatgaagtggttgcttta
cttggtaaaaatgactggtttggtgcattcttagaaactgatatgccaataaatggtaca
actaataatgtatcttcatcaacgttcccaattatacgttcaagatgtgatgtaaaatca
ttaacttactgcgatctacactatatagatttagttacattaagtgaaatattaaatcaa
catccacgttttaaagctgaattaaaaagttatttatatgaagatttatcattcaatata
caagaaggagttgaaaattatctgtcaaatgatgtgattactgttccagctattacatta
caattagctaatgatgaaaaagactgggaggggagtgaaactaaattgaatgtcattaat
gataagttgttaacaacatatgatgaagaatctggcctattaattccttatgcaaatgat
cgatcaaattctgaaatagcaattactaaaccactatcaacaagaacaaagccaacaata
acgggaataaatcagattggatggcaatttagatcaccatctcttagcacaaaatatcta
tcacattatccaagacgtttgcaatccactgataaaattgtaacaaaacgacggtttttt
ctactaaaatcatctaaatcatccggttgttcaagtaatatagacttgacacaaaaatca
aaagagaataagtcaccaccttctaattataaacccatagagataaatgaaactatgagt
cataaaatatttacttgcaatccgaaatcatttagccctaaacataatcgtcgacatact
atgccaacagttgaagctcgaaattctgaatcaaaatcaacaagttctagtgtgatgaat
aaataccgaagatctgatcttcatacagatgatacatggatattttcaaatcactcaagt
ggaacacagtcaaacgacgaattatgttcatcaagtataacatcagcacagtgtttatca
tataattatggaaaaactctattatccagtcagtgtctttcaattccaaatgtaaatttt
acagataatacacaaccacaaatggtacctattaagcctatatgcgtatctatgcaagtg
acacaattcaactcacttaattgtgatattaatacaatttcaacatcaaatttatgttta
tatacaccaaatacttctcctgttaattcaatttggtcatgtacaaatgattataatcat
aatcgatatacattatcaaatcgtgtatatcatgtacaaggcagcaatttaaatgaaatt
aatttaactaatgaattacgtaatttaaataatcgtttagaatcagtagaattagataaa
tgtttctttctatctgaggatcatcagttggatgtaactccagttactgctaagtataaa
ctaaaagtatcacaaagcttataa
DBGET
integrated database retrieval system
