Schistosoma mansoni: Smp_199010
Help
Entry
Smp_199010 CDS
T01095
Name
(RefSeq) ras GTP exchange factor, son of sevenless,putative
KO
K03099
son of sevenless
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Pathway
smm04068
FoxO signaling pathway
smm04150
mTOR signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04068 FoxO signaling pathway
Smp_199010
04150 mTOR signaling pathway
Smp_199010
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RasGEF_N
RasGEF
PH_10
SOS1_NGEF_PH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29830295
NCBI-ProteinID:
XP_018646943
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1386 aa
AA seq
DB search
EFSGRFNFNVCIYIVAIAEHVIGNFLQAAICYEDKALTENVIRASTVEVIFVLCVDELCS
FLHTCLEQMNLLIRVFREPILSVNPSSSTAGTSSYEQQTTTCTHTNEDNTQVLFGNILDV
YNNMRILLDTIEAEDEDNYSPNIVKSKNNCTLLTSSTTPSSGMLNIVKPLNTSNNSTLIT
SGNDKTTLMDSLSETLTTLESIPEKRFPSDDDRNEMKNNIEHNNECSHRNISNNNSSGSI
FHSPTLTDHTFSNDDNYDDLGICLIELAEDDSLHAFSRYANIVLDSNSRDRVWNLIEHEN
YAQELCQLSRTIVHTASLNNKYPGYNFFSSSTTTTTPVVDFHSFTCLHCQHWDTVVSKPR
RRSTSTTATPLNDDNNYFNVHNNKNTMSTSVDSADKFDLTSNMSLNRHHHRSPHLLEMNT
TSYAINCNYLTLHRCAYDEVDRARLEDVLSMLRKTRATLERDLAKHPWVALHLVRLISTG
QLTDRYRSLYLNAVSGASCPPSPVNYTAPPSPVGLSNQIGSHVSCASMSSTNCNASSSNI
FNYHNTHHSTPTTAITTTSISINSTDLSFTYGNTVQNKAEEIEKLLSSKDKLIMSSNYLN
TLGDFVMESRIHLRTTDSKKSSSEYIAYLFTGLLLICKWQERRSTPLNPNSVQQSILRIK
YRIPLDLIHITDLPPIVQPNLIGYVGHSGPMTPSLVGAAVLAATSSNNSYSHNNNNTASN
MNPHEETPTTGLSASNLCWDFCARNANACIDSVFLIASEKFNFTNLSSSINVNHIRIFLR
TPEEKADWIASLLSIQSYRLFIRYIRTLPRLEVSLRLPSSHIYKFSQPDSMDNIIFETNM
PTSIFPPQIRMATLDKLIERLTYPTYFDTRLVNCFLLVYRRVTTSDELLDLLIERFRIPD
PEFLPEEWNIEVEQGQLESPAQHMLKRFRSGYKKRIQSRVIMFLSRWVRNARYYQNDFAP
NPRLRQKLLDFLSSIQARHLISSVERIKHYLQNPPISTQYPEAMTTTTIRTMETSKDNAE
LLSLLSSSDPTSVSSIESNQLRNFVNRITLNNIHPFKLAEQVTLYEWELYRRIPFWEVES
RDRTGNAVPNLNKSKSFSNRFRSWLIYSILSEAHPDDRIVGIQRVIDLMLIMEHMNNLQG
SQEAKSALISASVYRLRKSFQAIRRMRHYREIVDRLRRESIHNPKCQRTSSSSSSSLSHQ
NNPMIDSNLSANHSIHNNNTSNTTSNNNSSNHFAGFGLPFSTGTSKSHERRIRVLEKQHA
SGELCHPCVPYIAAGVITRLIHLDLRHPDTIINDAGNVMINCWKHRQLADIVERYLAFQR
IPYTYNVDDNVRVSQSLLFLFLKMNVIPKEKDCVSTDLCLFPIHFQYYFFTYHYRNGFVG
EIIIYR
NT seq
4161 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gaattcagtggacgtttcaactttaatgtatgcatttatatcgttgctatagctgaacat
gtgatcggaaattttttgcaggccgctatttgctacgaagataaagctctgactgaaaat
gttattcgtgcatcaactgtcgaggtgatttttgtattatgtgttgatgaattatgcagt
tttctgcatacgtgtttagaacaaatgaatttattgatacgggtatttcgtgaaccaata
ttatcagtgaatccatcgtcatcaacagcaggaacatcatcttatgaacaacaaacaaca
acatgtacacataccaatgaagataatacacaagtattatttggtaacatattagatgtg
tataataatatgcgtattttactggatactattgaagcagaagatgaagataattattcg
ccaaatattgttaaatctaaaaataattgtacattgttaacatcatcaacaacgccatca
tcgggaatgttgaatattgttaaacccctgaatacttctaataatagtactcttattact
agtggtaatgataaaacaactttaatggattcattatctgaaacacttactacacttgaa
tcaataccagaaaaacgattccctagtgatgatgataggaatgaaatgaaaaacaatatt
gaacacaataatgagtgcagtcatagaaatatcagtaataataattcatcaggatcaata
tttcattcacccactttaactgatcatacattctcaaatgatgataattatgatgatctt
ggtatttgtttaattgaattggctgaagatgattcgttgcatgcattcagtcgatatgct
aatattgtgctagattctaactcaagagatcgtgtttggaatttaattgaacatgaaaat
tatgcacaagaattatgtcaattaagtagaactattgtgcacacagcttcattaaataat
aaataccctggatataatttcttttcatcttcaacaacaacaacaactccagtggttgac
tttcattcatttacatgtttgcattgtcagcattgggatacagttgttagtaaaccacgt
agaagatccacttcaacaactgctacccctttaaatgatgacaataattatttcaatgtg
cataataataaaaatactatgtccacttctgtagattcagcagataaatttgatttgaca
tcgaatatgtcattaaatcgtcatcatcatcgttcacctcatttattggaaatgaatact
acatcttatgcaattaattgtaattatttaacgttacatcggtgtgcttatgatgaagtt
gatcgggcacgtttagaagatgtgcttagtatgttgagaaagacacgggcaacattagaa
cgagatttagctaaacatccatgggttgctttgcatttagtacgactgatatcaactggt
cagttgactgaccgttatcgttcattatatttaaatgctgtttctggtgcttcttgtcca
ccaagtcctgtgaattatacggctccaccatcacctgttggtctttcaaatcaaattgga
agtcatgtctcatgtgcttctatgtccagcaccaattgtaatgcttcgtctagcaatata
ttcaattatcataatactcatcattctacaccaacaacagcgataacgacaacatcaata
tcgattaattctactgatctatcattcacatatggcaatactgttcaaaataaagcagag
gaaattgaaaaactcttaagtagtaaagataagttaattatgtcaagtaattatcttaac
acacttggtgattttgtgatggaaagtcgtatacatttacgtacaactgattcgaaaaaa
tcatccagtgaatatatcgcctatttatttactggtctcttattaatttgtaaatggcaa
gaacgtcgttcaactccattaaatccgaattctgtgcaacagtctattttacgtattaaa
tatcgcataccacttgatttaattcatattaccgatttacctccaatagtccaaccaaat
ttaattggttatgttggtcatagtggtccaatgacgccgtctttagttggcgctgctgtt
ctagctgccacatcttcaaataatagttattcgcataataataataatactgcatctaat
atgaacccacatgaagaaacgccaactactggactatcagcatcaaatttgtgctgggat
ttttgtgctcgtaatgctaatgcttgcatagattctgtgtttctaattgcttctgaaaaa
ttcaatttcactaatttatcatctagtatcaatgttaatcatattcgaatatttttacga
acaccagaagaaaaagcggattggatagctagtttactaagtattcaaagttatcgactg
tttatacggtatatacgaacgttacccagactggaagtctcacttcgtttgccgtcgtca
cacatttacaaatttagtcaacctgatagcatggacaatattatatttgaaacaaatatg
ccaacatctatttttccaccacaaatacgtatggctacattagataaactaattgaacga
ctcacctatccaacttattttgatacacgtttagtaaattgtttcttactggtttataga
cgtgtcactacatcagatgagttgttagatttactcattgaaaggtttcgtatacctgat
ccggaatttttacctgaagaatggaatattgaagtagagcagggtcaattggaatctccg
gcacagcatatgttgaaaagatttcgctcaggatataaaaagcgtattcaatccagagtg
ataatgttcctatcccgttgggttcgtaatgcacgctattatcagaatgattttgctcct
aatcctcgattacgtcagaaactgttagattttttatcgagtatacaagctagacattta
atttcatcggttgaacgtattaaacattatttacaaaatcctccaatttcaacacaatat
cctgaagcaatgacgacaacaacaataaggactatggaaacaagtaaagataatgcggaa
ttgttgtcactattatcatcgtctgacccaacatctgtatcatcaatcgaatcaaatcaa
ttaagaaattttgttaatcgtataaccttaaataatattcatcctttcaaattagctgaa
caagttacattgtatgaatgggaattatatcgacgtataccattttgggaagttgaaagt
cgtgatcgtactggtaatgctgtacctaatttgaataaatcaaagtcattttcaaatcgt
tttcgcagttggctaatctattcaatacttagtgaagcacacccagatgatcgaatagtt
ggcattcaacgcgttatcgacttgatgttaataatggagcatatgaataatttacaagga
agtcaggaagccaagtcagcattgattagtgcatctgtatatcgtttgagaaagtcattt
caggctattcgtcgaatgcgacattatcgtgagatagttgatcgtttaagacgtgaaagt
attcacaatcctaaatgtcaacgaacatcctcttcaagctcatcatcgttatcacatcaa
aacaatccaatgatcgattcaaatctatcagcgaatcattctattcataataataatact
agcaatactactagtaacaataattcaagtaatcattttgctggtttcggtttaccattt
tcaactggaacaagtaaatcacatgaacgccgtatacgtgtactagaaaaacaacatgcg
tctggtgaattatgtcatccatgtgttccttatatagctgctggagtaataacacgtcta
atacacttagatttacgtcatccagatacaattataaatgatgctggtaatgtaatgatt
aattgttggaaacaccgtcaattagctgatattgttgaacgttatttagcatttcaacgt
attccatatacatataatgttgatgataatgtacgagtaagtcaaagtttgttattttta
tttttgaaaatgaatgtaattccgaaagaaaaagattgtgtgtccactgatctctgtctt
tttcctattcatttccagtactatttctttacatatcattatcgaaatggatttgttggt
gagattataatctatagatga
DBGET
integrated database retrieval system