Schistosoma mansoni: Smp_199260
Help
Entry
Smp_199260 CDS
T01095
Name
(RefSeq) vesicular amine transporter, putative
Organism
smm
Schistosoma mansoni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
Ion_trans
I-set
Ion_trans_2
Ig_3
ig
Ig_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29830314
NCBI-ProteinID:
XP_018647360
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1343 aa
AA seq
DB search
MLVLFSFFFFFFLQCIALLSITCIILSILAYCMDTSPIFSTPLIRTELINTTDDYIDTTT
INTLSSTSTGTTTSSSISSTVSSIYYDKFNSNYTIIMNNKQYKKNIIFIYIECICNIWFT
IELIIRFTVTINHKKFVKNLINLIDIAALFSFYIQVILLHNHHSYHGNNNNNNNNINGDN
GSYHSDNDVTLISIIEFFSILRVMRLFKLTRHISGLKILILTFKASAKEFSLLIFFLAVF
IVLFAALIYYAERLSNTNTRNDFTSIPIGLWWAIVTMTTVGYGDMVPRSYAGMIVGAMCA
VTGVLTISLPVPVIVSNFSMFYSHTLARSKLPKKRRRILPVEAIRPKHKSNLIGSGTGHG
IMHHCSGYTSDTINLSNLAKGIVPNISQPIAKAKYSDNFSHIKENYQNRRKYPNSNEFPL
NEQYKCAYGIHTRRAAVIDASNSSLEQMNDDDNDCESLGKSLKSELQYTERLRKSFPIIP
KLLMNDAIKQNNCTHTNCSNLPNQTTEDYSIHIKIGIMFTVKPLIQFLTNPIVGPITNRI
GYSIPMFTGFLLLFASTVVFAFETNFYVLLVARAIQGVGSACSSVSVSSYLTTDVVLNST
GHCFSLELLDILLEVTIGAPYGGITYQFISRQAPFLILASLTVIDGLLQLLALKPRVQRE
SQEGSGLIELLKDPYILIAAGSITFGNLGMSVLEPTLPLWMKTTMNSTEWQQGVAFLPSS
LSYLVGTNIFGPISHRIGRGYSAGLGLLITTGCLIGLPFSKRMEHLIAPMFGLGFAVGMV
DSSMMPIMGYLVDLRHVAVYGSVYAIADVAFCFSFVIGPIVGSVLVKYLGFHWMMWITAI
ICFIYSPLTLFLKNPPQKEPKSEALQLRVNDQRICSSVKRPGKDIRRYISPSAKAWNINE
TVKDDICLTKTNNNPDEIENPPQIICEKSADEGLGETLEKKSIILKFYEQAKIVKFPKSL
KFREGSNQVIECSATGFPDLYVVWRLKNGSILKQSHQSNSSVSRSNIRLINLPLELSNIR
SDQHGDVYVCEAGINSAVNQNPVIKELMLEVNLYPKIHMTDNVIYTDIGVEERFNILVTG
YPTPTLTCNDLPVSDPHMLSNKPQGGTWAYRVVLSQITSQHLHEYLCKANNSLGSVNQKL
EVTVAPAPPKILSPNLTEFADYYLLHWTTNSRAPLKNVTVTISETSTNTESNTGSSIVPR
SPILHERVFNLEDDKIDTTSTVIQHIQSDSNNSKQIWHHLTNLSSDTRHDISLNVCNTYA
CSKSSTLRSRSGGSPSRFTIKTPEFDGSNKINPSLLQRSPKDLLSLDADETKSPRNGNSA
NLKPYQTWIILFIVTLLLRSILI
NT seq
4032 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttgttcttttctctttttttttctttttttttttacagtgtattgctctcctatca
atcacatgtatcattctatctatattggcttattgtatggatacatcaccaatattttct
acaccattaattcgtacagaattaatcaatacaacagatgattatatagatactactact
atcaatacattaagtagtactagtactggtactactactagtagtagtataagtagtact
gttagtagtatatattatgataaattcaatagtaattatactattattatgaataataaa
caatataaaaagaatattatctttatttatattgaatgtatatgtaatatatggtttact
atagaattaataattcgttttactgttactataaatcataaaaaatttgttaaaaattta
attaatttaattgatatagctgcattatttagtttttatattcaagtcatcttattacat
aatcatcatagttaccatggcaacaacaacaacaacaacaacaatattaatggtgacaat
ggtagttatcatagtgataatgatgtcactttaatatcgattattgaattttttagtata
ttacgtgttatgcgtttatttaaattaactcgtcatatatctggtttaaaaatattaata
ttaacatttaaagcaagtgctaaagaattttcattattaatattttttttggctgtattc
attgtattatttgctgcattaatttattatgctgaacgtttaagtaatacaaatacacgt
aatgattttacatcaataccaattggtttatggtgggctatagttactatgacaactgtt
ggttatggtgatatggtgccaagatcatatgctggtatgattgttggcgcaatgtgtgca
gtaactggtgttctaacaatatcattaccagttcctgtcatcgtatcaaatttctcaatg
ttttattcacatacattggctcgatcaaaattgccaaagaaacgaagacgtatactacca
gttgaagcaattcgcccaaaacataaatcaaatttgattggaagtggtacaggacatgga
ataatgcatcattgtagtggttatacaagtgatacaattaatttaagtaatttagccaaa
ggtattgtacctaatatttcacaacctattgctaaagctaaatactcagataatttttca
catattaaagaaaattatcaaaatcgacgaaaatatcccaattcaaatgaattcccttta
aatgaacaatataaatgtgcttatggaatacataccagacgtgcagcagtaatagatgca
tcaaattcatctttggaacaaatgaatgatgatgataatgattgtgaatcacttggtaaa
tctttgaaatccgaattacaatatacagagagattacgaaaaagttttcccattattccc
aaattattaatgaatgatgcaattaaacaaaacaattgtactcatactaattgttctaat
ttacctaatcaaacaaccgaagattatagtatacatattaaaattggtattatgtttact
gttaaaccacttatacaatttctaaccaatcctattgttggtccaattacgaacagaatt
ggttatagtataccaatgtttactggattcctactcttgtttgcatcaacagttgttttt
gctttcgagacgaatttctacgttttattagttgccagagctattcaaggtgttggatca
gcgtgctcatctgtatcagtgagttcctatctcacaacagacgtggttttgaactccact
ggtcactgcttctcactagagctcctagatatacttctcgaagtcactattggtgcccct
tatggtggaataacatatcagttcataagtagacaagcaccgtttcttattttggctagt
ttaactgtaatcgatggactcctacaactattagccttaaaaccacgtgttcaacgtgaa
agtcaagaaggttcaggattaattgaattattaaaagatccatatattttaatagcagct
ggttcaattacttttggaaatttgggtatgtctgtattagaaccaactttaccattatgg
atgaaaactacaatgaattcaacagaatggcaacaaggtgttgcatttctaccatctagt
ttatcctatttagttggtacaaatatatttggaccgatatcacatagaattggtcgtggt
tatagtgcaggtttaggtttattaattacgactggatgtttaatagggttaccattttca
aaacgaatggaacatttaatagcacctatgtttggtttaggatttgctgttggcatggtt
gattcatcaatgatgccaatcatgggttatttagtagatttaagacatgttgcagtctat
ggaagtgtttatgctatagcagatgtggcattctgtttttcatttgtaattggaccaatt
gttggttctgtactagtgaaatacctgggtttccattggatgatgtggattactgcaatc
atttgttttatctattcacctttaacattatttctcaagaatccaccacaaaaagaacct
aaatcagaagcattgcagttgagagtgaatgaccaacgaatttgttcttcagttaaaaga
cctggcaaagatattagaagatatatttccccatcagccaaagcctggaatatcaacgaa
acagtcaaagatgatatctgtttgacaaaaaccaataataatcctgacgaaatagaaaat
cctccccaaattatctgtgaaaaatctgcagatgagggtctgggagaaactttggagaaa
aaatctattattttaaagttttacgaacaagccaaaattgttaaatttccaaaaagtctt
aaatttagagaaggatctaatcaagtgattgaatgtagtgctactggatttcctgactta
tatgttgtctggcgcttaaagaatggctcaatcttgaaacaatctcatcaatctaattca
tccgttagtagaagtaacatacgactaattaatctcccattggaattgtcaaatattcgt
tctgatcaacatggtgatgtatatgtttgtgaagcaggcataaattctgcagtgaatcaa
aatccagttatcaaagaattgatgcttgaagtcaatttatatccgaaaatccacatgacc
gacaatgtaatttacacagatattggtgttgaagaaagatttaatattctggtaacaggt
tatccaactcctacactgacctgcaatgatctaccagttagtgatccacacatgttatct
aataaacctcaaggtggaacatgggcatatcgtgttgtattaagtcagataacatcacaa
catttacatgagtatttatgcaaagcaaataacagtttaggtagtgtaaatcaaaagttg
gaagtaactgttgctccagcacctccgaaaattttatctccaaatttaacagaatttgct
gattattatttattacattggacaacaaattcccgtgcacctttaaagaatgtcactgtt
actataagtgaaacatcaacaaatacagaatctaatactggcagttcaattgttccacgt
tctccaatacttcatgaacgtgtatttaatctggaagatgataagattgatacaacatcg
acagtgattcaacatatacaatcggattcgaataattcaaaacaaatttggcatcattta
acaaatctcagttcagatacacgtcatgatattagtttaaatgtttgtaatacttatgca
tgttccaaatcatcaacattaagaagtcgatctggtggttctccaagtagatttacaatt
aaaacacctgaatttgatggttcaaacaaaattaatccatctctattgcaacgaagtcca
aaagatcttctatcattggatgctgatgaaactaaatctccaagaaacggaaactctgcc
aatctcaaaccctatcaaacatggattatattattcattgtaaccttgttactcagatct
attctcatataa
DBGET
integrated database retrieval system
