KEGG   Spiroplasma monobiae: SMONO_v1c06680
Entry
SMONO_v1c06680    CDS       T06543                                 
Symbol
rnj
Name
(GenBank) ribonuclease J
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
smoo  Spiroplasma monobiae
Pathway
smoo03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smoo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    SMONO_v1c06680 (rnj)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:smoo03019]
    SMONO_v1c06680 (rnj)
Messenger RNA biogenesis [BR:smoo03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     SMONO_v1c06680 (rnj)
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B Lactamase_B_2 Anti-Pycsar_Apyc1 RMMBL DUF4453
Other DBs
NCBI-ProteinID: AUM62917
UniProt: A0A2K9LV47
LinkDB
Position
742638..744437
AA seq 599 aa
MEDKKQESLQQVKSVVADLENKIEIKKLADNINPPKKKLPQAPFPTKVFALGGLEEVGKN
TYCIEYNDEIIMIDAGVKFPDATQLGVSAVIPDFSYLVENNSKLKGLFITHGHEDHIGGI
PYLLQQVEVPVIFAPALAAALIRDRLKEYKLQNKTVVKEYKENDVYSTKNFTIQFAAVNH
SIPDAFGVHVQTPNGAIFSTGDYKFDWTPLGHDANVQRLASWGNDGIELLMADSTNAEVE
GYTIGERKVIQNIDTHFLKSKGRIIIASFASNVHRLQHIIELANKYGRRIVVIGRSIERI
IKIIRQMGHLNINDRMFIKPNEIDNFPKNQIMILCTGSQGEPMAALSRISRMEHQTIKII
PGDTVIMSSSPIPGNRADVENVINKLTRIGANVIENGADNKIHTSGHASQEEQKLLFTLL
KPRCFMPMHGEYRMLKIHGETATKVNVKPQNVFVVANGDQIELHNGVGQVGKRVPAEAVF
IDGKDMTGKASNVIRERNILSKDGLMAVIISIDSQANKLSAPPRIVSRGSFYVRDSGNVI
AESINIVTKAVQEVLNSQKPTFGAIKNAIKESLSPFIFRYKRRNPLIIPVILNKKAEVK
NT seq 1800 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaagacaaaaaacaagagtctctacaacaggtaaaaagcgtagttgcagatttagaa
aataaaattgagattaaaaaattggctgataacattaatccgccaaagaaaaaattacca
caagcaccctttcctactaaagtttttgctttaggtggattagaagaggttggtaaaaat
acttattgtatcgaatataatgacgaaatcataatgatagatgctggagttaagttccct
gatgctacacaattaggtgtaagtgcagttattcctgactttagttatttagtagaaaat
aattcaaaattaaaaggattgtttattacacatggtcacgaagaccacattggaggtatt
ccatatctacttcaacaagttgaagtaccagtaatttttgcaccagctttagctgcagct
ttaattagagatagattaaaagaatacaaattacaaaataaaacagtagttaaagaatat
aaagaaaatgatgtatattcaacaaaaaactttactatacagtttgcagcagtaaaccac
tcaataccagatgcatttggagttcacgttcaaacacctaatggtgcgatcttttcaaca
ggagattataagtttgactgaacacctttaggtcatgatgctaacgttcaaagattagca
tcatgaggtaatgatggtattgaattgttaatggctgactcaactaatgcagaagtagaa
ggatatacaattggtgaaagaaaagttattcaaaatattgatacacatttcttaaaatca
aaaggaagaattattattgcttcttttgcatcaaatgttcacagattacaacacattatt
gaattagccaacaaatacggtagaagaattgttgttattggtagaagtattgaaagaatt
attaaaataattagacaaatgggtcacttaaatattaatgacagaatgtttattaaacca
aatgaaattgataacttcccaaaaaatcaaataatgattttatgtacaggaagtcaagga
gaaccaatggctgccctatctagaatttctagaatggaacaccaaacaattaaaataatt
ccaggagatactgtaattatgtcttcatcacctattccaggtaatagagctgatgtagaa
aatgtaattaataaattaacaagaattggtgctaatgtaattgaaaatggtgctgataac
aaaattcatacttctggacacgcaagccaagaagaacaaaaattattattcactttatta
aaaccaagatgttttatgcctatgcatggtgaatataggatgttaaaaattcacggtgaa
acagcaacaaaagttaatgttaaaccacaaaatgtctttgttgttgcaaacggagatcaa
atcgaattacacaatggagttggacaagtgggaaaaagagttcctgccgaagcagtcttc
attgatggaaaagatatgacaggaaaagcaagtaatgttattagagagagaaatatttta
agtaaggacggacttatggctgtaattatttcaatagattctcaagcaaataaactttct
gcacctcctagaattgtttctagaggtagtttctatgtaagagacagtggaaatgttatt
gctgaatcaataaacattgtaacaaaggcagtacaagaagttcttaactcacaaaagccc
acttttggagcaataaagaatgcaattaaggaatcgttatcgcctttcatctttagatac
aaaagaagaaaccctttaattattccagttattttaaataaaaaagcagaggttaaataa

DBGET integrated database retrieval system