Candidatus Karelsulcia muelleri BGSS: IM46_004
Help
Entry
IM46_004 CDS
T03352
Name
(GenBank) Valyl-tRNA synthetase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
smub
Candidatus Karelsulcia muelleri BGSS
Pathway
smub00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smub00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
IM46_004
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
smub01007
]
IM46_004
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
smub03016
]
IM46_004
Enzymes [BR:
smub01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
IM46_004
Amino acid related enzymes [BR:
smub01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
IM46_004
Transfer RNA biogenesis [BR:
smub03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
IM46_004
Prokaryotic type
IM46_004
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1_2
Val_tRNA-synt_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIN47577
LinkDB
All DBs
Position
713..3334
Genome browser
AA seq
873 aa
AA seq
DB search
MNNIKVYDHKNVENKIYQYWIDKNYFSSYPDKRKPYTIIMPPPNITGILHMGHILNNTIQ
DILIRYARMKGYNACWIPGTDHASIATEAKIVSYLKKKCLSKEKIGRQEFLKIACKWKNK
YEKIIINQIKKIGCSCDWNRKKFTMDSIMNESVTKIFVKLYKEGKIYRDYSIVNWDPYAK
TTVSNEEIIYKKYNGKLFYIKYKIEGENNFLTVATTRPETILADTAICINPKDKRYFNLK
NKRVIIPLCSRSIPIIEDDYVDMNFGTGCLKITPAHEKNDKLIADRHNLSVINIFDDRAI
INKNGLIFYGKERFKARKEIIEFLKKKKRLVKIDNYIYNIGISERTKSIIEPKLSIQWFV
NMKDLIIPTINFINNKKINFYPKKIKKKFNHWLYNIHDWNISRQLWWGHRLPVYYYNNED
FVVSETIEGALKEARIKSDNNFLSYKDLRQENDVLDTWFSSWLWPISVFDGIRFTNNNEI
KYYYPTQNLVTAPDILFFWVTRMIMSGYYLMGTPPFKKIYFTGVVKDKKNIKMSKSLGNS
PNPIDLIDQYGADAVRVGILLSANAGNDLIFDENICLKGRNLANKIWNAFILINTLKSVN
FLKANIYAELAIKWFDNKINKFLSKIEFYIKKYRFSESFMMIYKLFFNDFCSLYLELIKS
NSKILNKKIINKTIFFFKKIIKLFHPYMPFITEKIWQNFKSKKNENDLIITNFPKKYLFN
NKLIKKFKKSITFISRIRNLRINNNISNNKKIKLLILSENKKKLFYSLILKLGNISSLHV
FKKKPKKKYYSLIFETKEYFIPKLLNSNNLEQKIKNKIFIKKMFLKKIKNKINNKKFLEH
ASLDIVKKEKKKELDCIKNIFLLKKNINEFSNG
NT seq
2622 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatataaaagtatatgatcataaaaatgtagaaaataaaatatatcaatattgg
attgataaaaattatttttcatcttatccagataagagaaaaccatatactataataatg
cctccacctaatattacaggtatattacatatgggacatattcttaataacacaatacaa
gatattttaattcgttatgctagaatgaaaggatataatgcatgttggattccaggtaca
gatcatgcttctattgctactgaagcaaaaatagtttcttacttaaagaaaaaatgtctt
tctaaagaaaaaataggtagacaagaatttttaaaaattgcatgtaaatggaaaaataaa
tatgaaaaaattattattaaccaaataaaaaaaataggatgttcttgtgattggaatagg
aagaaatttacgatggatagtattatgaatgaatctgtaacaaaaatttttgttaaactc
tataaagaaggaaaaatatatagagattatagtattgttaattgggatccatatgctaaa
actacagtgtcaaatgaagaaataatttataagaaatataatggtaaattattttatatt
aaatataaaattgaaggagaaaataactttttaacagtagccactacaaggccagaaact
atactagcagatactgcaatctgcataaatccaaaagataaaagatattttaatttaaaa
aataaaagagttattattcctttatgttcaagatcaattcctatcattgaagatgattac
gttgatatgaattttggcacaggatgtttaaaaatcactcctgctcatgagaaaaatgat
aaattaattgcagataggcataatttatcagttattaatatttttgatgatagagctata
ataaataaaaatggattaattttttatggtaaagaaagatttaaagctagaaaagaaatt
attgaatttcttaaaaagaaaaaaagattagtaaaaattgataattatatatataatata
ggtatttctgaacgtacaaaatctattattgaaccaaaattatctatccaatggtttgta
aatatgaaggatttgattattcccactataaattttataaataataaaaaaattaatttt
tatccaaaaaagataaaaaaaaaatttaatcattggctttataatattcatgattggaat
atatcacgtcaactttggtgggggcataggctacctgtttattattataataatgaagat
tttgtagtttctgaaacaattgaaggagctttaaaagaagcgcgtataaaaagtgataat
aattttttatcttataaagatcttagacaagaaaatgatgttttagatacttggttttca
tcatggttatggccgatatctgtatttgatggaattaggtttactaataataatgaaata
aaatattattatcctactcaaaatttagttactgcacctgatatattatttttttgggta
actcgtatgataatgtcaggatattatctaatggggactccaccttttaaaaaaatatat
tttaccggagttgttaaagataaaaaaaatataaaaatgtctaaatctttaggtaattcc
cctaatcctattgatttgatagatcaatatggagctgatgctgttcgtgttggtatttta
ttaagtgctaatgcaggaaatgatttaatatttgatgaaaatatttgtttaaaaggacgt
aatttagctaataaaatttggaatgcatttatattaattaatactttaaaatcagtaaat
tttttaaaagcaaatatttatgctgaattagctatcaaatggtttgataataaaattaat
aaatttttatctaaaatagaattttatataaaaaaatatagattttctgaatcatttatg
atgatatataaattattttttaatgatttttgttcattatatttagaattgataaaatca
aattcaaaaattttaaataaaaaaataataaataaaactatttttttttttaaaaaaata
ataaaattatttcatccttatatgccttttataacagaaaaaatttggcaaaattttaaa
tcaaaaaaaaatgaaaatgatttaattattacaaattttccaaaaaaatatttatttaat
aataaattaataaaaaaatttaaaaaatctattacttttataagtagaatacgtaattta
cgtattaataataatatttctaataataaaaaaataaagttattaattttatccgaaaat
aaaaaaaaattattttattctttaattttaaaattaggaaatataagttctttacatgtt
tttaaaaaaaaacctaaaaaaaaatattattctttaatattcgaaacgaaagaatatttt
ataccaaaattattaaattctaataatttagaacaaaaaataaaaaacaaaatttttata
aaaaaaatgtttttaaaaaaaattaaaaataaaattaataataaaaaatttttagaacat
gcttcattagatatagttaaaaaagaaaaaaaaaaagaattagattgtattaaaaatatt
tttcttcttaaaaaaaatataaatgaattttcaaatggataa
DBGET
integrated database retrieval system
