Candidatus Karelsulcia muelleri BGSS: IM46_017
Help
Entry
IM46_017 CDS
T03352
Name
(GenBank) SSU ribosomal protein S1p
KO
K02945
small subunit ribosomal protein S1
Organism
smub
Candidatus Karelsulcia muelleri BGSS
Pathway
smub03010
Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smub00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03010 Ribosome
IM46_017
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03011 Ribosome [BR:
smub03011
]
IM46_017
Ribosome [BR:
smub03011
]
Ribosomal proteins
Mitochondria/ Chloroplast
Small subunit
IM46_017
Bacteria
IM46_017
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
S1
S1_RRP5
Spt6_S1
DDHD
MRP-S35
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIN47584
LinkDB
All DBs
Position
11320..13134
Genome browser
AA seq
604 aa
AA seq
DB search
MNIILNKKNMSVEEKNESLILKDIIHINKNVKLSYFDWSSYELGLSKEEQEERKKIEKLY
SDTISSIHEFYIYNGKIIKIIDRNVVIDFGFKAEGVISLNEFQLPKVNDIIEVIVEKLDY
KGRCIISYNKAKKLKSWEIIQEKFIKNEIIIFFVAARTKGGLIVVLFGIECFLPGSQIYI
KPVKDFDFYVGKTMEGKIVKINNKKKNVVVSHKILIEKYIEKKKRKLISKLEKGQVLRGI
VKNITHYGSFIDIGGGIDGLCHITDISWERIEHPSEKLEIGQTINFVILSIDKIKNRVQL
GLKQLQSNPWNSLEEEIKKGKVVIGTVTVVTDYGAFVEIFPGVEGLVHVSEMSWSKTKKL
RSSQSFVKIGDKIKVLILNYDISDQKMSLSLKRLTPDPWENIEKKYKIGSIHIVTVKSFT
NFGVRLESKSESKSKSKSESKSKSKSESKSKSKSESKSKSKSESKSKSKSESKSKSKSES
KSKSKSESKYKLKLKLKLKLKSELDLESKLKSELESELEELEYLLYNDDISWIKNLNNSI
NIYKKGDLVKLIVLGLDLITGKINLGSKQLIKNFWYENIIGSIHTGKIIKFFYKGAIIKF
KKKI
NT seq
1815 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatataattttaaataaaaaaaatatgtctgtagaagagaaaaatgaatctcttata
ttaaaagatataattcatataaataaaaatgttaaattatcatattttgattggagttct
tatgaacttggtttaagtaaagaagaacaagaagagagaaaaaaaattgaaaagttgtat
tctgatactatttcaagtatacatgaattttatatatataatggtaaaattattaaaata
attgatagaaatgttgtaatagattttggatttaaagctgaaggagtaatatcattaaat
gaatttcaactacctaaagtaaatgatataattgaagtaattgtcgagaaacttgattat
aaaggacgatgtattatatcttataataaagcaaaaaaattaaaatcctgggaaataata
caagaaaaatttattaaaaatgaaataataatattttttgttgcagctcgtacaaaagga
ggcttaatagtagttttatttggaattgaatgttttttaccagggtcacaaatatatata
aaacctgtaaaagattttgatttttatgtaggtaaaacaatggaaggaaaaatagtaaaa
ataaataataaaaaaaaaaatgttgttgtttcacataaaattttaatagaaaaatatatt
gaaaaaaaaaaaagaaaattaatttctaaattagaaaaaggtcaagttttaagaggtata
gtaaaaaatataacacattacggaagttttatagatataggtggtggaatagatggatta
tgtcacattacagatataagttgggaaagaatagagcatccttcagaaaaattagaaatt
ggtcaaaccattaattttgttattttatcaattgataaaataaaaaatagagttcaatta
ggtttaaaacagttacagtctaatccttggaattctttagaagaagaaataaaaaaaggt
aaagtagttataggtacagtaactgttgtaacagattatggagcttttgttgaaattttt
ccaggtgtagaaggattagtacatgtctctgaaatgtcttggtctaaaactaaaaaatta
agatcttcacaatcttttgtaaaaattggagataaaattaaagttttaatattaaattac
gatatttcagatcaaaaaatgtctttaagtctgaaaagacttacacctgatccatgggaa
aatatagaaaaaaaatataaaataggctcaattcatattgtaactgttaaaagctttact
aattttggggttcgtttagaatcaaaatcagaatccaaatccaaatcaaaatcagaatcc
aaatccaaatcaaaatcagaatccaaatccaaatcaaaatcagaatccaaatccaaatca
aaatcagaatccaaatccaaatcaaaatcagaatccaaatccaaatcaaaatcagaatcc
aaatccaaatcaaaatcagaatcaaaatacaaattaaaattaaaattaaaattaaaatta
aaatcagaattagatttagaatcaaaattaaaatcagaattagaatcagaattagaagaa
ttagaatatttattatacaatgatgatatttcatggattaaaaatctaaataattctata
aatatatataaaaaaggagatttagttaaactaattgtgttaggtttagacctaattaca
ggtaaaattaatttaggtagtaaacaactaataaaaaatttttggtatgaaaatattata
ggtagtatccatactggaaaaattataaaatttttttataaaggagctataattaaattt
aaaaaaaaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
