Sphingobacterium multivorum: I6J00_23955
Help
Entry
I6J00_23955 CDS
T07579
Name
(GenBank) 1,4-alpha-glucan-branching protein
Organism
smui
Sphingobacterium multivorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
CBM_48
hDGE_amylase
AMPK1_CBM
Malt_amylase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQT44725
LinkDB
All DBs
Position
5526206..5528791
Genome browser
AA seq
861 aa
AA seq
DB search
MGKHISRLIGYLWVIVLLSSCANKKDIVDVEQPPVIEQQGSGLLNLSAPFIYWDQEITFQ
FDLSKGNAALKGSTTDLYLHAGLIPVNGGSWQHVATDWSKNDNAYKLKFISAGLYSFTFT
PSKFFNLTNGGEFGQMALLVRNGDGSLVQRNKNNSDLFLPLVTSNTQAIRFVSPTLQPTD
PITLEQMYTVGDNLKLKVQATQSGKISIWDNGLLLAESSAGLSLEKSLSLQSNGLHELEA
RLEAGGKIYFSKAQLFVQSKPTIAALPIGVNANGTTINREKGEVSFALTAPLKTSVYVLG
DFNNYKALPAYAMSQTPDGKTWWVTVSNLDFSKKQTYQFLVDGQLNIADPYAELILDPQN
DAVLGLTAAAVPAYPAAAQGVVGVLDLPAKSYSWKTTLFNKPAQGDLVIYELLVRDFVKQ
HQYTTLKDSLPYLKRLGINAVELMPVQESEGNSTWGYNPSFHRALDKYYGLKNDLKAYVD
ACHENGIAVILDVVFNHAFGQSPLVQLYFEQGNVAGNSPWFNTVAKHPFNVGFDFNHESS
YTQTFVKDVLTYWMQEYKIDGFRFDLSKGFTQKNSGTSESDLSAWNAYDASRVAILKQYQ
QHIRSIDPSCYIILEHLGGDQEEAELAQSGMLLWNNMNGVFNEAAMGWNANNGSDLGRLF
PSSHGMTQPSFVSYMESHDEQRLLFKCLNYGNSSGSYNIKNLSTALKRMEQAAVFLLASP
GPKMIWQFGEYGYDVSIDENGRTGEKPLLWSYLQQDDRKKLFETYAKLTRFKTKNSIFQN
GTIITSAMKDAVKYFVLEKEGQQVGVLGNFGVESVDFDLPAALQGQWVDNFTGKELNWSG
QSKLSLLPGQYQLISKTKLNK
NT seq
2586 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaagcatatctctcgtttaatagggtatctctgggtgattgtcctattatcatca
tgtgcaaataagaaagatatcgtggatgtcgagcaacctcctgttattgaacagcaggga
tctggtttgctcaatctttccgccccatttatctattgggatcaggaaattacgtttcaa
tttgatctttcgaaaggaaatgcggctctaaaaggtagtactaccgacctttacttacac
gccggattgattcctgtcaatgggggcagctggcaacatgtagcaacagattggtcaaag
aatgacaatgcttataaacttaaatttatttctgctggtttatattcattcacatttacc
ccctccaaattttttaacctgactaatggcggagaatttggtcagatggcacttttagtc
cgcaatggtgatgggtcgctggtccaacgaaacaaaaataattcagatctatttcttcct
cttgtaacgagcaatacacaggccattcgttttgtttcgcctacgctgcaacccacagat
ccaattaccctggagcagatgtacaccgttggggataatctgaagttaaaagtacaggca
acgcagtccggaaaaatcagtatctgggataatggtttattgcttgctgaatcttctgct
gggctgtcattagaaaaatcgctcagcctacagagcaatggcctgcacgagcttgaagca
cgtcttgaggccgggggcaaaatatatttcagtaaagcacagttatttgtgcaatcaaaa
cctaccatcgctgcactcccgataggcgtcaatgcaaacggaacaaccataaacagggaa
aaaggagaggtcagttttgcgctcacagcaccattaaaaacgagtgtgtatgtcttgggc
gattttaataactataaagcattaccagcctatgcgatgagccagacaccggatggaaaa
acctggtgggttaccgtatcgaatctggatttctctaaaaaacagacttatcagtttttg
gtggacggtcaactgaatatcgccgacccctatgctgagctgattcttgatccgcaaaac
gatgccgtactcggactgaccgcggcggctgtacctgcttatcccgctgctgcgcaggga
gtagttggggtattggatctcccagccaagtcttattcatggaaaaccacgctatttaat
aagccagctcaaggtgatttagttatttacgaactcttggtccgtgattttgtcaaacaa
catcaatataccacattgaaagattctttgccttatttaaaaaggctgggtataaatgcg
gtcgagctaatgcctgtacaggaatcagaggggaattcgacctggggttataacccttct
ttccaccgcgctttggataaatattatggcttaaaaaacgacttgaaagcatacgtagat
gcttgtcatgaaaatggtattgccgtgattttggatgttgtttttaatcatgcttttggt
cagtccccgctagtacagctttattttgagcagggcaacgtcgctggcaatagcccttgg
ttcaatacggttgccaagcatccgttcaatgttggctttgactttaaccacgaaagtagt
tacacgcagacttttgtcaaggatgttttgacctattggatgcaggagtacaagattgat
gggtttcgatttgacttatctaaagggtttacacagaaaaattcgggtacctcagaaagt
gatttaagtgcatggaatgcttacgatgcgtcacgtgtggctatcttgaagcaataccag
cagcatattcgcagcatcgatccctcgtgttatattattctcgaacatcttggcggagat
caggaagaggccgaacttgcgcaatcggggatgttgctatggaacaacatgaatggggtc
ttcaatgaggcggcgatgggctggaatgccaacaacggctcggatttaggcagattattc
ccttcgagccacggcatgacacaaccctcgtttgtgtcttatatggaaagccatgacgaa
cagcggctgctgttcaaatgcctgaattacggcaattcgtcaggtagctataacattaag
aacctcagcacggcattaaaacgtatggaacaggccgccgtgtttttattggcttcgccc
ggacctaagatgatctggcagtttggcgaatacggctatgatgtgtctatcgatgaaaat
gggcgcacgggcgaaaaaccattgttgtggagttatctacaacaagatgatcgcaaaaaa
ctctttgagacttacgccaaactcacgcgtttcaaaaccaaaaatagcattttccaaaac
gggacaattataacctcggctatgaaagatgccgttaaatattttgttctcgaaaaggaa
ggacaacaagtaggggtacttggcaattttggggtagaaagtgtggactttgacttgccg
gcagcgttgcaggggcagtgggtcgataattttacgggaaaagagctcaattggtctggc
cagtcaaaattgagtctcctacctgggcagtatcaattgataagcaaaacaaaactaaat
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system