Candidatus Karelsulcia muelleri ML: SMML_v1c00040
Help
Entry
SMML_v1c00040 CDS
T03536
Symbol
rpsA
Name
(GenBank) 30S ribosomal subunit protein S1
KO
K02945
small subunit ribosomal protein S1
Organism
smum
Candidatus Karelsulcia muelleri ML
Pathway
smum03010
Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smum00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03010 Ribosome
SMML_v1c00040 (rpsA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03011 Ribosome [BR:
smum03011
]
SMML_v1c00040 (rpsA)
Ribosome [BR:
smum03011
]
Ribosomal proteins
Mitochondria/ Chloroplast
Small subunit
SMML_v1c00040 (rpsA)
Bacteria
SMML_v1c00040 (rpsA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
S1
S1_RRP5
Spt6_S1
PCB_OB
MRP-S35
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIZ48775
LinkDB
All DBs
Position
4553..6190
Genome browser
AA seq
545 aa
AA seq
DB search
MDKNEYIILKDIININKNVKLSNFDWSSYELGKEEQEERKKIEKLYSDTISSIHEFYIYN
GKIIQIIDRNVVIDFGFKAEGVISLNEFRDEKKLPKVNDIIEVIVEKLYYKGRCIISYNK
AKKLKSWEIIQEKFIKNEIIIFFVAARTKGGLIVVLFGIECFLPGSQIYIKPVKDFDFYV
GKTMEGKIVKINNKKKNVVVSHKILIEKYIEIKKKKLISKLEKGQVLRGIVKNITHYGSF
IDIGGGIDGLCHITDISWGRIEHPSEKLEIGQTINFVILSIDKIKNRVQLGLKQLQSNPW
NSLENEIKKGKVVIGTVTVVTDYGAFVEIFPGVEGLVHVSEMSWAKKLRSSQDYVKIGDR
IKVLILNYDISDQKMSLSLKRLTPNPWENIKTKYKMGSIHIVTVRSFTNFGVRLKSKSEL
ELELKSELEYLLYNDEISWIKNLNNSINIYKKGDLVKLIVLGLDLITRKINFGSKQLIKN
FWYEKIIGSIHTGKIIKSFYKGAIIKFKKKNLKIFAPILKQSVKKTKFKIIYFNFKIQTF
YVSQI
NT seq
1638 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaaatgaatatattatattaaaagatataattaatataaataaaaatgttaaa
ttatcaaattttgattggagttcttatgaactgggtaaagaagaacaagaagagagaaaa
aaaattgaaaaattgtattctgatactatttcaagtatacatgaattttatatttataat
gggaaaattattcaaataattgatagaaatgttgtaatagattttggatttaaagctgaa
ggagtaatatcattaaatgaatttcgtgatgaaaaaaaactacctaaagtaaatgatata
attgaagtaattgtcgagaaactttattataaaggccgatgtattatatcttataataaa
gccaaaaaattaaaatcctgggaaataatacaagaaaaatttattaaaaatgaaataata
atattttttgttgcagctcgtacaaaaggaggcttaatagtagttttatttggaattgaa
tgttttttaccaggatcacaaatatatataaaacctgtaaaagattttgatttttatgta
ggtaagacaatggaaggaaaaatagtaaaaataaataataaaaaaaaaaatgttgttgtt
tcacataaaattttaatagaaaaatatattgaaattaaaaaaaaaaaattaatttctaaa
ttagaaaaaggtcaagttttaagaggtatagtaaaaaatataacacattacggaagtttt
atagatataggtggtggaatagatggattatgtcacattacagatataagttggggaaga
atagagcatccttcagaaaaattagaaattggtcaaaccattaattttgttattttatca
attgataaaataaaaaatagagttcaattaggtttaaaacaattacagtctaatccttgg
aattctttagaaaatgaaataaaaaaaggtaaagtagttataggtacagtaactgttgta
acagattatggagcttttgttgaaatttttccaggtgtagaaggattagtacatgtctct
gaaatgtcttgggctaaaaaattaagatcttcacaagattatgtaaaaattggagataga
attaaagttttaatattaaattacgatatttcagatcaaaaaatgtctttaagtctgaaa
agacttacacctaatccatgggaaaatataaaaacaaaatataaaatgggctcaattcat
attgtaactgttagaagctttactaattttggggttcgtttaaaatccaaatcagaatta
gagttagaattaaaatcagaattagaatatctattatacaatgatgagatttcatggatt
aaaaatctaaataattctataaatatatataaaaaaggagatttagttaaactaattgtg
ttaggtttagacttaattacacgtaaaattaattttggtagtaaacaactaataaaaaat
ttttggtatgaaaagattataggtagtatccatactggaaaaattataaaatctttttat
aaaggagctataattaaatttaaaaaaaaaaatctaaaaatttttgcgcctattttaaaa
caaagtgtaaaaaagactaaatttaaaattatatattttaattttaaaattcaaacattt
tatgtttctcagatttga
DBGET
integrated database retrieval system
