Candidatus Karelsulcia muelleri ML: SMML_v1c00660
Help
Entry
SMML_v1c00660 CDS
T03536
Symbol
trmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase TrmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
smum
Candidatus Karelsulcia muelleri ML
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smum00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
smum03016
]
SMML_v1c00660 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
smum03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
SMML_v1c00660 (trmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
SMML_v1c00660 (trmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
RsgA_GTPase
Roc
Dynamin_N
GTP_EFTU
AAA_28
GCV_T
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIZ48838
LinkDB
All DBs
Position
72400..73758
Genome browser
AA seq
452 aa
AA seq
DB search
MLKNDDTIVAIATPSGYGAIAVIRISGNNSMKIIKKIFYSFSKKKMEKTSIQLGYIKYKN
QLIDKVLIFLFKKPKSYTGEDIVEISCHGSIYIQNKLLSIILDQGARLANPGEFTLRAFI
NGKIDLCQAESILDIVNSETFFSHKFAINQIRGNISILIRKLRKKIINLLSLIEFELDFS
EENCNLINYLEFQKMLYNIIKKLKSLIRSFKIGNALKNGISVSIIGCPNVGKSTLFNKLL
KYERSIVSNIAGTTRNYIEDSLIINGIKFRFIDTAGINNKTKDYIEKLGIKKTYSKIKKS
DLILYVFDDLNEKWIFKKVKSLQEKYPKKKILIIINKYDLIKKKTINYKKIFKISAKYGY
GVNNLLSEITVFSKKMTSLKERTIVITQTRHYESFKKAIFYLYKVKKNLYSISPEFLSID
IRTALDYLGQVTGEVTNEDILSNIFSKFCIGK
NT seq
1359 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaatgatgatactatagtagctatagctactcctagtggatatggagcaatt
gcggttatacgtatttcaggaaataattctatgaaaattataaaaaaaatattttactcg
ttttcaaaaaaaaaaatggaaaaaacttctatccagttaggatatataaaatataaaaac
caacttattgataaggttttaatttttttatttaaaaaaccaaaatcatatactggagaa
gatatagtagaaatatcttgccatggatctatttacatccaaaataaattattgtcaata
attcttgaccaaggagcaagattagcaaatcctggagaatttactttacgtgcatttatt
aatggaaagatagacctttgtcaagctgaatcaatattagatattgtaaattcagagaca
tttttttctcataaatttgctattaatcaaataaggggaaatatttctatcttaataaga
aaattaaggaaaaaaataattaatttattatcattaatagaatttgaattagatttttct
gaagaaaattgtaatttgataaattatttagaatttcaaaaaatgttatataatataatt
aaaaaattaaaaagtttaataagatcatttaaaataggaaatgctttaaaaaatggaata
tcagtatctataataggatgtcctaatgtaggaaaatcaactttatttaataaattattg
aaatatgaaagatcaatagtatctaatattgcaggtacaactagaaattatatagaagat
agtttaattataaatgggataaaatttcgttttatagatacagcaggtataaataataag
acaaaagattatatagaaaaattaggtataaaaaaaacatatagtaagattaagaaatct
gatttaattttatatgtttttgatgatttaaatgaaaaatggatatttaaaaaagtaaaa
tccttacaagaaaaatatcctaaaaaaaaaatattgattattattaataaatatgattta
attaaaaaaaaaacaattaattataaaaaaatatttaaaatatctgctaaatatggatat
ggtgttaataatttattatctgaaataactgttttttctaaaaaaatgacttctttaaaa
gagaggactatagtaataactcaaacaagacattacgaatcttttaaaaaagctattttt
tatttatataaagttaaaaaaaatttatattcaatttctccagaatttttatctatagat
atacgtacagctttagattatttaggtcaagtaactggtgaagtaactaacgaagatata
ctatcaaatattttttctaaattttgtataggaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
