KEGG   Candidatus Karelsulcia muelleri PSPU: SMPSPU_008
Entry
SMPSPU_008        CDS       T03672                                 
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase A subunit
  KO
K02469  DNA gyrase subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
smup  Candidatus Karelsulcia muelleri PSPU
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smup00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:smup03032]
    SMPSPU_008 (gyrA)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:smup03400]
    SMPSPU_008 (gyrA)
Enzymes [BR:smup01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     SMPSPU_008 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:smup03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   SMPSPU_008 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:smup03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Facilitator
      SMPSPU_008 (gyrA)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C F-box_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAO66190
UniProt: A0AAD1EX79
LinkDB
Position
10706..13105
AA seq 799 aa
MKEKEKIITINIEDEMKSSYIDYSMSVIVSRALPDVRDGLKPVHRRVLYGMYEQGARFSK
NYRKSARIVGNVLGKYHPHGDSSVYDAIVRMAQSWSLRYILIDGQGNFGSIDKDPPAAMR
YTEIKLKNISEDMLLDIEKETVDMKLNFDDSCKEPLVLPTCIPNLLINGSSGIAVGMATN
MPPHNIVESIEAICSYIDKQKISIEELMKYIKAPDFPTGGIIYGYEGVKKYFLTGRGKIF
LRSKVHFEEKNNRICLIVDEIPYKINKEELINKTLKLVKEGKLEGLSHIRDESDRNGMRI
VYNIKQNVDKQRLLKNLFKETSLETSFNVNNLALVNGKPTILNLKDLIKHFVNHRHDVII
RRTKYDLNKAKNRAHIIEGFYIVLKNLETVIELIKSSKDRNDAKKKILIKYNLSEIQVQS
ILELKLNSLTKLENKKIKEEYIHIRKKISFFKKIISNKLLQKKIIKKELNIVKKKYGDLR
RTEINYLGLENEVYNNKFVITITKTGYIKKNNLNKYKIKNIGGIENLFTYKCKKNNLEKI
IIAKNYQDILFFSENGKYFLLKVFKIPEVLKKSKGQAIQNLLKINKKEKICSSILIEKNK
DKKYLNKNSVILITKNGIIKKQTLIQYYKKKKKLIKIINKDYLIDAKLTSEILIASKSGK
IIKFDESTITNIPLKSKSVTLSKNDDKIIDIICLNDLKKIYILGVSEKVFVKISNLRYKS
ICKGLKKINVTHKTVFLVAIKNVINKNDIIIINKYGLTFRIPVSKFFLRGRIKLKYYDKI
TYVAKVEYDNSLNILITER
NT seq 2400 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagaaaaagaaaaaattattacaataaatattgaggatgaaatgaaatcttcatat
atagattattcgatgtctgttattgtttcaagagctctacctgatgtaagagatggatta
aaacctgtacatagacgtgttttatatggtatgtatgaacaaggagcgcgttttagtaaa
aattatagaaaatctgctcgtattgtgggaaatgttttaggaaaatatcatcctcatggg
gatagttcagtatatgatgctatagtacgtatggcccaaagttggtctttacgttatatt
ttaatagatggtcaaggtaattttggttctatagataaggatcctcctgccgctatgaga
tatactgaaattaaacttaaaaacatatctgaagatatgttactggatattgaaaaagaa
acagtagatatgaaacttaattttgatgattcttgtaaagaaccgttagttctaccaaca
tgtatacctaatttattaattaatggatcttcaggtatagctgttggaatggccactaat
atgcctcctcataatattgttgaatctatagaagctatttgttcttatatagataaacaa
aaaatttctatagaagaacttatgaagtatataaaagctcctgattttccaacaggtgga
attatatatggatatgaaggtgtaaaaaagtattttttaacaggacgaggaaaaatcttt
ttaagatcaaaagttcattttgaagaaaaaaataaccgtatttgtcttattgttgatgaa
attccttataaaataaataaagaagaattaataaataaaacattaaaattagttaaagaa
ggaaaattagaaggactttctcatattagagatgaatctgatagaaatggaatgagaatt
gtttataatataaaacaaaatgttgataaacaaagattattaaagaatctttttaaagaa
acttctttagaaacttcatttaatgttaataatctagcattagttaatggaaaaccaact
atacttaatttaaaagatttaataaaacattttgtaaatcatagacatgatgtaattatt
cgtagaacaaaatatgatttaaataaagctaaaaatagagctcatataatagaaggtttt
tatatagttttaaaaaatttagaaactgtaattgaattaattaaatcttctaaagataga
aatgatgccaaaaaaaaaattttaattaaatataatttatccgaaatacaagttcaatca
attttagaattaaagttaaattctcttactaaattagaaaataaaaaaataaaagaagaa
tatatacatataagaaaaaaaatttctttttttaaaaaaattatatctaataaattatta
caaaagaaaataataaaaaaagaattaaatatagtaaaaaaaaaatatggagatttaaga
cgtacagaaataaattatttaggtttagaaaatgaagtatataacaataaatttgttatt
acaataacaaagactggatatattaaaaaaaataatttaaataaatataaaattaaaaat
ataggaggaattgaaaatttatttacttataaatgtaaaaaaaataatttagaaaaaatt
ataattgcaaaaaattatcaagatatactttttttttctgaaaatggaaaatactttttg
ttaaaagtctttaaaataccagaagtattaaaaaaatcaaaaggtcaagctatacaaaat
cttcttaagataaataaaaaagaaaaaatatgttcttcaattttaattgaaaaaaataag
gataaaaaatatcttaataagaattctgttattttgattacaaaaaatggtataataaaa
aaacaaacacttatacaatattacaaaaaaaaaaaaaaattaattaaaattataaacaaa
gattatcttattgatgctaaattaactagtgaaatattaattgcttccaaaagtggaaaa
ataattaaatttgatgaatcaacaattacaaatattccattaaagtcaaaaagtgtaact
ttatcaaaaaatgatgataaaatcatagacataatttgtcttaatgatttaaaaaaaata
tatatattaggagtgtctgaaaaagtatttgtaaaaatatcaaatttacgatataaaagt
atttgtaaaggtcttaaaaaaattaatgtaactcataaaactgtatttttagttgctatt
aaaaatgtaattaataaaaatgatataattataattaataaatatgggttaacttttcgt
attccagtatcaaaattttttctaagaggccgaataaagttaaaatattatgataaaata
acatatgtagctaaagtagagtatgataatagtttaaatattttaattacggaacgataa

DBGET integrated database retrieval system