Sneathiella marina: NBZ79_04770
Help
Entry
NBZ79_04770 CDS
T08200
Name
(GenBank) cadherin domain-containing protein
Organism
snea
Sneathiella marina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Cadherin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USG62290
UniProt:
A0ABY4W956
LinkDB
All DBs
Position
988629..992168
Genome browser
AA seq
1179 aa
AA seq
DB search
MSDDVVIDQAAKEALLDTSQASGQTGYDPLGNRAETIDMRDMKTVDDRSREAIHTGDKKD
HELKHDQVNDDEKSAQLSETDNQGADQREDVSSDDDSDPQPQELSSASGDNSASGRAREN
TEETRNGAAREGVGIDERIETNPASEVSEAEGASAASPAPGLSSTLNGLSREDELVVEAT
DAIDAAPHSITMDDQNIAEDAAVGDIVGTVSAIDPEGRALVYSLDDDAGGKFTIDSASGE
ISVASALDYETSKDHQLIVNVDDGAQVTQQVFIIDVGDVDEGIPGIKLDGTDGHDRLYGT
EDSDTLSGYGGNDSIYGYGSDDKLYGGDGNDRLYGGDGDDTLTGDAGNDYLYGHEGNDKL
SGGDGNDRLYGGDGDDKLTGDAGNDYLYGHEGNDKLSGGDGNDYLNGGDGKDNLSGGEGN
DRLYGGAGNDKLTGGDGNDTLVGQDGNDRLTGGDGNDYLSGGDGKDNLSGGDGNDRLYGG
AGNDKLTGGDGNDTLVGQDGNDRLTGGDGNDYLSGGDGKDNLSGGEGNDRLYGGAGKDKL
TGGDGNDTLVGDAGRDRLTGGDGNDYLNGGADNDRLTGGDGNDRLYGGDGNDKLTGDAGN
DYLHGGDGKDNLSGGDGNDRLYGGAGNDKLTGGDGNDTLVGDAGRDQLTGGDGNDYLNGG
ADNDKLIGGDGNDRLYGGDGKDILTGDAGNDTLFGQDGNDRLTGGDGNDYLSGGDGKDNL
SGGEGNDRLYGGAGNDKLTGGDGNDTLVGDAGRDRLTGGDGNDYLNGGADNDRLTGGDGN
DRLYGGDGNDKLTGDAGNDYLHGGDGKDNLSGGDGNDRLYGGAGNDKLTGGDGNDTLVGD
AGRDRLTGGDGDDYLNGGADNDRLTGGDGNDRLYGGDGKDNLKGGEGNDRLYGQDGDDKL
TGDVGNDYLHGGQGNDKLTGGDGNDTLIGDAGDDKLNAGDGDDYLNGGDGKDKLTGGDGN
DRMYGGDGEDRLTGDAGNDTLYGQDDDDKLTGGEGNDYLHGGAGNDTVSGGDGNDTLVGD
AGDDKLDAGDGNDYLTAGAGDDTLTAGDGEDRLYGGDGDDKMSGGDGNDRMYGQDGNDEM
TGGAGDDYAHGGDGSDIYFFGMDSGIDTFIGGDGGGWSDTIALSDGLPAGDLNDWLNLTS
GSVETADNGDIFLSEDAAGTITLGEDAVLTFDGVEKIEG
NT seq
3540 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgatgatgtcgtaatagatcaagcagcaaaagaagcactcctggatacgtcgcaa
gcgagcgggcagaccggctacgatccgcttggcaaccgtgccgaaacaattgatatgcgg
gacatgaaaaccgtagatgaccgatctcgggaagcgatccatacaggtgataaaaaagat
cacgaactcaaacatgatcaagtgaatgacgacgaaaaatccgctcagttgtctgaaacg
gacaatcagggagctgatcaacgggaggacgtgagctcagatgatgatagtgatccgcaa
ccccaagaactttcttcggcgtcgggcgataacagcgcaagtggccgagcacgcgagaat
acggaagaaacgcggaatggtgcagcccgtgaaggtgtagggattgatgaaagaattgaa
acgaatccggcatctgaagtaagcgaagcggaaggcgcaagtgccgcgtccccggcgcca
ggactctcttcgacgctcaatggcttgtcgcgagaagatgagctggtggttgaggcgacg
gacgcgatagacgcagcccctcattcaataaccatggatgatcagaacatcgcggaagat
gcggctgttggagatatagtgggaaccgtgtcggcaatagacccggaaggtcgtgctctt
gtttacagtttggatgatgacgccggcggaaaatttaccatcgacagtgcgtcgggagaa
atctcggtggcgagtgccttagactatgagacgtcaaaagatcatcagttgatcgtaaat
gttgatgatggtgcacaggttactcaacaggtttttatcattgatgttggtgatgttgat
gagggaataccgggcataaagctagacggtacagacgggcatgaccgtctttacggtacc
gaggatagtgacacattgtccggctacggcgggaacgactcgatatacggatacgggtcg
gatgacaagctctatggcggcgacggcaacgatcgtctttatggcggtgacggtgatgac
acacttaccggcgatgcaggtaatgattatctttatggtcacgaaggtaacgacaaactg
tctggcggcgacggtaacgatcgtctttatggtggtgacggcgatgacaagcttaccggc
gatgcaggtaatgattatctttatggtcacgaaggtaacgacaagctgtctggcggcgac
ggcaacgattatttgaacggcggtgacggtaaagataacctgtccggcggcgaagggaat
gaccgtttgtacggtggtgcgggcaatgacaaactgaccggcggggacggaaacgatacg
ctggttggtcaggacggtaatgaccgtctcaccggtggggatggtaatgattatttaagc
ggtggcgatggcaaagataacctgtccggcggcgatgggaatgaccgtttatacggtggt
gcgggcaatgacaaactgaccggcggggacggaaacgatacgctggttggtcaggacggt
aatgaccgtctcaccggtggggatggtaatgattatttaagcggtggcgatggcaaagat
aacctgtccggcggcgaagggaatgaccgtttatacggtggtgcgggcaaagataagctg
accgggggtgatggaaacgatacgctggttggtgatgcaggtcgagaccggctgaccggc
ggggatggcaatgattacctgaacggtggcgccgataatgaccgcctcaccggtggtgac
ggaaacgatcgcctttatggtggggacggtaatgataagctgacaggcgatgccggaaat
gactatttacatggtggtgacggtaaagataacctgtctggcggcgatgggaatgaccgt
ttatacggtggtgcgggcaatgataaactcactggtggcgatggcaatgatacgctggtt
ggtgatgcgggtcgagaccagctgaccggtggggatggcaatgattacctgaacggtggt
gccgacaatgacaaacttattggcggtgacggaaatgatcgcctctatggtggggacgga
aaagacattctgacaggcgatgccgggaatgatacgctttttggacaagacggtaatgac
cgtctcaccggtggggatggtaatgattatttaagcggtggcgatggcaaagataacctg
tccggcggcgaaggaaatgaccgtttatacggtggtgcgggcaacgataagctgaccggg
ggtgatggaaacgatacgctggttggtgatgcaggtcgagaccggctgaccggcggggat
ggcaatgattacctgaacggtggcgccgataatgaccgcctcacagggggtgacggaaac
gatcgcctctatggtggcgacggcaatgataagctgacgggcgatgccggaaatgattat
ttacatggtggtgacggtaaagataacctgtccggcggcgatgggaatgaccgtttatac
ggtggcgcgggcaacgataagctgaccggcggggatggaaacgatacgctggttggtgat
gcgggtcgagaccggctgaccggcggggatggtgatgactatctgaacggtggtgccgac
aatgaccgcctcaccggtggtgacggaaacgatcgtctctacggtggggatggcaaggac
aatcttaagggcggagaaggtaacgatcgtctctatggccaggatggtgacgacaaactc
acgggcgatgttggcaatgattacctgcatggcggccaaggtaatgacaaactcaccggt
ggtgatggtaatgatacattgatcggcgatgccggtgacgacaaactaaacgcgggcgac
ggcgacgattatcttaacggcggtgacggcaaggacaaactgaccggtggtgacggcaat
gatcgtatgtatggtggcgacggcgaagaccgtcttactggcgacgctggtaatgatacg
ctgtatggacaggatgacgatgacaagctaaccggtggcgagggtaatgattacctgcat
ggcggagcaggtaacgatactgtctcgggtggcgatggcaatgacactttggtcggagac
gccggagatgataaattggatgccggcgatggtaacgattatcttacagccggtgccggt
gatgataccctgactgccggtgacggtgaagaccgactatatggcggcgatggtgatgac
aagatgtccggcggtgacggtaatgatcggatgtatggtcaggatggcaacgacgaaatg
accggtggcgcaggcgatgattatgcacatggcggtgacggaagcgatatctatttcttt
ggtatggatagtggaattgataccttcattggtggagacggcggtggttggtcagacaca
atcgctttgtcagacgggttgcctgcaggtgatttgaatgattggctcaatctcacaagt
gggtccgttgaaactgcagacaatggggatatcttcctgtctgaagacgctgcaggtacg
attacgcttggcgaagatgctgttctaacatttgatggtgtggaaaaaattgaaggctag
DBGET
integrated database retrieval system
