Staphylococcus nepalensis: BJD96_10335
Help
Entry
BJD96_10335 CDS
T05272
Name
(GenBank) phage tail tape measure protein
Organism
snl
Staphylococcus nepalensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PhageMin_Tail
Peptidase_M23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATH60668
LinkDB
All DBs
Position
complement(2187836..2194819)
Genome browser
AA seq
2327 aa
AA seq
DB search
MDNIQGYAIKNTMDNTGIEQGMKSLKRQMGVLSSEVKANMSSFGKAEKSVQKYQTRLDGL
NNKMKVQKKMYDQAKTDLNNVKSSYEKASNSIKQQEQKVKELAEAHKKQDEAMRKSNQEM
KKSNKELDNAKMKQSVLSAEKAKAKTKLDDLRSAERRLKESGKASTEQIKQASNATKQQR
EVHQKLIASHKEETANVKKLTQSNKSITEENKKVKASYQQSNDAVKTAEKEYDKLSKTIK
DYPKDLAKAEKAVNNEKASMNGLQKSIDKAEQELKQMNKQQMIANSSYTKQADHLDKMSE
KYGKMSQNMRSVGRNMSMYVTTPIAGAMGYAGKLGVEFDDGMRKVQAISGATGKDLDALK
AKAREMGATTKFSASDSAEAMNYMAMAGWKSQDMMSGLPGIMDLAAASGEELGTVSDIVT
DGLTAFGLEAKDSGRFADVLASASANANTNVQMMGEGFKYAAPVAGALGYSIEDTSTAIG
LMSNAGIKGQKAGTALRTMMTNMTQDTAKAKENFQKYGVSLTDSNGKMKSFKTVMDDLRK
NIGNLDEKQQAQAATTLFGKEAQAGALSIINASQKDYDKLSKSIDNSEGSAKKMGDTMEK
GLGGSLRELKSAAEELGLSVFETIQPALSGMVGGLKSTVDFLNDLPKGAKVAGVAIAGVA
AAIGPVTLGVGLLLRAVQAAAGGYAQLNRRMAENSAEAAINAGATKANAGAITASGKSAK
GSAGLFGRFGKSTGKAAGKVSLLGQASKVLGNGIKILGGPIGWIITGVTLLGGAFIKAYN
NVDWFKKGVDGLFDVIKTFGGGAIDQLKNLGGWFSKTGSKIKETFFDEMKQGYKDLDDDD
LLKKAGDGFKKFMDKVGTASDKATDTTKVLGKGVSKETKNALDKYVKYSEDTTRVLSDIK
LNHGKITDDMREKLETSVRKGGEEALKQIQKRNKKVSDELNDMLENSEAFTAQEKQDMIQ
KNQEASDEKIKRLEELNQEIEELELKQFNDGKLTAQEEKDLKAKLDERNRITTESIAKGQ
KEQQAILSRMNANTGAIDTQQASEAIKDAVKAEKKAKKEAKKQREDDVVQADDLLAYGEI
DQKEHDKRVREIEDAYDEAIDTAEGKTGDIRKSVKKNNKDIADDIDLSSGHVYSNSEKWY
KKTKNFIKDDWNSFWQDVGSQASGIGTWIGDQTDEIIGAFKKGWGKVEDFFTETDWKELV
NGWFENIGEWIASPFKAIGEDIGDAVSSWKENISEAGEDIKSGFDTITGWFSEQGQEFWD
ALKEGWNIAIEAGGDLWNSLTGWLGETYENVSGWFVEKGSNIWSSLKNGWNTAIETGGDL
WQSLTGWLSEKWESTKEWFSEKGGHIWSNIKTGWNNALETGGNLWSYLTGWLGEKWEDTK
EWFSQKGHHIWSNIKTGWNDALEIGGNLWSSLTSWLGEKWEETKTWFSQKGGHIWSNIKS
GWNNALETGGNLWSSITNKLGESWENTKGWFSEKGQNIQQSFKNGWNSAWDTAGNIWGKV
TKGVSDTWENVKTSTRDKLEEAKGTATDKTKGIWKNTSKWFGDTYNSAKDKVTGVYTKTR
DKFTDAAGKVWDKSKSAYDGTKKWFGETYEKAKTKVTGVYNQAKGKFTDTASTAWDKSKS
TWKGTSKYFGQAYSSVKTNVSNMWGKAKTSFGNIAGEGWKKAESVYKGFKKWLGDTLQWI
KDIGADMGKAAGDLGKTVANKAVDGLNGMIGGVNKISKAITGKNELIKKIPHLATGTYDG
STLSTDSNGGLRQPTVAMVNDKGPGNGPGGRTQELIQRKDGSIDAPQGKNTIVGLGKGDG
VINARHTHKLQEQGIIPKRLSTGTGTKIPRFSKSSKKKKTYEQIADSIKDVSGGFKDKAS
KTAHGIKDKTADAMETVGDKMKDSASWLGEKIGDVWKYVKHPGKLVNKVMDSIGINFGGG
DNATVNLVKAAYKNLKSSLVDKVKDWFTEAKGGNGDASWLPWDNILQTFGHYTGGLMFNG
GRHYGIDFGMPIGTPVKAVADGKVSKVWNDYGGGKSIEVQVGKNLWNWYMHLSEQMAKQG
QKVSAGDVIGKSGDTGNFVNGAHLHFQLNKGDHSGNDTAINPKQWLESLESKGGKNSGQK
AVQAWKPEVMKALGLAGLPQTSTYANAWLRQINTESTGNPKAVGPGSSEGNPKGLVQVKP
GTFNAFKLSGHGNIFNGLDNLIAGMRYAKETYGGRMLKQIGVGGPYANGGIVTKHQIAEV
GEKNRAEAIIPLHKSKRNRAVGLMEKAMTAIGMDNGSANVTVNNDNSTMEKLLKQVVQLN
DTNNRMQQTIIKLLSGNNNNMSKNEVMNIFSQLLGSKANLDNFNQGF
NT seq
6984 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggataatattcaaggttacgcgataaagaatactatggataacacaggcatagaacaa
ggcatgaaaagtcttaaacgccagatgggtgtattaagttcagaagtgaaagcgaatatg
tctagttttggcaaagctgagaagtctgtacaaaagtatcaaacacggcttgatggactt
aataataaaatgaaagtccaaaagaaaatgtatgatcaagctaaaactgatttaaataac
gttaagagttcttatgagaaagcttcaaacagtattaaacaacaagaacaaaaagttaaa
gagcttgccgaagcacataagaagcaagatgaagcgatgcgtaaatctaatcaagagatg
aaaaaatctaataaggaattagataacgctaaaatgaaacaatctgtattaagtgctgaa
aaggccaaagctaaaacaaaactcgatgacttacgttctgcagaaagacgtttaaaagaa
tcaggcaaagcctctactgaacaaattaaacaagcttctaatgcgaccaaacaacaacgt
gaagtccatcaaaaattaattgctagccacaaagaagaaactgcaaatgttaagaagtta
acccaatctaataaaagcattacagaagaaaataaaaaggttaaagcttcttaccaacaa
tcaaatgacgcagttaaaactgctgaaaaagaatatgacaaactttctaaaacaatcaaa
gattatccaaaagacttagcgaaagccgaaaaagctgttaataatgaaaaagcttcaatg
aatggtttgcaaaaaagtattgataaagctgaacaagagctaaagcaaatgaacaaacaa
caaatgattgctaatagctcatatacaaaacaagcagaccatttagacaaaatgtcagag
aagtatggcaagatgtctcaaaatatgcgttcagtaggacgtaatatgtctatgtatgtg
acaacaccgattgctggcgctatgggctacgcaggtaaacttggcgttgaatttgacgat
ggcatgcgtaaggtacaagccatctctggcgctacaggtaaagatttagacgcgttgaaa
gcgaaagcccgtgaaatgggtgcgactactaaattcagtgcgagtgatagtgctgaagct
atgaactacatggctatggctggttggaaatcgcaagatatgatgagtggtttgcctggg
attatggatttagctgctgcatcaggtgaagaattaggtactgtttctgatattgttact
gatggattaacagcatttgggcttgaagctaaagatagtggccgttttgcggatgtctta
gcgtcagctagtgcaaatgcgaatactaatgttcaaatgatgggtgaaggctttaaatac
gctgcccctgtagctggcgcattaggttatagtatcgaagatacttcaacagctattggg
ttgatgagtaatgcgggtatcaaagggcaaaaagctggtacagcattacgtaccatgatg
actaatatgactcaagatacagcaaaagcaaaagaaaacttccaaaaatatggtgtaagt
ttaaccgactctaacggtaaaatgaaatcatttaaaacagtgatggatgatttaaggaaa
aatataggaaatctagacgaaaaacaacaagctcaagctgcgactacattatttggtaaa
gaagcgcaagcaggtgcgttatctattattaatgcttctcaaaaggattatgacaaacta
tctaaatctattgataacagtgaaggctcggctaagaaaatgggcgacacaatggaaaaa
ggcttaggtggtagtttaagagaattaaaatcagctgccgaagagcttgggttatctgtt
tttgaaactattcaacctgctttatcgggtatggttggcggtttgaaatcaacggttgat
ttcttaaatgatttacctaaaggtgcaaaagtagcaggtgtagctattgcaggcgtagct
gccgcgattggtcccgtaactttaggtgtaggcctattattaagagcggttcaagcagca
gctggtggttacgcacaacttaatcgacgtatggctgaaaactctgcagaagctgcaatt
aatgcaggagcaactaaagcgaatgcaggcgcaattactgcgtcaggtaagagtgctaaa
ggttctgcaggtttatttggacgtttcggtaaatcaacaggtaaagcagctggaaaagtt
agtttattaggtcaagcgagtaaagttttaggtaatggtattaaaattttgggcggtcca
attggctggattattacaggtgttacgttattaggtggcgcctttattaaagcatacaat
aatgttgactggtttaaaaagggtgttgatggtttatttgatgtcatcaaaacgtttggt
ggcggcgctattgatcaacttaaaaacttaggtggttggttctcgaaaacaggaagtaaa
atcaaagaaactttctttgatgaaatgaaacaaggctataaagacttagacgatgacgat
ttattaaaaaaagctggcgatggctttaaaaaattcatggataaagttggtacagcctca
gataaagcaaccgatacaactaaagttttaggtaaaggcgtttctaaagaaactaaaaat
gctttagataaatatgttaagtattcagaagatacaacgcgtgttttatcagatatcaaa
ctaaatcatggcaaaatcacagatgatatgcgtgaaaaacttgaaacttcagttcgaaaa
ggtggagaagaagccttaaagcaaattcaaaaacgtaataaaaaagtatccgatgaattg
aatgatatgcttgaaaacagtgaagcgtttactgcccaagaaaaacaagatatgattcaa
aaaaatcaagaggcatctgatgaaaaaattaaacgacttgaagagctaaaccaagaaatc
gaagaattagaactaaaacaatttaacgacgggaaacttacagctcaagaagaaaaagac
ctaaaagctaaattggatgaacgtaatcgtatcacaaccgaaagtattgcgaaaggacaa
aaagagcaacaagctattttatcaagaatgaacgctaacacaggtgctattgatacacaa
caagcaagtgaggctattaaagatgcagtcaaagcagagaaaaaagctaaaaaagaagct
aaaaaacaacgtgaagatgatgttgttcaagctgatgatttacttgcttacggcgaaatt
gatcaaaaagaacacgataagcgagttagagaaatcgaagatgcttatgatgaagcgata
gatactgctgaaggcaaaactggtgacatacgtaaatcagttaaaaagaacaataaagat
atagcggatgacatagatttatctagtggtcatgtttattctaattctgaaaaatggtat
aaaaaaacgaaaaattttataaaagatgattggaatagtttttggcaagatgtaggttca
caagcttctggaattggcacttggataggcgatcaaaccgatgaaattattggagctttc
aaaaaaggttggggcaaagttgaagatttctttacagaaacggattggaaagagcttgtt
aatggttggtttgagaacatcggtgaatggattgcttccccatttaaagcgataggtgaa
gatattggcgatgccgtttcttcttggaaagaaaatatttctgaagctggcgaagatatt
aagagtggttttgatactatcactggttggttctctgaacaaggtcaagaattctgggat
gcccttaaagaaggttggaatattgctatagaagctggcggagatctttggaactcttta
actggctggttaggtgagacttatgaaaatgtttctggttggtttgttgaaaaaggcagc
aatatctggtcaagtttgaaaaatggttggaatacagcgattgaaaccggcggtgatttg
tggcaatccttaacaggttggttatctgagaagtgggaaagtacgaaagaatggttctca
gaaaaaggcggccacatctggtctaatattaaaactggctggaacaatgctttagagacg
ggcggtaatctctggtcttatttaacaggttggcttggcgaaaaatgggaagatacgaaa
gaatggttttctcaaaaaggtcatcatatctggtctaatattaaaacaggttggaatgac
gcgcttgaaattggaggcaatctctggtcttcattgacaagttggctcggtgaaaagtgg
gaggaaactaaaacgtggttctctcaaaaaggcggtcatatttggtcgaatattaaatca
ggatggaataatgcgcttgaaactggcggtaatctatggtcatcgattactaacaaactc
ggtgaaagttgggaaaataccaagggttggtttagtgaaaaaggtcaaaatattcaacaa
tcattcaaaaatggttggaattcagcttgggatacagcaggtaatatttggggcaaagtg
acgaaaggtgtatctgatacctgggaaaatgtgaagacatcaacccgtgacaaactcgaa
gaagctaaaggtactgcgaccgataaaacaaaaggtatttggaaaaatacatctaaatgg
tttggagatacttacaattcagcgaaagataaagtaacaggtgtttatactaaaacgcgt
gataaatttacagacgctgcaggtaaagtgtgggataaatccaaatcagcatacgacggt
acgaaaaaatggtttggtgaaacttatgaaaaagctaaaactaaggtcacaggtgtttat
aatcaagcaaaaggtaaatttaccgataccgcgagtacagcttgggataaatcgaaatct
acgtggaaaggcacaagcaaatatttcggtcaagcttatagttctgttaaaactaatgta
agtaacatgtggggtaaagctaaaacaagtttcggtaatattgctggtgaaggttggaag
aaagcagaatctgtttataaaggcttcaaaaaatggctgggcgatacgctacaatggatt
aaagacattggtgccgatatgggtaaagccgcaggcgatttaggtaaaacagttgccaat
aaagctgtagatggtttgaatggtatgattggcggcgttaataagatatcaaaagccatt
acgggtaaaaacgaacttataaaaaaaatacctcatttagctacaggtacttatgacggt
tcaacgctctctacggattcaaatggtgggttaagacaacctacggttgcaatggttaac
gataaaggaccaggtaatggaccgggcggacggacacaagagctcattcaacgtaaggat
ggttcaattgatgcgccacaaggtaaaaatacgattgttggattaggcaaaggtgacggt
gttattaacgctaggcatacgcacaaacttcaagaacaaggcataatacctaaacgctta
tcaacgggtacaggaactaaaatacctcgtttctctaaaagtagtaagaagaaaaaaaca
tatgaacaaatagctgatagcatcaaagatgtatctggtggttttaaagataaagcatct
aaaacagctcatggcatcaaagataaaacagcagatgcaatggaaactgttggagataaa
atgaaagatagcgcatcttggcttggtgaaaaaatcggtgatgtttggaaatatgttaaa
catccgggtaaattagtgaataaagttatggatagtataggcatcaacttcggcggtggc
gataacgctaccgttaatttagttaaagctgcttataaaaacttgaaatcttcattagta
gacaaagtgaaagactggtttacagaagctaaaggtggcaatggtgatgctagttggttg
ccatgggataatatcttgcaaacatttggacattacactggtgggcttatgtttaatggt
ggtcgccactatggtatagattttggtatgcctataggaacaccagtaaaagctgtcgct
gacggtaaagtttctaaagtttggaacgattacggtggcggtaaatcgattgaagttcag
gttggtaagaacttatggaattggtacatgcatttatctgaacagatggctaaacaaggt
caaaaagtaagtgctggtgatgtcatcggtaaatcaggtgatacaggtaactttgtaaat
ggagctcacttacacttccaattaaacaaaggtgatcactctggaaacgatacagctatc
aatcctaagcagtggttagagtcattagagagtaaaggcggtaagaattcaggacaaaaa
gcagttcaagcatggaaaccagaagtaatgaaagcattaggtctagcaggtctgccacaa
acatcaacatatgcaaatgcttggttaagacaaatcaacactgaatcaactggcaatcca
aaagcggtaggacctggcagttcagaaggtaatcctaaagggttagttcaagttaaacct
ggtacatttaacgcatttaagttaagtggacatggaaatatattcaacggacttgataac
ttaattgcaggtatgcgatatgctaaagagacatatggtggaagaatgctaaaacaaatt
ggtgtaggtggtccttacgctaatggtggtattgtaactaaacatcaaatcgctgaggtt
ggtgaaaaaaatagagcagaagctatcattccacttcataaatctaaacgtaatcgtgcc
gttggcttgatggaaaaagcaatgacagcgattggcatggataatggttccgcaaatgtc
acagtgaacaacgataattcaacgatggaaaaattactaaaacaagttgttcagttgaat
gacaccaacaatcgtatgcaacaaacaatcattaagttgttgagtggcaataataataac
atgagtaaaaatgaggttatgaatatctttagtcaattgttaggtagtaaagctaattta
gacaatttcaaccagggtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
