Sneathia vaginalis: VC03_01265
Help
Entry
VC03_01265 CDS
T03854
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
sns
Sneathia vaginalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Beta_helix
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC95206
UniProt:
A0A0E3ZAY4
LinkDB
All DBs
Position
complement(248976..259184)
Genome browser
AA seq
3402 aa
AA seq
DB search
MDKIYNVQKNLKRCMKSNRKISFSMGLLISFLITGGIYTYANEYSHQIFFNGDFNRNVNF
DNTLKNFSHPDYPETLDNKDKYEYFGSYGVKKINTKYMDFVSFSTDLVPKKAPNIFLIEP
KNSTLKINAVNNITFDNPKVDDEKINKPENKPETKDPINIQKIDRKPIDTITLQNNVDIH
IEKIEQITPKNPTYTNISPSKISNDILPQNIDIKFDKRIVAAPKLEDFTPPTPKTPVELG
DTGFESVIYNEAYQLLDPDRNIGSERAEYNRGIVGQVSITKGTFKINNVYEDGCYFAYKN
YDSIPNYYSNPDYESYKNPIKLNDDNYLKEPKQFDLGLFDSADPDDYLVSEDIYNVKYDD
ERFRTFYGLNSSAYGYFGKDVDISYISNARKETTNNSYTNKNPNTVIYMETDSNSAQTLE
NLHNYKVVNDELYNEIKGYKDLSKLKDDDTFEFKKEIFPTGITLFNSEANVKLLGSYAKF
VTVTTQFSDERSNKRLSVFNNNGNISALNYTTNEDDDDIKNQIIFYSTPDATPKYSDFQR
YIYSNGQKGKINIYSNNAIGMYFTESGINGFQNALSTAFINNGEFNIYGAHSTGVSLKRP
ATLGTKSGIYLLKPINIFGDEAVGVFLPGDVSKVPEENLQLRVNIGEKGNNKEKVTWNDE
FPGNEEGEDYDAEDAEPKDIVIPNVGNTEGNSVDNVDYSIGLFYANSHKANIGLTDIKLG
KFAKNSTAIFASDGELHISKGKIDIDGEDNIGLLSQKNGTNGGKISYVGDITASGKKNKL
VYTDNKNISIEGTVSSTSKDSVSIYADTGTIDLTKADLNIDISGENVAAGYAVNNGKIKL
KDESKIKITNDAPSNGTALVAKKGGVIEAKKAKIDIKNIVAGLSASDDNSNIDFTGGTLN
YDGEGYSIYTDGKGKINLSDAKITLKGKAIGFDVDQDENSEQNVILNNMTRIKPESDDVI
LFNLKNSSDLDTKGGIRDHIISRIETKLKKTNPDINLTQLVTQPKAGEPGEFYKVSAMEG
GNIKIGSLDKSAVSTDDINGEPDTEEKKAKKDGFQFYNRLHIQRLIATTHDNSTISAILD
NKAASKFNNQVVALELSSSPSATSNAETQINIVKSNIIADRTEKGSGAIGLFINYGKIDV
DETSTISVENENSVDNKQAVGIYAVNGSEVSNKGEITVGSSNSVGILGENHRKATNSTEN
DKFGDGKINISNAGTIEIKKANSTGIYANNIDKEITDNTVVNSGTIKALGEHSNGIYSHK
GTVSNTGIIELGDKNVGIYSDSSIIKDLGTIKFNSNNSTAIFVKGSSTIDSGKKLTIENN
GDLSGNVGLYSENDLETDLVIDAKGKKITSYYTKSKALTVNADITTSEDGVGINGDNGSI
TYEQGKNLTVSKESFGILSHNSDVTLNGNIQLDSELGKGIYFDSSEKNLNISGNINVNAK
NVIGSYISNVTDSTKLTLTTPITFGENSDHSIAYLFNKSKFNNTSFTELKSKGTQHNTYI
FALSENKINLGTNEVSIKSEDSSKGFTGIYLGESNKLTGEKIKVSDKATGIYSKDNNTVE
IKNIEVNGQDTVGIYSEKSNRLKNVNISSSNSAVGIYGKKGKITFLGDNSLNLSSKGTGI
YLEEASLNGGSIKLVNKDNDKNNSLVGVYFKESKSSKNTSNISIDNDTKLIGLYLDKAKV
LNKGEIKATLGSSNTLAFVANGSTFTNSGNLTLTSSDSHAIYVNDGIAENTGNITVDNEG
NKDNKPSVAMAGMKTGKKVILTNDGKINVSNNSIGMYLDNGAIGNNKKDIVAQKKDSVGV
YVNGNQTLFTNTGKISADNIGVYLNNTEKGNIKKLGSVTLTNDNAVAVYANNSKVDFEIK
PTVKEGELPNNLISLYATGNTEISSKIYTANGKNSIGIYLKDNKVSFNDAYVKITEGHED
KNGVSYNTGIYADSEYKGDLKVNIENTAKNTIGIAVSEGSTVNYSGNITTGKDSIGILTK
GTLVTKNSTFNIDGGTGIFVDNTADAKIGTDENTIMNLSNKATAIYQNGGKLKLGDKLKF
GENSMGTLLISRNAEVDSNISYSVKTDSLGVGLYYTDNKDHKFTSSGKITLGSDNATGIY
AQSTGTGTNTLINNGEIITSDGMKNNIGIYADNVNVESNKISIGEKGVGIYLTKKVNLKN
TEITLNGENSVGIYSENISNGSNYSVGKITGEKNNQTGLFIFNEKYDENKNITLSDLDIN
LKNNSKGVGLQNANYTINGDSKISVGDKSTGLAFKDAKANVKANITVKENSLALYAQGEK
NVTFEGKIEAGKNSKWVYAKDKANITLNKFADFTVNGGLGLGADNATITADKETTITVNG
GTGAYINDGKIDKFKIDVQKGLGLYIQNGYNGTLPTVSLTGDNSKAYVLESLNKEFKVND
NITLDKTNQIYIYSKETGKGIDVKDIQIKGSDSYGIYNLADQNITTKDLNISGSKSFGIY
STGKGKINVDKITVTGKNSAGVYSIKGDITQTGDITSKGLGIYSEDGSVTLNGSKISLGD
KDGIGVKAKNSSVTISNAMTISNGKEGAAGIYSEGTGDITFENNLVVNKDIIGVYKSGTG
TINLNGSSTTILENGIGVYSKGAEVNNAGSLNVTNKNAKGIYVENNKLTSNGTVTINGEN
AIGLASKNGEISSTGDISVTGKDAVGIYSDEAEVKSTGKITSNSIGIYSKGTKDITQSGD
ITVGKDAVGIFKEGSGNVNITSKDVKVGDKGYALYYLNDSNKRGTITANIKNMNLGSEAI
GIYTKNGNLTYTGNINVGEKKNSAGIYADNSDVTFKGILNVSNPETIGIFAKGNSNVTIE
NGSTINVSNGSYGIMTNDDSTGKITIEKGATFNISNLSYGISAYGKNTIINNGTFNIDAN
STGIFHSFDSTISGSGNIPSDKIKTLNKKADVAGIDIKFNGEVKFPKNIEVVNGGTIKVN
GTVDINNMYLDFEHDNKPIIDANSIKGTAIVTSNFSMGNRVNKLVYQDVFRPRSENGFGK
FAGDVTSQSASWIAKISKTEPDTKTYDIMMVRIPYTVMFKGEKNSQLGKSLEEIRSTIPT
YSKIFKDLDNVSTEKELTDTIANIRGDIYSNIQERMLDVDNTFDKSYKEVLDSHNVTDRV
HKFSVIYSKNKHIDETLGVSSYDKDSYGILYLNDRENGANKYGFSVGLICSKFNFTGPTS
LGSSEEMRSGKFGLHYQRTKDNLKYLTRLELGVNKHITNRVSNVNGMKYKYNANYWSYNI
DWKNRLSYDIDVTKDFRITPYANLDVTYGKIFGINEDALTDPTLKLSIKPNSYFVITPRI
GIDAKYDIELKNDMHISLKGNLEYHYDLNELYKRVNMAKFSSVTDYYELSIPGYRRSGLK
VGGEVEIGKKDRYGVTFGATYDRSMKYSLRFNYKCLGFNYKF
NT seq
10209 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaatatataacgtgcaaaaaaatctgaaaagatgtatgaaaagtaatagaaaa
attagcttttcaatgggtttacttatttcttttttaattactggaggaatatacacttat
gcaaatgaatattcacaccaaatattttttaatggtgattttaatagaaatgtaaatttt
gataacactctcaagaacttttctcatcctgactatccagaaacattggataataaggat
aaatatgaatactttggttcatatggagtaaaaaaaattaatacaaaatatatggatttt
gtaagcttttcaactgatttagttccaaaaaaagcacctaatatttttttaatagaacct
aaaaacagtactttaaaaattaatgctgtaaataacattacttttgataacccaaaagta
gatgacgaaaaaattaataaaccagaaaataaaccagaaacaaaagatcctattaacata
caaaaaatagatagaaaaccaattgacacaataactctacaaaataacgtggatatacat
attgaaaaaattgaacagattacaccaaaaaatccaacatacacaaatatatcaccatca
aaaatatcaaatgatatactcccgcaaaacattgacatcaaatttgataaaagaatagta
gcagccccaaaacttgaagattttacaccaccaacaccaaaaactccagtagaattagga
gatactggatttgaaagtgtgatatacaatgaagcatatcaacttttagatcctgacagg
aatattggtagtgaaagagctgaatataatagaggtatagttggacaagttagcataact
aaggggacatttaaaattaataatgtttatgaggatggatgttattttgcatacaagaat
tatgatagcatacctaactattattctaatcctgattatgaatcctataaaaatcctata
aaactaaatgatgataactatttaaaagaacctaaacaatttgatttaggtttatttgac
tcagctgatcctgatgattatttagtttctgaagatatatataatgttaaatatgacgat
gaaagatttagaactttttacggactaaacagttctgcttatggatatttcggtaaagat
gttgatatatcatatatatctaatgcaagaaaggagactactaataattcttataccaac
aaaaaccctaataccgtcatatatatggaaacagacagtaactcagcacaaactttagaa
aatttgcataattataaggtagtaaatgatgagctatataacgaaattaaggggtataaa
gaccttagtaagttaaaagatgatgatacttttgaatttaaaaaagaaatttttccaact
ggaataactctatttaattctgaagctaatgtaaaactgttagggtcttatgctaaattt
gttacagtaactacccaatttagtgatgagcgctctaataaaagattaagtgtttttaat
aataacggaaatatttcagccctaaattatacaacaaatgaagatgatgatgacattaaa
aatcaaataatattttatagtactccagatgctactcctaaatatagtgattttcaaaga
tatatatattcaaatggacaaaaaggtaaaataaatatatatagtaataatgctattgga
atgtattttactgaatcaggaataaatggatttcaaaatgctctttcaactgcctttatt
aacaacggtgaatttaatatttatggtgcccatagtactggtgtaagtcttaaaagacct
gcgactctaggtacaaaaagtggtatatatttacttaaacccataaatatttttggtgat
gaagctgttggtgtctttctacctggtgatgtttcaaaagttcctgaagaaaatctacaa
ttaagagttaatattggagaaaaagggaataataaggaaaaagtaacttggaatgatgaa
tttccaggtaatgaagaaggtgaagattatgatgctgaagatgccgaaccaaaagacatt
gtaatacctaatgtaggaaatacagaaggcaatagtgtagacaatgtagactacagtatt
ggtctattttatgcaaactctcataaagctaatatagggcttacagatattaagttgggt
aaatttgctaaaaatagtacggcaatatttgcttccgatggagaacttcatatatcaaaa
ggtaaaatagatattgatggagaagataatattggtcttctttctcaaaaaaatggcact
aatggtggaaagatttcttatgttggtgatattacagcttctggtaagaaaaataaatta
gtgtataccgataacaagaatatttcaattgagggtacggtttcaagtacatcaaaggac
tctgtttctatttatgctgatactggtactattgatttaacaaaggctgatttgaatatt
gatataagtggtgaaaatgttgctgctggttatgctgtaaataacggtaagattaaatta
aaagatgaatctaaaattaaaataacaaatgatgctccttctaatggtactgctcttgta
gctaaaaaaggtggagttatagaagctaaaaaggctaaaatagatattaaaaatatagta
gctgggctttctgctagtgatgataattctaacattgattttactggtggaacactaaat
tatgatggtgaaggttactcaatttacacagatggaaaaggtaaaattaatttatctgat
gcaaagattacactaaaaggaaaagctataggttttgatgtagatcaagatgaaaatagt
gaacaaaatgtaatattaaataatatgacaagaattaaacctgaatctgatgatgtaatt
ctatttaacctaaaaaactcaagtgacttagatactaaaggtggaataagagaccatatc
atatctcgcatagaaacaaaacttaaaaagactaatcctgatattaatttaacccaactt
gtaactcaacctaaagctggagaacctggagaattctacaaggtctcagctatggaaggt
ggtaatattaaaataggtagtcttgataagtctgctgtttctactgatgatataaatggt
gagcctgatacagaagaaaagaaagctaaaaaagacggtttccaattctataaccgtcta
catatacaaagattaatagctactacacatgacaatagtacgatttctgctattttagat
aataaggcagctagtaaattcaataatcaagtagttgctcttgaattaagttcatcacct
tctgcgacttctaatgctgaaactcaaattaatatagttaagtctaatataattgctgat
agaactgaaaaaggttctggtgcaataggtctatttatcaactatggaaaaatagatgta
gatgaaacttctacaatttcagttgaaaatgagaatagtgtagataataagcaagcagtt
ggtatatatgctgtaaatggttcagaagttagtaataaaggtgagataactgttggaagt
tctaattctgtaggtatattaggtgaaaatcacagaaaagctacaaatagtactgaaaac
gataaattcggtgatggaaagataaatatatctaatgctggaacaatagaaattaaaaaa
gctaattctacaggtatatatgctaacaatattgataaagaaattactgataatactgtt
gtaaactctggtacaatcaaagcattaggtgaacattctaatggtatttattcacataaa
ggaactgtttctaatactggtattatagaacttggtgataaaaatgtaggaatatattct
gattcatctattataaaagacttggggactataaaatttaatagtaataatagtacagca
atatttgtaaaaggttcttcaacaatagatagtggtaaaaaacttacaattgaaaataat
ggtgatcttagtggtaatgtaggtctttattctgaaaatgacttagaaactgaccttgtt
atagatgcaaaaggtaaaaagataacctcatactatactaagtccaaagcattaactgtt
aatgctgatataactacaagtgaagatggtgtaggtattaatggtgataatggtagcatt
acttatgagcaaggtaagaatttgactgtttctaaagaatcttttggtattttaagtcat
aatagtgatgttacacttaatggaaatatacaactagatagtgaattaggaaaaggtata
tactttgattctagtgaaaaaaacttaaatatttctggaaatattaatgtaaatgcaaaa
aatgtaataggttcatatatctctaatgttacagattcaactaaattaacattaactaca
cctattacttttggagaaaattcagatcatagtattgcatacctatttaataagtctaaa
tttaataatactagttttactgaacttaaatctaagggtacacaacataatacatatatt
tttgcacttagtgaaaacaaaattaatttaggtactaatgaagtttcaattaaatctgaa
gatagcagtaaaggatttactggtatatatttaggagaaagcaataaattaactggtgaa
aaaattaaagtttcagataaagctacaggtatttattcaaaggataataatacagtagag
attaagaatatagaagttaatggtcaagatacagttggaatatatagtgaaaaaagtaat
agattaaaaaacgtaaatatatctagcagtaatagtgctgtaggtatttatggtaagaaa
ggtaaaatcacttttttaggtgataattcactaaatttatcttctaagggtacaggtata
tatttagaagaagctagccttaatgggggtagtattaaacttgtaaataaggataatgat
aagaataatagccttgttggtgtatactttaaagagtctaaatctagtaaaaatacttct
aatatatcaatagataatgatacaaaactaataggactttacctagataaggctaaagtt
ttaaataaaggtgaaattaaagcaactttaggttcatctaatactctagcctttgttgct
aatggatctacatttacaaatagtggcaatttaaccttaactagttctgatagtcatgct
atatatgtaaatgatggaattgcagaaaatacaggaaatattactgtagataatgaaggt
aataaagataataagccttctgtagcaatggcaggtatgaaaactggtaaaaaggttatt
ttaactaatgatggtaaaattaatgtatctaataatagtataggaatgtatttagataat
ggtgctataggaaataataagaaagatattgtagcacaaaagaaagattcagtaggtgtt
tatgtaaatggaaaccaaacactgtttactaacactggtaagattagtgctgataatata
ggggtatatttaaacaatacagaaaaaggtaatattaaaaaactaggttctgtaacccta
acaaatgacaatgctgttgccgtttatgcaaataattctaaagttgattttgaaataaaa
ccaactgttaaagaaggagaattacctaataacctaatatcactttatgctacaggtaat
acagaaataagtagcaaaatttatacagcaaatggtaaaaattctataggtatctattta
aaagacaataaagtttcatttaatgatgcttatgtgaaaataactgaaggtcatgaagat
aaaaatggtgttagctacaacacaggaatttatgctgatagtgaatataaaggtgattta
aaagttaatattgaaaatacagctaaaaatactattggtattgctgtaagtgaagggtca
acagttaattactcaggtaatattacaacaggtaaagattctataggtattcttacaaaa
ggtaccttggttactaagaatagtacatttaatatagatggtggtacaggtatttttgtt
gataatactgcagatgcaaaaataggtactgatgaaaatactataatgaacttatcaaat
aaagcaactgcaatataccaaaatggtggtaagcttaaattaggagataagctaaaattt
ggtgaaaatagtatgggtactctattgatttctagaaatgcagaagttgattcaaacatc
tcatattctgttaaaaccgactctttaggtgttggactatattacacagataataaagac
cacaaatttacctctagtggtaaaataactctaggtagtgataatgctactggaatatat
gcacaatcaactggaactggtactaatacattaataaataacggagaaatcattacttca
gatggtatgaaaaataatataggtatttatgctgataatgtaaatgttgaaagtaataag
attagtataggggaaaaaggtgttggtatctacttaactaaaaaagtaaatcttaaaaat
acagaaattactttaaatggtgaaaactctgttggtatttattcagaaaatatttctaat
ggttcaaattattcagtaggtaagattacaggcgaaaaaaataatcaaactggtttattc
atatttaatgaaaaatatgatgaaaacaagaatattaccctttcagatttagatattaat
ttaaaaaataattctaagggtgttggacttcaaaatgctaattatacaataaatggagat
tctaaaatatctgtaggtgataagagtacaggtttagcatttaaggatgctaaagctaat
gttaaagctaatattactgtaaaagaaaactctcttgccctttatgcacaaggagaaaaa
aatgtaacttttgaaggtaaaattgaagctggtaaaaattcaaaatgggtgtatgcaaaa
gataaggctaatataaccttaaataagtttgctgatttcactgtaaatggtggtctaggt
ttaggagctgacaatgcaactattactgcagataaagaaacaacaattacagtaaatggt
ggaactggtgcatatattaatgatggtaagatagacaaatttaaaatagatgttcaaaaa
ggtttaggtctatacatacaaaatggatataatggtactctacctactgtaagtctaact
ggtgataactctaaagcatatgttttagaaagtttaaataaggaatttaaagtcaatgat
aatattactcttgataaaacaaaccaaatatatatttattcaaaagaaacaggtaaagga
atagacgttaaggatatacaaattaaaggctcagatagttatggaatatataacttggct
gatcaaaatataactacaaaagatcttaatatatctggttctaaatcatttggtatatat
tctactggtaaaggaaaaattaatgtagataagattactgttactggtaaaaatagtgca
ggtgtttattcaataaaaggtgatatcacacaaactggtgatattactagtaaaggtcta
ggaatatactctgaagatggtagtgtaacacttaatggttctaagatttcattaggtgat
aaagatggtataggtgttaaggctaaaaattctagtgtaactatttcaaatgctatgaca
attagtaacggaaaagaaggtgctgctggaatatattctgaaggaactggagatattact
tttgaaaacaacttagtagttaataaggacattattggagtatacaagagtggaacaggc
acaattaatcttaatggttctagtaccactatcttggagaatggtataggagtatatagt
aagggtgcagaagtaaacaatgctggaagtttaaatgtaactaataaaaatgctaagggt
atctatgttgaaaataataaacttacttcaaatggaactgtaactattaatggagaaaat
gctataggtctagcaagtaaaaatggtgaaataagttctacaggtgatattagtgttaca
ggtaaagatgcagttggaatctactctgacgaagcagaagtaaaatctactggtaaaatt
acttctaatagtataggaatatactctaaaggtactaaagatattactcaaagtggagat
attactgttggtaaagatgctgttggaatatttaaagaaggtagtggtaatgttaatata
acttctaaagatgttaaagttggtgataaaggttatgccctttattatctaaacgactct
aataagagaggaactattactgctaatatcaaaaatatgaatcttggtagtgaagccata
ggaatatatactaaaaatggtaatttaacatatactggtaacattaatgttggagaaaag
aaaaattctgcaggtatttatgctgataattcagatgttacattcaaaggtatcttaaat
gtttctaatcctgaaactataggtatatttgctaagggaaattcaaatgtaactatagaa
aatggtagtacaataaatgtttcaaatggaagttatggtattatgactaatgatgactca
actggtaaaattaccatagaaaaaggtgctacatttaatattagtaatctatcatatggt
atatcagcttatggtaaaaatacaataataaacaatggaacatttaatattgatgctaat
tctacaggtatattccactcatttgactctactataagtgggtctggtaatattccaagt
gataaaataaagacactgaataaaaaggctgatgtagcaggtatagatattaaatttaat
ggtgaggttaaattccctaaaaatattgaagttgttaatggcggtacaataaaggttaat
ggaactgttgatattaacaatatgtacctagattttgaacatgataataagccaataata
gatgcaaattcaataaaaggtactgctattgtaacttctaatttctctatgggtaatcgt
gttaataagctagtgtatcaagatgtattcagacctagatctgaaaatggttttggtaaa
ttcgctggtgatgttacatcacaatctgcttcatggatagcaaaaatcagtaaaactgag
cctgatacaaagacatacgatattatgatggttcgtattccatacacagttatgtttaaa
ggtgaaaagaactcacaattaggtaaaagcttagaagagataagaagtactataccgaca
tattctaaaatatttaaagacttagataatgtttctacagaaaaagaacttacagataca
atagcaaatattaggggtgacatatactctaatatacaagaaagaatgttggatgtagat
aatacatttgataagtcatataaagaggtattagattcacataatgtaacagatagagta
cataagtttagtgtaatatattcaaagaataagcacattgacgaaactcttggtgtttct
tcatacgataaagattcatatggaatactttacttaaatgatagagaaaacggggctaat
aagtacggattctcagttggattaatttgttctaagtttaactttacaggaccaacttca
ctaggttcaagtgaagaaatgcgttcaggtaaatttggactacattaccaaagaacaaaa
gataatcttaaatacttaacaagacttgaactaggggttaataagcatattacaaataga
gtaagtaatgttaatggtatgaagtataagtacaatgctaattactggagctataacata
gactggaagaatagactaagttatgatatagatgtaactaaagactttagaataactcca
tatgctaatttagatgttacttatggtaagatatttggtattaatgaagatgctctaaca
gatcctacacttaaattaagtataaaaccaaattcatactttgttataacacctagaata
ggaatagatgctaagtatgatatagaattaaaaaatgatatgcatatatcacttaaagga
aacctagaatatcattacgatcttaatgaattgtataagagagtaaatatggcaaaattc
tctagtgtaacagactactatgaattatctataccaggttatagaagaagtggtttaaaa
gtaggaggagaagttgaaataggtaaaaaagatagatatggcgtaacatttggagctact
tatgatagatctatgaagtatagtttgagatttaattataagtgtttgggatttaattat
aagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system