Sneathia vaginalis: VC03_04155
Help
Entry
VC03_04155 CDS
T03854
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
sns
Sneathia vaginalis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_head
YadA_stalk
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC95695
UniProt:
A0A0E3ZAI4
LinkDB
All DBs
Position
complement(826977..833030)
Genome browser
AA seq
2017 aa
AA seq
DB search
MKNINIEEVKRYLKRSLKKKVKITTSLIVLFMMSNSIGMATNISIEKGKIGSWGSENTNK
GSIALNPKGENDSKVQYQVVKDYAIAIGLGSEANASDSVSIGHGSVVENNAAKAIAIGNN
AKIYNTVLPNGESNNNSIAIGTGAEAYIFKSVAIGEGAQTLSVDFYNDGTRDDNKRKKGD
GGQSTAIGSGAIAVDQATSVGNDTYAIGRSSIAIGSDDNRKFREETTPYDFEKYFKNLYN
KIGNSDGHKYGSSKQGQFAKFHENDYSYNYSPTLSAGEGGIALGTRALSYGTGATSIGAM
SFALGDYSTAMGAKTRAEGKGAIAIGNSTKVFSDHSVAVGNENQILNEGGTAYGYKAYSG
GKNSIAIGTEVYSNTILRDDKQGIHSDFIGKYTGKDNGTLFSNDYMNGKISDVLKAKETK
LSESGSLSVNKKKLHDINNIIDSKDGNNNSIVLGTKSMATESNSIALGHGTFTLAKNSMA
FGSFSYVKGENSLGLGVDSKVLSNNSIAIGTRAGVGYKSDNSLVMGNFSYSTGKNALVFG
NKSKVTAEDGLAIGSNSEASLANSTALGVNSKTDYTKEDLEKDAYAPRGVLSMPSTEKIG
VISVGSKGAERRIVNVAAGYRDTDAVNVSQLKAMEEKINQSGLMDVEDDDLNISDNGIHY
LSVDKNGYRSKDIKEIMQKQRDYNKYIEYKSRQLEMKAREARGDKLPDPYKTKINAKVEN
LENKYKNDTQFNQIELKKITDQEIEGIKNNGASFDAIITKINLAKEKDKYITYTDENGQE
IQKLKTILYEDEVKKINESNYNNKGAIGKDSIALGYQTKSTGDKGIAIGTGDQRSLDILE
KQKIIDVSRGEEKQKLVNKEIRLNNNMYTRSGENAVAVGTGAIAKDWSVALGGNTQTEDT
AVAIGDRSKALGNRSIAIGNKAATGRYYEFNGKEKINETLKKSNIQTLNYDSIGMVGYDG
AEKAIAIGSHSTATSDYSVAIGNGATTGDNKTYTKEIYVKDRTKNDLTESEQAMIIRKHF
HKDADSFNQDENNRLQSLIKDYESKNLDRQKQEILEKNYYLKEQEVNKDEKKKKIFDELV
RSINAKTEQEKKDAKEKILQKYFHKKQSELSTNEKKEFNQKVALVQGANKEMILQKYFAK
SKYDQLSEGEKKEFDTIIKDLTDSEKENLLRTYFMGKKEEELTPEEKKEFDAFKDNFKKK
VIVGGAENAIAIGKYAKASKNDTIALGKDSNAVEEKAIAIGKEARAKGAQSVVIGTPNSS
NSKADEDTDSNIGEISAGQSSVSVGNGVKSGDYSVGIGGNVVAGKTAVAIGDRSRAIGDT
SVAIGEKALAKGPRSIAIGNETKANAEDSYVFGGKSEISSTAGQSSAIGINISVKSAQAI
AMGNDVVIEENSRGAVAIGSDDSSYNEGNNKIGGNNYTKTMAKGNATTAIGAHAQATNVA
ATALGARAFATEKETVAVGANSKASVEGAVAIGSYSLADRVKNTTYYNPKTGNTDGKDTD
KLATKAALSIGDTSKNIRRQLIGLAAGTNDTDAVNVWQLKELKGYFDENKKFDLEGDKNG
KQTFELPNKLEVKGNTEKKTDGKTYQDWDNTYTVENVQTYISKSGNNAKILIGIKNKPRF
DKVYVGNETTGLEIAQDNSNNITLTQNGAKITLTKDNNNLKMSGIANGVADNDAVAYGQV
KNPFIVKADKSTPKASTEKSMSLGKTLEFTGRKFDGTKNYDDWSVDETVTGKSGNYTSEN
VETFVTQDNVTGRTGVLIGLRKDPRFDKVTLGELDNDRTEITKDGISITKKATPDKVVKF
GIDNNGNATLTDARNKDASPIVTEKSLGDQKIKYAANSKNKKETTLTNGFNFSDGTNTTA
EVGDNGVVKFNLKDKLTGITSITNGNEDNANENSKIELTNKDLKLTNKGKSVKILTKGTN
GNEEILIEFERPVKNETSSGKPIINQKHEDYGIGTINYLKDRRASKDGDYGTGTNIGRAA
TEGAVKEVNDAIKTVENNISKKADKTDLSGICKSRCK
NT seq
6054 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaatataaatatagaagaagtaaaaagatatttaaaaagaagtttaaagaagaag
gtaaagataacaacgagtttgatagtgctatttatgatgagtaatagtatagggatggct
actaatataagtatagaaaagggaaaaattggaagttggggtagcgaaaatactaataaa
ggatcaatagctttaaatcctaaaggtgaaaatgattcaaaagtacaatatcaagtagtt
aaagattatgcaatagcaataggattaggatctgaagcaaatgctagtgattcagtttca
atagggcatggttcagtagttgaaaataatgctgcaaaagcaatagcaataggtaataat
gcaaaaatatataatacagtattgccaaatggtgaaagtaataataactctattgctata
ggtacaggggcagaagcatatatttttaaaagtgtcgctataggtgaaggtgcacaaaca
ttaagtgttgatttctataatgatggcacaagagatgataataaacgaaaaaaaggagat
ggtgggcaatcaactgcaataggttctggagcaatagctgttgaccaagctacatcagta
gggaacgatacatatgcaataggaagatcatcaattgcgataggatcagatgataataga
aaatttagagaagaaacaactccttatgattttgaaaaatattttaaaaatttatacaat
aaaataggaaatagtgatgggcataaatatgggtctagtaaacagggacaatttgcaaaa
tttcatgaaaatgattattcatataactattctccaacattatcagcaggtgaaggaggt
atagctttaggaacaagagcactatcatatgggacaggtgctacttctattggagctatg
tcatttgcactaggagactatagtactgcaatgggagcaaaaactcgtgctgaaggtaaa
ggtgctatcgctataggtaatagtactaaggtattttcagaccactcagttgcagtgggt
aatgaaaaccaaatattaaatgaaggtggtacagcatatgggtataaagcatattcaggt
ggtaaaaactcaattgctataggtactgaagtatattctaatactatacttagagatgat
aaacaaggcatacatagtgactttataggaaaatatacagggaaagataatggaactctc
tttagtaatgattatatgaatggaaaaattagtgatgttttaaaagcgaaagaaactaaa
cttagtgaatctggatcactttctgtaaataaaaaaaagttacatgatattaataatatt
atagatagtaaagatggtaataataattcaatagttttaggtacaaaatcaatggcgact
gaatcaaatagtatcgctttaggacatggtacttttacgttagctaaaaatagtatggct
tttgggtcattttcatatgtaaaaggtgaaaattcattaggtttaggagtagattcaaag
gtcttgtctaataactcgatagctataggtacaagagctggtgttgggtataaatcagat
aattcactagtaatgggtaatttctcatattccacaggtaaaaatgcattagtatttggt
aataaatcaaaagttacagcagaagatgggttagcaatagggtctaattcggaagcaagt
cttgcaaactctactgcattgggtgttaattcaaagacagattatacaaaagaagattta
gaaaaagatgcctacgcacctaggggtgtattatctatgccttcaacagaaaaaataggg
gtaatatcagttggttctaaaggagcagaaagaagaattgttaatgtagctgctggttat
agagatactgatgctgttaatgtttctcaattgaaagctatggaagaaaaaattaatcaa
agtggattaatggatgtagaagatgatgatttaaatatttctgataatggtatacactat
ttgtcagtagataaaaatggatatagatcaaaagacattaaagaaataatgcaaaaacaa
agagactataacaaatatatcgaatacaagagtagacaattagaaatgaaagctagagaa
gctagaggtgacaaattacctgatccatataagacaaaaataaatgctaaagtagaaaac
ttagaaaataaatacaaaaatgatactcaatttaatcaaatagaacttaaaaaaattact
gatcaagaaattgagggaataaagaataatggagcttcatttgatgcgataataacaaaa
ataaatttagcaaaagaaaaagataaatatataacatatactgatgaaaatggacaagaa
atacaaaaactaaaaactattctatatgaagatgaagttaaaaagataaatgaatcaaac
tataataacaaaggtgctataggtaaagatagtatagcattaggataccaaacaaaatca
acaggtgataagggtatagctataggtacaggtgaccaaagaagtttagatatattagaa
aaacaaaaaataattgatgtaagtagaggtgaagaaaaacaaaaacttgttaataaagaa
ataagattaaataataatatgtatacaagatctggagaaaatgctgttgcagttggtaca
ggtgctatagcaaaagattggtcagtagcattaggaggtaatacacaaactgaagataca
gcagttgcaattggagatagatcaaaagcattaggaaatagatcaatagcaataggtaat
aaggcagcaacaggtagatattatgaatttaatggtaaagaaaaaataaatgaaacacta
aagaaatctaatatacaaacattgaattatgattctataggtatggttggatatgatgga
gctgaaaaagcaatagcaataggttcacattcaacagcaacatcagattattcagtagca
ataggtaatggagcaactactggagataacaagacatatactaaagaaatatatgttaaa
gatagaacaaaaaatgacttaacagaatctgaacaagctatgattatacgtaagcacttc
cataaagatgcagatagctttaatcaagatgaaaataatagattgcaatcattaattaaa
gattatgaatcaaagaatttagatagacaaaaacaagaaatactagaaaagaattattat
ttaaaagaacaagaagtaaataaagatgaaaagaaaaagaaaatatttgacgaattagta
agatcaattaatgcaaaaactgaacaagaaaagaaagatgcaaaagaaaaaatattacaa
aaatattttcataagaaacaaagtgaactttcaacaaatgaaaaaaaggaatttaatcaa
aaggtagcattagttcaaggagctaataaggaaatgatcttgcaaaaatattttgctaag
agtaagtatgatcaactatcagaaggagaaaagaaagaatttgatacaataataaaagac
ctaacagatagtgaaaaagaaaatctattaagaacatactttatgggtaaaaaagaagaa
gaacttacaccagaagaaaagaaagagtttgatgcttttaaagataatttcaaaaagaaa
gttatagtaggtggtgctgaaaatgcaatagctataggtaaatatgcaaaagcatcaaaa
aatgacacaattgctttaggaaaggattcaaatgcagttgaagaaaaagctatagctata
ggtaaagaagccagagcaaaaggagcacaatctgttgttataggtacacctaatagtagt
aatagtaaagcagatgaagatacagattcaaatataggtgaaataagtgcaggtcaatca
tcagtatcagtaggtaatggtgttaaatctggtgattattcagtaggaataggtggaaat
gttgtagcaggtaagacagcagttgcaattggagatagatcacgtgcaataggtgacaca
agtgtagcaataggagaaaaggcattagcaaaaggtcctagaagtatagctataggtaat
gaaacaaaagcaaatgcagaagattcatatgtatttggaggtaaatctgaaatttcttca
actgcaggtcaatcatcagctatagggattaatatatcagtaaaatctgctcaagcaata
gcaatgggtaatgatgttgtaattgaagaaaattcacgtggagcagtagctataggtagt
gatgatagttcatataatgaaggtaataacaagataggtggtaacaactatactaaaact
atggctaaaggaaatgcaacaacagcaataggagctcatgcacaagcaactaatgttgca
gcaacagctttaggtgctagagcatttgcaacagaaaaagaaacagtagctgttggtgct
aattcaaaggctagtgtagaaggtgcagttgctataggatcatattcattagcagacaga
gtaaaaaacactacatactataaccctaaaacaggaaatactgatggtaaagatacagat
aaactagccactaaggcagcactatcaattggagatacaagtaaaaatattagaagacaa
ttaataggacttgcagctggaactaacgataccgatgcagtaaatgtatggcaattaaaa
gaattaaaaggatattttgatgaaaataaaaagttcgatttagaaggtgataaaaatgga
aaacaaacatttgaattaccaaataaattagaagttaaaggaaatacagaaaagaaaact
gatggaaaaacatatcaagattgggataatacatatacagttgaaaatgtacaaacatat
atttctaaatctggcaataatgcaaaaatattaataggaataaagaataaaccaagattt
gataaagtttatgtaggaaatgaaacaacaggtcttgaaattgcacaagataatagtaat
aatataactttaacacaaaatggagcaaaaataacattaacaaaagataataataatctt
aagatgtctggtattgcaaatggtgtagcagataatgatgcagtagcatatggacaagta
aaaaatccgtttattgtaaaagcagataaatcaactcctaaagctagtactgaaaagagt
atgagtttagggaaaacattagagtttacaggaagaaaatttgatggtacaaaaaattac
gatgattggtcagttgatgaaacagttactggaaaaagtggtaattatacttcagaaaat
gtagaaacttttgttacacaagataatgttactggaagaacaggtgtacttataggtcta
agaaaagatccaagatttgataaagtaacattgggtgaattagataatgatagaactgaa
attactaaagatggaatcagtattactaaaaaagcaaccccagataaagttgtaaaattt
ggaatagataataatggtaatgcaacattaactgatgcacgaaataaggatgcatcacca
attgtaactgaaaaatcattaggtgatcaaaaaataaaatatgcagcaaatagtaaaaat
aagaaggaaactacattaacaaatggatttaactttagtgatggaactaatacaacagct
gaagtcggtgataatggagttgttaagtttaatttaaaagataaattaacaggaataaca
tcaataacaaatggtaatgaagataatgctaatgaaaattcaaagatagagttaacaaat
aaagacttaaaattaacaaataaaggtaaatcagtaaaaatattaacaaaaggaactaat
ggtaatgaagaaatactgatagaatttgaaagaccagtaaaaaatgaaacatcaagtggg
aaaccaattataaatcaaaaacatgaagactatggaataggaacaataaactatctaaaa
gatagaagagcttctaaagatggtgattatggaactggaacaaacataggaagagcagca
acagaaggagctgttaaggaagtaaatgacgccataaaaactgtagaaaataatataagt
aaaaaagcagataaaactgatttaagtggaatatgcaaaagtagatgcaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system