Entry |
|
Symbol |
pspA
|
Name |
(GenBank) pneumococcal surface protein PspA
|
Organism |
snx Streptococcus pneumoniae OXC141 (serotype 3)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
160253..162799
|
AA seq |
848 aa
MNKKKMILTSLASVAILGAGFVASSPTFVRAEEAPQVVEKSSLEKKYEEAKAKYDAAKKD
YDEAKKKAAEAQKKYEEDQKKTEEKAKKEKEAAKEVDDASLAVQKAHVEYRKVLDSRNSY
RNPSDYAKKLAEADKKITEETTKLTNAQTKFQSIRTTIVVPGQSELAETKKKAEEAKAEE
KVAKRKYDYATLKVALAKKEVEAKELEIEKLQDEISTLEQEVATAQHQVDNLKKLLAGVD
PDDTEAIEAKLKKGEAELNAKQAELAKKQTELEKLLDSLDPEGKTQDELDKEAAEAELNK
KVESLQNKVADLEKEISNLEILLGGADSEDDTAALQNKLATKKAELAKKQTELEKLLDSL
DPEGKTQDELDKEAAEAELDKKVESLQNKVADLEKEISNLEILLGGADSEDDTAALQNKL
ATKKAELEKTQKELDAALNELGPDGDEEETPAPAPQPEQPAPAPKPEQPAPAPKPEQPAP
APKPEQPAKPEKPAEEPTQPEKPATPKTGWKQENGMWYFYNTDGSMATGWLQNNGSWYYL
NANGSMATGWVKDGDTWYYLEASGAMKASQWFKVSDKWYYVNSNGAMATGWLQYNGSWYY
LNSNGAMATGWAKVNGSWYYLNANGSMATGWVKDGDTWYYLEASGAMKASQWFKVSDKWY
YVNSNGAMATGWLQYNGSWYYLNSNGAMATGWAKVNGSWYYLNANGSMATGWVKDGDTWY
YLEASGAMKASQWFKVSDKWYYVNSNGAMATGWLQYNGSWYYLNSNGAMATGWAKVNGSW
YYLNANGSMATGWVKDGDTWYYLEASGAMKASQWFKVSDKWYYVNGLGALAVNTTVDGYR
VNANGEWV |
NT seq |
2547 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaataagaaaaaaatgattttaacaagtctagccagcgtcgctatcttaggggctggt
tttgttgcgtcttcgcctacttttgtaagagcagaagaagctccacaagttgtcgaaaaa
tcttcattagagaagaaatatgaggaagcaaaagcaaaatatgacgctgctaagaaggat
tacgacgaagctaaaaagaaagcagcagaagctcagaaaaaatatgaggaagatcagaag
aaaactgaggagaaagcgaaaaaagagaaagaagctgctaaggaagtagatgatgctagt
ttagcggtgcaaaaagcacatgtagaatatagaaaagttctagattctcgtaatagctac
agaaacccgagtgattatgctaaaaaattagcagaagcagataaaaaaataactgaggag
acgactaaactaaccaatgctcagacaaaatttcaatctattcgaacaacaattgtagtt
cctggacaaagtgagttagctgagactaagaaaaaagcagaagaagctaaagcagaagaa
aaagtagctaagagaaaatatgattatgcaactctaaaggtagcactagcgaagaaagaa
gtagaggctaaggaacttgaaattgaaaaacttcaagatgaaatttctactttggaacaa
gaagttgctactgctcaacatcaagtagacaatttgaaaaaacttcttgctggtgtggat
cctgatgatacagaagctatagaagctaaattaaaaaaaggagaagctgagctaaacgct
aaacaagctgagttagcaaaaaaacaaacagaacttgaaaaacttcttgacagccttgat
cctgaaggtaagactcaggatgaattagataaagaagctgctgaagctgagttgaataaa
aaagttgaatctcttcaaaacaaagttgctgatttagaaaaagaaattagtaatcttgaa
atattacttggaggggctgattctgaagatgatactgctgctcttcaaaataaattagct
actaaaaaagctgaattagcaaaaaaacaaacagaacttgaaaaacttcttgacagcctt
gatcctgaaggtaagactcaggatgaattagataaagaagctgctgaagctgagttggat
aaaaaagttgaatctcttcaaaacaaagttgctgatttagaaaaagaaattagtaacctt
gaaatattacttggaggggctgattctgaagatgatactgctgctcttcaaaataaatta
gctactaaaaaagctgaattggaaaaaactcaaaaagaattagatgcagctcttaatgag
ttaggccctgatggagatgaagaagaaactccagcgccggctcctcaaccagagcaacca
gctcctgcaccaaaaccagagcaaccagctcctgcaccaaaaccagagcaaccagctcct
gcaccaaaaccagagcaaccagctaagccggagaaaccagctgaagagcctactcaacca
gaaaaaccagccactccaaaaacaggctggaaacaagaaaacggtatgtggtatttctac
aatactgatggttcaatggcaacaggttggctccaaaacaacggttcatggtactaccta
aacgctaacggttcaatggcaacaggttgggtgaaagatggagatacctggtactatctt
gaagcatcaggtgctatgaaagcaagccaatggttcaaagtatcagataaatggtactat
gtcaacagcaatggcgctatggcgacaggatggctccaatacaatggttcatggtactac
ctaaacagtaatggcgctatggcgacaggttgggctaaagtcaacggttcatggtactac
ctaaacgctaacggttcaatggcaacaggttgggtgaaagatggagatacctggtactat
cttgaagcatcaggtgctatgaaagcaagccaatggttcaaagtatcagataaatggtac
tatgtcaacagcaatggcgctatggcgacaggatggctccaatacaatggttcatggtac
tacctaaacagtaatggcgctatggcgacaggttgggctaaagtcaacggttcatggtac
tacctaaacgctaacggttcaatggcaacaggttgggtgaaagatggagatacctggtac
tatcttgaagcatcaggtgctatgaaagcaagccaatggttcaaagtatcagataaatgg
tactatgtcaacagcaatggcgctatggcgacaggatggctccaatacaatggttcatgg
tactacctaaacagtaatggcgctatggcgacaggttgggctaaagtcaacggttcatgg
tactacctaaacgctaacggttcaatggcaacaggttgggtgaaagatggagatacctgg
tactatcttgaagcatcaggtgctatgaaagcaagccaatggttcaaagtatcagataaa
tggtactatgtcaatggcttaggtgcccttgcagtcaacacaactgtagatggctataga
gtcaatgccaatggtgaatgggtttaa |