Solenopsis invicta (red fire ant): 105199943
Help
Entry
105199943 CDS
T03916
Name
(RefSeq) neuroblastoma-amplified sequence isoform X1
KO
K20473
neuroblastoma-amplified sequence
Organism
soc
Solenopsis invicta (red fire ant)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
soc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
soc04131
]
105199943
Membrane trafficking [BR:
soc04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
NRZ (DSL1) complex
105199943
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nbas_N
WD40
WD40_WDHD1_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105199943
NCBI-ProteinID:
XP_011165578
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(4095444..4103516)
Genome browser
AA seq
1923 aa
AA seq
DB search
MSNVDETSNEPILYELLEYFVRKQEPELIKCKNDAAILPSTGTIKNALRYLNNRYSLPES
ISQQISLTLPWKFAVGDHGRVLAILQENIIEIRKAKDEYSSIVGKASAPKDAFPQWRKLA
WSPDGMILILASSSGYTSFYNALGNNIFNINPKTISQNPHILEAGDAIASMLFLKPRLTS
EKWAYEFILISYSGLLRSYYISTSGFSANYDFSFGNFYKNGINVVAYDEKRSLFYVAGNM
ITQKLMSTASESGLTSWRLLNDYPYCKLSFTFEDSATSNSRFSVWNLIPIFSFQSESIIF
SIKISPNGEFLVCLHTDGSVSLWGLPNLILQKKWKLSEQPEYNIPNPLGITKFKKFPPGF
TEFHPIDIGWWSDQAIIIARYSGSTSVCSTWNLKNLLGVSPEFLAGQPQVCELDLEKGFL
CLDCETFITSKKRSRESSDGHLSEASSESEKDDDELEPVTILSYTTNLVQSTLYSITDIE
RFQPKRKKSKILHRTYRILNLKRTTPEELYSRKIDIEEYEEALALANTYNLDTDLVYQTQ
WRKSELSLNAITEHLSKISKRSWVLNECVVRVPDTLEAARELLNFGLRGANLETLIAIDI
CDNDKFVNPDIDDDWQILDQMTVSLKQVQKVNEMLEKIDIKNLSEAQKDLIKYRRKFLNH
LDKLLTYEIILESPLKYKKEFYEEFRRLSPIENAIRFAKNSDYRAVEIMFTYYGESLLPH
WLAIISFFPETLNTLDYQKLLPQCDSEGQLFLLDQRELRQKDWSEKYEFNEIISVDLEDP
SKILYEQDPSLSVYRNTQLTSDLLQKWYKTRAYEIEKNSSLVDNALQLIKIGKSHNINGL
EDLLLELETLDDLVYTVHLEDMPLDKLEKLSNMEKIKLLMSTSNKVNFVENIKNLLLPFI
KRRHQYLGGDLQKCLLSDYLISLSKDDLTFPVKFFDYLKQTQDMEIIELIDDVATLALDC
IYACDDLDMYEKAKDILDSISEDYDGKRTNAICNLLEESEGELDCVKLLSKYGVKTTLNF
IRKNRNDPDIAKSLLTQMARSLNKSLIPPDEREWAQLLNDLLDIHGLIFSCIAVETCFEI
CVSARLLSRIKCTIRNCTTLIETKRNEKSLLKVSYEKAVNLILEASKEYFNGSRTLTDPH
MELAKTCLDLIEDDNTKIKEEYDLIKSLQILNEFNVDILPLQVRLTVDKLTLIEYCLNNQ
RDAYKNRQKLLTLAIYLRIEGNNSRLREGKILELIAKKALETEDYNTCATICIQLAENNY
LPAWEICLNLGCCDNYQDLKIRQKCLWFAINNGPNDILGNALEHTHLLRIQMLHKDLELW
MPSAEFESLKDEESDTSEDDFTDAMTTPQIEVKEFVPKMLETSTGIVKSSANIMKESTFN
LIRNISNTNFWKSRLNLNFKNDLETNAEHESEMKQNEEDANLQSFPCYYESLHELCRISV
NETRYNKYSMTDLENTKLKCCRALLRITILSESSSYGLEISDINHLLLECAKHTISDDWL
LGMAYLLSLNRDRILDAQTIFVNLPQFELYMQTALYYYSLELYKKLYTDCEKLYLNSPLD
LMKTMIIAAQKSEECDIVKALQYWQSYLLGGAQIININQMKDISPFELGQSSTHVHSVKI
SKTINEEQESAKCVDTNDILSNSKADEDLKMTISDNIDAVEWTDDWGDFSDDNIEVNSDK
NKIRSEEISQEETILSLDHTITENTTEKDRFKLFQKLFNQINNLEQYQEVKRMISQWPKF
NMPDHIMIDNHPVLKMMKVIVELAKTNMTDFEKRVLQEHEELIGLLTSEEILKQFLELER
GHINFVQSLYIRLCSQDVLMHEEAVSLIKEQQATVLPPLVLEKLFLNNLTALFNPDHTVY
KQIIEHVFINESLTGIEENAKTLVHELRKQKYILEALHIIKLMKRIPSTLCTFDTCFQLL
MQE
NT seq
5772 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaacgtggacgaaacgtcaaacgagcctatactatacgaactattggagtatttc
gtacgcaagcaggaaccagaattgatcaaatgcaagaatgacgcagctatcctcccatct
actggcactataaaaaatgctctcaggtaccttaacaacaggtactccctacctgaaagt
atctcgcagcaaatcagtcttacactaccgtggaagtttgctgtcggagatcatggtcgg
gtacttgctatcttacaggaaaatatcattgaaatacgaaaggctaaagatgaatattct
tccatagtagggaaggcatctgctccaaaggatgcttttcctcaatggcgtaagcttgct
tggagtcctgatggaatgattttgatattagcatctagtagtggttatacctccttttac
aacgcactaggaaataatatctttaatataaatccaaagacaatttcacaaaatcctcat
attctcgaagctggtgacgctatagcgtccatgctcttcctcaagccaaggctaacaagt
gagaaatgggcctatgagtttattttaatttcatacagtgggttgctcaggtcttattat
atttctacaagtggttttagtgccaattatgacttttcttttggcaatttttacaaaaat
ggtatcaacgttgtagcttatgatgaaaaacgtagcttgttttatgttgctggaaatatg
ataacacaaaaattaatgtccactgcgtctgaatctggattaacttcgtggcgacttttg
aatgattatccatactgtaaattatcatttacatttgaagattccgctaccagtaattca
cggttttctgtatggaatttaattcccatctttagttttcaatcagagtcaattatattt
tcaataaaaatttcaccaaatggcgagtttctggtatgcttgcatacggatggttcagtt
tcattatggggtttgccaaatttaatactacaaaaaaaatggaagttgtctgaacagcca
gaatataacatacctaatcctttgggaataacaaaatttaaaaaatttccaccaggcttt
acagaattccatccaatagatattggttggtggtctgatcaggctatcataatagctcga
tattcaggctccacttcagtctgttccacatggaatttaaaaaatctattaggtgttagt
ccagaatttctagcaggacaaccacaagtatgcgagcttgatttagagaaaggattctta
tgtttagattgcgaaacctttattacaagtaaaaaacgaagtagagaatccagtgatggt
cacttgtcagaagcatcgtctgaaagcgaaaaggatgacgatgagttggaacctgttact
atattaagttatactacgaatttggttcaaagcacgctgtattcaataaccgatattgaa
agatttcaaccaaagagaaaaaaatcaaaaatattacatcgaacgtatagaattttgaac
ttaaaaagaacgactccggaagagctctattccaggaaaatagatattgaggaatatgag
gaagcgttagctttagcgaacacgtataatttggacacagatctagtgtatcaaacacag
tggagaaagtcagaattatctttgaatgctattacagaacacttaagtaaaataagtaaa
agatcttgggttttaaatgaatgtgttgtacgcgttcccgatactctggaagctgcaagg
gaattattgaattttggattaagaggcgcaaacctagaaactttaatagctatcgatatc
tgcgacaatgacaaatttgtaaatcccgatatagatgacgattggcaaatactagaccaa
atgactgtaagtttaaaacaggtgcagaaagttaatgaaatgcttgaaaaaatagatata
aaaaatttatctgaggctcaaaaagatttaattaagtatcggaggaagtttctaaatcat
ttagataaattgcttacgtatgaaattatattagagtcaccactcaaatataaaaaagaa
ttttacgaagagtttcgaaggttatcacctattgaaaatgcaatcagatttgccaaaaat
agtgattaccgagctgttgaaattatgtttacctattatggagaaagtttgctacctcat
tggctagcaattatcagcttctttccagaaactttgaatacattagattaccaaaaactg
ctaccacaatgtgattcagaagggcaattatttttgttggatcaacgtgaattacgacaa
aaagattggtcagaaaaatatgagtttaatgaaataataagtgttgatttagaagatcca
tcaaaaatactgtatgaacaggatccctcgttgtcagtatatagaaatacacaacttact
tcagatttattacaaaaatggtataagacacgtgcttatgaaattgaaaaaaatagctct
ttagtagataatgctttgcaattaattaaaattggaaagtctcataatattaatggccta
gaagatttgttattagaattggaaactttagatgatcttgtgtatacagtacatttggag
gatatgccattagacaaattagagaaattgagtaatatggaaaagatcaaacttttgatg
agtacatcaaataaagttaattttgttgaaaacataaagaatcttttgttaccttttatt
aaacgaagacaccaatacttgggtggagatcttcaaaaatgcttactaagtgattatcta
atttctctaagcaaagatgatttgacattcccggttaaattttttgactatttaaaacag
acgcaggacatggaaataattgaattaatagatgatgttgctactttagctttagattgt
atatatgcctgtgacgatcttgacatgtatgaaaaggctaaagatattttagattcgata
tcagaagattatgatggtaaaagaacaaatgcaatatgcaacttgttagaagaatctgaa
ggagaacttgactgcgtcaaacttttaagcaaatatggtgtaaaaacaacgttaaacttt
atacgaaaaaacagaaacgatcctgacatcgctaaatcgcttttaacacaaatggcaaga
agtttaaataaaagtttgatacctccagatgaaagagaatgggcgcaattattaaacgat
ctgttagatatacatggactaattttttcatgtattgctgttgaaacctgtttcgaaata
tgcgtttcagcccgtttactttcgagaattaaatgtactatccgtaattgtaccacttta
atagaaaccaagagaaatgagaaatctttgttaaaagtatcttatgagaaagcagttaat
cttatattagaagcatccaaagaatattttaacggttctagaacgcttactgatccacat
atggaattagctaaaacttgcctcgatctcatcgaagatgataacacgaaaattaaagaa
gaatatgatcttattaaatcgctccaaatattgaatgaattcaatgtcgatatattacca
cttcaagttagattaacagtagataaattaaccttgatcgagtactgtttaaataaccaa
agggatgcttataaaaatagacaaaaattgttaacgttagcaatttatttacgaattgaa
ggaaataacagtagacttcgcgagggaaaaattttggaattaatagctaaaaaagcactc
gagactgaagattacaatacatgtgccacgatatgtatccaattagcggaaaataattat
cttcctgcttgggaaatttgtttaaatttggggtgttgtgataattatcaggatttaaaa
attaggcaaaagtgtctatggttcgcaataaataatggccctaatgatatattaggtaat
gctttagaacatacacatttgttaagaatacaaatgttacataaggatttggaattgtgg
atgccttctgcggaatttgaaagtttgaaggatgaagaaagtgatacgagcgaagatgat
tttacagatgctatgacaacgccacaaatagaagtgaaagaatttgttccaaaaatgttg
gaaacttcaaccggaattgttaaaagttcagctaatatcatgaaggaatctacattcaac
ttgataagaaatatcagtaatacaaatttttggaaatctagactaaaccttaattttaaa
aacgatttagaaactaatgcggaacatgaatcggaaatgaaacaaaacgaggaagatgct
aatcttcaaagttttccatgctattatgagtccttacacgaactatgtcggataagtgtt
aacgaaacaagatataataaatattctatgacagacttagaaaatacaaaattaaaatgt
tgccgagcgcttttaagaataactatactgagtgaatcctctagctatgggctagaaata
agtgatattaatcatttgcttctagaatgtgcaaagcacactatatcagatgattggtta
cttggtatggcgtatctattgagtttaaatagagatcgcatcttggatgctcaaacaatc
tttgtaaatttaccgcaatttgaattgtatatgcaaaccgcgctttattattattcatta
gaattatataagaaattgtacactgattgtgaaaagttatacttaaacagtccattggac
ttaatgaaaaccatgataattgcagcacaaaagtctgaagaatgtgacattgttaaagca
ttacaatattggcaaagttatctactcggcggagcacaaattattaatataaatcaaatg
aaagatataagcccgtttgaactgggacaaagtagtactcatgtacattctgtgaaaatt
tcaaaaactataaacgaagaacaagaatctgcaaaatgtgtcgatactaatgatatccta
tcaaattctaaagcagatgaggatctaaaaatgactatctcagataatattgatgccgtg
gagtggacagatgattggggtgatttttccgatgataacatagaagtaaatagtgataag
aacaaaattaggtccgaagaaatttcacaagaagaaaccattctttctctcgatcacacc
attactgaaaatacgacggagaaagatcgatttaaattatttcagaaactgtttaatcaa
atcaacaacttagagcaatatcaagaagtgaaaagaatgatatctcaatggccgaaattt
aatatgccagatcatattatgatagataatcatccagttttaaaaatgatgaaagtgata
gttgaacttgcaaaaacgaatatgactgactttgaaaaaagggtattacaggaacatgaa
gaactcattggattattaacgtctgaggagatcctcaaacaatttttggaactcgaacga
ggtcacattaattttgtacaaagcctttacattcgattatgctctcaggacgtattgatg
catgaagaggcagtaagtctcattaaagaacaacaggctactgtgctaccaccgttagta
ctggagaaactcttcctaaataatttaacagcattgttcaatccagatcatactgtatat
aaacagataatcgaacatgtttttataaatgaatctttaaccggcattgaagaaaatgca
aaaacactcgtacacgagttaagaaaacaaaaatatatactagaagctttgcacattata
aaattaatgaagagaataccgtcgaccttgtgcacatttgatacttgttttcagttacta
atgcaagaatga
DBGET
integrated database retrieval system