Shewanella oncorhynchi: RA178_01270
Help
Entry
RA178_01270 CDS
T09381
Name
(GenBank) heme lyase CcmF/NrfE family subunit
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
sog
Shewanella oncorhynchi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sog00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sog02000
]
RA178_01270
Transporters [BR:
sog02000
]
Other transporters
Others
RA178_01270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
ResB
DUF2651
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMB73288
UniProt:
A0AA50KDT2
LinkDB
All DBs
Position
268529..270508
Genome browser
AA seq
659 aa
AA seq
DB search
MIPELGHFALIIGVAFAFLLISVPLIGVARKDQYLVRYAWPLTYGMFFFITLSVVVLAYS
FAVDDFSVAYVAHHSNSQLPIFFKISAVWGGHEGSLLFWVFALSTWAAAVALFSKGLEEV
FTARVLAVLALIVIGFSLFMLLTSSPFERLFPIPAEGRDLNPMLQDVGLIFHPPMLYLGY
VGFSVSFAFAIAALMSGRLDSAWARWTRPWTLAAWTFLTGGIALGSWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASFMPWLVGTALVHSLIVTEKRGAFRNWTVLLSIFAFSLSLLGTFIVRSGVLTS
VHSFAADPSRGMFILLLLGLAVGGSLTLFALRASEMSSPARFELKSKETMLLVCNVLLTV
AAGTVLLGTLYPLLIDALGMGKISVGPPYFNAVFVPIVLVLFGFMGIGPIIRWKKSKAGE
LKRQLLIPAMIAAAIGIVTPFIVDGAFNIWVAFGIAAAAWIILATARAAYNMVKSKEGDI
SISRMGRSQLGMIFAHLGIAVSVIGATMVSNYSIEKSVRMGPGVSQELAGYTFKYLETKN
VVGPNYTAQQGQIEIYKGDELLTLLKPDRRQYNVRTMDMTEAGIDWGLFRDLYVTMGDPI
TSTEFAVRLNYKPFVRWLWFGAIFMMIGGFFAASDKRYRAKVTAAVAPLAEKAKLATAQ
NT seq
1980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcccagaacttggacactttgcgttgataataggggtggcttttgccttcttatta
atcagcgtccccctaataggtgttgccagaaaagaccaataccttgttaggtacgcttgg
ccattaacgtacggaatgttcttttttattaccttatctgttgtcgtgctggcttatagt
tttgccgtcgatgatttctcggtcgcctatgtggcacatcattcaaattctcagttacct
atcttctttaagatctcggccgtatggggcggtcatgaagggtcactgttattttgggtg
tttgctttatcaacttgggcggctgcggttgccttgtttagcaaaggtttagaagaagtg
tttactgcccgtgtgctggcagtattggctcttattgtgattggctttagtttgtttatg
ctactcacatctagcccatttgaacgtttattcccgatcccagccgaaggtcgtgactta
aatccaatgctgcaggacgtgggattaatcttccatcctcctatgttgtacttgggttat
gtgggcttctctgtaagctttgcatttgcgattgctgcgctgatgagcggccgtctcgat
tctgcatgggctcgttggactcgtccatggacattggctgcttggaccttccttacgggc
ggtatcgcactaggatcttggtgggcttattatgaattaggctggggcggttggtggttc
tgggatcctgttgagaacgcctcttttatgccttggttagtgggtactgcgcttgttcac
tctttaattgtgactgagaaacgcggcgccttccgtaactggactgtattactgtctatt
tttgctttctctttaagtttgcttggtacctttattgttcgctcaggtgtattaacctca
gtgcattcattcgcagccgatccaagccgcggtatgttcattctgttgttacttggttta
gcggttggcggttcattaacactgtttgctttacgtgctagtgaaatgagtagtccagcc
cgtttcgaacttaagtctaaagaaactatgctcttagtgtgtaatgtgctactgacggtt
gccgcaggtacggtactattgggtacattatatccattgctcatcgacgcgcttggcatg
ggtaagatctctgttggacccccatactttaatgcggtgttcgtgcctatcgtattagtg
ctatttggctttatgggtattggtccaattattcgttggaaaaaatcgaaagcgggcgag
cttaagcgtcagctattgatcccagcaatgattgctgctgctatcggtattgtgactcct
tttatcgtcgatggtgcattcaatatttgggttgcctttggtattgctgccgcggcttgg
attattctggctaccgcaagagcggcctataacatggtcaagtcgaaagaaggtgatatc
agcatcagccgcatgggccgtagtcagcttggtatgatctttgcgcatctcggtattgcc
gtttctgtgattggtgccactatggtgtcaaattactcgattgagaaaagtgttcgtatg
ggacctggtgtaagccaagaacttgccggttatacttttaagtatctcgagaccaaaaac
gtagtgggtcctaactacactgcacagcagggacagatagagatctacaagggcgatgag
ctactgacattactaaaaccagatcgtcgtcaatataatgtgcgaactatggatatgaca
gaagccggtattgactggggtctattccgtgacttgtacgtaactatgggtgaccctatt
accagcactgaatttgcggttcgtttaaactataagccgttcgtgcgttggttgtggttt
ggggcaattttcatgatgataggtggattcttcgctgcatcggataaacgttaccgtgcg
aaagtcactgcagccgtcgcgcctttggccgaaaaggcaaaattggcaacggctcaataa
DBGET
integrated database retrieval system