Shewanella oncorhynchi: RA178_03080
Help
Entry
RA178_03080 CDS
T09381
Name
(GenBank) leucine-rich repeat-containing protein kinase family protein
Organism
sog
Shewanella oncorhynchi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
Pkinase
LRR_14
LRR_4
LRR_LRWD1
LRR_1
LRR_9
Kdo
Kinase-like
ABC1
APH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMB73623
UniProt:
A0AA50KEZ0
LinkDB
All DBs
Position
672958..674313
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MQTLAQLRAGQLQGITRLQLVEDLTEFPREIFDLADTLEILDLSNNQLSTLPEDLHRLSH
LKIIFASNNRFEHLPEALGRCTNLEMIGFKANQIKTVTAAALPLQTRWLILTDNLIETLP
AAMGDLHRLQKLALAGNRLTTLPESMANCRNLELVRLSANQLHALPAWLLSLPKLTWLAF
AGNPFSHTLVDPHADVATVANVTLGDIKLAEKLGEGASGVIYRGDWLNQAMIAATGSAQI
AVKLFKGEVTSDGYPADELDCCLTTGDHPSLIKVVAHISQKDQLGLVMELIPPGFSNLGL
PPSLVTCTRDTFKDGSEFRLDEVAKITHQLADAMAHMHTKQVSHGDVYAHNIMVNQQMSL
LFGDFGAASNLRNLSTAERLAIEAIEVRALGCLIEDLLAYVDASAYVNTSIDPLYYTQLS
AIKDECMQLDVAQRPCFADVKKAIGALLKGK
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcagacgttagcgcagttaagggcagggcagttacaagggatcacacgtttacaattg
gttgaggatttaaccgagttcccgcgggagatttttgatttagccgataccctcgaaatc
ctcgatttatcgaataatcaactgagcactttgcccgaggatttacaccgcttatcgcat
ttaaagataattttcgcctcgaataatcgctttgaacatttgcctgaggcattagggcgc
tgcacaaatttagagatgattggctttaaggccaatcaaatcaaaacagtgactgctgcg
gcattaccgctgcaaacccgctggctcatcctaaccgataacctcattgagacattgcct
gcggccatgggcgatttacatcgtctgcaaaaattagctttagcgggtaaccgtttaaca
accttgcccgagtcgatggccaattgccgcaacttagagttagtgcgtttatcggccaat
caactccacgcactgccagcttggttactcagtttgcccaaactgacttggctcgccttt
gcgggaaatccattcagccataccttagtcgatccccacgccgatgtggccacagtggcg
aatgtgactctgggtgatatcaagttggctgaaaagcttggcgaaggggcttctggggtc
atttatcgaggcgattggttgaatcaagccatgatagccgcgacggggtcggcgcagatt
gcggtaaaactctttaagggtgaagtgacgagcgatggttatcccgctgacgagttagat
tgctgtctcacaacgggtgatcatcccagccttattaaggtcgtggcgcacattagccag
aaagatcaattgggtttagtgatggaacttattccgccagggtttagtaacttagggcta
ccaccaagtcttgtcacctgtactcgcgatacctttaaagacggtagtgaatttcgcctt
gatgaagtcgccaaaatcacacaccagttggccgatgcgatggcgcacatgcataccaaa
caagtaagccatggtgatgtctacgcccataatattatggttaatcaacagatgagctta
ttgtttggggattttggtgcggcatcaaacttacgcaatctatcgacagcagaacgctta
gcgatagaagctattgaagtgcgagcgcttggttgcttgattgaagatctgttggcctat
gtggatgcatctgcctatgtgaatacctcgattgaccctctgtactacacacagttgagt
gcgattaaagacgagtgcatgcagttagatgtggctcagcgcccctgttttgcagacgtg
aaaaaggccatcggagcactgttaaaaggtaaatag
DBGET
integrated database retrieval system