Shewanella oncorhynchi: RA178_12710
Help
Entry
RA178_12710 CDS
T09381
Name
(GenBank) TrkH family potassium uptake protein
KO
K03498
trk/ktr system potassium uptake protein
Organism
sog
Shewanella oncorhynchi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sog00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sog02000
]
RA178_12710
Transporters [BR:
sog02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
RA178_12710
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TrkH
TPIP1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMB71298
UniProt:
A0AA50KAB6
LinkDB
All DBs
Position
complement(2823595..2825076)
Genome browser
AA seq
493 aa
AA seq
DB search
MIAVSGIQKSSSRFHTIIHLCSFLIVIYSFTMLMPIAVALFYKDGYITPFLITFLLSFFI
GVVGWKMTSEENKNLQKRDGFMVACLFWLIFSLMSALPFLLDRRLDLSLTDAMFEGVSGI
TTTGASIFSDIDELPKSILFYRAQLNFLGGLGIIVLAVAIMPFLGIGGAKLYQSEMPGPM
KEEKMTPRLADTARNLWGLYSVLALGCAVAYKLAGMNWFNAICHSLSTVSLGGFSTHSDS
LGYYNSAAIELVGGVFSILAAINFALYYTVLVRRSFKPIWYNAEVRFFILILSIVVGIAC
LELNRTQTFDIKDSLVHGFFQTVSVMTDNGLGSAGYPNWPSHIVLLLLGASFFGGCFGST
CGGIKAVRFLLLYRQGIREIHQLVHPNAILTTKISGQVVSDRVIRSVWGLFFLYIFFTCV
FVWGLVAIGHDFATAFGTVAACINNMGIGYGDTASGFGTLKDAAKWLMCVAMLFGRLEIF
PVLIIFSRAFWRF
NT seq
1482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgcagtcagtggaatacagaaatctagctctcgatttcataccataattcatcta
tgtagctttttgattgtcatatatagcttcaccatgttgatgcctatcgctgttgcatta
ttttataaagatggatatatcactccatttttaatcacattccttctttccttttttatt
ggtgtggtcggttggaagatgacaagtgaggaaaataaaaatctgcaaaaacgtgatggc
ttcatggtcgcttgtttattttggctgatattttccttaatgagtgcattaccttttctt
cttgatagacgattggacttgagtttaaccgatgccatgtttgaaggtgtgtctggcatt
acgacgactggagcctcgattttttcagatattgatgaactacctaaatcgattttattt
tatcgagcacagcttaatttcctcggtgggttagggataattgttttggccgttgcaatt
atgccatttcttggtattggtggcgcaaaattatatcagtctgagatgccaggtcccatg
aaagaggaaaagatgacgcctcgccttgcggatacggctcgaaatttatgggggctttat
agcgtacttgccttaggttgtgcagttgcttataaacttgcaggaatgaattggtttaat
gccatatgtcatagtctatctaccgtttcattgggtgggttttctacacatagtgacagc
ttaggatattataacagtgctgcaattgagcttgtgggtggtgtgttttcaatactggca
gcaatcaatttcgccttatactacacagtattagttcgacgaagcttcaagcctatttgg
tataatgcggaggttcgattttttattctcatattatctatcgttgttgggatcgcttgt
ttagagctgaatcgtactcaaacttttgatattaaagattcattggtacatggatttttt
caaacagtttcagttatgacggacaatggattaggctctgcaggttatcctaattggccc
agtcatattgtgcttttattattaggcgcgagcttttttggtggatgctttggttctact
tgtggcggtattaaagctgtcagatttttacttttgtaccgtcaagggatccgagaaatt
catcaattggttcatcctaatgccattttaacgacaaagatcagtggccaagtcgtttca
gacagagtcattcgttcagtatggggattatttttcctgtacatattttttacttgcgtt
tttgtatggggattggtcgccattggacatgattttgccaccgcctttggaaccgtcgct
gcgtgcattaataatatgggaattggttatggtgacactgcatctggatttggcacgtta
aaagatgcggctaaatggctgatgtgtgtcgctatgctttttgggcgattagaaatattt
cctgtactcatcattttctcacgggcattctggcgattttaa
DBGET
integrated database retrieval system