Shewanella oncorhynchi: RA178_15935
Help
Entry
RA178_15935 CDS
T09381
Name
(GenBank) carotenoid oxygenase family protein
Organism
sog
Shewanella oncorhynchi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RPE65
TAT_signal
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMB71899
UniProt:
A0AA50KBK3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3569667..3571331)
Genome browser
AA seq
554 aa
AA seq
DB search
MDRRQFLAGSAALMTTAVWACSVDKLLALDNAQAVAREPWAIGFSGAEGDYQLLTMQVSG
EWPAQLNGNLYRNGPAKMSRAGKAYQHWFDGDGMVQQFSVSNGQIQHQAKFIQTKKFKVE
EAAGAFKYTTAGTVIPNALPIRNNDDLNVANTSLLPRHGELLALWEAGSPYRLDAQTLTT
LGVKSFGDKFKGLPFSAHPLDDGQGGLWNFGVWYVGGEKLLLVYQVAADESIARMEVIEL
PQASYLHAFAQSENKLVFYISSCVYEEGETYIDAFKWRPELPSQLLVIDKADFKARQLHP
LPAGFVFHFGQAIEKNDELSVQLCLYPNSAILTQGMKGLLTGARKTKTPHAELVTTTVPL
TVPLTAASKTQFAETLSSSARINRSGVMMEFPQFSQHIMGKKQTSGEKAFAEKTGGASEF
VPLFGVGARSDSAVNSGSSSNFKYEAESDSESGLSNTLYCIHNAKDSSKHSADTIGDASY
SAFYLGKGKIAEEPLYIPATEQHEAYLLMTWLDYHNAQSGLSLFRASDISAGPIASAQMN
RVLPLGFHGCFIEA
NT seq
1665 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagacgtcaatttctagcaggctcagccgccctaatgacgaccgctgtttgggcc
tgttcagtggataaattgctggcgctggataacgcacaagcggtcgcacgtgagccatgg
gcgattggatttagtggtgctgaaggcgactatcagctactcactatgcaggtttcgggc
gagtggccagcgcagttgaatggcaatctatatcgtaatgggccagcgaaaatgtctcgg
gcaggtaaggcatatcaacattggtttgatggtgatggcatggtgcaacagtttagtgtg
agcaatgggcaaattcagcatcaggctaagtttatccaaacaaagaagtttaaagtcgaa
gaggccgctggcgcgtttaagtacacgaccgcaggcacagtgatccccaatgctttacct
attcgaaataacgatgatttgaatgtggctaatactagtttattgccgcgccacggcgag
ttgctcgctttatgggaggcgggttcaccctatcgactcgatgcgcagaccttaaccacg
ctcggcgttaaaagctttggcgacaagtttaagggtttacccttttccgcccatccactc
gatgatggacaaggtggattgtggaattttggcgtctggtatgtcggcggcgagaagcta
ttacttgtgtatcaagtggcagccgatgagagcattgccagaatggaagtgattgaatta
ccgcaggcgagttatttacatgccttcgcgcagagtgagaataagctagtgttttatatt
tcatcctgcgtgtatgaagagggcgaaacttatatcgatgcttttaaatggcgccccgaa
ttgccatcgcaattactggttatcgacaaagccgactttaaagcgcgccagttacacccg
ctgcccgctggatttgtgtttcactttggtcaagccattgagaagaatgacgaactttca
gtacaactttgcctctatcccaattcggcgattttaacgcaagggatgaaggggttacta
acgggtgcccgaaaaacaaaaacaccccatgcagagttagtgactaccacagtaccgctc
acagtaccactcacagcagctagcaaaacgcagtttgcagagaccttgtcttcctctgca
cgtattaaccgcagcggcgtgatgatggagtttccccagttttcgcagcacattatgggt
aaaaaacaaactagcggtgaaaaagcgtttgcagagaaaacaggcggggcttcggagttt
gttccgttatttggcgttggagcaagatcagattcagctgttaactctggctccagctct
aactttaaatatgaagcagaatctgactctgaatcagggctaagtaacactctgtattgt
attcataatgcaaaagacagcagcaagcacagtgcggatacaattggcgacgcgagctat
agcgcgttttatcttggcaaaggcaagattgccgaagagccgctctatatccccgccact
gagcagcacgaagcctatttactgatgacttggctcgattaccataatgcacagtctggt
ttgtctttgtttcgtgccagtgacatcagtgcgggccccatcgcttcggctcaaatgaac
agggtattgccactagggtttcatggctgctttattgaagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
