Shewanella oneidensis: SO_0033
Help
Entry
SO_0033 CDS
T00099
Name
(GenBank) peptidoglycan-binding protein
Organism
son
Shewanella oneidensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
LysM2_NFP
FlgT_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAN53120
UniProt:
Q8EKQ7
LinkDB
All DBs
Position
38024..39160
Genome browser
AA seq
378 aa
AA seq
DB search
MDRTMKRLILLALMTFNSTLVFADTLTLKAGHPESYVVKKGDTLWDISTTFLNDPWKWPR
LWDVNPQIANPHLIYPGDQLTLVFIDGQPRLVRNGASVSTSEAKPHIRKSPEGRVIAKSN
AIPAVDLALIQNYLVQNRVVDADWFIQQPMVLAGESPSRHHVIGDVIYINSELPLHQKLG
VYERGREFFNKETGEALGQEAILASTGQVIESGKVSKVKLLSNFRETKAGFRVLPLEDEA
LMSAYFTPKPAELKTSASVLAIESKMREAGKLNVVYLDKGTQDGVKPGEVFSIYRDGEEI
VINNDGQPVPVMERTAYDDVVASLSSDRSLKMPDVYNGKLLVFKVFDKASLGLIVSTERS
VRVDDKLIAPDILAFRGQ
NT seq
1137 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaccgcaccatgaaacggttaattttacttgcgttaatgacctttaatagcacattg
gtttttgctgatactctcacgttgaaagccgggcatccagagtcatatgtggtaaagaaa
ggcgataccctgtgggatatttcgacaacctttctaaatgatccgtggaagtggccacgt
ttatgggatgtgaatccccagattgccaaccctcatttaatttaccccggcgatcagctc
accttagtgtttattgatggccaacccagattagtgcgtaatggcgccagtgtcagtacc
agtgaagctaaaccccatattcgaaaatcaccagaaggacgtgttatcgctaaaagcaat
gcgataccagcagttgatctagcactaattcaaaactatctcgttcaaaaccgtgtcgtt
gatgccgactggtttattcagcaacctatggtgcttgcgggggagagtccttcacgtcac
catgtgattggcgatgtgatttatatcaatagtgaattacctttgcatcaaaagttaggt
gtgtatgagcgcggtcgtgaattctttaataaagaaacaggcgaggctctcggacaagag
gcgattttggcatcgactggacaggtgatcgagtctggcaaagtatcaaaggtgaagctt
ctcagcaatttccgtgaaaccaaagcgggttttagggtgctgccgctggaagatgaggcg
ttaatgtcggcctattttacgccaaaacctgcagagcttaagacgtctgctagcgtatta
gcgattgagtcaaaaatgcgtgaagcgggtaaactcaatgtcgtttatctcgataaaggt
acacaggatggtgtaaaaccgggagaggttttctctatttatcgtgatggtgaagaaatc
gtgatcaataacgatggccaaccggttccggtaatggaacgtactgcctatgatgatgta
gtggcgtcgctttcgtccgatcgctcgctcaaaatgcccgatgtttataatggtaaattg
ttagtattcaaagtgtttgataaagcgagtcttggtttgattgtatcgacggagcgttct
gtgcgtgtcgatgacaaattaatcgcacccgacatactagcctttagaggtcaataa
DBGET
integrated database retrieval system