Shewanella oneidensis: SO_1822
Help
Entry
SO_1822 CDS
T00099
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
son
Shewanella oneidensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAN54874
UniProt:
Q8EFZ2
LinkDB
All DBs
Position
1914181..1916991
Genome browser
AA seq
936 aa
AA seq
DB search
MHKNNLLAKSVRFALIGGVAATALNVPLVMAADEAGADKKVERIEVTGSRIKRTDMEAAS
PVLSMNRDEIEATGMISVGDILQTIPAAGSALNTAFNNGGDGSTNMDLRNLGSQRLLVLV
NGKRWISSLGSTVDLNTIPTSTIERIDVLKDGASAVYGSDAIAGVVNIITRKNFEGVEVS
VYGGQNAKYDDGRQYTADFTVGSVSEKGGLLFNMAHVTQQPIWAGDRDISDTGYSSTADN
TRIRVKGSQLNQANQDALAAIGKPNSSGIYDYMSKEGTGANVGMDQFRPRTGSDVYNFAP
DNYLSTPQNRNSFYVQGFYDISDNLRVVSDFMMTNRKSSQELAPMPLTLGASFGAAASRV
DIGGNNIYNPFGETLYGDSARAVANGKPVGYVPYALQRRMVEAGSRQYNQNDTTYRAMVG
LEGNINDNWSWTASYIYGQNNQDVLTTGLLNLTRINQALGDNCNASNGCVALNLFGGPGS
VTQDMVDYITFDSVSRSGLTMKDYTFNIAGDLFDLPAGPVGLAFGLERREESGFDTPDPL
TVTGESSGNQRDATSGGFRLDEAYAELAIPVIESLLITPAVRVSDHDAYGNNTTGKVGAE
FRPMDDMLLRGTWAQGYRAPSISDLYAGSADSYPTWNDPCNTRDSKGNVLNISGLPGCAG
VPDGYRQANTQIRISQVSSPDLKPETSESYTFGTVYNPSWLEGAEFTVDYYNIKVEDAIG
RYGHTTIARECATGDKVSSCDKIDRDSLGNIVDLRNFLQNAGTYEVEGIDFFTAYRFPET
SFGSFKTSLDLAYVLGNEFDGEDRAGIQYGDGGFPELKGSLNIDWAMGDWDAHWKMRYVG
ELTSDFYANDPANYDFYKDNGYRETFSAYMVHNVSVGYNIEDYNTKVSLGINNLFATEPQ
AEGPTNNEALSSNNFSVTEYDVNMDRFIYLRATTKF
NT seq
2811 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataagaataacttattagccaaatctgtgcgtttcgcattgattggtggtgtagct
gcaactgcattaaatgtgccattagtcatggctgctgatgaagctggtgctgataaaaaa
gtagagcgtattgaagtaacgggttcacgtatcaagcgtaccgatatggaagcggcaagt
cctgttctttcgatgaatagagatgagattgaagccacaggtatgattagtgttggtgat
atcttacaaacaattccagctgcaggttctgcactaaacactgctttcaacaatggtggt
gacggttctactaacatggacctgcgtaaccttgggtctcaacgtctactggtgttagtg
aatggtaagcgctggatatcttctttaggttcaacggttgacttaaacacaattcctaca
tcaacaattgagcgcatcgatgtattaaaagatggtgcttcagcggtttacggttctgac
gctattgcgggtgttgttaacattattactcgcaaaaactttgaaggtgttgaagtttct
gtctatggcggacaaaacgctaaatatgacgatggtcgccaatacaccgctgattttact
gttggttcagtatctgaaaaaggtggcttattattcaacatggcccacgtgactcagcaa
cctatttgggctggtgaccgtgatatttctgatactggttacagttctactgcggataac
actcgtatccgcgttaagggctcgcaactgaatcaagctaaccaagatgcattagctgct
attggtaaaccaaacagttctggtatttacgactatatgtctaaagaaggaactggcgcc
aatgttggcatggatcaattccgtccgcgtaccggtagcgatgtttataactttgcccct
gataactatctatctacaccgcaaaaccgtaactctttctatgttcagggtttttatgat
atttcggacaacttaagagttgtttctgactttatgatgaccaaccgtaagtcatctcaa
gaattagcgcctatgcctctgacattaggcgcctcatttggcgctgctgcaagtcgtgtg
gatattggtggaaataatatctataacccatttggtgaaacactctatggtgatagtgca
cgcgcggttgctaatggtaaacctgttgggtatgtgccttatgctttacagcgccgtatg
gttgaggccggttctcgtcaatacaatcagaacgataccacctatcgtgcaatggttggt
cttgaaggcaatatcaatgataactggagttggactgcgagctacatctacggccaaaat
aaccaagacgtgttgaccacaggtctactcaatttaacgcgtatcaatcaagcattaggt
gataactgtaatgcaagcaatggttgtgtggccttaaacctgtttggcggtccgggttcc
gtaactcaagatatggttgattatattactttcgatagcgttagccgttcaggtttaacg
atgaaagattatacatttaacatcgcgggtgacctatttgacttacctgcgggtcctgtt
ggtttagctttcggacttgaacgtcgtgaagaatctggttttgatacgccagatccatta
actgtaacaggtgagtcttctggtaaccaacgcgatgcgacttctggtggcttccgtttg
gatgaagcttatgctgaattagcgattcctgtaatagaaagcttattaattacgccggct
gttcgagtttctgaccacgatgcctatggtaacaatactacgggtaaagtgggcgctgaa
ttccgcccaatggatgatatgttgttacgtggtacatgggctcagggttaccgtgctcca
tctatttctgatttatatgcgggtagcgcagattcttacccaacttggaatgatccttgt
aatacaagagattctaaaggtaatgtacttaatatttcaggtttaccaggatgtgctggt
gtgcctgatggctatcgtcaagccaacacgcaaattcggatttctcaggtttcatcaccc
gatttaaaacctgaaacttcagagtcatacacttttggtacagtgtataacccatcttgg
ttagagggggcagaatttaccgttgattattataacatcaaggttgaagatgcaattggc
cgttatggacataccactattgctcgtgagtgtgctactggagataaggtttcctcttgc
gataagattgaccgtgatagtttaggtaatattgttgatttacgtaacttcctccaaaat
gctggcacatatgaagttgaaggtatcgacttcttcacagcatatcgattccctgaaaca
tcatttggttcattcaaaacttcacttgatctggcttatgttcttggtaatgagtttgac
ggagaagatcgtgcaggtattcagtatggtgatggtggtttccctgaactcaaaggtagt
ttaaacattgattgggcaatgggtgattgggatgcacattggaaaatgcgttatgttggt
gagttgaccagtgatttttatgctaatgatccagccaattatgacttctataaagacaat
ggttatagagagacattcagtgcttatatggttcataacgtatctgttggttataacatt
gaagactataacactaaggtttctttaggtatcaataacttgttcgcaacagagccgcag
gctgaaggcccaactaataacgaagcgctttctagcaacaacttctctgttacagagtat
gatgtgaatatggatcgctttatctatttacgtgcaacaaccaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system