KEGG   Shewanella oneidensis: SO_1872
Entry
SO_1872           CDS       T00099                                 
Name
(GenBank) surface lipoprotein with VCBS repeats
Organism
son  Shewanella oneidensis
SSDB
Motif
Pfam: Big_9 Cadherin_5 RCC1_2 Cadherin_4
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAN54924
UniProt: Q8EFU3
LinkDB
Position
complement(1965426..1969694)
AA seq 1422 aa
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NT seq 4269 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system