Shewanella oneidensis: SO_2907
Help
Entry
SO_2907 CDS
T00099
Name
(GenBank) ArgR-regulated TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
son
Shewanella oneidensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
son00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
son02000
]
SO_2907
Transporters [BR:
son02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
SO_2907
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAN55923
UniProt:
Q8ED60
LinkDB
All DBs
Position
3034797..3037451
Genome browser
AA seq
884 aa
AA seq
DB search
MRANSTLTKAVRFALIGGATTAALSTMSVFAAEDDNAKVERIEVTGSRIQRTDMESALPV
TVLSAEDIAKTGLSDVSAVLAQMPFNTAGSFISDAGSSASNHASSGMRGLGSNRTLTLIN
GRRIAPSATFGGDATNLNLIPMDAIERIEILRDGASAIYGSDAIGGVINIILKKTFDGLA
FDAKFGNPTQGGRDEKSASVTFGNTSDKSSSLVIIEHKQFDPLEGGQRPHLTANWDEKYG
RSALYAPEGTYRPVASRPIKGADGTFSDPVYTGLQVPGKDCPADRIVTSKAGSACGFNHF
DGTDYLPDQTKDSVFSNMTYRITDELEWFGQAIVMRDKSITSSTALWTPNLYIAADNPLN
PTFGTANASEVQAYHRLKGVADRTTEFDSNVVDVVTGLNLELDAGSLSWYVQYSDQIVNI
ETDSYVFEDKLQEAVDKGLYNPFVEGGNATQATLDTFLHTATRKATSNTTGTGLSWAALA
PISLPGGDLGYAVGMEYQKIEYKDTRDAQQAAGNVLGTYGGDSAGDRSYKAAFVELELPV
LDHLNVKLASRYDQYSLPDVGQLSNSVNVRYEALDNLVLRASYGQGFRAPSLDDLLGEPA
TSYDYVTDTTLCQSLPADQQKGNPACEDTQYLRKSSGNKELEPEKSAQYSFGAVWNITEN
IDFVVDYYNIEITDQVSYIDAQTIVDLEAIGGLGAYDPNYIYVKRKADGTIDEIGAGNIN
MDGVQTSGLDVSFTSNFDLADLGTFKFAVEGTYALEYTEQASPIAKRYDVLGTKGYPPLR
FNTTFSYAIDDFSTSLIAKYIDSYDGETPQQQEVGTNKQDFSSFTTWDLTFNYDFNSYGN
VTVGARNLFDAMPAVNYSLGYPGYDTDTHNILGRVVFAGYKVKF
NT seq
2655 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcgctaattcaacattaaccaaagcggttcgctttgctttaattggtggtgccact
acagcggctctatctacaatgtcagtttttgcagctgaagatgataacgctaaggttgaa
cgtattgaagtgactggttctcgtattcagagaacagatatggaatcagcactaccagtg
acagtgttgtcagcggaagatattgctaagacgggtttaagcgatgtatcagcagtttta
gcgcagatgccatttaacacggcgggtagtttcattagtgatgctggtagctctgcgagt
aaccatgcaagttcaggtatgcgtggtttaggttcaaaccgcaccttaacgctgatcaac
ggacgtcgaattgcaccatcagcaacttttggtggcgatgcaaccaacctcaatttaatc
ccaatggatgctattgagcgtatcgaaatattacgcgatggtgcatcagcaatttacggt
tcagatgctatcggcggtgtaattaacattattctcaagaaaaccttcgatggtttagca
ttcgacgcaaaatttggtaatccaactcaaggcggtagagatgaaaaatcagcttctgtc
actttcggtaataccagcgataaaagcagcagcttagtaatcatcgaacacaagcaattt
gatccactcgaaggcggtcaacgtcctcatttaacggctaactgggacgaaaaatacggt
cgcagtgctttatatgcacctgaaggaacatatcgtccagtagcttctcgcccaataaaa
ggcgcagatggtacatttagcgatcctgtatacactggtttacaagtgccaggtaaagac
tgtcctgcggatcgcatagtcaccagcaaagcaggttcagcttgtggctttaatcacttt
gacggaacagactatttacccgatcagacaaaagattctgtcttctcaaatatgacttat
cgtattactgatgaattagagtggtttggtcaagcaattgttatgcgtgacaaatcaatc
acgtcttctaccgcattatggacacctaacctgtatatcgccgcagataacccattaaac
ccaacgtttggcacagctaacgcgtcagaagtgcaagcttaccatcgattgaaaggtgta
gcagatcgtacaactgaattcgactcaaatgtagttgacgtagtaactggtctaaacctt
gagttagatgcaggctctctgagctggtatgtacaatactcagatcaaatcgtgaacatt
gaaactgactcttatgtattcgaagataagctgcaagaagcggttgataaaggtttgtat
aacccattcgttgaaggtggtaatgcgactcaagccactctagacacgttcttacacaca
gcaactcgtaaagcaacctcaaatacaactggtactggcttgtcatgggccgcgcttgca
ccaatttccttacctggtggtgacttaggttatgctgttggtatggaataccaaaaaatt
gaatacaaagatacccgtgacgcgcaacaagcagcaggtaacgtattaggtacttacggt
ggcgattctgcaggtgatagaagctacaaagcggcattcgttgagttagaactaccagta
ttagatcacctgaatgtgaagctagcaagccgttacgaccagtatagcttgccagatgta
ggccagctttctaactccgttaacgttcgctacgaagccttagataacttagtgttacgc
gcatcttatggccaaggttttagagcaccttcactggatgatttgttaggtgaaccagca
accagctatgactacgtcaccgacacaactctctgccaaagtctgccagcagatcagcaa
aaaggtaaccctgcttgcgaagatacccaatatctgcgtaagagttcaggtaataaagag
ctagaaccagagaaatctgctcaatactctttcggcgcagtgtggaatattactgagaat
atcgatttcgttgttgattactacaacattgaaattaccgaccaagtaagctacatcgat
gcacaaactatcgttgacctagaagctattggtggtttgggtgcttatgaccctaactac
atctatgttaaacgtaaagctgatggcactatcgatgagatcggtgctggcaacatcaac
atggatggcgtacaaacttcaggtcttgacgtatcatttacgtcaaactttgatttagct
gacttgggtacatttaaatttgcagttgaaggcacttatgctctggaatacaccgagcaa
gcaagcccaattgctaaacgttatgatgtgttaggtactaaaggttatccaccactacgt
tttaacactacatttagctatgctattgatgacttctctacatctttgattgctaaatac
attgattcctatgatggtgaaacaccgcagcaacaagaagtcggtactaataagcaggac
ttttcgtcgttcacaacttgggatctgacatttaactacgacttcaacagctacggcaac
gtaactgtgggtgctcgtaacctgtttgatgctatgccagctgttaactacagcttaggt
tacccaggatacgataccgatacccacaatatcttgggtcgcgtagtattcgcaggatac
aaagtgaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
