Shewanella oneidensis: SO_3485
Help
Entry
SO_3485 CDS
T00099
Symbol
emrD3
Name
(GenBank) multidrug efflux pump EmrD3
Organism
son
Shewanella oneidensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
MFS_2
Sugar_tr
RWP-RK
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAN56478
UniProt:
Q8EBM5
LinkDB
All DBs
Position
complement(3634284..3635432)
Genome browser
AA seq
382 aa
AA seq
DB search
MNIKPPLWLAVLLMMFPQIMETIYSPALPDIAEHFAVPISAAAQTLSVYFVAFAIGVFCW
GRLADVIGRRKAMLAGLVCYAIGSAFALLVSDFSLLLMARVLSAFGAAVGSVITQTMMRD
SYSGEELAKVFSVMGMSFGISPVIGLLLGSVLSAFWGYQGVFVVLMSSAIVLLFLSVKSL
PETKPAHTQTIAIGELAIKMLSDRGIIKNTLLVAAFNLMWFSYFSLAPFMFEAQGLSTLI
FGMSGLLLGFGAFLGSYFNQVLLGRCCTSPRLIRLASSIALVGGVGIWLLQSTFIGLNNV
YFLAPMLLIVIAYGIAIPNILSSALAGYRTYAGSAGALFGLFYYILLGAGLGVVGLINHL
GGVITLAALFCTVLSMSRARGE
NT seq
1149 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatataaaaccaccattatggcttgctgtgctgctaatgatgtttccgcaaattatg
gaaaccatttatagtcctgcattgccagatattgccgagcactttgccgtgccgattagc
gctgccgcgcaaaccttatcagtctattttgttgcctttgcgattggtgttttttgctgg
ggacgtttagccgacgtgattggtcggcgcaaagccatgctcgcgggattagtctgttat
gccattggctctgctttcgctttactcgtaagcgactttagtttgttgctgatggctcgg
gtattgtcggcctttggcgcggcagtgggctctgtgataactcaaaccatgatgcgtgac
agttatagtggcgaggagttagcgaaagtcttttctgtgatgggaatgtcatttggaata
agccccgttatcgggttgcttttgggcagcgttctcagtgccttttggggatatcaaggt
gtgtttgtcgtactgatgagctcagcaattgtgttgctgtttttgtcggtaaaatcctta
cccgaaaccaaacccgcacacacccagacaattgccataggtgagttagcgattaagatg
cttagtgaccgcggaattattaagaataccttgctggtggcagcgtttaacctgatgtgg
tttagctacttttcactggcgccatttatgtttgaggcgcaagggttatcgacgcttatc
tttggtatgagtggcttattgttaggctttggcgcattccttggtagttattttaatcaa
gtattgctgggtcgatgctgcaccagcccacgactgattcgtttagccagtagcatcgca
cttgtcggtggagttggcatttggctattgcaatcgacctttatcggcttgaataatgtt
tattttttagcacctatgttattgattgtgattgcttacgggattgcgataccgaatata
ctcagctctgctctggcaggctatcgtacttacgctggctctgctggcgcactctttggg
ttgttttactatattttgctcggcgcgggattgggtgttgtcggtctgattaaccatctt
ggcggcgtgattacgttggcggcattgttttgtacagtgctcagtatgagtcgcgcccgt
ggcgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
