Sphingobacterium oryzagri: PQ465_20355
Help
Entry
PQ465_20355 CDS
T10198
Name
(GenBank) carboxypeptidase regulatory-like domain-containing protein
Organism
sop Sphingobacterium oryzagri
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
OMP_b-brl_4
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
SpaA
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WDF68634
UniProt:
A0ABY7WJ58
LinkDB
All DBs
Position
complement(4992927..4996319)
Genome browser
AA seq
1130 aa
AA seq
DB search
MKKFLLFFFIALSTTILHAQVTTSSMNGVISSNTGEPLAGATVKVTHRPTGTVYAVSSAN
DGRFNIANMRVGGPYLVEVTYIGSEPKTLDNIYLQLGQPYVLNTALSGGTTLEQVVVSAT
GSKLNTDRTGASTNVNSKQLQELPQITRSITEFTRLTPQASGNSFAGRDARYNNVQIDGA
NFNNRFGTASGLLPGGSTQPISLDAIEEIQVNIAPYDVRESGFTGAGVNAVTRSGTNEFH
GSAYGFYNNQNLRGHRIGDITLDRQEAYTANYGFRLGGPIIKNKLFFFVNAEIEQQGGAN
ASGANLWRPSTDGIADGENNIARTTVDDLEAVRSHLINTWGYDPGRYQGYANEARQNSYK
FMARLDWNINENNNFNIRYNQAIGSVLSQANGTSGPYPRSQTNRISQNSITFENGNYSTE
NKVHSLSAELNSRINSNLSNQFIAAYTRIQAVRGTPSNQLFPFVDIGDGVGYPDSYSNYM
SFGTELFSYNNDVLNNNYNFVNNLTYSKGKHTMTFGAAFEIQNFGNSYTRMGTSYYRYSS
VADFLTTGTDREVPPITYGLTYPYEGQDTYARINFGLASLYAQDRYDVSDRFTLTYGLRA
ELPIYMNRLTPNHAIDAITLLNQYNAPTNYSSGSWPKSRILWSPRVGFNYDVRGDRTLVI
RGGTGMFSGTVPFVWLTNMPTNSGVLQNTIEPGNYAQVAPWIGNVTFNPDAYHYVNNPPA
GGENVFITTLEGGAPSSFSLVDENFRMPMVWRTSIGGDYSIPNTPLVLNADLLYTKDINA
VFQYGANRAVPTTRLNYGASEDVEGDYGDNRLFYPTGVQRYNTAIGANNATILTNTSVKG
YAYSATVGVTLPNYRGINASLHYTYSNAKEVSANAGSNASSAWGGSPSINSPNDQILMPS
AFAIPHRVVGTLNYRIEYANALATTLGIVYSGEHQNRFSYTYTSDINRDGIVADLVYLPN
DLSNLNFVDRVNATGQVLFTAEEQRSALQDFINANGLAKYQGSYLPRNGFLMPWLNHFDV
RVLQDIYKNIGTKRHTLQISFDVINFGNLLNKSWGVQSNLNNAQFLLGNSLTPGVNSQGN
PVLNTVATPASGNPTLNMNVINGEIPMTPFQNASTISTTWRMQLGLRYIF
NT seq
3393 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagtttttactcttttttttcattgcgcttagcacaacgattttgcatgcgcaa
gtaacaacaagtagcatgaacggtgttatctcaagtaataccggtgagccattagcagga
gctacggtaaaagtaacgcataggccaacgggtacagtatatgccgtatcttcggcaaat
gatggccgttttaatattgctaacatgcgcgtcggcggaccatatctcgtagaggttacc
tacatcggctcagaaccgaaaaccttagataacatctatttgcagttggggcagccttac
gtgttaaacacagccctttccggaggcactacgttagaacaagttgtggtatcggcgacg
ggttcaaagctcaatacagatcgtactggagcgagtaccaatgtcaattcgaagcagcta
caggagctgccgcaaattacacgaagcataacggaatttacgcgcctgacaccgcaggca
agcggtaactcgtttgcaggtcgcgatgcgcgttataacaatgtgcagattgatggtgcc
aattttaataatcgctttggtacagcgagtggtcttttgccaggcggtagcacacagccg
atttctttggacgcgatcgaagaaatacaggtgaacatcgcgccatatgacgtgcgcgaa
agcggctttaccggtgcgggagttaatgctgtgacgcgtagcggtacaaatgagtttcat
ggtagcgcttatggtttttacaacaatcaaaacctccgagggcatcgtataggcgatatc
acacttgatcggcaggaagcttacacggccaattacggctttcgtctgggcggaccgatt
attaaaaataagctctttttcttcgtaaacgcagagatcgaacagcagggaggagccaac
gcatcgggagcaaatctttggcgaccatctaccgatggtatagcggatggtgaaaataat
attgcccgcacaacagtggatgatctggaggctgtgcgtagccatctaatcaacacctgg
ggttatgatcccggtcgctatcagggttatgcgaatgaagcaagacaaaatagctataaa
tttatggcgcgattggactggaatattaacgagaataataattttaatattcggtataat
caggcaataggctctgtcctgtctcaagccaatggcacatcagggccatatccgcgtagt
cagacgaatcgcatcagccaaaactctattacattcgagaacgggaattatagcacggaa
aataaggttcattcgctatcagccgagttaaacagccggatcaattctaacctctctaat
cagtttattgctgcgtacacgcgtattcaagccgtacgagggacaccgagtaaccaattg
tttccattcgttgatatcggcgatggggtaggatacccggactcttatagtaattacatg
agttttggtaccgagcttttttcgtacaacaacgatgtactaaacaacaattacaatttt
gtaaacaatctcacttatagcaaaggaaaacataccatgacctttggagctgcttttgaa
atacagaatttcggaaacagttatactcgtatgggcacatcctattatcggtacagcagc
gtggcagatttcttgaccacgggaacagatcgtgaggttccaccgattacatatggcctt
acctatccatacgaaggccaagacacctatgcacgcattaatttcggtcttgcttcgttg
tatgcgcaagatcgatatgatgtaagcgaccgttttacgcttacctacggtctgcgtgca
gagttgccgatttatatgaacagacttacgccaaaccacgctattgatgcgattacttta
ctaaatcagtataatgcaccaactaattacagcagtggttcctggccaaaatcacgtatt
ttatggtccccacgagttggttttaattatgatgttcggggtgatcgcaccttggtcatc
cgcggtggtacgggcatgttctcgggaaccgttccctttgtgtggttaacgaatatgccg
acaaactcaggcgtgctgcaaaatacgatagagcctggaaactatgcgcaggtagcgcca
tggattggaaatgtcacttttaatcccgatgcgtatcattatgtaaataatccgccggca
gggggcgagaatgtatttatcacgactctagagggcggggctccaagtagtttttctttg
gtagacgaaaacttcagaatgccgatggtttggcgtaccagtattggtggcgattatagt
attcccaacaccccgctggtattgaatgccgatttattgtataccaaagatataaatgcg
gtgtttcagtatggtgccaatcgagccgttccaacaacccggttaaactatggtgcaagc
gaagatgtggaaggagactacggtgataatcgcttattctaccccactggtgtgcaacgc
tacaacacagcaattggtgctaataatgccacaattttaacgaatacttcagtgaaaggc
tacgcgtatagtgcgacagtgggcgtaacgttgccaaattaccgtggtataaatgcgtct
ttgcattatacttattctaatgctaaggaagtctcggccaatgccggctcaaatgccagc
tcggcatggggcggtagtccaagcattaacagcccaaatgaccagattttgatgccttcc
gcttttgctattccacatcgtgtggtcggaaccctaaattatcgtattgagtatgcaaat
gccttagcaacaaccttaggcattgtatatagcggcgaacatcaaaatcgcttctcttat
acctatacatctgatattaaccgcgacgggattgtggcagatctagtttacctgccaaac
gacttaagcaacttgaatttcgtagatcgcgtaaatgccacggggcaagtgctgtttact
gctgaagagcaacgtagtgcgttgcaagatttcatcaacgcaaatggtttagcgaaatac
cagggatcttacctgccgagaaatggctttctaatgccttggttaaatcattttgatgtg
cgcgttttgcaagatatttataaaaatattggaactaaaaggcatactttacagattagt
ttcgatgtcatcaattttggaaatcttttaaacaaaagttggggcgtacaaagcaattta
aataatgcacagttcctactcggcaatagcttgacaccaggtgttaattcgcaaggtaat
ccggttttaaataccgtggctacaccagcaagtggtaatccaacacttaatatgaacgtt
atcaatggcgaaataccaatgacgccatttcaaaacgccagtacaattagtacaacctgg
agaatgcagttgggcttaagatatatcttttag
DBGET
integrated database retrieval system