KEGG   Spirosoma oryzicola: LQ777_25000
Entry
LQ777_25000       CDS       T08981                                 
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
soq  Spirosoma oryzicola
SSDB
Motif
Pfam: CBM_3 Big_12 Reelin_subrepeat-B Big_13 fn3 Big_6
Other DBs
NCBI-ProteinID: UHG93782
LinkDB
Position
unnamed1:215140..219603
AA seq 1487 aa
MKNLLLLLGSLLTVYSVQAQTITLVQESFETDGRNTRYTSNEFDSRSASSSLPYFTRALT
NPLLNPFNPSNVCFGTNKYPVTIGGVDGAVFWSSEAVRSTATSPADDDRAPGVVTLNAIN
ASTYGSLKLVVALADARGPSSPTLTKNGGELNPQYDSNDFIRLQYSTNGGTTYNTLAQFV
GNNPSGQGFMQLDADLDGTADGAQTATNTLDINMRDFSFNIPGSPSSLLVRVQVDQRGGS
EELAFDNIRVTGVANTVSPPTLSNLENDPLPYAEGQGATKVTNTITVVNPGGSTLSRATV
SISSGRGAGDQLVFTNTNLISGSYNSSTGVLELNGTAPTEDYQAALRSVAFRNSDAINAP
MGTRTLDFVVYNGTTSSNQVSRNVTVTASLDAATTLPYQEDFEVDKEGTRYSSNTFVARN
GTGAAWLRTTANPYQTNPPSPNPTTFSNISGSAYWYGNNTNSLANSATRMGTLQTLQINT
AGYTNLTFSIRIGASSGANARWQNTDYFKVYYRVAGGAQVPILSFRGNTATQSAQGNLQQ
DADPSATTGIPNGTTLTPALNTFTAQLPASVSGQVVDFLVVLMSDDISAELAFDNIQLTG
TQLTAPTVTTNSSASNVTTSSASLGGNVTNDGGASVTERGIIYKAGANAPNASDSKVASG
TGVGGFSATLTGLTSGTQYTARAYAINSVGTGFGSTVTFVTTPGSPQLNTPTNGTYVATG
TPIYTGTTQVGSTVQVYVDGTLLNATPTVDNAGNFTVVQPSSLNEGSHTVYATATVTING
TTSPTSANSNTNTFIIDVTAPTVSLTSATAPNGSSYNSSPFVYNATFSENVANFVASDIT
VGNGSVTGFSAISSSQYSFTVTPTTSGAVSVSLARSVASDVAGNGNVESDPYTIIYAPLP
TISGFTATTPSVCVSSPVTFTATVGNVTGAYTYTLTNGVSTTTGTSSNPAFNQSVVSTNS
GTQNFTLTVSANNGQVTTAFVSVTVKSTLTNIRGSQSATSLCAPGGQVNFQVTPDPIEFY
TVTLFRNNVQDGQTTGSYGSTIIFPRNVTQSANYQIVVTSSCASLTTTFTPVTVTPLPTP
SIVGLATAYCQDAGSQPLKGEPSGGVFTIDGNPATSFDPTSLTIGQHTVVYSYTNAGGCS
NTATQIVTVTETPTAPRLVTQTGGPYPAGVSSLTISQNTGDVILTVSGCANGTINWNGGN
AATLAVSTANTGTQNFTATCTQNGCTSPAATATVTVVLPTLRVLSRDPDNGQQNSNTIKP
YLLLQNVGTTPISYGSITVRYWLTTEPNMNLIFQKNYVAIGQNNLNLRYVPLASPRQGAT
GYIEYSFNSAAGSLAPMGDSGPLEVQAYQQNYAVLNQLDDYSYINNSTFTLNPRITAYQN
GVIFYGTEPAGSGNTRVAAKEAESILQVNVLGNPVIGHSAEVEISGVSGQSVQIRLVDLQ
GKSVFEHSIKEVSSTERVILPLGTAQGILLLNVSTANQRQQIKLLRP
NT seq 4464 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaatttacttttacttctcggttcattactaaccgtttattctgtccaggcgcag
actataaccctggtgcaggaaagcttcgagaccgacggtcggaatacgcgctacacctcg
aacgagtttgattcgcgctcggctagttcttcgctgccttacttcacgcgggcgctgacc
aatcccctgctcaatccgttcaatccgtccaatgtgtgctttgggactaataaatacccc
gttaccattggtggggtagacggcgcggttttctggtcatctgaggccgtccggagcacg
gcaaccagcccagcggatgatgaccgcgctccgggggttgtcacgctcaacgccattaac
gccagcacctatggctcattaaaactagtggtagcccttgccgatgctcgcggccccagt
agtcctactctcaccaaaaatgggggcgaattgaacccccaatacgattctaacgacttt
attcgcctacagtattcgactaatggcggaacgacctataatacactggcgcagtttgta
ggtaataatccgtctggacaaggttttatgcaacttgacgcagacctggacggcactgcc
gatggagcgcagacagcgaccaacacgctagacattaatatgcgtgatttctcgttcaat
attccgggctcaccgtcctcgttactcgtacgggtgcaggtcgaccagcgcgggggcagc
gaagagttagctttcgacaatatccgggtaacgggcgtggccaataccgtgtctccgccg
acgctcagtaatcttgaaaacgatcccttaccgtatgccgaaggccagggcgctacaaag
gttaccaacactataaccgtggtcaatccgggaggatcgacgctgagtcgggctaccgtc
agtatcagcagcggtcggggtgcgggcgatcaactggtatttactaacactaaccttata
tcaggatcatataattcatcgacgggagtacttgaactgaatggtactgcaccgacggag
gattatcaggcggctttacgatcggtagcctttcggaattcggatgcaatcaacgcacca
atgggcacacgcaccctggattttgtggtgtacaatggcaccaccagcagcaaccaagtg
tcgcgtaatgtgacggtgacggcctccctggatgcggctacgacattgccttaccaggaa
gattttgaagtggataaggaaggtacgcgctacagttcgaatacgtttgttgcgcgaaat
ggcactggggcggcctggttacggacaaccgcgaatccctatcagacgaacccgccttcg
ccaaaccccaccacattcagcaacatcagcggttccgcttactggtacggcaacaatacc
aactccttggcgaacagtgctacccgcatgggcaccttacagacgctgcaaatcaacacc
gcaggttacacgaacttaactttctcgatacgcattggagcctcgtcgggtgcgaatgcg
cgctggcagaacaccgattactttaaggtttactaccgggtagcgggcggtgcccaagtg
cctatcctttcgttccggggaaacacggcgacgcaatctgcacagggtaacttgcaacag
gatgctgaccccagcgccacgacaggcataccgaacggtacgactttaacgccggccctg
aacacctttaccgctcaactgcctgcttccgtatcaggacaagtagtcgatttcctggtg
gtgctgatgtcggacgacatctcggcagaactggctttcgacaatatacagctaacgggc
acgcaactgacagcaccgaccgtgacaaccaattcgtcggctagtaacgtaaccacctct
agcgccagcctgggaggtaacgtgacgaacgacggaggagccagtgttaccgagcgaggt
atcatatacaaagctggcgcgaatgcgccaaacgccagtgattccaaagtagccagcggt
acaggagtggggggcttttcagctaccctgaccgggttgacatcggggactcagtataca
gcgcgggcctacgccatcaacagcgtcggtactggttttggcagcacagttacgttcgtt
actacgcctggaagcccgcaactgaacacgcccaccaacggtacctatgttgccaccggc
acacccatttacacgggtacaactcaagtgggcagcacggtacaagtgtatgtagatggc
accctgcttaatgccaccccaacggtcgataatgcgggcaacttcaccgttgttcagccc
tcatcactgaacgagggaagccatactgtatacgccacggctacggtaacgatcaatgga
acgaccagcccaaccagcgccaactcgaacacgaacacctttatcattgatgtgacggcc
cccacggtcagcttaacctccgcgacggctcccaacggcagttcctacaacagttcgccc
tttgtctacaacgctaccttttcagagaacgtagccaattttgtagcctccgatataacg
gtgggtaatggttccgtaacgggctttagtgccattagcagcagccagtacagtttcacc
gtaacgcctaccaccagcggagcagtttccgtgagtttggcgcgtagcgtggcaagcgat
gtagcgggtaatggtaacgtcgagtccgatccatataccatcatttacgcaccactccct
actattagcggctttacggctactaccccatcggtatgtgtgagtagtccagtcacattt
acggccacagtaggcaacgtaacgggggcttatacgtatacactgacaaatggtgttagc
accacaacgggcaccagtagcaatccggcgtttaatcagtcggtggtatcaaccaactca
ggtacccagaacttcacgcttacggtaagcgccaacaatggtcaggtaaccacagctttt
gtaagtgtaaccgttaaaagcacccttacgaacatcagaggcagtcaatccgcaactagc
ctatgcgcaccggggggtcaagtaaatttccaggttacaccagatccaatagaattctat
acggtgacgctcttccgcaataatgtccaagatgggcaaacgacgggctcgtatggatca
accattatctttcctcgcaacgttacgcaaagcgccaactaccaaatcgttgttacctcg
agctgtgccagcctgacgactacgtttacacccgtgacggtcacgcccttgccgacgcct
tcgattgtgggcttagcaacggcttattgtcaggacgcgggtagccaacccttgaaggga
gaaccatcggggggcgttttcacgattgacggtaatccggctactagcttcgaccctacc
agcctgacaatcggtcagcacacagttgtctacagctatacgaacgctggtggctgttcg
aatacggcgacccaaatcgttactgtcaccgaaacgccaacagccccgcgcctggtaacc
cagaccggtggcccttatccggcgggggtgtccagcttgactatttcgcaaaatacaggt
gatgtaattttaactgtgtctggctgtgcaaatggtacgattaactggaatggtgggaat
gcagctacattggccgtctcgacagcgaacacaggtacacagaactttaccgctacctgt
acccaaaatggttgtacgagtcctgctgctacagcaacagtaaccgtggttttaccaacg
cttagagtcttgtctcgcgatcctgacaacggtcaacagaacagcaatacgatcaagcct
tatctgcttttgcaaaacgtaggtacaacgcctatttcgtatggctcaatcaccgtgcgc
tattggctgacgactgaacctaatatgaatctgatctttcagaaaaactatgtagccatt
ggccaaaacaacctcaacttgcgctatgttccgctggcgagtcctcgtcagggagcaacg
ggctacatcgaatacagcttcaactcggcagcaggtagcctggcaccgatgggtgattcg
ggtccactagaagtacaggcttaccagcagaattatgcggtgctcaaccagttggatgat
tactcgtatatcaacaatagtacattcacgctaaatcctcgtatcaccgcttaccagaac
ggggtgatcttctacggtacagaacctgctggtagcggcaacacgcgggtagctgccaag
gaggcagagtctatacttcaggtcaacgtcctaggcaaccctgttatcggccattccgct
gaggtggagattagcggagtgtctggtcagtcggtacaaatccggctagtcgacttacaa
ggtaagtcagttttcgagcatagcatcaaagaggttagctcaacggagcgtgtaatcctg
ccgctaggtacagcccaaggtatccttttactgaatgtgagcaccgccaaccagcgtcag
caaatcaaactactacgtccttaa

DBGET integrated database retrieval system