KEGG   PATHWAY: sot03010
Entry
sot03010                    Pathway                                
Name
Ribosome - Solanum tuberosum (potato)
Class
Genetic Information Processing; Translation
Pathway map
sot03010  Ribosome
sot03010

Other DBs
PDB: 1FFK 1J5E 4V4A 4YBB 4V6U 4V6X 4UG0 4V88 3A1Y
Organism
Solanum tuberosum (potato) [GN:sot]
Gene
102577445  [KO:K02962]
102577484  [KO:K02877]
102577496  [KO:K02885]
102577526  [KO:K02995]
102577530  [KO:K02993]
102577534  cyc07-like; cyc07-like protein [KO:K02984]
102577535  [KO:K02964]
102577548  [KO:K02984]
102577551  [KO:K02942]
102577552  [KO:K02947]
102577564  [KO:K02896]
102577601  [KO:K02936]
102577606  RPS27A; putative ubiquitin extension protein [KO:K02977]
102577644  [KO:K02985]
102577655  [KO:K02892]
102577675  [KO:K02932]
102577682  [KO:K02880]
102577693  [KO:K02995]
102577695  [KO:K02937]
102577710  [KO:K02903]
102577718  [KO:K02930]
102577734  [KO:K02894]
102577739  [KO:K02973]
102577759  [KO:K02918]
102577788  [KO:K02943]
102577793  [KO:K02957]
102577827  [KO:K02966]
102577830  [KO:K02997]
102577837  [KO:K02882]
102578219  [KO:K02893]
102578519  [KO:K02941]
102578588  [KO:K02885]
102578677  [KO:K02922]
102578685  [KO:K02924]
102578705  [KO:K02933]
102578863  [KO:K02969]
102578978  [KO:K02933]
102579003  [KO:K14753]
102579045  [KO:K02970]
102579278  [KO:K02935]
102579307  [KO:K02918]
102579458  [KO:K02936]
102579483  [KO:K02938]
102579491  [KO:K02906]
102579775  [KO:K02902]
102579828  [KO:K02959]
102580008  [KO:K02945]
102580084  [KO:K02866]
102580086  [KO:K02985]
102580154  [KO:K02976]
102580255  [KO:K02943]
102580286  [KO:K02927]
102580322  [KO:K02942]
102580340  [KO:K02941]
102580372  [KO:K02895]
102580390  [KO:K02880]
102580417  [KO:K02985]
102580539  [KO:K02906]
102580579  [KO:K02926]
102580654  [KO:K02942]
102580700  [KO:K02872]
102580731  [KO:K02880]
102580984  [KO:K02912]
102580996  [KO:K19032]
102581028  [KO:K02971]
102581050  [KO:K02921]
102581085  [KO:K02884]
102581110  [KO:K02881]
102581235  [KO:K02962]
102581332  [KO:K02905]
102581547  [KO:K02955]
102581781  [KO:K02981]
102581830  [KO:K02882]
102582055  [KO:K02951]
102582163  [KO:K02942]
102582176  [KO:K02953]
102582336  [KO:K19034]
102582361  [KO:K02867]
102582481  [KO:K02895]
102582499  [KO:K02894]
102582594  [KO:K02896]
102582667  [KO:K02952]
102582696  [KO:K02973]
102582711  [KO:K02866]
102582754  [KO:K02905]
102582763  [KO:K02983]
102582768  [KO:K02954]
102582925  [KO:K02913]
102582943  [KO:K02891]
102582959  [KO:K02936]
102583043  [KO:K02866]
102583160  [KO:K02979]
102583185  [KO:K02962]
102583223  [KO:K02908]
102583234  [KO:K02903]
102583353  [KO:K02871]
102583424  [KO:K02910]
102583499  [KO:K02938]
102583648  [KO:K02991]
102584040  [KO:K02938]
102584045  [KO:K02995]
102584366  [KO:K02910]
102584409  [KO:K02975]
102584420  [KO:K02875]
102584617  [KO:K02997]
102584650  [KO:K02991]
102584651  [KO:K02969]
102584826  [KO:K02872]
102584866  [KO:K02879]
102584890  [KO:K02949]
102584897  [KO:K02991]
102584908  [KO:K02868]
102584937  [KO:K02997]
102584982  [KO:K02868]
102585144  [KO:K02882]
102585207  [KO:K02949]
102585355  [KO:K02893]
102585360  [KO:K14753]
102585385  [KO:K02942]
102585478  [KO:K02988]
102585523  [KO:K02915]
102585572  [KO:K02883]
102585829  [KO:K02940]
102586017  [KO:K02922]
102586211  [KO:K02872]
102586267  [KO:K02879]
102586268  [KO:K02900]
102586281  [KO:K02917]
102586304  [KO:K02915]
102586389  [KO:K02927]
102586531  [KO:K02953]
102586592  [KO:K02879]
102586719  [KO:K02918]
102586829  [KO:K02924]
102586831  [KO:K02941]
102586850  [KO:K19033]
102586898  [KO:K17422]
102586955  [KO:K02964]
102587065  [KO:K02958]
102587067  [KO:K02996]
102587145  [KO:K02865]
102587160  [KO:K02871]
102587187  [KO:K02964]
102587374  [KO:K17435]
102587452  [KO:K02937]
102587469  [KO:K02894]
102587483  [KO:K02978]
102587574  [KO:K02953]
102587601  [KO:K02872]
102587654  [KO:K02899]
102587684  [KO:K17428]
102587726  [KO:K02987]
102587779  [KO:K02901]
102588047  [KO:K02987]
102588076  [KO:K02921]
102588127  [KO:K02943]
102588229  [KO:K02914]
102588385  [KO:K02960]
102588476  [KO:K02945]
102588477  [KO:K02945]
102588595  [KO:K02983]
102588688  [KO:K02876]
102588702  [KO:K02912]
102588822  [KO:K02945]
102588825  [KO:K02935]
102588846  [KO:K17426]
102588872  [KO:K02898]
102588879  [KO:K02893]
102588916  [KO:K17435]
102588930  [KO:K02957]
102589010  [KO:K02969]
102589033  [KO:K02912]
102589256  [KO:K02914]
102589285  [KO:K02993]
102589288  [KO:K17434]
102589364  [KO:K02917]
102589413  [KO:K02927]
102589540  [KO:K02932]
102589553  [KO:K02911]
102589601  [KO:K02870]
102589641  [KO:K02907]
102589687  [KO:K02917]
102589849  [KO:K02973]
102589955  [KO:K02873]
102589971  [KO:K02929]
102590082  [KO:K02895]
102590107  [KO:K02925]
102590167  [KO:K02930]
102590182  [KO:K02990]
102590282  [KO:K02958]
102590287  [KO:K17402]
102590339  [KO:K02881]
102590343  [KO:K02922]
102590355  [KO:K17427]
102590369  [KO:K02874]
102590439  [KO:K02995]
102590512  cyc07-like; 40S ribosomal protein S3a-like [KO:K02984]
102590529  [KO:K02974]
102590530  [KO:K02977]
102590786  [KO:K02958]
102590993  [KO:K02996]
102590994  [KO:K02888]
102591158  [KO:K02897]
102591198  [KO:K02911]
102591222  [KO:K02904]
102591266  [KO:K02978]
102591299  [KO:K02931]
102591306  [KO:K02961]
102591316  [KO:K02875]
102591378  [KO:K02899]
102591593  [KO:K02921]
102591658  [KO:K02873]
102591743  [KO:K19032]
102591755  [KO:K02935]
102591814  [KO:K02957]
102591827  [KO:K02971]
102592155  [KO:K02971]
102592234  [KO:K02874]
102592271  [KO:K02906]
102592385  [KO:K02920]
102592446  [KO:K17424]
102592453  [KO:K02929]
102592502  [KO:K02896]
102592650  [KO:K02929]
102592795  [KO:K02980]
102593024  [KO:K02977]
102593045  [KO:K02877]
102593057  [KO:K02943]
102593291  [KO:K28397]
102593316  [KO:K02899]
102593567  [KO:K02949]
102593585  [KO:K02875]
102593885  [KO:K02949]
102593964  RPL37A; 60S ribosomal protein L37a [KO:K02921]
102593985  [KO:K02995]
102594083  [KO:K02997]
102594168  [KO:K02918]
102594318  [KO:K02934]
102594485  [KO:K02935]
102594603  [KO:K02913]
102594641  [KO:K02932]
102594660  [KO:K02937]
102594809  [KO:K02935]
102594934  [KO:K02884]
102595051  [KO:K02908]
102595052  [KO:K02953]
102595055  [KO:K02955]
102595065  [KO:K02890]
102595077  [KO:K02917]
102595243  [KO:K02888]
102595475  [KO:K02912]
102595510  [KO:K02877]
102595549  [KO:K02881]
102595592  [KO:K02927]
102595901  [KO:K02974]
102596008  [KO:K02897]
102596272  [KO:K02935]
102596426  [KO:K02926]
102596507  [KO:K02957]
102596561  [KO:K02898]
102596593  [KO:K02896]
102596885  [KO:K02940]
102597208  RPL27; 60S ribosomal protein L27 [KO:K02901]
102597213  [KO:K02968]
102597278  [KO:K02915]
102597496  [KO:K02989]
102597770  [KO:K02957]
102598025  [KO:K02920]
102598040  [KO:K02918]
102598069  [KO:K02925]
102598170  [KO:K02951]
102598237  [KO:K02923]
102598242  [KO:K02889]
102598285  [KO:K02868]
102598332  [KO:K02935]
102598365  [KO:K02923]
102598427  [KO:K02897]
102598507  [KO:K02920]
102598879  [KO:K02894]
102598901  [KO:K17413]
102598906  [KO:K02909]
102598919  [KO:K02916]
102598992  [KO:K02871]
102599049  [KO:K02908]
102599194  [KO:K19035]
102599270  [KO:K17411]
102599327  [KO:K02976]
102599440  [KO:K02940]
102599549  [KO:K02865]
102599598  [KO:K02943]
102599656  [KO:K02985]
102599673  [KO:K02904]
102599913  [KO:K02953]
102599917  [KO:K02978]
102599926  [KO:K02980]
102599930  [KO:K02889]
102600083  [KO:K02891]
102600146  [KO:K02974]
102600208  [KO:K02937]
102600252  [KO:K02978]
102600285  [KO:K02991]
102600412  [KO:K02891]
102600463  [KO:K02870]
102600468  [KO:K02934]
102600501  [KO:K02946]
102600564  [KO:K02893]
102600569  [KO:K02960]
102600589  [KO:K17408]
102600598  [KO:K02927]
102600627  [KO:K02893]
102600770  [KO:K02924]
102600786  [KO:K27351]
102600827  [KO:K02975]
102600958  rpl27; 60S ribosomal protein L27-3 [KO:K02901]
102601057  [KO:K02998]
102601080  [KO:K02890]
102601170  [KO:K02887]
102601255  [KO:K02882]
102601402  [KO:K02934]
102601481  [KO:K02998]
102601557  [KO:K02960]
102601623  [KO:K02921]
102601657  [KO:K02937]
102601848  [KO:K02882]
102601925  [KO:K02933]
102601959  [KO:K02894]
102602105  [KO:K02867]
102602148  [KO:K02882]
102602153  [KO:K02942]
102602605  [KO:K19033]
102602694  [KO:K02961]
102602695  [KO:K19034]
102603178  [KO:K02951]
102603301  [KO:K02920]
102603378  [KO:K17411]
102603415  [KO:K02993]
102603529  [KO:K02939]
102603531  [KO:K02988]
102603576  [KO:K02979]
102603686  [KO:K02912]
102603924  [KO:K02990]
102603931  RPL13; ribosomal protein L13 [KO:K02873]
102603978  [KO:K02902]
102604004  [KO:K02883]
102604160  [KO:K02966]
102604693  [KO:K02981]
102604819  [KO:K02876]
102604878  [KO:K02929]
102604893  [KO:K02955]
102604933  RPS4; 40S ribosomal protein S4 [KO:K02987]
102604938  [KO:K02947]
102604998  [KO:K02930]
102605043  [KO:K02948]
102605048  [KO:K02863]
102605171  [KO:K02915]
102605576  [KO:K02895]
102605683  [KO:K17427]
102605939  [KO:K02987]
102606013  [KO:K02864]
102606043  [KO:K02865]
102606169  [KO:K02989]
102606209  [KO:K02868]
102606349  [KO:K02973]
102606370  [KO:K14753]
102606393  [KO:K02900]
102606429  [KO:K02939]
107057649  [KO:K02957]
107058344  [KO:K02918]
107059623  [KO:K02922]
107060632  [KO:K02873]
107061375  [KO:K02950]
107062361  [KO:K02976]
107063141  [KO:K02948]
4099858  rps2; 30S ribosomal protein S2 [KO:K02967]
4099867  rpl33; 50S ribosomal protein L33 [KO:K02913]
4099868  rps18; 30S ribosomal protein S18 [KO:K02963]
4099869  rpl20; 50S ribosomal protein L20 [KO:K02887]
4099877  rps11; 30S ribosomal protein S11 [KO:K02948]
4099878  rpl36; 50S ribosomal protein L36 [KO:K02919]
4099879  rps8; 30S ribosomal protein S8 [KO:K02994]
4099880  rpl14; 50S ribosomal protein L14 [KO:K02874]
4099881  rpl16; ribosomal protein L16 [KO:K02878]
4099882  rps3; 30S ribosomal protein S3 [KO:K02982]
4099883  rpl22; ribosomal protein L22 [KO:K02890]
4099884  rps19; 30S ribosomal protein S19 [KO:K02965]
4099885  rpl2; 50S ribosomal protein L2 [KO:K02886]
4099886  rpl23; 50S ribosomal protein L23 [KO:K02892]
4099892  rps7; 30S ribosomal protein S7 [KO:K02992]
4099902  rpl32; ribosomal protein L32 [KO:K02911]
4099912  rps15; ribosomal protein S15 [KO:K02956]
4099921  rps7; 30S ribosomal protein S7 [KO:K02992]
4099927  rpl23; 50S ribosomal protein L23 [KO:K02892]
4099928  rpl2; 50S ribosomal protein L2 [KO:K02886]
4099933  rps12; rps12 [KO:K02950]
4099936  rps12; ribosomal protein S12 [KO:K02950]
4099937  SotuCr001; 16S ribosomal RNA [KO:K26195]
4099938  SotuCr002; 23S ribosomal RNA [KO:K26196]
4099939  SotuCr003; 4.5S ribosomal RNA [KO:K01984]
4099940  SotuCr004; 5S ribosomal RNA [KO:K28351]
4099941  SotuCr005; 5S ribosomal RNA [KO:K28351]
4099942  SotuCr006; 4.5S ribosomal RNA [KO:K01984]
4099943  SotuCr007; 23S ribosomal RNA [KO:K26196]
4099944  SotuCr008; 16S ribosomal RNA [KO:K26195]
4099950  rps16; ribosomal protein S16 [KO:K02959]
4099967  rps14; 30S ribosomal protein S14 [KO:K02954]
4099972  rps4; ribosomal protein S4 [KO:K02986]
Reference
  Authors
Ban N, Nissen P, Hansen J, Capel M, Moore PB, Steitz TA.
  Title
Placement of protein and RNA structures into a 5 A-resolution map of the 50S ribosomal subunit.
  Journal
Nature 400:841-847 (1999)
DOI:10.1038/23641
Reference
  Authors
Clemons WM Jr, May JL, Wimberly BT, McCutcheon JP, Capel MS, Ramakrishnan V.
  Title
Structure of a bacterial 30S ribosomal subunit at 5.5 A resolution.
  Journal
Nature 400:833-840 (1999)
DOI:10.1038/23631
Reference
  Authors
Cate JH, Yusupov MM, Yusupova GZ, Earnest TN, Noller HF.
  Title
X-ray crystal structures of 70S ribosome functional complexes.
  Journal
Science 285:2095-2104 (1999)
DOI:10.1126/science.285.5436.2095
Reference
  Authors
Ban N, Nissen P, Hansen J, Moore PB, Steitz TA.
  Title
The complete atomic structure of the large ribosomal subunit at 2.4 A resolution.
  Journal
Science 289:905-920 (2000)
DOI:10.1126/science.289.5481.905
Reference
  Authors
Nissen P, Hansen J, Ban N, Moore PB, Steitz TA.
  Title
The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis.
  Journal
Science 289:920-930 (2000)
DOI:10.1126/science.289.5481.920
Reference
  Authors
Wimberly BT, Brodersen DE, Clemons WM Jr, Morgan-Warren RJ, Carter AP, Vonrhein C, Hartsch T, Ramakrishnan V.
  Title
Structure of the 30S ribosomal subunit.
  Journal
Nature 407:327-339 (2000)
DOI:10.1038/35030006
Reference
  Authors
Carter AP, Clemons WM, Brodersen DE, Morgan-Warren RJ, Wimberly BT, Ramakrishnan V.
  Title
Functional insights from the structure of the 30S ribosomal subunit and its interactions with antibiotics.
  Journal
Nature 407:340-348 (2000)
DOI:10.1038/35030019
Reference
  Authors
Noeske J, Wasserman MR, Terry DS, Altman RB, Blanchard SC, Cate JH
  Title
High-resolution structure of the Escherichia coli ribosome.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 22:336-41 (2015)
DOI:10.1038/nsmb.2994
Reference
  Authors
Armache JP, Anger AM, Marquez V, Franckenberg S, Frohlich T, Villa E, Berninghausen O, Thomm M, Arnold GJ, Beckmann R, Wilson DN
  Title
Promiscuous behaviour of archaeal ribosomal proteins: implications for eukaryotic ribosome evolution.
  Journal
Nucleic Acids Res 41:1284-93 (2013)
DOI:10.1093/nar/gks1259
Reference
  Authors
Anger AM, Armache JP, Berninghausen O, Habeck M, Subklewe M, Wilson DN, Beckmann R
  Title
Structures of the human and Drosophila 80S ribosome.
  Journal
Nature 497:80-5 (2013)
DOI:10.1038/nature12104
Reference
  Authors
Khatter H, Myasnikov AG, Natchiar SK, Klaholz BP
  Title
Structure of the human 80S ribosome.
  Journal
Nature 520:640-5 (2015)
DOI:10.1038/nature14427
Reference
  Authors
Naganuma T, Nomura N, Yao M, Mochizuki M, Uchiumi T, Tanaka I
  Title
Structural basis for translation factor recruitment to the eukaryotic/archaeal ribosomes.
  Journal
J Biol Chem 285:4747-56 (2010)
DOI:10.1074/jbc.M109.068098
KO pathway
ko03010   

DBGET integrated database retrieval system