Solanum tuberosum (potato): 102581411
Help
Entry
102581411 CDS
T02981
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
sot
Solanum tuberosum (potato)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sot00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
sot01003
]
102581411
Glycosyltransferases [BR:
sot01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
102581411
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102581411
NCBI-ProteinID:
XP_006347576
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1141 aa
AA seq
DB search
MEMASKSFKASRSSLSTSSDLPDPQHGKPPLPPHVTFQRRTSSGRYVNYSRDDLDSELSS
SDYMNYMVHLPPTPDNQPMDSISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESEANHP
QMAGAKGSSCAIPGCDAKVMSDERGIDIVPCECDFKICRDCYLDAVKTGDGICPGCKEQY
KVTDWEEANGNNRPLPLTGPGGMSRMERRLSIMKSTKSGLIRSHTSEFDHNRWLFETKGT
YGYGNAIWPKEGGFVNGKDDDIMEPTELMSKPWRPLTRKLKIPASILSPYRLLIVVRFVV
LGLFLAWRVNHPNKDAVWLWGMSVVCEIWFAFSWILDQLPKLCPINRATDLSVLKEKFET
PSPGNPTGRSDLPGVDMFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDGGAL
LTFEAMAEAASFANIWVPFCRKHKIEPRNPESYFNLKKDPYKNKVKQDFVKDRRRAKREY
DEFKVRINSLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKQQRQKTDDEPLENVKIPKATWMADGTHWP
GTWLNSGLEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDDPLYGNNEDGIIDLTDVDIRLPMLVYVSREKR
PGYDHNKKAGAMNALVRASAVMSNGAFILNLDCDHYIYNSQAIREGMCFMMDRGGDRLCY
VQFPQRFEGIDPSDRYANRNTVFFDGNMRALDGLQGPMYVGTGCLFRRVALYGFDPPRSK
DHQSGCCSCCYGRKKKHVNTSEEHRALRRGDSDDEEMNLSLAPKAFGNSAVLIDSIPVAE
FQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPREHLDASTVAEAISVISCWYEEKTEWGQRVGWIYGS
VTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNA
LFSSSKMKFLQKIAYLNCGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVTFLVYLLII
TVTLCLLAVLEVKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVVAGIEISFTLTS
KSAGDEEDDDFADLYLVKWTSLMIPPITIMMVNLIAIAVGFSRTIYSVIPQWSRLLGGVF
FSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAINPPAGTTQIGGSFQF
P
NT seq
3426 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatggcttcaaaatcattcaaagctagtagatcatctctgtcaacatcctcagat
ttgcctgatccacagcatggcaaacctccacttcctccacatgtgactttccaacggcgg
acttcctctggccgatatgtgaactactcaagggatgatcttgatagtgaacttagcagc
agtgactatatgaactatatggtacatctccctccgactcctgacaatcagcccatggat
tctatttctcagaaggtcgaagagcagtatgtatccaattcactgttcacgggtggcttt
aattctgttacacgcgctcatcttatggacaaggtgattgaatcagaggcgaatcatccc
caaatggcgggtgcaaaagggtcgtcgtgtgctatccctggatgtgatgctaaagtgatg
agtgatgaaaggggcattgatattgttccatgtgaatgtgatttcaagatatgcagagac
tgttacctggatgctgtcaaaactggtgatggtatatgcccggggtgtaaggagcaatat
aaagtcactgactgggaggaagctaatggaaacaatcgtccgcttcctctcactgggcca
ggtgggatgtcaaggatggagagaaggttgtcaattatgaaatcaactaagtcgggattg
attaggagccatacttcagagtttgatcacaaccgttggttgtttgaaacaaagggaaca
tatgggtatggaaatgctatatggccgaaagaaggtggatttgtaaatggaaaagatgat
gatattatggagcctactgaactgatgagcaaaccatggaggccacttacgcgcaaattg
aaaattcctgcttctatcctaagtccttatagacttttgatcgtagttcggtttgttgta
cttggacttttcttggcatggagagtgaaccatcccaacaaagatgcagtttggttgtgg
gggatgtctgttgtttgtgaaatatggtttgctttctcttggattcttgatcaattgccc
aagctttgcccgatcaaccgtgctactgatcttagtgtcttgaaagaaaaatttgaaaca
cctagcccaggcaatcctactgggagatctgatctccctggtgttgatatgtttgtctct
accgctgatccagagaaggaaccccctcttgtgactgctaatactatattgtccattcta
gctgcagattatcctgtagaaaagcttgcttgttatgtttctgatgatggaggtgctctt
ttgacctttgaggcaatggcagaagctgcaagttttgctaatatatgggtgccattttgt
cgtaaacataaaattgaacctagaaatccagaaagttacttcaatttaaagaaggatcct
tacaaaaacaaggtaaagcaagactttgttaaggatcgtaggcgggcaaagcgtgagtat
gatgagtttaaggttcgtatcaatagcttgccggattccattcgccgtaggtctgatgct
tatcatgcaagggaagaaattaaggccatgaagcaacagaggcagaagactgatgatgaa
cctttagagaatgtaaagatcccaaaagctacgtggatggcagatggaacccattggcct
gggacatggttgaattctggactggagcattccaagggcgatcatgctggaataatacaa
gtgatgttgaaacctccaagtgatgatccactatatggtaacaatgaagatgggattatt
gacctgactgatgttgatatccgtcttcccatgcttgtttatgtttcccgtgagaagcgt
cctggctatgatcacaacaagaaagcaggtgctatgaatgccctggttcgagcatctgcg
gttatgtccaatggtgcatttattctaaaccttgattgtgaccattacatttacaactcc
caggctatcagggaaggtatgtgttttatgatggataggggaggggatcgtctttgctat
gttcagttcccgcagaggtttgagggcattgacccatctgataggtatgccaatcgcaat
actgtctttttcgatggtaacatgagggcccttgatgggctacagggtccaatgtatgtg
ggaactggatgtctctttcgaagggtagccctttatggtttcgaccctcctcgctccaag
gatcaccagtccggttgctgtagctgctgctatggtcgcaaaaagaaacatgttaataca
tcagaagaacatcgggccttgcgacgaggtgattcagacgatgaagaaatgaacctctca
ctggctcccaaggcttttgggaactcagcagtccttattgattcaattcctgtggcagag
ttccaaggtcgtcctttggcagatcacccagctgtgaagaatggacggcctcctggtgct
ttgaccattcctcgagagcatcttgatgcatcaacagttgcagaggccatcagtgtcatc
tcctgctggtatgaggaaaagacagagtggggacaacgtgtcggatggatttatggttca
gttactgaagatgttgtgacaggatacaggatgcacaacagaggttggaagtcagtttat
tgtgttaccaaacgtgatgcattccgtgggactgcccctattaatctcactgataggctt
catcaggtccttcgatgggctactggttcagttgaaatcttcttctcccggaacaatgcc
cttttctccagctcaaaaatgaaattcttacagaaaattgcttacctcaattgtggaatc
tatcccttcacatcaatcttcttaatcgtctactgtttccttccagcactgtccctgttc
tccggtcagttcattgtccaaacactcaatgtcacctttcttgtgtacctcctgattatt
acagtcaccctctgcctgcttgcggtgctcgaggtcaagtggtcaggcattgagttggaa
gagtggtggaggaatgagcagttctggctgatcggagggacaagtgctcacttggctgct
gtgcttcaggggctcctaaaagttgttgctgggattgaaatttctttcaccttgacgtca
aaatcagctggtgatgaagaagacgatgactttgctgatctgtatctcgttaagtggaca
tccctcatgattccaccaattacaatcatgatggtgaacttgatagcaatagcagttggt
tttagcaggacaatatacagtgttataccacaatggagccgtttactaggaggtgtattc
ttcagtttttgggttttagcacatctctatcccttcgcgaaaggtcttatgggcagaaga
ggcaggacaccaaccattgtctttgtatggtcaggacttatcgcgatcaccatatccctt
ctttgggtggcgattaatcctccagcaggcactacccaaattggaggatcattccagttc
ccatga
DBGET
integrated database retrieval system
